EMLSAG00000000575, EMLSAG00000000575-683341 (gene) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAG00000000575
Unique NameEMLSAG00000000575-683341
Typegene
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Homology
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592912074|gb|GAXK01046301.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp581353_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 150.599 bits (379), Expect = 6.332e-39
Identity = 110/323 (34.06%), Postives = 159/323 (49.23%), Query Frame = 0
Query:    3 VHNLKSPGPGSVYRVTEIKEGSDVLLVIQRGNNEIKKCSYSTVTGFGHRITGISCEPSVGLPAECFCWNDKCSTPYVSLSELLQSITALG-RIKSINRFNYTELREWEVAK--VVPXSYLRIVYEKDRDDRDKISWIPWKVHFSGVAPGTEMRAMPQSVSVNYDIHSFEFLTTSRDDGKRNIFLSEEENL-IPKGIFC-QXXXXXXXXXXXXEDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKFAPKSHSIFPSIFFSQFAISSKLPEDSFNIVHDFESGLQYTINQRTGNCSIQKIPLTSPEAELVDSTHARLKHAKE 320
            V NL      +V  +  + E    L V    +N    CS+ T  GFG   TGI C  S   P ECFCW+  C  PY+ L ++    T+ G   K I    +  L  W V K  +   +  ++V       R+K  + P  +   G   G  + +   +  + Y +  F+       +    I      NL  P GIFC +      +  PD  +QFSV+IETI K+   VSY++ ++DL+H LVS KF+P+ HS  PSIF S  +++  L   ++NI+HDF +GLQYT++ RTGNCS+Q I  T  +A  +D    RLK A E
Sbjct: 1887 VKNLDDNREYTVSELHSVDEEMSKLTVKDPQHNATSTCSFHT-GGFGQATTGIRCRTSRNFPEECFCWDKVCKHPYLPLHKVFLKFTSQGGDFKQI----FPGLFTWNVEKQDLKLNATFKVV-------RNKFLY-PLDISIEGF--GYAIGSKQDTARLKYSVILFQ------PEDPDPISAGHVFNLQPPDGIFCPRSTIHPPQTFPDFPNQFSVQIETIQKDSRKVSYSQHHYDLKHKLVSMKFSPRPHSS-PSIFLSTLSLAPHLLPQTYNIIHDFNTGLQYTVSDRTGNCSVQPISPTYSDAAKLDGRTVRLKLAYE 2789          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592761044|gb|GAXK01193369.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp1252349_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 132.494 bits (332), Expect = 6.594e-33
Identity = 94/295 (31.86%), Postives = 144/295 (48.81%), Query Frame = 0
Query:   35 NEIKKCSYSTVTGFGHRITGISCEPSVGLPAECFCWNDKCSTPYVSLSELLQSITALGRIKSINRFNYTELREWEVAK--VVPXSYLRIVYEKDRDDRDKISWIPWKVHFSGVAPGTEMRAMPQSVSVNYDIHSFE-----FLTTSRDDGKRNIFLSEEENLIPK-GIFC-QXXXXXXXXXXXXEDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKFAPKSHSIFPSIFFSQFAISSKLPEDSFNIVHDFESGLQYTINQRTGNCSIQKIPLTSPEAELVDSTHARLKHAKE 320
            N    C   T +GFGH  TG+ C+ S  LP ECFCW+  C  P++    L   +  L + K   R N+     W++    +   S   +V E+           P ++       G  + +      + Y I  FE      L         N+F     +L P  G+FC +      R  P+  +QFSV+IETI+K    V Y++  +DLRH LVS +F+P+ HS  PSIF +  +++  L   ++NI+HDF +GLQ+T++   GNCS+Q I L   +A +++    R+K AKE
Sbjct: 1229 NATSTCMMHT-SGFGHATTGVRCKTSRNLPEECFCWDGLCKHPFLPFYSL---VNKLLKQKEDLRANHPGYFSWDIDNNGIKINSTFHLVNER--------FLFPLELFVESF--GYILGSKRDVARLKYSIIQFEPSDPYSLREQIQPTGPNVF-----DLQPMPGVFCPRSSIHPPRVFPEFPNQFSVEIETIEKNADKVFYSQHRYDLRHKLVSMRFSPQPHSS-PSIFLTTLSLAPHLLPQTYNIIHDFNTGLQFTVSDWAGNCSVQPISLGFGDAAILEKKSVRIKLAKE 2053          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592898934|gb|GAXK01059441.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp1977420_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 72.0182 bits (175), Expect = 2.337e-13
Identity = 68/247 (27.53%), Postives = 112/247 (45.34%), Query Frame = 0
Query:   15 YRVTEIKEGSDVLLVIQRGN---NEIKKCSYSTVTGFGHRITGISCEPSVGLPAECFCWNDKCSTPYVSLSELLQSITALGR--IKSINRFNYTELREWEVAK--VVPXSYLRIVYEKDRDDRDKISWIPWKVHFSGVAPGTEMRAMPQSVSVNYDIHSFEFLTTSRDDGKR-------NIFLSEEENLIPK-GIFCQXXXXXXXXXX-XXEDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKF 245
            Y+V E+    D +  I   +   N    C++ T +GFG   TG+ C+ S  LP ECFCW+  CS P++    L+  +   G   ++S     +  L  W++ +  +   +   ++     DDR      P  +H  G   G  + +      + Y   + +F  +   D ++       N+F     +L P  GIFC    I   R   +   QFSV+IET+ K+   V Y++ ++DL+H LVS KF
Sbjct:   70 YKVQEVHINDDEISRISVKDPQRNATSDCTFHT-SGFGLATTGVRCKASRNLPEECFCWDGVCSHPFLPFYMLVNKLLKWGEDLVES-----HPGLLRWQMDRDGIKINATFTVI-----DDR---YIFPIMIHVEG--NGYSLGSKQDVARLKYS--TIQFQPSDPVDLRQHNQPRGFNVF-----DLQPSPGIFCPTTSIRLSRTFPEFPSQFSVQIETVQKDKRRVFYSQHHYDLKHKLVSMKF 741          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592759095|gb|GAXK01195318.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp2033015_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 46.595 bits (109), Expect = 7.112e-5
Identity = 26/63 (41.27%), Postives = 40/63 (63.49%), Query Frame = 0
Query:  271 SFNIVHDFESGLQYTINQRTGNCSIQKIPLTSP--------EAELVDSTHA-----RLKHAKE 320
            ++NI+HDF++GLQY ++++T NCS+Q  P+T+         +AE  D+  A     RLK AKE
Sbjct:   42 TYNIIHDFKTGLQYIVSEQTSNCSVQ--PITAEYGDAVQPIKAEYGDAVTAHGKSVRLKLAKE 224          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592861750|gb|GAXK01095812.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp7169241_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 42.743 bits (99), Expect = 1.667e-4
Identity = 19/51 (37.25%), Postives = 26/51 (50.98%), Query Frame = 0
Query:   46 TGFGHRITGIS----CEPSVGLPAECFCWNDKCSTPYVSLSELLQSITALG 92
            +GFG   TG+     C+ S  LP ECFCW+  CS P+     L+  +   G
Sbjct:  148 SGFGLAATGVRLGVRCKSSHNLPEECFCWDGVCSHPFFPFYSLVDKMLKHG 300          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592805457|gb|GAXK01149111.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp2565703_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 30.8018 bits (68), Expect = 4.110e+0
Identity = 13/35 (37.14%), Postives = 21/35 (60.00%), Query Frame = 0
Query:  272 FNIVHDFESGLQYTINQRTGNC---SIQKIPLTSP 303
            F +++ F +G+ Y  N +TGNC   ++  IPL  P
Sbjct:  204 FKLLNVFSAGIMYFNNMKTGNCFRTTLTYIPLNGP 308          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592754017|gb|GAXK01200396.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp307120_c0_seq11 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 30.8018 bits (68), Expect = 7.968e+0
Identity = 17/48 (35.42%), Postives = 25/48 (52.08%), Query Frame = 0
Query:  210 EDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKFAPKSHSIFPSIF 257
            ++ FS  + +      S S+ +Q+FD+   LVSF F  K    FPS F
Sbjct: 1710 DEMFSASMTSFRLTLFSASFIKQSFDIVIFLVSFLFTFKDWFCFPSFF 1853          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592754020|gb|GAXK01200393.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp307120_c0_seq8 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 30.8018 bits (68), Expect = 8.492e+0
Identity = 17/48 (35.42%), Postives = 25/48 (52.08%), Query Frame = 0
Query:  210 EDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKFAPKSHSIFPSIF 257
            ++ FS  + +      S S+ +Q+FD+   LVSF F  K    FPS F
Sbjct: 1710 DEMFSASMTSFRLTLFSASFIKQSFDIVIFLVSFLFTFKDWFCFPSFF 1853          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592754021|gb|GAXK01200392.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp307120_c0_seq7 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 30.8018 bits (68), Expect = 8.492e+0
Identity = 17/48 (35.42%), Postives = 25/48 (52.08%), Query Frame = 0
Query:  210 EDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKFAPKSHSIFPSIF 257
            ++ FS  + +      S S+ +Q+FD+   LVSF F  K    FPS F
Sbjct: 1710 DEMFSASMTSFRLTLFSASFIKQSFDIVIFLVSFLFTFKDWFCFPSFF 1853          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592754022|gb|GAXK01200391.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp307120_c0_seq6 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 30.8018 bits (68), Expect = 8.492e+0
Identity = 17/48 (35.42%), Postives = 25/48 (52.08%), Query Frame = 0
Query:  210 EDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKFAPKSHSIFPSIF 257
            ++ FS  + +      S S+ +Q+FD+   LVSF F  K    FPS F
Sbjct: 1710 DEMFSASMTSFRLTLFSASFIKQSFDIVIFLVSFLFTFKDWFCFPSFF 1853          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000000575 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s1097:5804:46829:-1 gene:EMLSAG00000000575 transcript:EMLSAT00000000575 description:"maker-LSalAtl2s1097-augustus-gene-0.8")

HSP 1 Score: 661.374 bits (1705), Expect = 0.000e+0
Identity = 320/320 (100.00%), Postives = 320/320 (100.00%), Query Frame = 0
Query:    1 MKVHNLKSPGPGSVYRVTEIKEGSDVLLVIQRGNNEIKKCSYSTVTGFGHRITGISCEPSVGLPAECFCWNDKCSTPYVSLSELLQSITALGRIKSINRFNYTELREWEVAKVVPXSYLRIVYEKDRDDRDKISWIPWKVHFSGVAPGTEMRAMPQSVSVNYDIHSFEFLTTSRDDGKRNIFLSEEENLIPKGIFCQRPDIYRRRIPDIEDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKFAPKSHSIFPSIFFSQFAISSKLPEDSFNIVHDFESGLQYTINQRTGNCSIQKIPLTSPEAELVDSTHARLKHAKE 320
            MKVHNLKSPGPGSVYRVTEIKEGSDVLLVIQRGNNEIKKCSYSTVTGFGHRITGISCEPSVGLPAECFCWNDKCSTPYVSLSELLQSITALGRIKSINRFNYTELREWEVAKVVPXSYLRIVYEKDRDDRDKISWIPWKVHFSGVAPGTEMRAMPQSVSVNYDIHSFEFLTTSRDDGKRNIFLSEEENLIPKGIFCQRPDIYRRRIPDIEDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKFAPKSHSIFPSIFFSQFAISSKLPEDSFNIVHDFESGLQYTINQRTGNCSIQKIPLTSPEAELVDSTHARLKHAKE
Sbjct:    1 MKVHNLKSPGPGSVYRVTEIKEGSDVLLVIQRGNNEIKKCSYSTVTGFGHRITGISCEPSVGLPAECFCWNDKCSTPYVSLSELLQSITALGRIKSINRFNYTELREWEVAKVVPXSYLRIVYEKDRDDRDKISWIPWKVHFSGVAPGTEMRAMPQSVSVNYDIHSFEFLTTSRDDGKRNIFLSEEENLIPKGIFCQRPDIYRRRIPDIEDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKFAPKSHSIFPSIFFSQFAISSKLPEDSFNIVHDFESGLQYTINQRTGNCSIQKIPLTSPEAELVDSTHARLKHAKE 320          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. nr
Match: gi|1067067513|ref|XP_018017825.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC108674397 [Hyalella azteca])

HSP 1 Score: 107.457 bits (267), Expect = 3.548e-22
Identity = 76/285 (26.67%), Postives = 131/285 (45.96%), Query Frame = 0
Query:   40 CSYSTVTGFGHRITGISCEPSVGLPAECFCWNDKCSTPYVSLSELLQSITALGRIKSINRFNYTELREWEVAKV---VPXSYLRIVYEKDRDDRDKISWIPWKVHFSGVAPGTEMRAMPQSVSVNYDIHSFEFLTTSRDDGKRNIFLSEEENLIPKGIFCQRPDIYRRRIPDIEDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKFAPKSHSIFPSIFFSQFAISSKLPED-SFNIVHDFESGLQYTINQRTGNCSIQKIPLTSPEAELVDSTHARLKHAKE 320
            C + T T  G  + G+ C     LP  CF  +D    PYVS++ L+  ++              E+  W  A     V  ++  I    D    +  SW+   ++FS    G+   A   ++ + Y + +   L  S  D            + P G+ C  P   R+ +P + +QF++ +ET+ +   +++Y  Q++D     VS+ + P  H+    +F            D ++ +VHDF +G+QY I++ + NCSI+ IPLT+ +A LVD+   RL+HA E
Sbjct:  121 CIFDTFTNEGFTLDGMKCGRQKDLPQRCFS-SDHKRRPYVSVAALMSFLSRHNASVHQESLGAVEVSVWSAAHANMSVEAAFSNISLPDDAPGAE--SWLT-PLYFSLAGDGSVFLAEAGNIELQYRVLAALPLQDSVAD----------LTITPPGVLC--PIDERKYLPKLANQFTLTMETVIENLGTIAYEHQSYDSEEKFVSYTYRPHLHAQ-DMMFVHNVPRRENFTADRTYRVVHDFRTGVQYIIDETSSNCSIEYIPLTALDATLVDNQTIRLRHASE 388          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. nr
Match: gi|919055896|ref|XP_013409792.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC106173269 [Lingula anatina])

HSP 1 Score: 68.9366 bits (167), Expect = 2.227e-9
Identity = 49/187 (26.20%), Postives = 89/187 (47.59%), Query Frame = 0
Query:  136 IPWKVHFSGVAPGTEMRAMPQSVSVNYDIHSFEFLTTSRDDGKRNIFLSEEENLIPKGIFC-QRPDIYRRRIPDIEDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKFAPKSHSIFPSIFFSQFAISSKLPEDSFNIVHDFESGLQYTINQRTGNCSIQKIPLTSPEAE-LVDSTHARLKHAKE 320
            +P ++  +G +P T   +       +   H++EF+          IF +      PKG+ C  R +I  + +P+I DQF++  ET+ +   SV   ++ +D    +  F    K      S       +++K    +   +HD+ +GL+Y I++  GNC+I  IPL + + E + D  H R+KH+ E
Sbjct:  194 VPVRLAINGTSPNTRDPSGKLQPGSHEFRHNYEFIYYKPGAMDPTIFQT------PKGVVCPGRINI--KSLPNITDQFTLDGETVHQSSKSVDMIKEFYDFSAKMFRFDRKLKH-----STRRWNRNMTAKYGAANLKFIHDYNAGLEYVIDKEKGNCTIHPIPLLAWDGEQMPDHHHLRMKHSYE 367          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. nr
Match: gi|919027062|ref|XP_013397328.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC106164081 [Lingula anatina])

HSP 1 Score: 68.9366 bits (167), Expect = 2.343e-9
Identity = 49/187 (26.20%), Postives = 89/187 (47.59%), Query Frame = 0
Query:  136 IPWKVHFSGVAPGTEMRAMPQSVSVNYDIHSFEFLTTSRDDGKRNIFLSEEENLIPKGIFC-QRPDIYRRRIPDIEDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKFAPKSHSIFPSIFFSQFAISSKLPEDSFNIVHDFESGLQYTINQRTGNCSIQKIPLTSPEAE-LVDSTHARLKHAKE 320
            +P ++  +G +P T   +       +   H++EF+          IF +      PKG+ C  R +I  + +P+I DQF++  ET+ +   SV   ++ +D    +  F    K      S       +++K    +   +HD+ +GL+Y I++  GNC+I  IPL + + E + D  H R+KH+ E
Sbjct:  194 VPVRLAINGTSPNTRDPSGKLQPGSHEFRHNYEFIYYKPGAVDPTIFQT------PKGVVCPGRINI--KSLPNITDQFTLDGETVHQSSKSVDMIKEFYDFSAKMFRFDRKLKH-----STRRWNRNMTAKYGAANLKFIHDYNAGLEYVIDKEKGNCTIHPIPLLAWDGEQMPDHHHLRMKHSYE 367          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. nr
Match: gi|1126180896|ref|XP_019622904.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC109468968 [Branchiostoma belcheri])

HSP 1 Score: 67.0106 bits (162), Expect = 1.117e-8
Identity = 41/132 (31.06%), Postives = 69/132 (52.27%), Query Frame = 0
Query:  190 IPKGIFC-QRPDIYRRRIPDIEDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKFAPKSHSIFPSIFFSQFAISSKLPEDSFNIVHDFESGLQYTINQRTGNCSIQKIPLTSPEAELVDSTHARLKHAKE 320
            IP G+ C  RP +  + +PDI + FS + E + K    VSY ++ +D  + LV + + P S S            S+    D+  +VHDF +G++Y  +  +GNC+ + I  TS ++E VD    R+++  E
Sbjct:  257 IPAGVVCPGRPPV--KPLPDIPNAFSYRSEILVKYNFVVSYIDEYYDYNNKLVRYDYKPLSAS------------SNSFGTDNEIVVHDFRTGIEYLTDAISGNCTTRPISNTSFDSEAVDPYTIRMRNKFE 374          
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. Tigriopus kingsejongenis genes
Match: maker-scaffold12_size759060-snap-gene-5.12 (protein:Tk05578 transcript:maker-scaffold12_size759060-snap-gene-5.12-mRNA-1 annotation:"hypothetical protein BRAFLDRAFT_118423")

HSP 1 Score: 103.99 bits (258), Expect = 7.738e-27
Identity = 49/102 (48.04%), Postives = 72/102 (70.59%), Query Frame = 0
Query:  191 PKGIFCQRPDIYRRRIPDIEDQFSVKIETIDKEGASVSYTEQNFDLRHNLVSFKFAPKSHSIFPSIFFSQF-AISSKLPEDS--FNIVHDFESGLQYTINQR 289
            P G+FC RPDIYRR++PDI + F+  IET+D+  + VSY+ Q++D  +N+VS KF+P+ H++   IFF +  +I     E S  F ++HDF +GLQYTIN+R
Sbjct:   93 PPGVFCPRPDIYRRQLPDIPEHFATTIETVDEGDSIVSYSHQSYDYDNNIVSMKFSPRPHNVQRPIFFIRVPSIYGDFGESSRAFTVIHDFNTGLQYTINKR 194          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000000575 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 (Blast vs. GO)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of EMLSAG00000000575 vs. C. finmarchicus
Analysis Date: 2014-05-09 (TblastN vs C. finmarchicus TSA)
Total hits: 15
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|592912074|gb|GAXK01046301.1|6.332e-3934.06TSA: Calanus finmarchicus comp581353_c0_seq1 trans... [more]
gi|592761044|gb|GAXK01193369.1|6.594e-3331.86TSA: Calanus finmarchicus comp1252349_c0_seq1 tran... [more]
gi|592898934|gb|GAXK01059441.1|2.337e-1327.53TSA: Calanus finmarchicus comp1977420_c0_seq1 tran... [more]
gi|592759095|gb|GAXK01195318.1|7.112e-541.27TSA: Calanus finmarchicus comp2033015_c0_seq1 tran... [more]
gi|592861750|gb|GAXK01095812.1|1.667e-437.25TSA: Calanus finmarchicus comp7169241_c0_seq1 tran... [more]
gi|592805457|gb|GAXK01149111.1|4.110e+037.14TSA: Calanus finmarchicus comp2565703_c0_seq1 tran... [more]
gi|592754017|gb|GAXK01200396.1|7.968e+035.42TSA: Calanus finmarchicus comp307120_c0_seq11 tran... [more]
gi|592754020|gb|GAXK01200393.1|8.492e+035.42TSA: Calanus finmarchicus comp307120_c0_seq8 trans... [more]
gi|592754021|gb|GAXK01200392.1|8.492e+035.42TSA: Calanus finmarchicus comp307120_c0_seq7 trans... [more]
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BLAST of EMLSAG00000000575 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 (Blastp vs. self)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
EMLSAP000000005750.000e+0100.00pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s1097:5804... [more]
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BLAST of EMLSAG00000000575 vs. SwissProt
Analysis Date: 2017-02-10 (Blastp vs. SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of EMLSAG00000000575 vs. Select Arthropod Genomes
Analysis Date: 2017-02-20 (Blastp vs. Selected Arthropods)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of EMLSAG00000000575 vs. nr
Analysis Date: 2017-02-20 (Blastp vs. NR (2/2017))
Total hits: 4
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BLAST of EMLSAG00000000575 vs. Tigriopus kingsejongenis genes
Analysis Date: 2018-04-18 (Blastp vs. Tigriopus kingsejongensis proteins)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
maker-scaffold12_size759060-snap-gene-5.127.738e-2748.04protein:Tk05578 transcript:maker-scaffold12_size75... [more]
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Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1097supercontigLSalAtl2s1097:5804..46829 -
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Blast vs. GO2014-04-02
TblastN vs C. finmarchicus TSA2014-05-09
Blastp vs. self2014-05-10
Blastp vs. SwissProt2017-02-10
Blastp vs. Selected Arthropods2017-02-20
Blastp vs. NR (2/2017)2017-02-20
Blastp vs. Tigriopus kingsejongensis proteins2018-04-18
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Descriptionmaker-LSalAtl2s1097-augustus-gene-0.8
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
NotePREDICTED: uncharacterized protein LOC108674397 [Hyalella azteca]
Cross References
External references for this gene
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (gene)EMLSAG00000000575 (primary cross-reference)
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAT00000000575EMLSAT00000000575-696422Lepeophtheirus salmonismRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at LSalAtl2s1097:5804..46829-

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAG00000000575-683341 ID=EMLSAG00000000575-683341|Name=EMLSAG00000000575|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=41026bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1097:5804..46829- (Lepeophtheirus salmonis)
CTATCGTGTAACAATGAAAGTTCACAATCTAAAATCCCCAGGCCCAGGAA GTGTATACCGTGTAACAGAAATTAAAGAAGGCTCCGATGTTCTCCTCGTG ATACAAAGAGGAAACAATGAGATCAAAAAATGCTCCTATTCCACTGTCAC TGGATTTGGACATCGGATTACAGGTAAGTCCCACACATTGGAGTTTATGC TCAATAAACTGGTTACTCACAAGTTGTGAGTTCAAGGCACTATTTATACG TCTCATAACCCCTTATTTAATTACAAAAGTTATATTTAATAATTAATCGT TAATGCTTTCATTCAATTTTGATCCATTAAAATTACTTGGTTATTATGTA TAACTGGAAAAAATATCAAAGGGCAATTGTATTTTGTAATGTGCTACACA GTAGATATTAATTTTGTATTTTTTTTTATAAAAAAGTAATAAATAAATCA TTAATAAATTGACCATACACAGAATATTCAATGATTTGATTAATCTCATT ATTTGGTTGCAACTTGTATAATTTCCTCACACAACTTTTTCAACTTGTAT AAAATTACACCTTGTACACAATAATTATATAAAATTTATGTATTATTAAT TATTAGAATATATCAGTTAAGATAAGAAGCCCCTATATATAAATACAAAA AAACAATTTGAATCAACATGTTCAAAAAAGGACTTGTCCCCAAAACACCA TAAAATATTAATAAGATAAGAAACAGGGATGAGCAAACTTTTTCGTAAAA GTCCCAGAAGAAGAAAGTTATAAATTTCAATGTGTTGCATTTAAAAAATG TCACTTAAATAAAATATTTCATCTTTTAAAACGGGTATATTTACTTACTA AAACACAATTGATTTTTTACAATCATCTCCCAAAATTATCAAAAACTCTG ATATTTTTGAGTCAGCTGTCAATTTTCAATTTTTTTTATTCGTTATTAGT 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TAAATTTTACTTTTATATTAATATAAAATAAGATATTTATAGCGATTGAA ATGTATTTTCAATATCCAATATATATATAAAAATAAAAGTATGTTTAGGT TAGGAAAAGCGGAAGGTAAAATTGGTTTACTTAAAGTATGTGCATACACA CATATATTTTATTGACAAGGGAAATTTAATTATCTGGTTTTGCATATAAA ATGAAACTTATATTTACAAAGACATAACATAGTTGGCTTAATACCAACTG TGTTTGGACTTCTTTCTTAGCAAAGAAAATCAATAAAAATATCGACGTAC TGACTTTATTAATACACCTTTTTAAAAATTCTAATATATTTATAGTTATC TTTATACGAAAAAGTTAGTGACGTCACAATTAATCTCTCTGCTATCAGGA CACTAACCCAATGCTTATAAGAATCATGAATACTTTATTTAGCCTTATTT AAGAATAGTGGAAAATTATTATTGTGCAGAAAATATATATTCTTGGGGTT TTACTTAATGAACTCAATTATCTAAACTGAGCAAGGTAAATTTGATTATT ATATGAATTAATGATGCCATATAAATGGTTTTTTTCGAATGTAGAACGTT TTTCTAGGACAAATATCAGAAAAGGGCGGAACCTATGTCAAAGCCAATAT TAAGTACACATATATTCCTCATAAATACTAAAACTRCAAAATCTTCAAAA TTTAGAATGAAATTATTCTCTAATAAAGGTATTTTAAACGACATCATAAG ACGTCTCTCTAGAACAATCAAGCTACAACTAAAATACTTTCACAAAGGAT GGTTAAGTACATTTATTAACATAATTTTGATCAATATCATTTTTTGACAA TTTATATTTTGATTATATTTTTGCAACTACTTTTTAAAAGTATAATAATA YCTTTGTAACATTTCATAGCTAACAAGACACTTTCCCTTTATTATTTTGT 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