EMLSAT00000000017, EMLSAT00000000017-695864 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000017
Unique NameEMLSAT00000000017-695864
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1004supercontigLSalAtl2s1004:64175..82140 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000017 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000017EMLSAG00000000017-682783Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000000066EMLSAE00000000066-708994Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000067EMLSAE00000000067-708995Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000068EMLSAE00000000068-708996Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000069EMLSAE00000000069-708997Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000070EMLSAE00000000070-708998Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000071EMLSAE00000000071-708999Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000072EMLSAE00000000072-709000Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000073EMLSAE00000000073-709001Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000074EMLSAE00000000074-709002Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000075EMLSAE00000000075-709003Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000076EMLSAE00000000076-709004Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000077EMLSAE00000000077-709005Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771134auto771134Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000017EMLSAP00000000017Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000017

>EMLSAP00000000017 ID=EMLSAP00000000017|Name=EMLSAP00000000017|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1166bp
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YPWEDDDHPSLSLDRTSHTINSASRPIGGHQYRQYSLSSELPTTSYGRQQ
NSYISSGSSSSRHHPSLVHQSRIETSTASSSEQHRNIASGGGGGGGLATG
IGAPTTTTRKKTVRFDPTEEWTSNRPSNSSPLHRPYHQQTPAPDEWMTIE
DVESGRWAHWDTIRQESQESATRDSGIETSSCFTSSEDSNRGDQFHFKKH
PVSWQQDGPRLVGHMILQKNLKEGYGSSSTASLLGVKVVGGKLLPITNHY
GAIVEKVKKGSVADTIGHLLPGDEVLEWNGHSLVGKTYEEVHDIISDSRH
DSQVELRVSRSRPLPSDMGRSAVNNTSGGFVHARPANPYGRKYMERPSVT
ISDPLGDTHMLRSHSPSNLSQPSATRIQVKTWYDTDRVSLIVTVLSAVDL
PPRVNGQYRNPYAKVYLLPDRSESSKRRTKTLGNTNNPNWNQSFVFTNIE
AYELASRVLEVTIWDYDRFGANEFLGEVSVNGEDLVGGSSGDEGTWLPLS
HHHPPFFSDQVGVLKRGMYLDTDHPSSSHHHISPPSTMSRLSDSEFSDLD
EYGLPRGAGNIPGVTDLDRYPSRRYDADYIQSSNPQDHSRRQNFPHHKYQ
DPDDQSHYYSSSYYHSRSRSQEDERRVPQMPPSSTSLSHSHHHRGASRSA
TATPTGSPQKRRLPQIPSSTRERDFDDRPRMLKNRXXPPPNGPFGGGRRG
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GSGGXRRPSYSSGGRMMSETHQPTVEFAGDSDIESVISAFSSQSAPHSRG
GRKTGVHGKANLDRIHLDRTLTERDDKADSFVLDGSLSDTAVSSLDALDR
QKQVKDALRKGQSIGPDNMGQSGGNPSSSGLGKKSNSTSQLSAAGHKRRL
GLLGAKRTTITVHRSEEILPSDIRSRDVTSGLVRQNTSVSSEGEDKDLDL
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DRRGHLEVEVIRARGLQCKPGSKVLPAPWVKVYLVCGKRCLAKAKTAXAR
RTLDPLYQQQLVFHEKYHGSQIMLDDLDLSNIVIGWYKLFGTSSLVSLPP
NGPSKKGSIHSLDSFG
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1004:64175..82140-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000017-695864 ID=EMLSAT00000000017-695864|Name=EMLSAT00000000017|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17966bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1004:64175..82140- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCGTTCAGGTATACCGGGAACCCATGGGCAATCCGCTCCTCCGTATTT ACATCGACATCGCTTCATCACGAGATCCAACTCTGTGCCAGAACAATATG ATCCTTACAATAATGAATGGTTGATTGGAAACAGAGGATGTTCCTCGTCA TATCCTTGGGAAGACGACGATCATCCKTCTCTATCTTTAGACAGGACTAG TCATACTATTAATAGCGCATCCAGACCCATAGGAGGTCATCAATATCGCC AATATTCTCTTTCAAGTGAATTACCTACCACATCGTACGGCCGGCAACAA AATTCATATATTTCCTCTGGTTCTTCCTCTTCAAGACATCACCCTTCCTT AGTTCATCAAAGTCGTATAGAAAGTAGTTCTCGAGGATTAAGCAAATATT CTTTCAATCCTCTRCCRCCGRCAAGKCCGCCATTAACTCTTGGTCGATCC TTGCAGCTTGTTACATCAGGATCTTTTTTAGCATCAACAGCATCCTCATC AGAGCAGCACAGGAATATTGCTTCTGGAGGAGGAGGAGGTGGTGGACTTG CAACTGGAATAGGGGCTCCAACCACAACAACCCGTAAAAAAACTGTCAGA TTTGATCCCACTGAAGAGTGGACCTCCAACAGRCCGAGCAATTCCTCCCC ACTCCATAGGCCTTATCATCAACAAACCCCTGCACCGGATGAGTGGATGA CCATAGAAGACGTAGAATCTGGTCGTTGGGCCCACTGGGACACCATACGA CAAGAAAGTCAGGAATCTGCTACTCGGGACTCTGGTATTGAAACAAGCTC CTGTTTCACGTCCAGCGAAGACTCAAATCGGGGAGATCAATTCCATTTTA AAAAGGTATCATTATTTTTGTCTCTGAGTGCCCTGCTTTCACATTCATTC TCTCTCTCTCTCTTTTTCTCTTTCCAAATTCAAAATGAAAAGTCCCAAAA TCATAGCATATCCCTCATATATTTTCCATTTTCAGCATCCAGTTTCATGG CAACAAGATGGCCCACGCCTAGTGGGTCATATGATCTTGCAAAAGAACTT GAAGGAAGGTTACGGTTCATCTTCGACAGCAAGTCTTTTGGGAGTCAAAG TCGTGGGTGGTAAGCTTTTGCCCATTACAAATCACTACGGAGCTATCGTT GAAAAAGTTAAAAAGGGTAGTGTAGCGGATACAATCGGACATTTACTCCC GGGTGATGAAGTTTTAGAATGGAATGGTCATTCATTGGTGGGAAAGACGT ATGAGGAAGTTCATGACATAATCAGCGATTCCCGCCATGATTCTCAAGTA GAGCTTCGAGTCTCAAGGAGTAGACCTCTTCCCTCTGACATGGGAAGAAG TGCTGTCAATAACACGAGTGGAGGATTTGTTCATGCCAGACCAGCAAATC CTTATGGCCGAAAGTACATGGAGCGACCCTCCGTCACGATAAGTGATCCT CTAGGAGATACCCATATGCTCAGATCTCATTCACCTTCCAATCTAAGCCA ACCCTCTGCGACACGAATACAGGTATGTGAGCCTTAAATATGTTTACATT ATACAATATACATATGTCTATTAGTACATGCAACATAATCCATTTTTTAC ACTATCTCTTGTCTTCTGTTGTCTTGCCGCCCTCAGCATCTATTGATTAA TTGCACTGTTTTTTCATAATTAATTAAAATTACTATTATTCATTATTAAC AAACTTAGTTCAAAGAGACAAAACACACCTAACTTATTTTAAATAAATAA TATTAGCTATATAATAATTAAATTAATCATATTAATGTATTGCTATTCAT TAACTAAAAAAATATGCATAGATTTTCTCAAGGACGAAATAAACTTAATT TTTTACTTCAGAAGAAAAATATATACTGAACAATAAAATATACATTGAGG 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GCTACCTTCCGTTCATCCCACCTACCGACACCCCTGCATATATACAGGCC AATATTTATAGACATATTTGAGTCAACTATAGGCTTAATACTCAATTTGC TTGAATGAGTTAAGATATCCAAGAATTTTATCAATAGTACCTATACTTGA TTTAAAAGACTTATATTGGCCCCAATATGGCTTGTTTCAAGCATAAAATA CGTTAAATTCTCAAATTTTAAAACGACGCTCAATTTTGGATGTTTTAAAA GCAATTTTTGACACACACAAGGGGTTAACAAGAAAAAGAAGCAAAAATAT AAGATTGAATATTTGTAATCCGCCGACAATCTTGAACACAAATCAAGAAA AAGAGATAATACAAATAAATTTTTAGTTCGTACACCGGTAGTTGCATAAA TACGCGGACTATTTGTGGCAAATAATTAAATGTGTAATAAAATTCGTATG ACGTATTTTTTTTGAGAATTATATAATAGAGAATTTATTCTGGTATAAAA TTTAATATAATTACTGAATATAACCGCCATCAGCTGCTATGACACTCTCC AAGCGCCCGTGGAAGGCCTTGCACACATTGATGATGAAATGGTCTTCCAT GGCTGCCCATTGTTCATTGACCTTGGCCTTCAATGATTCCAAATTCGGGT GGCGGATAGCACAGGCCTTCTTCTCAATTTGCCACCACACACTGTAGTCA AGGGGATTCAAATCAGGTGATTTAGGTGGCCAAATGTTTTTGTTCCAAAA TGGCATGTTGGCTTCTTTTTAAACTACTCCTTGTTTGCATTATTAGTCGT ATGTTTTGGATCATTGCCGTTGTGAAATATCCGTTACAAGACCCATTTTA AGTGTAATACCCGAGGGAAGAAGATTTCGTGGCCAATAGTAGGATTAACA TTAAAATTGTTCTTTCCCCTTTCCAAAGAAATATTTACACCCTCATGTTT GACAGTGGCGAGGGMGTTCTGTGTTCATGTTATCCAACTGATAAAATATA CCTTACAGTAACATTATTGACCCTTATTTGCTAGTCCGTGGGAATACTTA TTTTATCCACTCTACATATGTTGGCCCCAGTATGTTCAAACACAAAATCA GAGAATCTATCATTCTCTTTCTGTGCTGATCAATTTTGACTCATTAATCT AATTGAATGAAATCTTTTACTCCATTTTGAATTTTAATAGTTTATGAACA AAATAAGGAAATAAAAACGGTGCAAGAACAGAATATATTTGTTATCTCAA CATAAAGATCATCTTGAACAAAATTCAAGAAAAAAAATCCCAATTCATAT TTTGAATACAAATATATATATAGGTATACAAACAGACTAATATTTCATAT ACTTATTTGATCTAATTATATGCTCAGTACTCAAATTACGGAAATGAGGT AAGATACTCCGGATTTTATTCTCAGGTTTAAAAACCTTTATTTGATTTAA GAGACTAAGATGGGCCATTTTAATCATAAAATTTGTCATTTTCTCATTCT TTTTATTCCCAGTATTAATTTGCACCACTATAAGAGTGACATTTGCAGCA CAGCCAAAGGTTTAACAAGAATAAATTGTATATTTTAGAATTTAAAAATA TATTAATATCAAATAGGAAATCAGAATGAAAATATCAACGTACAGTCCAA TATTTCATAGACTTATTCCAGTCAATAAATTGACTGGAATGAGAGTAGAT ACCCAAGAATATTAGCTATAAGTTCGAATCTTAATTTGGTTTGAGAGACA TATAGTGGCTCCSATATGACCCCTTTCAATTTTTAATTATTTCTTTGGTA GCGAGCAATTTGTTGAAAATATTTTGTATATAGAAATTGACGATTATTCG TCGTCGAATACAAAGATAATCATTGCACAATTTTGATAAAAACATTGTAG 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TTAATTCAAAAATTCATAGCTTTTCACAAAAAATTAAACTTTTTCTAAAA TTAAAGCAAAAAATTAATTTCTTACATTACATTTTTTCGAAATAAAATCA AAAATCTGAAGCTATTTACAGAAAATTAAATTTCAAATATTAAACTCTAG GGAAAAAAATTCAAAAATCCGAAGATATTCATATGAAAAATTAAACCGAT CCAGAACACAACATCTTTTTGCTAGGCTGAATTAGTTAGACCTCCATAAG ATTTTCAAAGCAAAGACTACAACCATTTCAGACTGCGATCTCACGATTTT TTTATCTCAATATATTTATGAACTTCTTTTTTTTCTTTTTTTCTTTGTCT CAATCTATGTGTTGTACAAATATGATTTATGTAACACATTTAACTAAATT GACGTAATATGCCGATGTTTACAATTTTTAAAGAAACATGATTCATCAAA AATGCATCTTCCGGGTGCGGCAAAAACAATCTTTACAGTTCATTTTTGCT AAATAAATCAAGATTTTTTTTTAATGCAATAAAATTATTCTGGTCAAATA CTAAAAAAAGTGGGAAAAAAATGGAATAAACAGAAAAAAAAAATCTTCCT AAGTGTTTTAGAAGACGAGAAAATGTCCTCTGAACGTGACCATTAAATTT AAGTTTGTGCACTTTTAGACACTGGCAAGAAACCAGGGGCAGAGAAGTTA TTACCATGGATCGAGAGACCAACTACCCGGACATTAACGTGGTATTCCAT AAGGATGGTGCGTCTCCACACACGTCCAAAAAGACCCAGAAGGGGTTGGA GGACAACTTACCCTTCTGGCCTAAAAAAATGTGGCCTCCTAATCACCAGA TGCCAACTCATTGGACTTCACTTTTTGACTGCATTTGGCCTGCACCGTAC ACCATCCAAATATCAACAACCTCAAGGAAACCGTCAATGTCTTAGAACTA CATCTGCAATTGGTGCAAGGCCTTCCGTGGCAGCCTGGAAGCCATCWTTG CTGCCAAAGAGCCCTACATCAATTATTAGGGTAGCCAAGACAGTATATTA GCTCTTTTTATTCCACTATATAACCTATTACAGCTGGTTGTTCAGATACA CATCTTGATGAAGTTCTAGATTAAAAGTATAAAGATTTTTTCGCCACACC CGTTAAAAAATTAATGTTGACTGGATTTTAAATGAGACAGTTCTAAACCG ATTTTTTTGAAAGACCAGCGTAACCCAATTTTTATTTGAGACCGATTAGA CTTAATTAATGTTTGAGAGTGGTCCAGACTGAACTTCTTTTAGGTACAAA ATTAAGTCAGTCTACTAAAAATCACAACTGTCTCAGACCGGTTTAGGATT TTTAGCCGAAAGCCAACATCCAAAAACAAACGAAGGTTGGTATTAGTATT TCTGGCATAATAATAATAAAACAAATAGTTATGATCCAAGTCACCCTTCT TGCTTTTCGAAATGTGGTGCATCAACCTAAAGACAATATTCTACAAAATC AAGAAGAGGAAATAATCCCTATTAATTTGTTTACTTCATATATATCTATG TAGAGTAGACGTCGACTGATTTATCGGATCAAAATCGGATAGCCAATATA TTTGGCCAACTGTCCAACATCGGCAACGAATTGGTATCGAAGAAAGTTTT TTACAAGCTTTGACATTTGCTCCTCCGATATTTTATATAATCTATTCAGA AAAAACGAGGAAATTAAATAAAAAAACTGTCATAACATTTTGGGTTCCTG GGATTCCTTATTCATTAAAATATTAATGAATAAATGCATTCATCCGTTAT TACTTAACCATATATGGACGAAATTAAGATCCACTTTGAGTAAAAATTTG AAATTTATATTTTTTTAACTTAGTATAAACCCCATTGAAAAAATATTTAT TTCAAAATATATTTTGATCTTCCTATCAAGAATTTCCGCTGGTGTCGTTT TAAAAGTACCATTCCAGTATAAATAACTTTTGTTGTTATTTCATAGTATC CATGCTTATTAAAAAACTACTGTAAAAGTAACGTTAATCAAATTTCTATT GTTTCTAAATATATATATATTGGCTGSTAAATATAAATTTGGTGACTTTA AAAAAATATTGATTGACAAATAAACTATCCACTATGAAATTGAACGAAAC ACAGCCTTTCTGCAACTAAGCATAATGGGATTTGGGATACTGCATTGCAA TTTTGTTTTCATGCAGCATTTTGYCATTTTACAACGCTGTTGTGTAGGAA GGGGTTCAGGAAAATGAGATATTTGGTCTAAATGACCTTTGGTTTGAGGA ATTGCTTTGACTCTATTTGGGATCTTTCCTTGGAAAAGAAGTCCTCTAGC AACTTTGTTTTTAAATGTATGAAGATCATCTTGTTGATTGGAAGGAATAC TAAGCTTATCAGAATCTCTTCTGTATAGGAGCAAGCAGCTTATAATAGTC ACGCACATCAAATTAAAAACAATTTTTAGATATGCTTTCTTTGTTCGAAC ATGGATTCTGTACAAACCAATAAGAGAGTCCATCAAATCGACTCCCCCCA TAAATGAATTGTAAATCTTAATGATGGAGGGGCATGGCACAGTTGCGAAC TCTTTGCGTTTTCTGATGTACCGGTTGACTTCACTTATTGGTTGAGCTGT AGCAAAGGATATAAATTATGTTCACACATCTCTTCATTAGCTCATTGTCA GATGGTAGAATATGTACTACACCTGGAACTCGATTGATTCTCACAGTTCC AAGAGAATATATTTCCTTTATCGCTAGTTCTAAAATGAAGGGAACACTGG TAAACCAATTATTGAAATACAAGAGGTGATTTAGTCTCTTTGGTATAGAC 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GAAGAATATACATCTTCTTTTAGCATTTTTTCCACTTGGACTACAATTCG AGATTTCGGACATCGCTGTAGAATTTTTTTGGTTTCATTTTCGTGAAGAC AAGGAATTAATTTTTACATGAATAAGCCTTTCAAAAGGAAACGTACATAA AACAATTTAATTATATTAATTATAATAGGATTTTAAATTTGAAACTAATT ATTCAATTCTTGAGCATTTAGCTACCACTGATAAATTAATTAGGTATTTC ACTTACTTGTAAGTAGGGATTTATGACCACCAATTTTTTGAAATCCTTGA CTTCCAAAATCAACGCAACACAATACGCAAATAACGTCATTTCTGAAGAT AATCACAACTATTCAGCAAAGTACTTTATATCAAAGAAGTAACTTTGGAT CAAAAGTCAGGATGGATTAATTGTGGGGAAAAAAAATTGTTTTTTTCTGT TCGTAAAATAGATATTTCTATTGCGTACTTGTAGAAGGACAATCGTCCCT AGGTACTTCATAAAAAGAGTGGTATACAAAGTTTACCTCCTTTATCATGG CGTTAGGTTACAAAACCTTATATAAGATTTATTCATTACTTAGGCCTGTC AAATTTGTTTTCATACAAATCGGTCTTTTTTTTTAACCGTTCATTTTATT GACATTAGTTATGCGAGATTGTTTTGATGAATCCGTACTTTATAACTCTC ACAAGTAAGCCTTTTTGATCAAGTAAGGTTTTAGTGAACAAGGGCTAAAA GAATATGCAAACAGAAAAAACCCATAGTGATCAAACATAATAAATACTTT CACGAATATGGTTCAATCTAGTGTTGTCTCAGTCCTTATTTAGGAATGAA GAATGCAGAGCCTGTCCAGATCAATCTTCTTGTTCAGTCCTGCATATCAG TTCTAAAACCTTATAAAGTTCGGTCCTTGATGACATCACTCAACTTGATT 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