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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000001258 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000001258 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s1205:8164:20174:1 gene:EMLSAG00000001258 transcript:EMLSAT00000001258 description:"maker-LSalAtl2s1205-augustus-gene-0.4") HSP 1 Score: 130.568 bits (327), Expect = 4.376e-41 Identity = 65/65 (100.00%), Postives = 65/65 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MQFNLKVIFALLSIFALAMPMALGEHKDHSGKRSIRSAKTHAKGKGGKRSIRSAKGHAKGQTNST 65
MQFNLKVIFALLSIFALAMPMALGEHKDHSGKRSIRSAKTHAKGKGGKRSIRSAKGHAKGQTNST
Sbjct: 1 MQFNLKVIFALLSIFALAMPMALGEHKDHSGKRSIRSAKTHAKGKGGKRSIRSAKGHAKGQTNST 65
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000001258 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
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BLAST of EMLSAG00000001258 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| EMLSAP00000001258 | 4.376e-41 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s1205:8164... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1205 | supercontig | LSalAtl2s1205:8164..20174 + |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Description | maker-LSalAtl2s1205-augustus-gene-0.4 |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
| Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s1205:8164..20174+ Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000001258-684024 ID=EMLSAG00000001258-684024|Name=EMLSAG00000001258|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=12011bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1205:8164..20174+ (Lepeophtheirus salmonis)
TCTCCATCGTTTTTTTCCCATACATATGACATTTGGCAATTCTGTTAATG
AATTAATACAAAGTTGTCATTTTAAGAATTTAACGAGTATCACCAAGTAT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTACTT
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GACACAAACAAGAAGTAGTTTTATATGGACTATCGTCATTCTAATTCATA
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GACCGGCACTATAATTATTATCAGTTAAAAAAATTAAAGGATAATTACAT
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TTAAACGAAAACATACTCCCTCTTTATGGGAAGTTCCGTATGATAGATCA
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GAAAGTCATCTTTGCTCTTTTATCCATCTTTGCTCTTGCCATGCCCATGG
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CGATCCGCAAAAGGACATGCCAAGGGTATGTGTTTTATATATTTACTTAT
AAACTCAATTCACAATCTTTTTTCCTTTTTATTTTAGGCCAAACGAATTC
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AATTATAACGATCATTATTGCTCTGTTACTCCATCCTCACATACTTCAAA
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GATAAGATATAACTATTTATTCGCATCAAAAGCCGTTCTTTCAAAAAAAG
GATAAAATCGACAGAAACTGATGAGTCAGTCATATTTTGCCCCCTCAAAT
TTCTAACTATT back to top
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