EMLSAT00000000128, EMLSAT00000000128-695975 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000128
Unique NameEMLSAT00000000128-695975
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1020supercontigLSalAtl2s1020:112711..132784 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000128 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000128EMLSAG00000000128-682894Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000000551EMLSAE00000000551-709479Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000552EMLSAE00000000552-709480Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000553EMLSAE00000000553-709481Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000554EMLSAE00000000554-709482Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000555EMLSAE00000000555-709483Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000556EMLSAE00000000556-709484Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000557EMLSAE00000000557-709485Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000558EMLSAE00000000558-709486Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000559EMLSAE00000000559-709487Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000560EMLSAE00000000560-709488Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772470auto772470Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000128EMLSAP00000000128Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000128

>EMLSAP00000000128 ID=EMLSAP00000000128|Name=EMLSAP00000000128|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=941bp
LVVLLALSETGSAINNLPIFQNSQGVPFDEEDIPMDRNTLPKELLDQLED
DEIIDDITVTIDNKQTSVNLRDDDSQEDAGVIHIPTDSAESQRIINEFLS
QISREEGLRRSDAAEEDRQGFFNNGFSKEQLLKILGNTQDLEKALPINRG
IPHTEKVKKCRTPLIKECGDEIKGPEVCTTQYENHCETQYKTYELEQDEP
NCRMVEELRCKNETIALLHIGGDSSSQPFGVRERCEKWPVQKCELEKKKV
TKVHPKTECTKVPKKVCTPSNCKTKPGEEICYEESRTHIQNVPDEECGLQ
PEENCRMEASLVPRLVPKNNCIKVPKEVCVTTKKNPKKSHQYSKVSLMIT
YFIVKSIVLKKMCSNSIYLLFLFCGLLGNVQAQQGLSRANLLSILKRSPE
LKSGSLEDITRNLFVNENSLPGVLKKDGKRCVPKVVEVEETVYERGMECQ
HTFSKKCHLTYITDYSSSAEKKCDTTFKKNCHITFNPVPHNEKVKVCHTP
LIRECNGDDGPEICKTEYENHCETQYKVYELEQDEPNCRMVEELRCQNVT
VELFHIGDDNGGSPFAVKEKCEKWPVQKCDLQKNNVKKVHPETSCKKVPR
EVCAPSNCVTKPGDEICHEESRTQIQNIPEEECDLQPQENCHMESSLVPR
PIIGQRYNQADILSIIKKSQGVNDFGKPSSEKVKVCRTPLIKKCSPGTKG
PQVCTTQYENVCETKYKSYELQQDEPKCKMVEQLRCRNISVELFHIPTDS
SSAQPFGIKEKCEKWPVQKCELNRETVKKVHPETSCRKAPREICAPSNCV
TKPGKEICHEESRTHIQNVPEEDCDLQPEENCHLQSSLVPRFQNVNINTN
TRRSSGENLEGLTRNTFVDSNRLPGKLKPDGTYCINKVVEVEETEFERGM
ECHHTFNKKCHITYITDYSSSAEKKCDTDFRKKCRITFKAV
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1020:112711..132784+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000128-695975 ID=EMLSAT00000000128-695975|Name=EMLSAT00000000128|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=20074bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1020:112711..132784+ (Lepeophtheirus salmonis)
CTTGTTGTACTCCTTGCATTGAGTGAAACCGGATCAGCAATAAACAATCT CCCTATTTTCCAAAATTCTCAAGGGGTTCCCTTTGATGAAGAAGATATTC CCATGGATAGAAATACACTTCCTAAAGAACTATTGGACCAACTTGAAGAC GACGAGATCATCGATGACATCACAGTAACCATTGATAATAAGCAAACATC CGTCAATTTGAGAGATGATGACAGTCAAGAAGATGCCGGTGTCATACACA TTCCAACTGATTCAGCAGAATCACAAAGAATAATAAATGAGTTTTTGTCT CAAATTTCAAGAGAGGAAGGCTTAAGAAGGTCGGATGCTGCTGAAGAGGA TCGTCAAGGCTTTTTCAACAATGGTTTTAGTAAAGAACAACTTTTGAAGA TTTTAGGAAACACCCAAGACCTTGAGAAAGCACTACCCATCAATAGAGGG ATTGTAAAGCAACGAGTTACAAACGGAGATATTGATGATTTAACGAGGAA TATCATTCTTGATGAGAAAAAATTACCTGGTGTTCTTACGGAAGATGGTA AAAGATGTGTTGAGAAGGTTATTTTAGTTGAAGAAACTGAGTATGAAAGA GGCATGAAATGCCACCATACCTTCAAGAAGAAGTGCCATTTGACTTACAT CKCCGACTATGKCTCCGCTTCCGAGAAGAAATGCGACACATCCTTCAAAA AGAKCTGCCATATTACCTTCAAACCAGTAGTAAGTACAAATACCTTAGTA CTTAGATGAAATCATATTCAACAGAATCTTGATTTTTTCTTAATACTTCT TTTTAGCCCCATACTGAAAAAGTAAAGAAATGTCGAACTCCTCTCATTAA AGAGTGTGGAGATGAAATAAAAGGGCCTGAAGTCTGTACAACTCAATACG AAAACCACTGTGAAACACAATACAAGACCTATGAGCTTGAACAAGATGAA CCTAATTGTAGAATGGTTGAGGAACTCAGATGTAAGAACGAGACCATTGC ACTTTTACATATTGGAGGAGATAGCTCATCTCAACCTTTCGGTGTGAGGG AAAGGTGTGAGAAGTGGCCAGTTCAAAAGTGCGAATTGGAGAAAAAAAAA GTAACGAAAGTTCACCCAAAAACCGAATGCACAAAAGTTCCCAAAAAAGT GTGCACTCCTAGTAACTGCAAGACGAAACCAGGTGAAGAAATTTGCTACG AGGAATCCAGAACTCATATCCAAAATGTTCCCGACGAAGAATGTGGTCTT CAACCCGAGGAGAATTGCCGGATGGAAGCTTCCCTTGTTCCTCGGTAAAT CATGACATTAATGTTGTTTTAGTAGGAAGAAAAACTATTCTTTTGTATTA TGTTTTATCATTTTAGTCTTGTTCCCAAGAACAACTGTATTAAGGTCCCT AAAGAGGTATGCGTAACTACAAAGAAAAACCCCAAAAAGGTGAGCAAACC TATTGTGAAGAACTGGTGTTATCGCCCTGAAGATTTGAAGAAACATGAGA ATGATTTATAATTTTAGGAATTTGAATATTAATAGTATATAAATAATATA TTTGCATTAGTTATAAAAATAAATAAAAAGTTGTTTTACTGTTTGATACT TATATTTTGATTTATTGGRGGGCCAAAAATACAAAAAATATTTCAAAGGG AAAACACAAAAATTTACATATATATTAATAGAACAAAGTCCATTTGTATG TATGTACGAATTTCTGTCCAGTATACAATCATTTTTTAAACGTCTTGTGC TCTCATCATAAAAAAGGAATCGGAGAATTAAGTGGTATAATATATGAACT GAACAAAACACCGGCCAGATTTTATTTAAGTTTAGATAACGGCAGATCAT ATTTTATACAATTTTTAACATATATTTATTGTGTACTTGTGGAGAGCTGA 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AATGAATTGTTGTTTTGGGGTATTCGGTTATTGACACTCTTCTCTCTCCA TGCAAAATTCCTTGATGAGCTTCATTTGTATCATCATGGTGTGGTAAAAA TGAAGGCTGTTGTATATACCAAGATCTGGTAGCCTGGCATTGATGACGAC ATCAGTTTCTTCGTTACCGCATGTAGTACGTACCAAACTACTAATTCGTT CCTTTGCCGAATTCATGCCGTTTCTCCCTTGTGATGCATGGCGACGTCTA CTCATTGACTATCTTCAATTGGGCAAACAAAATATCCTGATTTTAATGGA TTCGGGATCTAAGCGGATCGAGGCTGCATCAATGCCGAACACCTCAGCTT CCCAACTGCTTCAACAGTGGTTTTCCAGGTTTGGATTTCCACAGAGCTTC ATTCAGACAATGGTCCACAGTTTTCTAGGTCGAAGCTTCATCTCATAATT GTATTAATGGGGGGGGGGGGGAGTATCTTTCTCTCCTCCCTACCATCCGC AATCAAATGGCCAGGCAGAAAAGGGCGTGAGAATTATCAAAGAGTTAATG AAGAAAAACCCCGGAATCACCCTCGACAAATTATATTCACCTACTACTCT ATACCTTTGTCTTGCGGCAAACCCCCGGCTGAATTCCTTTTATCTCGCAC CATCCTTATCTGCTTGGACAGATTATTCACGTCTAAACCTCCCCCTTCAA AAGACTATGTTTGTTAAAGCATGTATGTGTGGTGTAAATCATTTGACAAG CGCAAATCCAAATGGATACTGGGGCAGATAATTTGCAAAGATGGTATTTG TATTTGGTCAGTCCTAATTGATGGTCAAAAGAGGTCAAGGCACATTAATC AACTCCGGCCTCACCGAGGAGTTGATGGAAGGGGGGGGGGGTATGATGTT GAGTATTCAACTTGTTCCTACCCTCCTTCTTTTACGACTTTATATGTTTG ACCATGTTATTCTCCTTTKGTCTTTTAGTGTTGATCTTACCTCCTTTTTG GAAGCATCAAAGAAATAATTTAAACTATCGCTGTTGAGTCATTTGGGGGA TCGTCAACAAGAATGGGTTTCTAACATGATATTACTTATCTCTACTAGGT ATATACATAACAATGGTTGAAGAGGATGGCTCGTCAACTTCCACGTCTGA ATCTGAGTGAACTCTAGAAGGMAGTCTTGGAGATGGAGTTTTTTGATAGT GAGGAGGCTCTCCAAGCATTAAGGAAGACCGACCTGGCAGTTTTTTTCAG GGATAATTTGCTTGCGTGCGGATCTGATCCTTGAAGTATGACTTCAACAC TACTGAAAGTACGCCAACAGAACCTTCGTATAAGTCCCCTCAGTCTAGTC CCCCGGGTGTGACTCAGCCTCTACCATTCGATCTCTATGTCCCTCAACAT GGTTATCGTTGTGCTACGTGTAGGCACTATCTTCAACTAGGATGACCTAA AATGTAATTGCTGGTTTTATGCGTTAAAATTGAATAAAAAAMATCCTTTT CCGTGAAACATTCATGAAAAGGTCTCAAAGGTCACGGTAATTAAAAGTTT AAACTTTTGTGTTGAATTTAATGTGAATTAAACGTCACTGCAAATTTTCA TATTTATCAGTCCAATATTTGGGTTGCAATACAGAAAAAAAATAAACAAA GGGTTATGAGCTGAATTACAATCAACTTCAATTGACGTTATTTTTAACAT ATATATATTAATTTTTCGGAAATAGTTATAAAATATATTTCATTGTAAAT TTAGTTACCTCAGTATTTTATTCCCAAAAAAAAAAAAAAAATCAGGWATA TGGAKAGTATTCAAGGATATACTCAGCTTTTTATTTAAATATTTAAATTT TCAAAACTTTAGGGCCGTTGAGCTACCTATAAATATTTTTTTAACCACTT TAAACTTTTTTCAAATGTTTTTTGTACAATTGGAAACCATTTTTAACCTA AGCCATTTCTTTTCCGAAAAAAATGATTTTATTGTGACCTTAATGACGCT AAAATCAATTTATATTGAGAATCGTTTCAGGCCTAATTTGAAATAAGTCA GATTTTTTAAAGATCGAATTGTTCTTTTAAACCGATTTAGAGCGATTTTT TCCTATGAACCGATGTAGACCCAATTTTTCTGTGAGAGCAGGCTAGACCG GACTTGTCTAAGGACCGAATTAGTTCGGTACAACACTAATCATAACGGTC TCAGATTGGTCAAGAATATCCAGACTGAAACTCATCACTAGTACTTTTGT ATTTTTATGTAACTTATGAATTCCGTTAGACTCCATTTAGTCACGCAATT CTTCTAAAATTGAATAACAATAATGTCTTTTGTATTCGATGTTTATTGAA ATTTATCCAATATTTTATTATTCAAATGATCAGTGATAAATACATAGTCT AACACTCTTATAGGAAAATTATTACGTGTACTTATGTCATACCCATGTTA CATAGTAGTTTACATACCATAAGCATAATGATTATAAACACCAAATGAAA AGATCATCCTCACTACTAATGTATACAAACATAAATGTACCATTATCATA AAAGCAAGCTAGAACTATTTTTCTCTAAACTGAATCTTGAGTATATTTGT ATTCTTTGAGGAATTAATACCGTTATTTTCAATCAATAAATTATTCTGGT AATTCATTTTGAGCCGCTGCAAATTACACTTTAGGTAGTAAAAGTTAATC ACCCTCATAATAAAATAATTACAGATTGATACATTTTATTTAAAAGGCCG TATAAGGATATAAATCAAATCTCATAAACCAAATTAAGGCTCGAAACTAT TTTTATCAAAAATGAGGCTGGYTTATATTTGTATTCTTTTTTGTTAATTT CTATCAATATAATATTCTGATTATTTCTTTGGAAATGCTGCAAATTGTAC ATAAAGTATCAAAAGTTACAATGTAATATTTTAGAATGGATAGATTTTAT TTTAATGGCTATATTGAGTGAAATAAAGCATCATAGATCAAATTAAGGCT CTTGTCTATAGCTTACAGTCCTGTTACTCATCTCATATATTTGAATAAAA AACTAAAGCAGGCTAAAATATGTTTATTAAATATTGAACTTTATATCTAT AAGATGAAAAAAAAGTTATATTGGTAATTTCTCCTCTTCAAATATCAAAA ATAATTACTAAAAATTTGATAATTCTTTCTCTGTGTTTCCTTGTCTACGT TTGATTTTTATATAATAAGCCTAGGGAAACTTATAAAAAGTAGCAATAAA TAAAATAAATGTGGAATCATTCATTAAAAAAATAGTATATCTTACACGGA GACGATACAACTTCGATAATTCACTTCTTGATTAAACTTTGCAGAATAGT ACTCCAAATCGTTTCAAGGGAACTCTCATGAAAGTCTTAAAGCGCACTAT TCAGAGGACTCCCCAGTTTATTTTAAGAATAATATTATAAAAACATTGAA AACAAACTTTATTTTATATTCTAAATATTTAAGTATTTCATTGTGAAATA TAAAAACATTTTTATACGAAATCATTTTTCATAAATTGTCCTAGATGCCA AAATATGTTTTGTTTACAACGTTTTTAAAATAATTAATTATCATTCTAGA TTTTTTTCACAAATCAACCAAAATTTCCAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAAG AGGTGTTTTTACAAAAGTTATACATAAAAAATAATATGTTTTCATATCTG GTATAAAATAAAGAAGAATTTCAAATTTTATAATTATAAAATGGTAGGAA TATTTAAATAAAAAATGAACTTATAAAAAAAATCGGAAAAATATTAACCA 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AAAAATGGCCTGTTCAAAAATGTGAATTGAATAGGGAAACAGTCAAGAAA GTTCATCCAGAGACTTCCTGTCGTAAAGCACCAAGGGAAATTTGTGCTCC CAGTAATTGTGTGACAAAACCAGGGAAAGAAATATGCCACGAGGAATCTC GAACCCATATTCAAAATGTTCCTGAAGAAGACTGTGATCTTCAACCGGAG GAAAATTGTCACTTACAATCATCTCTTGTCCCGCGGTGAGTACTCTGGTT ATAGGTAGAAATTGTACAGTCTTGATAACTATGATTCCAGCCTTGTTCCA AAAAATAATTGCCTCAAAGTCCCAAAAGAAGTTTGTGTCAACACAAAGAA AAATCCAAAAAAAATCCAAAAGCCTATTATCAAGCAATGGTGTTATAATC CCAATGATTTAAAGCCAGCCAAGAATTACCACTAAAAAACTAAACTACAT ACCTATGTATATCAATTGTTGAGTTTTCAAATTTTATTAACTAACATATT TCTATATATATTTAAGTTTTATAGACCATAAACAAAAAATTTTATTTAAA GGGGTTGTTAATTTTTTGTAAAAGATTAAATATTCCTATATCGCTAGTTA AAATAATTTTACTAATGAAATTAAAGAAAAACTCACAAAATCAAGAAAGT AAGATTTTTTTAAAATTTGTTAATATCATGTCATTATAGATTTTTATTTA TTTTCCATGTGTATGTTTGTATAAAATTTACATATTCAGTGAGTATTAAG TTTTAGCATAAATATGAATGTAGATATACTATAATGGGAACTTTTTAAAA TTGAAAACAAAAAATCAAATTCTATATAGAAAAATTAATAAACATACAGA AATATTAAATAAATTATGAAAATATTTTTTCTAAATGATTTAAAAAAATA TATGTATGTACGTTAAAAAAAGATCAACTTTGTAAATACATAATTATAAT 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