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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1004 | supercontig | LSalAtl2s1004:96464..133388 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000021 >EMLSAP00000000021 ID=EMLSAP00000000021|Name=EMLSAP00000000021|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=121bp
MSLTPRSIPSSGSSSQITPDLSHLTPEEREIIENVMQRQHNEESKEIMFL RHKQEEVMKLEAQIHHKAEMQRKAGAELDCTCQICLKTKFADGIGHICHY CSLRCCARCGGKVTLRSNKKI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1004:96464..133388- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000021-695868 ID=EMLSAT00000000021-695868|Name=EMLSAT00000000021|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=36925bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1004:96464..133388- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAGTTTAACACCCCGTTCAATTCCAAGCTCTGGATCAAGTTCTCAGAT
AACGCCGGATCTGAGTCATCTCACACCCGAGGAACGGGAAATCATTGAGA
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TATATCACTAATCCATAAAAATGTATTCCGTAGATGCATAAACTTTATCT
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TACCTAATTACTCAAAACTTAGATGTTCCCTCCTCAAGAATGAAGTAATA
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TAGGGATGTACCACTTGTATAATATTTTTCGGGATTTTTTTGAAAATAAA
TCCAAAAATTGAACTTTTTTGGACCAAAAGTTCAAAATATTAAATTTTTT
CGAAAAAGAAATCAAAAAACTTTAGTTATTCGCAAAAAATTAATCTTTTG
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TCATGAGTCGTTCAAAAGGTCCGTAATTACGGTTGTATTACGCAGTTGAC
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GGTTTCGGTCTCCACTCCATGGATAAATGAATATTACTTTATCTATTTAT
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GCAGGCTTCGTTCTTTTCTGAATGAACTATCAAAAAAAATTGAATATCAC
CTTTTATTTTTTGTTTTGTTTTTAATCATACAACATAAAAATTAACTAAT
CTTTTTTATATTATCGCATATATGTACATATTTTGTAATAAAATTATAGA
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GCTAATAAATGATATTGATCCCTACTCTTTTTTCCCCGCAAAATTAGTGG
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AGCATATAAAATGGACTTCTCTTCAAATCAACTTTTTTATACATATATAT
TGTAATATTGCATTTCATATAATATACAAGGGCTACATTATCATACCTCT
AAGAATATTTTAACACTTGTACGCACCGAAAGTGTCTAATCATTAACAAA
TAATAGCATTGACCATTCTCAGTGTGATTTCCCACTCTCTTCTTGGCCCA
AGCAATGCCAGGTAACCCTTTACTATTAAATATATATAAAAAGCACACTA
GTTTAGATATATTTTGTTCCAAATTCAAAGATGTATCAATTTTAGTTGGA
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TGGTACTAAAAATGTACTCATTAACTTCGTTGTAATTTGTAGCAACGCAT
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AATCCCAGTTCACTAATGAAGTTTTTGAAAAGATTATATATTTTTTTTCT
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AAATAACTATTTTAATTTATAATTAAATCCCTAAACAAAAGATTAGACGT
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ATACCTTCTGACGTTTCAACAAAGAGCCCAATCCATTTTAGAAAGCTTTT
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TCCCCAACTGAACTGCTGGAACTCATCTTCACTTGCTATAAAACAACTAA
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ATATATCCTTGTAAATACGGTGGCTTTGTATTCAACAGCACACTTAATGT
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AATAGTTGTACAGGTTGTGCAAGTTATTGATGCTGCGAAACTGATTTATT
TTTCAAATTTAATTTTCTCTCAAAAACCATTTATCAGATTAACAAAATCA
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CTTTACAATGCTGAAGCGCGAGCAGGCCATTGCCACATGGTCCCCTGGCA
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TTGATATTTTTTGCTTCTTGCTCACTCATACCTTGGTCACTATCATGTCC
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AAAAAAAGGACTCCTCCATCAATTATTATTTTAAAAAATATTTAATATTT
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GATGAGGAAACTCAGAAGTTGTGTCTCTAATTGGTATTGATGTCGATGTA
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TAAGAGACTAATATTGGCGTTGATATGGGCCTTTTAATGGACCTTATGTC
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TGTATATTTTGTTATATAAAAAAGTGTATCTCTTGAAATTTCATACTTAA
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GTATATCATTTTTCTATAAAGTTGAACATAATTTGAAAATAGTTGTAAGT
ACATTAGTTTTTCTGATGGTGGTGTAGGTTAGTATAAGAACTTTAAAGAT
TTTTCGAACCTTTGCCATCACTTTGATGACTTTGGTATCAGATGTGTCTA
GTCAATCTTTACCAAAAGTCACGGTAAATCACCTTGTGATTGAATTATCA
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TAAAGCTTAGCCCCCCAAAATTTATGAACACAGCAATATGACTACTTTTA
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AAGTGGAGTAGGGGTTTAGAAGTATTTGTCAGGCTTTAAACCCTTAAATT
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AACAAGTGATAAACTACTATTTTTTTTTTTTAATTTGTCATCTTCTAATC
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TTCTATTGTGACAATCAATTTTTGATCACTTTCAGAGAAATTTACTGCGT
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TGTTGAAGAATAAAAATTTAATCCACACGCAAATTTAAAAAAAACAAAAA
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TCAGTTAGGCATTTCTACTAGATGGCTGTCCATTTTAAGATTTTTTTTTC
TATGTTATAGATCGTTCATATAAATTAATTGCTTTTAAGTTTTAAAAAAA
TACTTTTCGATGGATCAATATGTTGTAAATAACAAATTACTCTACATTGT
CAGTCATATTCTATAAGTCTCTTACAATTTTCATCGGTAAAATTTGATGT
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ATCACATTGACTCTGTCAAGAAAAGAAATAGTTGACCAAAACTAGAGACG
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ATWAATATTTTTTCCCAATTTTTAAATTAAAATATAATTGTATTTAGCTT
TTCAAAATAATAATGATAGATCAGGGCGATTATTATGACTATAACTCAAT
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AGTATGCTCGCAAATTTGATTCAGNGAGATGGATCAAATACATGATCATT
TATAGATTGAAAGCCCTAATTATTTTTCTTTAAACTGACATTTTATACAA
CGGATATACGATATAAAATTGTTGGAGCTTTTAGCTAGAAAAACAATGTC
TTTGATTTTTTTGGTCTTTTTTCTCTCGTCTGCTATGTGACATCAAAGAA
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GTTTAGACCCTTTGGTGCGGACGAGCATAATAATATCTTGCCTATATAAC
AGAATATATATCAATGATTATTAAGTTAAATAAAAAATGAAATTGAATTT
TACACTTCAAATAACATAGCAAAATATATGCATGAAAAAATTGTCATGAT
GAAAAGTCTATCTTTTATTTTTGTCAAAAAATAGGTAAATCGAAATTTAA
AAAAAAACGGTTTAGCACTTATTTTGCAAAATATAAGTAGAAAATAGCTC
TTATTGACATTGTAAAGAGGAACACAAAACTTCTATGTTGTTTTTTTTTC
GTACTTGCGAAATCAAAAAAGTTGTTGAAAATAATGTCGTTAATAAAATA
ATCCTCGATAATTGGTTCATGTTTTAGAAATTGAAAATACTCTATTGTTG
TAAAATTAGAGTTTTTGATTTGATGTTCAAAATGCATCGTTTTGTTGGAT
TTCTTCTTAAAAATAGAAAATGGACATTTGATGAAAAAAAAAGATATAGC
AATTTTTTGTGTTTTGGGTATAGAATAAGAGCCCCTTATATGACCCACCA
CCTCCTGAAAATCGGTACCTCCGTTTTAGACTAACCAGATTAAAAAGAAG
TGCCTATGCAAAGTTTTAACCTCCTTGGTCTAGCAGTAGTTGACATTATA
CTAGCAGTAGCATTGCTTTACTTATAATGATTTATTAGGTGTCGACAAAC
AGACAAACTTTACTTTAATCTTATAGAAGATAACTTCCAAACGAATCCTT
ATTGTCACTCTCCGTTTTTCATGTGCGTACTCATACGTAGTTACTCTATA
CTTAGATGAAGAATGAAYGAATAATGCTTGCAGCTTCAGAAAATGAAACA
AAATGCWTTTTTCAGCTTACCGACAACAACAAAAAGCTTTAGGATTTACA
GCCATTAATATATTCTATTTTTTATTTTATAAGCATGATGCACTTAGCTT
CAGCTCAAAACCCAGTTTGCTATGCCTCTTAAGTCAAATTCATTATATTT
AATCTTATATATGTACTATAAATCTATTCAAAAATATACTTTTTTGAATT
GTGACATGTGTCCACATTTTCCCCTTGCTATAAGATATGAAAAAGCTCGG
AATTCATTTTTTGGGTATCTAAATATTCCCAAAACCATACCTAATTGGTA
TTAAAGTTGTTCCCAGTTGCCTCAGGTGATAATTTTGTTCAAAAAGTATG
GATAAAACATAGAATTGAATGCTACAAAAGACATTAAACTAAAATATGAT
TATTTTTGCATTGTACTTTTTTATCTAAGTATCAAGATTWCTAATACGAT
GAAGGTAAAAGAAAACAGGATCGTAATACTAAAAATATATACTCCCATCG
ATCAATTATCTTTTATTAGCACTGTTTAACTCAATTTCTTAGTTTTAAAT
AATTTTCCTATTACCAATTTGAAAATCTAAATAATATATAATTGATCAAC
TATGAAAATCTTCTTGCCCAATATAATTTTCACAATTGCCCCATTTTCTT
ACATCACTCGAGCCTCCTAGCTTTCCTGCCCTCTGTCAGAAGGTGGTGTG
TGGTCCTTGTGAAAGAAAATAATCCCAAGCGGTGCTTTATTGCCCTCACG
ATGGTCTTRGGAGCCACAGAGAAGTTGTTGCCGAGGCGATTGATCGATTT
AGTGGGATCCTCCTTTCTATTCTTCTCCAAAGTCAACAAGAACTTCATAM
CCCTTTTTAAATTATMCCATCCACNTGATCGATTTAGTGGGATCCTCCTT
TCTATTCTTCTRCAAYGRCAACYAGAACTTCATAACCCTTTTTAAATTAT
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TGACCAACATAAAAACTGAGCTCCTAGAACACTTTAAAATGTCCAGAATC
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GTAAAAACTCGTTTTGATTTAAAGCCAAATGCAGCTTAATCTGATCTCAA
GCTAGCCGGTCAATAAAATCATTGCAAAATAGCATAACAACTAACAATAA
GTCTACTTTTCTTTCTTTCTATTAGTCACTATGTCACAGGACACAAAATT
TTAGCAGCAGTCAACATGCAGTTTTTAACGAATTTTCCAGAACTATAAGG
CTATGATCCGAAAGCTATTTGAGTTATAATTAGATTACTAGCTTTTACCG
TCACCAGATGAAAACTGATGGCTGTTTTTTCAGAACCATGATCATTTTAT
TATTCAGTTGTTTTATCAGGTCTCCCTGCAAGCTGATATACTTTTCTTAT
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TACTTTCCATTCACTTCTTTGAAAATATAAGAAAATTTCTCTGTGTCAAG
TTACTCTTTTTTCACAATGACATTACACTGATGCAGATGCAAGGCTAAAG
GAAAATATCTACTACAATTGATTCAATAGATCCTAAACATCATTAAATAC
TACCCCCTACTGGTGTTAGTTTCCCCACAATATAGCTTTTATGCTCTCTA
CTAGTATTACAATACTGCGTCCCTAACGAACAAGAAAAGAATAAGTGATT
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TGGATCCGGCCGTCGGGATGTATTTTTTACACCACTGGTTTAATGGTACA
TACATACTTCTCAAATAACTAATCTTCAATATTTTGCATGTATGAATGTT
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TCTTGATTAATGATCCCTCTTTCTTGTCTACTCCTACTTATTAGGATATT
TGTCTTGTATGTAGATAAAAAATAATATACCGGTTTAGAAAATCTCATTT
TGCGTGTGATCTATTTCAAGCTGTTATGAACTTAATGGATCCTATTTTCT
TTAAATAATGAGCAAAATAATTATGGGAAGGGATCCTCATTATAATCATA
TATCCGTAATGATTTTATTTAGAAATACTGTAGAAAATACAATTGTGCCC
CGTCGCCACAAAAGGAAGCTTTGATTTTTTTTTCAACATTGAGTGTGGAT
TAAATATATATTCTTCAAGAAATTATTCGTTTTACCCCTCTGTGTGTGTT
GCAAATTGCAATTAAAGCGACAAAATCGACAGTCAGAATGAGAAAATGAS
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TTGAATTAGAGGTTCTTAACTATGTATAACTAAAATAATTGACCATCTYA
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TATCAAGTATAGTATATATATATAGTTCAAAAAATATATGGTAAATTTTT
TCCTTCTTTTGATTTTTGTTCAGAATTGTTTCTATGTTAACGTATCACAT
ATATAAATCGGAACCTATAAAATATGATGTATACATTCGACTTTAATAAA
TTGAATGGGCCCAACTTTTTACACTGCAAGTCAAAAGTATGTGTAGAAGT
TTATTTTATCGTATAACATACAAATATAAAATAATAATTTAAAGAATATT
GATATATACAATTTGGGAAGTGTTGGGTGCGAGGGATCTAACATTACAGG
TCTTTGTTCTGTTTGCTAGAAAACTTTGATAGTTTCAACTAAATAGGCTT
CCTAGTATGCGTTATTTATTCTTTGTGGTTGTTGGACCCCACCACATTAT
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ATATAAATTAGTCTGTTATTAATTTTTTTGTTTTTTCGAAAGACCTGACG
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GACCAATATTAATAAAATGTGTACAAGTTTTGTAGAGCCTTTGGTTTTAT
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TACATTTTTTTCCCCATTACATACACAGATTTGTTATGGATTTTCTCCTA
GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATGAAAGCTGAATAAAAAAATATTATT
TTTCAATAATATCAATCACCTTTGGTATCTATAATAGTCTCGAACCTACC
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