EMLSAG00000001126, EMLSAG00000001126-683892 (gene) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAG00000001126
Unique NameEMLSAG00000001126-683892
Typegene
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Homology
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592945551|gb|GAXK01013002.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp680588_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 120.168 bits (300), Expect = 1.556e-29
Identity = 84/272 (30.88%), Postives = 131/272 (48.16%), Query Frame = 0
Query:   37 PSKEEQVEQFLAK------------GELSQSRNEIEQLRKRLEEQTGLESKISGMKSQMDAITETYDELHEKMHEIDKTRKNNLIFYGDREEIL----------------------------RLSKLLKGTNI-------------------------------YVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSVVPLI----SQRYSGPNRL------YYNNMTQQVQSGMSMI-RSASVHSVGSH 226
            P+KEEQ++    K             +++  + EI  L+  +   TG E+++  MK++M++I++ Y +L EKMH++DK  KNNL+FYG   E L                            ++++L  G  I                               YV+EDLSRK REQR+EL+K+MR V+ ++P KKCV+R DKLYIDN+ + FD+ +  VV  I     +  S P R         +++++ V +   M+ R+ SVHSV  H
Sbjct:  926 PTKEEQMKALQDKVQAYEDKIDCLEKDVASHKEEISGLKSTVAGMTGFEAEVKEMKAKMESISDVYGDLQEKMHDVDKAIKNNLLFYGLVPEYLPEMASALTLKIHNLFKFNLGISRQLPLSKVARLTTGPEIRGCRPVLVAFTSFQDREEVLSKSKLLKTANIYVSEDLSRKTREQRHELSKHMRFVKRKAPHKKCVIRYDKLYIDNEPYTFDEIEGKVVRFIPTGGDRALSPPRRADSRQDRTESSLSRAVSTPQPMLARAESVHSVNGH 1741          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592815644|gb|GAXK01138924.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp2209825_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 97.8265 bits (242), Expect = 1.089e-21
Identity = 43/75 (57.33%), Postives = 59/75 (78.67%), Query Frame = 0
Query:  111 YGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSV 185
            Y D+E+ILR +KLLKG NI+++ED SRK+RE R ELNK+M+ +RSR P ++ VLR DKLY+ NDVF ++D+   V
Sbjct:  806 YNDKEDILRKAKLLKGVNIHISEDFSRKVREHRQELNKFMKEIRSRDPARRMVLRYDKLYMGNDVFFYNDKTGRV 1030          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592928047|gb|GAXK01030440.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp1888337_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 87.4261 bits (215), Expect = 1.587e-18
Identity = 52/179 (29.05%), Postives = 87/179 (48.60%), Query Frame = 0
Query:   66 LEEQTGLESKISGMKSQMDAITETYDELHEKMHEIDKTRKNNLIFYG----DREE----------ILRL--------------------------------------------SKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSVV 186
            + +   LE  I G+  +M+++T   D++ EKM++ ++ ++NNLIFYG    DRE           +LRL                                            SK+L  + + VTEDLS++ RE R EL K+MRT++ ++P++ C L  DKLY+D+ +++++D    VV
Sbjct:  449 MNKMVALEENIKGVNEKMESVTIQIDDIQEKMYDFEQNKRNNLIFYGVPGEDRESRDDLRIKISNLLRLHLNMRREIPISKASRMLTGPQVHGCRPTLVTFECFKDREDVLKNSKVLGRSQVTVTEDLSKRTRESRQELRKFMRTIKKKTPERHCFLEYDKLYVDHAIYVWNDILGQVV 985          

HSP 2 Score: 43.8986 bits (102), Expect = 3.965e-4
Identity = 39/137 (28.47%), Postives = 69/137 (50.36%), Query Frame = 0
Query:   13 SGDIELNPGPPRRAPSTANSAPKGPSKEEQVEQFLAKGELSQSRNEIEQLRKRLEE-QTGLESKISGMKSQMD-AITET-------YD-ELHEKMHEIDKTRKNNLIFYGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKM 139
            SGD+E NPGP  R      S  +GPS +EQV  +    ++++ + + E L K + + Q   +SK   + +++D A+TE+       YD ++ E  H ++  R  +    G+ E   +L  L++    +V  DL  K+
Sbjct: 1028 SGDVETNPGPTGR-----RSVAQGPSTDEQV--YTLNTQVAEIQTKCEGLEKGVNDIQNDFDSKFDSLSNKIDEALTESINVLKNDYDNKIGEVQHAVEGLRAESFSHLGETEA--KLDNLIREKIDHVNGDLLEKI 1411          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592789490|gb|GAXK01165078.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp1653113_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 85.1149 bits (209), Expect = 3.327e-18
Identity = 37/75 (49.33%), Postives = 57/75 (76.00%), Query Frame = 0
Query:  111 YGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSV 185
            + DRE+ILR + +LKG+NI+VTED+SR++RE R+EL K+MR V+  +P  +  ++ DKLY+DN  FI++D +  V
Sbjct:  437 FKDREDILRKANMLKGSNIHVTEDMSRRIRESRHELRKFMRDVKRGNPAARVAMQYDKLYVDNKCFIWNDVQGRV 661          

HSP 2 Score: 38.891 bits (89), Expect = 1.272e-2
Identity = 15/39 (38.46%), Postives = 27/39 (69.23%), Query Frame = 0
Query:   74 SKISGMKSQMDAITETYDELHEKMHEIDKTRKNNLIFYG 112
            S  +G + Q+  + E  D+++EKM++ +  ++NNLIFYG
Sbjct:  876 SSTAGTQGQIQELLERVDDINEKMYDFEVNKRNNLIFYG 992          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592924478|gb|GAXK01033937.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp2534510_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 83.9593 bits (206), Expect = 3.702e-18
Identity = 34/76 (44.74%), Postives = 55/76 (72.37%), Query Frame = 0
Query:  111 YGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSVV 186
            Y D+E++LR   ++KG+ I+VTED+++K R+ R EL ++MR V+  +P   CVL  DKLY+DN VF+++D +  V+
Sbjct:  379 YKDKEDVLRKGGMMKGSKIHVTEDMNKKTRDSRTELRRFMRAVKRNNPGASCVLHYDKLYVDNKVFVYNDVQGKVI 606          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592802360|gb|GAXK01152208.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp2623389_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 85.8853 bits (211), Expect = 3.768e-18
Identity = 34/76 (44.74%), Postives = 58/76 (76.32%), Query Frame = 0
Query:  111 YGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSVV 186
            + DREE+LR   +LKG+NI++ ED+S+++RE R+EL KYMR ++  +P+  C ++ DKLY++N +++F+D +  VV
Sbjct:  855 FKDREEVLRKGNMLKGSNIHIGEDMSKRIRESRSELRKYMRKIKKANPEATCFMQYDKLYVNNKIYVFNDLQGRVV 1082          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592797932|gb|GAXK01156636.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp3729714_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 82.4185 bits (202), Expect = 4.399e-18
Identity = 39/75 (52.00%), Postives = 53/75 (70.67%), Query Frame = 0
Query:  111 YGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSV 185
            + DREE+L+ SK +K   I VTEDLS++ RE R EL K+MR V+  +P+K+C L+ DKLYID  VFIF +   +V
Sbjct:   17 FKDREEVLKNSKFIKKPTISVTEDLSKRTRESRQELRKFMRHVKRINPEKRCFLQYDKLYIDGKVFIFSEASGAV 241          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592888469|gb|GAXK01069906.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp1222585_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 85.1149 bits (209), Expect = 1.083e-17
Identity = 41/90 (45.56%), Postives = 62/90 (68.89%), Query Frame = 0
Query:   99 EIDKTRKNNLIF--YGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSVV 186
            E+  TR   + F  + DR+E+LR +++LK  NI+V EDLS++ RE R EL K+MR VR  +P+K C L+ DKLYID+ +F++++    VV
Sbjct:  523 EVRGTRPVLVTFESFKDRDEVLRKARMLKKANIHVEEDLSKRTRENRTELRKFMRQVRKANPEKSCFLQYDKLYIDSKIFVYNEVLGQVV 792          

HSP 2 Score: 45.0542 bits (105), Expect = 1.659e-4
Identity = 31/98 (31.63%), Postives = 50/98 (51.02%), Query Frame = 0
Query:   10 LLLSGDIELNPGPPRRAPSTANSAPKGPSKEEQVEQFLAKGELSQSRNEIEQLRKRLEEQTGLESKISGMKSQMDAITETYD----ELHEKMHEIDKT 103
            +LLSGDIE NPGPPRR+      A KGPS +E++    A                     +  E+K+SG++ +++   E Y+    + +E++  I+KT
Sbjct: 1450 ILLSGDIESNPGPPRRS-----IAEKGPSADEKLSSLEAT-------------------ISNYEAKVSGLEHEIETQKEDYEKKILDFNERLEIIEKT 1671          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592758717|gb|GAXK01195696.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp2661962_c0_seq2 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 80.8777 bits (198), Expect = 1.704e-17
Identity = 35/76 (46.05%), Postives = 56/76 (73.68%), Query Frame = 0
Query:  111 YGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSVV 186
            + DRE++L+ SK L+ T+I VTEDLS++ RE R EL K+MRTV+  +P+++C L  D+LY+D  +++++D    VV
Sbjct:  373 FKDREDVLKNSKTLQRTHITVTEDLSKRTRESRQELRKFMRTVKKTNPERRCFLEYDRLYVDQKIYVWNDIAGQVV 600          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592798080|gb|GAXK01156488.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp3538698_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 83.5741 bits (205), Expect = 3.050e-17
Identity = 36/79 (45.57%), Postives = 58/79 (73.42%), Query Frame = 0
Query:  111 YGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSVVPLI 189
            Y D+E+ILR + LL+G+NI+VTED+++K RE R EL ++MR+V+  +P   C L  DKL++DN V++++D +  VV  +
Sbjct:  379 YKDKEDILRKAGLLRGSNIHVTEDMNKKTRESRTELRRFMRSVKRNNPAVNCTLNYDKLFMDNKVYVWNDIQGKVVEQV 615          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000001126 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s118:232763:291174:1 gene:EMLSAG00000001126 transcript:EMLSAT00000001126 description:"maker-LSalAtl2s118-snap-gene-3.38")

HSP 1 Score: 553.132 bits (1424), Expect = 0.000e+0
Identity = 268/268 (100.00%), Postives = 268/268 (100.00%), Query Frame = 0
Query:    1 MKRYYLWFLLLLSGDIELNPGPPRRAPSTANSAPKGPSKEEQVEQFLAKGELSQSRNEIEQLRKRLEEQTGLESKISGMKSQMDAITETYDELHEKMHEIDKTRKNNLIFYGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSVVPLISQRYSGPNRLYYNNMTQQVQSGMSMIRSASVHSVGSHADDKEHDLPREKPDLKVNGRATSPAVESPSKDSMPTIDENIK 268
            MKRYYLWFLLLLSGDIELNPGPPRRAPSTANSAPKGPSKEEQVEQFLAKGELSQSRNEIEQLRKRLEEQTGLESKISGMKSQMDAITETYDELHEKMHEIDKTRKNNLIFYGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSVVPLISQRYSGPNRLYYNNMTQQVQSGMSMIRSASVHSVGSHADDKEHDLPREKPDLKVNGRATSPAVESPSKDSMPTIDENIK
Sbjct:    1 MKRYYLWFLLLLSGDIELNPGPPRRAPSTANSAPKGPSKEEQVEQFLAKGELSQSRNEIEQLRKRLEEQTGLESKISGMKSQMDAITETYDELHEKMHEIDKTRKNNLIFYGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSVVPLISQRYSGPNRLYYNNMTQQVQSGMSMIRSASVHSVGSHADDKEHDLPREKPDLKVNGRATSPAVESPSKDSMPTIDENIK 268          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000010242 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s67:605805:637353:-1 gene:EMLSAG00000010242 transcript:EMLSAT00000010242 description:"maker-LSalAtl2s67-augustus-gene-6.7")

HSP 1 Score: 96.6709 bits (239), Expect = 1.498e-22
Identity = 46/93 (49.46%), Postives = 66/93 (70.97%), Query Frame = 0
Query:  108 LIFYGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSVVPLISQRYSGPNRLY 200
            L+ Y D+EE+LR S+LLKGTNIY++ED SRK+RE R+EL K+++ VR+R P ++  LR DKLY+ +DVF F+D  N V  + +   S  N  +
Sbjct:  223 LVNYRDKEELLRKSRLLKGTNIYLSEDFSRKVREHRHELIKFIKEVRTRDPARRMTLRYDKLYMGHDVFFFNDRTNRVEKMQTNLESSANSTF 315          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000006929 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s393:115311:134498:-1 gene:EMLSAG00000006929 transcript:EMLSAT00000006929 description:"maker-LSalAtl2s393-augustus-gene-1.20")

HSP 1 Score: 80.8777 bits (198), Expect = 1.026e-17
Identity = 32/70 (45.71%), Postives = 55/70 (78.57%), Query Frame = 0
Query:  111 YGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDD 180
            + D+E++LR  KLL+G++IYV ED S+K++E R EL ++MR ++ R+P+ KC L+ DKL+I+ D++ ++D
Sbjct:  216 WHDKEDVLRKGKLLRGSHIYVGEDFSKKVKEHRAELMRFMREIKRRNPKVKCSLKYDKLFINKDIYAYND 285          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. nr
Match: gi|585667677|ref|XP_006817358.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC102803378, partial [Saccoglossus kowalevskii])

HSP 1 Score: 57.7658 bits (138), Expect = 4.698e-7
Identity = 32/86 (37.21%), Postives = 53/86 (61.63%), Query Frame = 0
Query:  111 YGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSVVPLISQRYSGP 196
            Y  R+E+LR ++ LKGT   + ED + K+R+ R +L K++  V +R+  K   +  DK+ ID+ V+I+D+   ++ PL S  YS P
Sbjct:   53 YKQRDEVLRAAEKLKGTEFRIREDFTPKIRDLRRKLGKFV--VDARAEGKTVKVLYDKIKIDDTVYIYDEVMKNIKPLRSLNYSSP 136          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. Tigriopus kingsejongenis genes
Match: maker-scaffold335_size202896-snap-gene-1.20 (protein:Tk05625 transcript:maker-scaffold335_size202896-snap-gene-1.20-mRNA-1 annotation:"sporulation-specific protein 15-like")

HSP 1 Score: 172.17 bits (435), Expect = 2.712e-51
Identity = 108/296 (36.49%), Postives = 152/296 (51.35%), Query Frame = 0
Query:    6 LWFLLLLSGDIELNPGPPRRAPSTANSAPKGPSKEEQVEQFLA------------KGELSQSRNEIEQLRKRLEEQTGLESKISGMKSQMDAITETYDELHE--------------------------------KMHEIDKTRKN---------------------------NLIFYGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSVVPLISQRYSGPNRL---YYNNMTQQVQSGMSMIRSASVHSVGSHA 227
            L  LLL  GDIE NPGPPRR PS A  A K PS+E+++ +               +  +   R+EI+ L+  ++   G+E K+ G+ ++MDAIT  YD+LHE                                K+HE+ K   +                           N + + DREE+LR +  L+G+NIYVTEDLSRK+RE R+EL KY R VRS+SP KKC++RQDKL+IDN ++++D++K+ VVP    R   P+R+    Y NM   ++      RS SVHSV   A
Sbjct:   49 LSILLLRCGDIESNPGPPRRQPSAAPGATKAPSQEDKLARLEEKVKEYEEKIVNLEKTVKSHRSEIDGLKDLVKNLDGMEDKLIGITTKMDAITGVYDDLHEKMHEIDKTRKNNLLFYGIKPDFLPEIQTQLEQKIHEMMKVNLHISREIPCTKISRMISGPQVRGCRPVLVNFVNWKDREEVLRKATFLRGSNIYVTEDLSRKVREHRHELQKYARQVRSKSPNKKCMIRQDKLFIDNHMYVYDEDKHDVVPF--ARPPSPHRVPSRNYTNMDNILR------RSTSVHSVNGEA 336          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. Tigriopus kingsejongenis genes
Match: snap_masked-scaffold198_size266703-processed-gene-1.7 (protein:Tk12352 transcript:snap_masked-scaffold198_size266703-processed-gene-1.7-mRNA-1 annotation:"hypothetical protein DAPPUDRAFT_215456")

HSP 1 Score: 87.8113 bits (216), Expect = 9.035e-20
Identity = 38/76 (50.00%), Postives = 53/76 (69.74%), Query Frame = 0
Query:  110 FYGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMRTVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSV 185
             + D+EEILR + LLKGTN+Y+TED SRK+R  R EL K+ R +R+  P  KC L+ D+L +DND F+F+  +  V
Sbjct:  769 LFKDKEEILRKAHLLKGTNVYLTEDFSRKVRHAREELIKFARDIRAHCPTAKCSLQYDRLIVDNDAFLFNSTEGKV 844          
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. Tigriopus kingsejongenis genes
Match: maker-scaffold1166_size57906-snap-gene-0.6 (protein:Tk05907 transcript:maker-scaffold1166_size57906-snap-gene-0.6-mRNA-1 annotation:"PREDICTED: uncharacterized protein LOC102803158 partial")

HSP 1 Score: 72.0182 bits (175), Expect = 1.790e-14
Identity = 39/96 (40.62%), Postives = 57/96 (59.38%), Query Frame = 0
Query:  111 YGDREEILRLSKLLKGTNIYVTEDLSRKMREQRNELNKYMR-----------TVRSRSPQKKCVLRQDKLYIDNDVFIFDDEKNSVVPLI-SQRYS 194
            + DRE +LR SK LK  +I VTEDLS++ RE R EL K++R            V+  +P+K C L  DKLYID+ +F++++    V+    +QRY 
Sbjct:  323 FKDRETVLRQSKTLKKASIDVTEDLSKRTRESRQELRKFLRKASQPLRRLQPKVKRGNPEKNCFLEYDKLYIDHKIFVYNEALGQVIEQAEAQRYG 418          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000001126 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 (Blast vs. GO)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of EMLSAG00000001126 vs. C. finmarchicus
Analysis Date: 2014-05-09 (TblastN vs C. finmarchicus TSA)
Total hits: 25
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|592945551|gb|GAXK01013002.1|1.556e-2930.88TSA: Calanus finmarchicus comp680588_c0_seq1 trans... [more]
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Pages

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BLAST of EMLSAG00000001126 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 (Blastp vs. self)
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BLAST of EMLSAG00000001126 vs. SwissProt
Analysis Date: 2017-02-10 (Blastp vs. SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of EMLSAG00000001126 vs. Select Arthropod Genomes
Analysis Date: 2017-02-20 (Blastp vs. Selected Arthropods)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of EMLSAG00000001126 vs. nr
Analysis Date: 2017-02-20 (Blastp vs. NR (2/2017))
Total hits: 1
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gi|585667677|ref|XP_006817358.1|4.698e-737.21PREDICTED: uncharacterized protein LOC102803378, p... [more]
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BLAST of EMLSAG00000001126 vs. Tigriopus kingsejongenis genes
Analysis Date: 2018-04-18 (Blastp vs. Tigriopus kingsejongensis proteins)
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Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s118supercontigLSalAtl2s118:232763..291174 +
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
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Blast vs. GO2014-04-02
TblastN vs C. finmarchicus TSA2014-05-09
Blastp vs. self2014-05-10
Blastp vs. SwissProt2017-02-10
Blastp vs. Selected Arthropods2017-02-20
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Blastp vs. Tigriopus kingsejongensis proteins2018-04-18
Properties
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Descriptionmaker-LSalAtl2s118-snap-gene-3.38
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
NoteHypothetical protein
Cross References
External references for this gene
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (gene)EMLSAG00000001126 (primary cross-reference)
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAT00000001126EMLSAT00000001126-696973Lepeophtheirus salmonismRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at LSalAtl2s118:232763..291174+

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAG00000001126-683892 ID=EMLSAG00000001126-683892|Name=EMLSAG00000001126|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=58412bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s118:232763..291174+ (Lepeophtheirus salmonis)
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