EMLSAG00000007789, EMLSAG00000007789-690555 (gene) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAG00000007789
Unique NameEMLSAG00000007789-690555
Typegene
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Homology
BLAST of EMLSAG00000007789 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592953134|gb|GAXK01005419.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp1934186_c0_seq1 transcribed RNA sequence)

HSP 1 Score: 28.1054 bits (61), Expect = 6.263e+0
Identity = 21/79 (26.58%), Postives = 36/79 (45.57%), Query Frame = 0
Query:   24 TKNAYQKVTQHSDLQETSKDKNDENDKPMPVPSMK-IELDHSQLIKANKTLTAH--PINIHQQDKVEALIDKLIKGGIM 99
            TK   +KVT+H +         DEN   M    +K IE +   L + +  L+ H  PI+  +   V+ L+  ++   I+
Sbjct: 2471 TKTVLEKVTKHFEKHRVFLTSEDENAAFMTFGHLKSIETEKVYLNRLSGVLSLHLLPISYSKNGMVKCLVRDILTNFIL 2707          
BLAST of EMLSAG00000007789 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000007789 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s457:148963:163475:-1 gene:EMLSAG00000007789 transcript:EMLSAT00000007789 description:"maker-LSalAtl2s457-snap-gene-1.16")

HSP 1 Score: 209.149 bits (531), Expect = 6.905e-71
Identity = 101/101 (100.00%), Postives = 101/101 (100.00%), Query Frame = 0
Query:    1 MNMLNIYNNPLFALEELWCYKKETKNAYQKVTQHSDLQETSKDKNDENDKPMPVPSMKIELDHSQLIKANKTLTAHPINIHQQDKVEALIDKLIKGGIMSF 101
            MNMLNIYNNPLFALEELWCYKKETKNAYQKVTQHSDLQETSKDKNDENDKPMPVPSMKIELDHSQLIKANKTLTAHPINIHQQDKVEALIDKLIKGGIMSF
Sbjct:    1 MNMLNIYNNPLFALEELWCYKKETKNAYQKVTQHSDLQETSKDKNDENDKPMPVPSMKIELDHSQLIKANKTLTAHPINIHQQDKVEALIDKLIKGGIMSF 101          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000007789 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 (Blast vs. GO)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of EMLSAG00000007789 vs. C. finmarchicus
Analysis Date: 2014-05-09 (TblastN vs C. finmarchicus TSA)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|592953134|gb|GAXK01005419.1|6.263e+026.58TSA: Calanus finmarchicus comp1934186_c0_seq1 tran... [more]
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BLAST of EMLSAG00000007789 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 (Blastp vs. self)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
EMLSAP000000077896.905e-71100.00pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s457:14896... [more]
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BLAST of EMLSAG00000007789 vs. SwissProt
Analysis Date: 2017-02-10 (Blastp vs. SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of EMLSAG00000007789 vs. Select Arthropod Genomes
Analysis Date: 2017-02-20 (Blastp vs. Selected Arthropods)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of EMLSAG00000007789 vs. nr
Analysis Date: 2017-02-20 (Blastp vs. NR (2/2017))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of EMLSAG00000007789 vs. Tigriopus kingsejongenis genes
Analysis Date: 2018-04-18 (Blastp vs. Tigriopus kingsejongensis proteins)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s457supercontigLSalAtl2s457:148963..163475 -
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Blast vs. GO2014-04-02
TblastN vs C. finmarchicus TSA2014-05-09
Blastp vs. self2014-05-10
Blastp vs. SwissProt2017-02-10
Blastp vs. Selected Arthropods2017-02-20
Blastp vs. NR (2/2017)2017-02-20
Blastp vs. Tigriopus kingsejongensis proteins2018-04-18
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Descriptionmaker-LSalAtl2s457-snap-gene-1.16
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
NoteHypothetical protein
Cross References
External references for this gene
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (gene)EMLSAG00000007789 (primary cross-reference)
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAT00000007789EMLSAT00000007789-703636Lepeophtheirus salmonismRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at LSalAtl2s457:148963..163475-

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAG00000007789-690555 ID=EMLSAG00000007789-690555|Name=EMLSAG00000007789|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=14513bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s457:148963..163475- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATATGTTAAATATTTACAATAATCCTCTGTAAGTTTGATGGAGGCA TCAAAAGAAAAACCAACCAATGCACATTGTATATTATATATACAACAACA TGTCGAAGAAGCTATCAAACCCTATATCAAAAACGCTTTTAACAATGGAC TTTACTGCAGTTTTTAATGCAAAATAAAATATGATAATGCAGTATAGAGG AGTTCTTATATAAAGTTCATAAATCCGYRTAATCAAATAAAAATCAATAA AAGGTACTGTGATAAATTATTGAAAGCATTTGTGTACAACTTTAAAATCT GTATAATTGGNNNNNNNNATTTACGGTTTGTAAAAAAGAAAAGAAAATCG ACGCAAGATAATTTTAGACTGAGCCACTTTACCGCAATACTGTCAAAAAA GTCATTTTCGTATACACTTATAACTTTACAAGGCCTTATTGTATGCTCCG ATATGTTCATTGATGCACAAGATGACGGCCATTTACAGATTGTTTGGATT TTTTGTTGTTCCAAACATTCAATAAAAGAACAGTTAAGTCTGATAATGAT AAAAAAGTAAATGTATTAACTCTTATAAATTTAAATAATAACTTTATTAT TAGTATACACTTTCGGAGTCAAACTTTTAAGGTTATGTATACAATTGATT TAATAGATATGGNNNNNNNNNNNNNNTAAACGAATTTGTTTCATGCACAG ACATGTAAATTAAATTATATAAATAGATTTAAAATGTATTCTTGTCTGTT TAAAAATTATCTAACTTTGATAAAGTTCAATTTGTTATTTTGTTAGTAAC ATAATTATTTAACCTTCTACTAAGGTATTTTTGTTACTTTACGTACAAAC ATAATATTATAATCATCTGATATTTGAACAAGGAGGATTCCTATTATTAG AAATCATATGATCTACTCACAACACAATTCTTCATAGTAGAAAAAAACAA GGAGTTATGAAATTTTAAACCTGTTAAAATAATCAAAGAAAGAAACCAGT ATTTTACATATTATGTACTATATATTTTCAAATTTAACCAAACGAAGGAG CATCTAACTTTTGGACATTACCTAAAAACGGAAATTAATATATATTTTTC ATCTGGAAGAGGGGAAGTATCATCATGCTCTTGTGAGAGAAGTATTATGA AGAAGACCCACGGATCTTATATCAGTGAATTGATCGATCCTCTGAGAAGG TTACACCTTTTGTTAATCTCTATCGAAATCAATATGACCATGGATTCAAA GAGTCCCAAAGTTTAAGAACTCTCAATCGCTTTGTAGTCCAAACCTACTC TAATTTATCAATTAATTTCAATTCAATCTATACCAGCTGCCTCATTCCAA GTCTAAGCTCCCAGAAAAAAAAATCTTAATTTTTTCTTTTAAGACAAGAT ATCGGGTCTGGCACAAAAAGGAAGAAGTAAGTATTGAACACGAGATATAC TCTTTAAAGGGTTAATTGAAAATTACGAGTCTTCTTTCATTGTCATGTGA TAAAGTTTAATATTGACATCTTATGTGATCTCTGGCCACTTGAAAATGAT TTTTATTTCATTGAAGACTGATGAAGTCAAAAAAAGATATAAATCTGTTG TTTTTTTTACTTTGAATTGTACAAAAACTCAAATTTTATATTTTTATCAA TTTTGGCTACTGATGTGTATTTAATCATCAGACTTAAACTATAAAAAATC GATATTAAGGCTTATAATTAATCTTTAATGCCTGTTTATTTTTATTTTAA ACAAAACATTAAATGGTTTATTTTATTTTTATTATCAAATAAAATCATAG TGTCTGATTTTTGCAAATATTTCGGGAAATATTGTAAGGTGAGAAATGTG GTCCGTTTAGGTTTGCGATTATTTATTTTAAATGCAATTTTGAAGAACAA AGATAGAAGGAGATGATTTTGATCCCCCATAATTGAGTTCTTCTACAAAT CCTTAGTCTTCATCGTTGTTCAATTAACGAACTGTTCTGTTTGAATTGAG ATTAAAGGCTTAGTAATTAAGACGATTTTTCAAAAATACTCCATTAAAGA CTAATTTGTTCGTCTAATTTGAATACAATTTGTAGTCAAGGCAATACATT AAATGATTTGGAATTTGAGATTATTCTCTTATTTTTTTATATTCCATGAG CACTTTTGAAATTTTATCTAATTGAGCTGAATTTTAGATTTCAATATTCC TCTTGGTTTTTTTATGAAGGATTCTTTGAAAAAGACATAAATCTAAAAGT ACACTTTTCTATTTTTCTTACCTTATGTATATATTTTTTTTATGTTTGTT CCTCATTACTTCTTTTAGATTTGCTTTGGAAGAATTATGGTGCTATAAAA AAGAAACAAAGTATAAATGGGAAGTATAATTGTTCTACTTTCATATGGAA GGCCACGAAACGATTTCTATCTTTAGATGTACTGTGCACGTCTTCATAAA AGGCATGTTGACTTTTTCGCAATTACCAAGTACTTTAACTAAGAGTATTA ATTAAAAGTAACTTATTTCATCGGTTTTTACAAGATATGTAAACAATAGA GTTTAGGGTTGATATTCTTTTTTATATGAGGATTAAGTTCAATTCCAGGA GCTTAAAAAAAATAAAAAATTCCAATGCTGTTATATCTTCGTTTAAAAAA AAGCAATTTTAAGTTATTATATTTTACATTTTATCTTACACTACCATCAC AATTTTGATAAAATTCATGACTAGTGATGAAAATCACGTGTATTTTGGGC ATGTAAAAAAAAAGAAACCAAAAATCAACATGGTAATCCTGACAATTTGA AGAATCATTTAGAGGGGAACTGCTTACACCATTTAAGAAAATCATTTTAG GATATTTTTTTAATATTTGATACAACCAAGAAATTCAATTTGTCGTAAAT AACTAAAGTTTTATACTTTCACAATTTGAACAACATAATAGGATTTATAA ATAATCCCATTTATTTTTTCTCAAATTGTCCAAGAATCCAAGTTATCATA TTTTAACTTCCAGAGATCTGTTTGATAATTTGTTTTTATTACAGTTTTGC AGGGTCGTCCACAGGGTGTGGGTTTGAGGGGTTGTTTTTGCTTTCTACTA GAAAATTTAATTTTTGAAATCAGATTAAATTTTCCAACTTTTTTTGCAAG AAATTTCATTTTCTATAAATATCTATGGATTTTTTTAATTTTTCTCCAAA AATTCACATTTGAAATATAATTTTTCAAATTTGTTTCCCAAAAATTTAAT TATTTGAGAACAGCTGTAGATTTATGCACTTTTTTTTTGGGATTTTTGAA TTTTTTTCCAAAAAATTGCTGTTTTTTTTTTGTGAACAGCTTTGGATTTT TGAAATTTTTTCCTAAAAGTTTAACATTTTAATTTTTTATACAAAGGCTA TGGATTTTGCAATTTTTTTGGGAATAGCTATAAATTTAGATATTTTATTT AAAAAATTTAAATAATAACATTTATTACAAATTAACATTTAAATATATTC ATATATTTATCATTTGAAAACATTATATTCTCTATATACCGGGTGTGGCG GAAAAATTACACTTCGCTTTTGCTATATAAATCATTTTTTTTGGTAATGC GGTAAAATTGTTCTGGTCAATTACAAAAATAAACAAAAAATGAAATAAAT AAAAAAATAGATAAGTGTCTAAGATACCGAGAAAATGGCATCTGAACTTG ACAAACGAATTTTGTTCCGTTCCCTTTTGAACACTGGCGAGAAACTAACA AAGGTTGCAAAGCAGTTGGGGATCTCCAACATGAACTTGGACATGAACGT GGTGTTCTAGTAGAATGGTGCGCCTGCACACATGTCCAAAAAGGACCAGA AGTGGTTGGAGGACAACTTGCCTTTCTCACCAGATGCTACCCCATTGGAC TTCACTTTTTGGGTGAATGTTGAGTCCAAGGCCTACACCTTTCGTCACCC AAATATCAACAACCTCAAGGACACCGTCAAACAGCCCTGAGATCTCATGT CAGAGAACTACATCTGCTATGGGTACAACNCCTTCCGTGGCCGCTTGGAA GCCATCATTGCTGCCACGTTGGGCTACATCATTGATAAGGGTAGCCATGA CATCATATGAGTTATTTTTATTTTATACCTTATTACAGCTAGTTGTTGAA ATACATCTTGATAAGGTTCTAGATTGAAAGTGTAAAGCTATCATGTACAA TGTACTGTTCATTTTTGAAAGGACAAATATATTAAGTTTTAATTATTAAG TCCATTGTCAGAATTTAGTAATTTATCTCTTTAATACATGTACCTACCTC TATATATTTAATAAGCATTTAAATTTGTATTTGACGTCACAAATGTCTGA CAAATACATTAACCTTGAAATTGAAGAACAGAAATACTTCATTCAAACAT TGAGACTCACTGGTGTGATATCAAATATGAATATCATCGAGTTCATCTAA ATATATAATGTATTCATGTTAATAAGAAGTATTCAATTAGATGTAAATAT TTATTATTGTCATTGAATAAATAAGTATGTTCTAAGGCCAGTAGGTGAGT TCATTGCTGATTGTCGAAACATTAGTCATAACATAGCTTTGTCGGTAAGA TTCTATGGACACTATTTATAAGCTATCCCAAATTGTGTGATACAGAGAAA ATGTCGTCTAATATTTTGATTCAACAAATCACTCATTTAAGCCCTCTATA ACAGTTATTATTAATTGTTTTCATATTCCTTTATAAAAATTTGACAGACT CCCGCGTATTGGTTTAATCAAATGTAACGTTTATATTTACTATTAGTATT AAGTAATATTCAATACAAGTGTAGGTGTTTTTTTGTGTGTTTTTTTTAAG CCTTTTGATGAAGTTTCATCAATATTTATTGGAAATTTGTCAATTTTAAT TAATAATATATTAACTATGAGTCCTCCATAAAATAGGTGTAGTAAAGAGA AATCGATTAATTTTTGAGTAGAAGTTTTTGTAATGTGTATATTGTTTTGT ATCAGTGCGATCGGTTTACGCTGGAAGACGTTAGACAGATAAGATTTCGT ACTAAAAAAACTTTTGGGCTTCCTAGACAATTTTTAAACCACGGTTTCTT AGCTTTTCTTCTCGAATTCTCCACTTTTTAGTGAGCAATTCTCAATTTCT TATCACAGCATTGGTCTTTGATTTTAACCCAGGCAGTGTTTTAGTACGTA AATGTACGCTTTGCTTTTTTGTCCCATTTTACTCTCTGAGTTTTGTTTGC ATATATTATATGTTTTTACTAACATTTATTATTTGGAAATAAGCCCCATA TGAAAAGATTCTTCCTTTTTTTTTTTGTAATTAATTTGGCAAATAAAAAC ATCCAAATATGGAACGCTAGACGCATACAMCTTAATGAGACTTTGCATTT GTTTTCCCTTGACGAGTGCCTCAATGTTCTGTTCCACTTTTAAATTGACG TAGATTGCAAATCAGATTCAAAGTCGATCATGCAGTTTTGCGATTTGGTT TTGATCTCAACCATGCTCGAAAACGCAGTGTTGCCACGTTACCTAAACAT GACGTACAATACCTCATAGATTGGGGTTTTTTTTTGTTTTTAAAGCAGTT TGTAAAGGGTGTGATTGGAAATTTGGTTGGAAATTAGTAAAAATTGAAAT TGGTGAAATTTTGAAGCAGTGGTTCTTCTATCCGTCCGGCCATTCCCAAC CTGTGGGAAATTCCCATCAGGCTAAGAAACACTTTGTTAAACTCAGTACT GTTTGAGCGCACGTCAAAGGTGGACACCAGAAAAGAGAAAATAGGTCATA TTTTTCAGTTTTTTCTTCAAWAAAGGCGAAAACGKAAGCCAGTCGTCTGA TAATTTGAATAATGTTTATGGTCCAGATACTGTAACTGCTAATCACGCGG TATTTTGGTTTTGTCGATTCCTTCCCAGTAATTTTATGTCAAAAATACAC CACGTCCTCGAAAGCCAATTGTCGAAAATGTGGATAAAATAATGGAAATT GTTGAGTCCGACGAAAGCGATAAACATTAATAGATTTTTTATTTTTAAAA TCCACTACAAATTTATTATTACTACAGCTTATAATATAACACATAAGGTT GTGAAATTACAACTAATAAATGTTTAGTCATTTTGTGCTTAAAATATGTT ATTTGGTCTAATTTTCTTCATTTCTAACTCATACTTGATTTTTTTAACTA TTGCTCCAGCAATAGAAAATTAATATCTAGCTTTGTTAAAAAATGCAAAA CAATTACAATGTATGGCGTGAGAACATCAAATATGCTAAAAATTTGTAAA ATTGGAGAGGCCTGGGTAGTTAAATAAATATAACGTTTGAAGATATTATA TTTTTAAATATAAATTTTTAGAAATGCGTATCAAAAAGTGACTCAACACT CAGACCTACAAGAGACTTCAAAAGATAAAAATGATGAAAGTAAGAACTTG AAAAGAGATCTCGAAAAATGCAAACATTATGGGAGCATTTGTTTACTATT TAATGTTTTTACATTATACAGAAAATGCATGTGAAATATACATAATAAGG CTTAGACTTTGGTTGAAAGGAATCCGTTATTCAAACATAAAGTAAAATAA CTAGAATTATTAGTCATTTACTTATAAGTGGTTCCGATGAATTTGTTAAT GTAAGTATAAAATTATTATTAAAATTGTTATTTTAAGTGTTTCGAAGACA CTGCCGGAAAAAATAATAAATAAAAATGATGAAAATGCATGCTGCAATAG TATAAAATTTATGATTCCCATTCATATATCTCCAATTTTAAAAGACAAAA TACTCTATAAAGAGTTTGTCATGAATTGCAGTAATTAATTGTATAACAAA AATCACGGCTTTACCTCGCTAACGCTAAGAAAAAAATTATATTATAGACA CTATCTCTATAATTTAAGCCAATTGAGATTCAACTAGATTTTTCATTTAT TTTTGTTTTGGAACTTTTATGTATACCCTATTTATATTTGTATACGCATT CTTTAGATGTAAAATTATGTCACGTAGAGCTCAAATTTAGTATTATATTC AAAAAATCAAGACTTGATTGATGATATATGTACAAGGATTTATTCTACAC TTGGATATGTAAAATTTGATGATGTTGCATAATATCATAATTTACAAACA AATTAAATATATATGTATGCATAGTAAATTGAGTGTAGAACACACCTGGG TAGAAAAAGTACTGAGACTTGTCTCTAAGAAGTCATTAAAATACTCATAA TTGATCAGGATGATGTCGTAAATAGAACATTTTATTTTATAATATTTTTT ACTATAATAATGCACATTAATTATGAATCTGGTCTGCATCAGTCTCAATA ACGGCCTCTAAACGCCTCCGGAACCCCTTGCACACATTGGAAATGTAGTC CTTTTTCATGATCCTCTACTGCTGGTTAACAGAGATATTCAGGGCCTCAA TATTCGAATGATGGACTTTGCAAGCCTTCTTCTCTATTTGACCAAAAAAA AAAGAAGTAATCCAATTCATTCAAATCTTGGCTCTGAGGGGGGCAAAGGT TCTTGGACCAGAAGTTCATGTTGCTATCTATCTACTCTTGTACAGTATTA GCAGTATGGGTATACGCGACTAGCCTTGTTGGACTTCTTCTTTGGTCTTG GTGATCTATGGGACCACATTTTCCTTCAACACAATCAAGAAGTCGGCCAT AGGTAACCGGTATCCAACAGGAAACAAAATTGAATGCATTTTTTCTCCAG TCGATACCACAGCCCCCAGCATCATCACAGAGGCCGGATGTTTGGTCTTG GTGACTGTCCTGATGCAGTTGTCGGCCTTGTCAAAGCATAGCACCAGATC ATTTTGCTTGTTGTGGACGGGGTAAACGGTAAAGGTCCTTTGATAAAAGA AAAAAATTACCCTGTTGCTGTTGTGCTTCAAATCATTCAAGAGTTGTTGA CCTCGCTGAAGACGGAGTTCTTTTTGACGTTGGGACAGGAATGGCCTCTC GATTCTTCTAATCAGCCAAACGATTTCGGACACTAAAAACTGTAGCCTTG ATGACGTTTAAGGCCTTCATTATTTCCTAGGTGGTCTTTTGGGCGCAGAT TAAATTGGCTATGATGGTTTTTCTTGTCTCCATCACGACATATGCAGAAT TTTTGTTTAATCAAATCAAATCTATCAAAGGCTTAGAATCTAAGCTATTC AAGAATAATCAGAACTTTAAGAATTAATCAACAACAACTATTCTAAACTA TATTTTTAGAAGATCTCATTACTTTTTCTACACGCTATAATTATAAATTC CATTACACAATTGCAAATTTGTCTTCTTTTAAATAATTTACGAATTAAGG ACTTTCTTTTCTGTAAACTATTTGATTAATTCCGTGTTTTATAAAGATAA TATTCCTTATTTTTTTTTTTGAGAGACATTTCTGTGGTTTCTTAAATAAC CATCAGTAGCAGAGTTGTTAAAGTAGAATGAAAAATTAGGGAATTTCTTT TTAAAGAAAGAATTTTTTTTTGAAGCAACTTTTTTTATTAAGTAAATCAG 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