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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1061 | supercontig | LSalAtl2s1061:189630..200459 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000387 >EMLSAP00000000387 ID=EMLSAP00000000387|Name=EMLSAP00000000387|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=187bp
MGSLMCIAGLSTLVIPFLVNFPTMGLFRFTQCFCIGAFMTADASLIIYXM
GPIKSRPFTNAIHAICGVGCFLGTILARPFLPPSNDDMEDLCGKGNSSDS
SGNMPHFEIDSLYGVQSIAWPFLIGGIFTAFTFGICGPLALQPAAAIIID
SCYNGGFMCGRIVSVGLAGIIRPRNMIYICLLFAFVG back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1061:189630..200459- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000387-696234 ID=EMLSAT00000000387-696234|Name=EMLSAT00000000387|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10830bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1061:189630..200459- (Lepeophtheirus salmonis)
ACTTACGGAATTCAAAGGCCAAACTCGTATACATGGGATCCCTTATGTGC
ATTGCCGGCCTTTCTACATTGGTGATACCCTTCCTTGTCAATTTCCCCAC
TATGGGATTATTCCGATTCACTCAATGCTTTTGCATTGGGGCATTTATGA
CTGCAGATGCATCCCTCATTATCTATKCCATGGGTCCCATTAAGTCCCGT
CCATTCACAAATGCTATTCATGCCATTTGTGGCGTTGGTTGCTTCCTTGG
AACGATTCTGGGTAAGGAGTATTTATTAATACTTTAATTTATAGGAATAA
AGATTTGTTTCTACGTCTTTTTTTTTAGCACGTCCATTCCTACCACCAAG
TAATGATGATATGGAAGATCTTTGTGGCAAAGGAAATTCCTCGGATAGTA
GTGGAAATATGCCTCATTTTGAGATTGATTCACTTTATGGAGTTCAGAGT
ATTGCATGGCCGTTCCTCATTGGTGGAATATTTACAGTTGCTGCCTCAAT
GGGATATATTATTCTTGGTAAGGATTTATTTTCATTTATAAAAGAATAAA
TAAAACTTCYTCCTTATAGATATAAGTAAAAGTGGGCATTTTGTAAAGTA
CAGAGAGAAAGTGGGAGGAAAATTTATAATAGTACGTAATTAAGACCCTT
GCATACTTCAGCTGCCTTTAATATAATTTTGAAGGAAATAATAGATTGCT
GTTATTAAGAGAGGAGAGCCTTTAAAATTTACACAAACATTATTCTTGAA
AAAAAATTGTATTCAAACATATACAAGCTATTAATCCTGTGGAAAGGACT
TTTTTTTTCGAAACGCAATTTTATCTCCAACCAGATGTCAGATTTTAAAA
AAGAAAACCAAATTTTGAAAGCTTGATAGACTCTGATTTATTTATTCAAT
AAAATCACCGTTAGCCTCAATTAAAATCTCTGTATGAGGCCCAAAAGAAC
GAGTGGGCCTTTACCACTTAGTCTCTTGTAAAAAAATCCTTGAAGTTTGT
CTTTGGTGTTGCAGGTGGTTCGTTTGATTTTTCGTTCGATTGCGTCGTTC
GTTTTCGAGGTGTGGTAGGGAGGCAAGTCCCGTTACTACATGTAAGACAT
GTGATCAGTAATTAACTTAGTTTAAAAACAAAATCTGCCAAATAACACTA
TTTAAGTTACCTATCCGACATATCTATTAAATGAAGAATACATAATTAAT
TATCCCAATATCATTATAAATTGAATTAATATAAGCAATAGCCTATATAA
ATTGATTAAATATAATTTTTCGACCAAATGTCTGTTTGGCAAAATGTGCA
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AGGAGTTATTTCTGAAAATTTGAAGATTCTTGGGAGATAAACAGCTTAGC
TGTCCTGACATTGTATTTGATTAGGAAATGAAAATTKCTCCCCTCCATAT
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TCCAACCATTGATACTCTTCATCTAAGTTCTAGTTATAACTTTGTACATA
CATGCAGAATTATTTACCGATTTTTGTTCAGAACATATTGCGGACAATAA
TGACATTTCGAATGACTTGACTTGTGATCAAATTTAATCAATGTAGCCAC
CATTTGACTCAATGACACMGGRCAGKCCKCGTCTGAASCTGCCACAGACT
TGCTGGATGTAATCAGCGTCCATGGAGGCCCAGCCCTTGTTGACAGCAGC
CCTTTAGGCATTTATGTTCTTGTGTCGTTTTTTGCAGGCCTTGGTCTCCA
CGTGTGCCTAGATAGGGAAGTCTAGTGGGTTCAGATCTGGGCTCTGAGGG
GGCTAGTACTCGTTGGCCAAAAGTTCATGTTGTCCTTGAGCCACTCCTGA
GCTTTCTTGGAAGTGTGGGTGGGTGCTCCATCTTGTTGAAAAACCCAAGG
AGAGTTGCCGACTATGGATTTGATCCACGGAAGGACCTTGGACGCCAGAA
TCTTCACATAAGCCTCCGCTGTTAATCTGAGCCAGTGGGGAACCATACCG
GCTTCATGGCCTTCCTGTTGGATCTCCAAACATCTCCAAAGCTCACAACA
CGGTCATTTTGCCTGTTGAAAACAGGATCGACCGTAAAAGTTTTCTCATC
TGAGAAAATGATGATGCGTCCAGATGAGCTTTTGATATCATTCAAGATTT
TCTTGGCACGCTCAAGTCTGACTTTTTGCTGATGTTAAGTTAGCAGAGGG
CGTTCAGTACGCCTCAGGGACTGTCCTCCATCCCTTTTCAATGCCCTTGA
AACAGTTGATCTCGACGTTCCCATCTTTCTGGCTATGTCGGCAATGGACT
TGTTGGGAGTCCTCTTGAATACTGCCTTTACTTGCCTTGTTGAGACAGTG
GGATTCCTTCCAGCCCCAGGGGAATGTTTGAGATCACCCTCAGTCTCCAA
GCACTTGGAAACGTTGTAAATTGTCTTCAATGAGACCCCAACCTGTTCCT
TAATGTTGTTATGAGGCACTCCTGCTCGGAGGAGGGCTGCAATTTCGATC
CTCTTTGTTTCCTGATTGGACATGGTCTTNGGACATGGTCTTACGTGTGG
AAGTTGTTACGCTCTCACAGGAAGGACTTTTGTTTATTTTAACAGTAAAA
ATACGAAACAATCAGATTGGTTGCCACAAAACCTCTTAAAAAGTATTTTT
ACATCATCGGTAAATAATTTTGCACGGGCCGGTATATGTTCGTTTCTCAT
AAATTAAAAAATAACTTTAGAAAATTTTAAAGCCTGTTCAGATTGCCAAC
CAAGAAATTCGCTCCCCCTTTCTACGACATATTTTGTACACCTTTAACAA
TAGCTCGCAGTACTTTACTTTATTAATGTCTAAATAATTTTTTCTAGCTA
CTCTTCCGTTGAAAATGCCGATTTTCAGCTATGGAGACTACTCTTCTTCT
TCTCCGGACCAAAATGAGGCACCTGTCCAAGGAAAGCGTGTACTCACTCA
TTGGAAGACAATGCTCGTTTTTGTATTTATATTTTATGTTCTATCCTGTG
GAATTGAACGGATTTTTCAACCCATGGTAAGTTGACATCATTAATATTTT
GGTATATGTGTGGTTGAAAATCGTTAGGATTTTCGGTATGTAAAAGAAAA
AGCCTTAAATTAGGAAGGTAACTTGACAACTTGAATAATGCTTTAGAGGA
AAATAGGAGGTGACTTTAATTTTGTGTTGACCTTTTATTTGGAAAAATGT
ATTCACATTCAAATACAGTGCATTTAAAAAAAAAACCGTTAAAACAAACC
TGTTTATGAAAATAAATTTGCAATTTCTTGAAACCCCTAAGACATGTACA
TACTTCATTTCGAATAGCTAAATAGAATAGCTAAACATGCTCCCCGGCGT
CTGATCCCCACAACGCTAGTACCAAAACGTTGAAAATGCAAATTATGGCA
TAGGGACTTATTGTTTTCCCTTTTGATCCGGATAAATTTAATTTTGGTTT
ATTAACTTATTCAAAATGGAATTATATGTTCTGACCAAATAGTATTTAGC
TGAAATTTTAGTCGACACGAGAAAGCAGTCTGTAAGATAGTAATAATTGC
ACCATTCTTGGCACATTGGGTCTTATCCTGAAAACATAAGGACCCAAAAT
GTATTTTTTTCTAATACGTTTCAATTGTAATTCCTTTCCCTAACTCCACA
TGTTCCTTCAACTTCCACAAAAGGGCCTTACCCACGTCTTCAACCTTACA
TAATGTCCTTAAATTTATGTTCATTGTACAATAGAACTGCAACACATTTT
CATTTTAATTTTTGATCGTAACTTAGCTGAGAAAATCTGATTTCAACGTC
GAGCACCTCCATAAGACCTCTTCAAATTTAAATTTTTTTTCAAACCTTTT
AATATTTAACTTTTCCCCGTTCTCCAAGGTCCAAAATCAAAATGTCTAGT
ATATTTAGTTTCTATGGACCTTGGAAAACGGTAAAAAGTTAAATATTAAA
AGGTTTGAAAAAAAAGTTAACATTTGAACAGGTGTAACCTCCATAGAAGT
CGTTGTTATTTTTTTTATTTTTTTATCAAACGAGACATTAACATTTTATT
CAACATAACCTATCATAAATTTATTTTAAACGTACAAAGAAAAAAATACA
TTTAAGGGCCTACTGTTCATTCCCGATCCCATGAATGTGAAATTTGTAGC
ATCTGACAGCTTTTACTACGATTAAAGTTTCAGCTGGATAGATTCTAGTA
TATGGTGAGAGAATACAATTAAATTTTGAATAGCCTCATATACAAAATCC
ACTTTAACATTATCTGAAGGATCCTAACTAATTAATATCATTGGAAATAT
CTATTTAATGAAAAGAAAAGTGCCTTGAGCAAATATTTTTTCCGTAGGTC
CAATTACGGTACAACCTCCTAAAAACAAACACTGCTCTTGAACTATTGGA
AAATTCATTACTTAATAGTAAACAATATGTTTACAGCTAAACATGGCCTA
ATTTTACCCTACCGATCATCGTTCAGAGTACTAATTATAAGATGACTTTT
GGTAAATATGTCCTGCAACACATACGACATTTTTTCAATTTTGCAATCTG
AGCGGTGTTTTATATTTTCCAGTCATTATTCCTTTATTCTTGAGGAGGGA
ACATCTAACTATAAAGTATTCAGAAGTGCATTAAAGTCGAAGAGTAAGAA
AGAGTATTTGTTGTGAAGTAATATGTGTAAGTCCTTGTTGGGCTCGGAGT
AGAAAAGAGGATTACACATCAGAGAATTCCTACTTATGTGTCTATATATA
ATACCGAGTCGATTTTTTTTCTGTAGCTACATTTAATTAAACTAATAAAA
AAGGATGAATATGTCTACTTTTCAATGAAGGAATTATTATTTTTATTTTC
ATGGGGGTTATAAGGGTATGTTCTTGTTGGACTCAGTCTATAATTGAGGA
TTGACTTTGGAATAATACCTGTATATTTCCTTGCTAGATATGGAAAAGGA
TCTATACAAATTTATTTCCATTCATTACATACTGGTAGTCAATATTCCTT
ATAACAAGGGAACTTTCACCTTTCTTAATTAAAAGCTTATTTGTAAATAA
TATCTATAATGAAGAAGGAGAATTTAATGTAGCCATGTCCTGGATATTGA
ACAAAATATTTGTCAGAAAAGTTCCAGTAATCTGATTCAGCTCTTTCATC
TTAAAACTTCATTTACCAGTCTTACAAATCAATAATCCAATTATCTAAAT
TTATCTATCAGAGTGTTATGGAGTAGTATTTTCCATTTTTTTACACCGAT
TACATCGATTCCATAATTTTGTGACCCTGTCCTGTCCTCTTACTTTAATA
TTTGGTACTTTTTCAAAGACCGATAACTTGAGGCATGTTAAGCTCCATAT
TAAGTCTCCGTCATTTCTTAAATTGTCAGGTTTCATTAGCAAACCGACAA
GTTATCCTTTCTACAACTCTATTAATAGGGAGAGGGGTTGTGAGCACATG
AAAATGATCAAATTACATTTTAGGCAAACTTTTTAGATGTCAAATGATAT
TTTAAGAACAAATGATAAAAATTAACACCTAACTTCTATCCCCAAAATTA
CTTTTTGACCCATGAATGCGTATTTTTTAATCTATTTTCTAAGTAATAAG
TAGAATCTCGGAAATGACGTGATTATTAAAGACTTTTTATGCATACAACA
ATATTTATATAACCATTTTAAGTTTTTAAAGTAGAGTGTTGAGGTAATAT
AAAAGGTCAACTTCCTCCAAATTTTTATTTTAGCGTTTTTACTAGGGTGT
AAAATTTATAGAATGACCTGTTAATTCGATCTTTTGTTGCATTTTAAAGA
AAAATATATGTTTGTAAAGTTCTAGTCTTCAAAGGATGTTTTTTAACCTT
TATAGCCATTTGAAAATGATATTTTTTAACGACATTCTCTATTTGTAAAG
GGATTGAGAAGTCTAAATTTTAAAGTTATGCTGCTTAATTTCAAGACTTT
CAATTTTAAAGTTATGTTGTTGAGTTTCAAAAGAGTTTGAATAAAGTTCC
TTTTCTCAAGTGGTACATACTAATATAATCTTTATTTTTCATTTTGAAGA
AAAACAAATTATAGCCCAACAAAATACTTAGGATAATCAAAGGATTCGAA
CCACTGTACCTTGAGTGGACAGAAATATAAAAACTATTTTTTCATGATTG
CTTAAAATATGCTCTAGCATCTGAAAAGTTGGGCTAAAATTGAATTTGAT
TGTCACAGAGCCCCCCCCCCCCCTCCACAAATAAGAGGAAKGAGTTCTAG
AAAAATCGACAGCTGATATTAAAATACATTTTAAATTTTAATGTCAGAGG
GATAAATAATATATTAAAGGTCGAGTAATACATTAAGGCTGTTCAATGTT
TATAACTACCAATGGTATAAAACTTTTAGAGTAAAGTTTGTTTTCCTCTC
TAAATTAATTTTCTTGCCATCGGGATACTGTTATTATTACCATATAGGTA
ACTACTTATATGGTTTGGATGCATAAATTTATATATTTTACATACCAATA
CGTACCTCAAATGAGAAAACTATGCAAATTTTCAAGAAACTGTACAATAC
ATCCTATATATTGAATATCCACCTGGTTATTAGTTTTGAGACTTAGTCCA
ACTGAATTTATATCTGGTTCAGTCTTAATCCTTCTTTTCAACACCGTTAT
TTCAGTTCAACTCGGGATCTTGGACTAAAATGTAATCGTTTTCTAATCGT
GCCCCGTTTTTTTTTCTCAATACACAAAGTGGGAACTTCAAACATAGAGT
AGGACGACACCATTTTGAAAAATGTGATTTTGATATAATCTAGAAAATAC
AACTTTAAGCCAATTTGTGATATATGTAAATACTACATATATTCAGTTAT
TTTATTAATTAAATATATCTTCCTTTAGTAGCAATAAAAGCATAGACAAG
CCGGTAAACACAATGACAGCTCTTGATGATGAAAGAAGTGCTCTTAGCGG
ACACTGCTGTCATTATGGCAACTTGAAGCGAATCCAAGTTTAGATTTGAT
GTGTGACAGACGTTCTTCTATAATGTACTTTAGACTGAACAGTCTAGAAG
GTTAAGGTCGGGGTTAAAAAAAGGAAAGTGGAGGTAGTCTAGAAGTTATC
AGCCATAATGTTCCTACTAGAGTTTTGATTCTTCTTCACTGAATGGGGCT
GTAATTGACTTATTGATATTGTAGGGAGTCCAAACTGAGATGCATACGGT
CTTTGTAGCCTTTTCGGCACTAACATGGAAGATCAGATCATAAGAGTTTG
CACACATGTTCCAGTTTTTTACATTGAGGCATGCAATAAAAACAATACTT
GTTTATTTTTGTTTCAACCCTGGATTGATAGCGTAACAAAAACTCATAAT
TAAAAATAACATGTATAAAAGTTTTATCAAATGCTGTTACAGCTTTGGGT
CCCACTCTGTATAGACCGATCTTTACGGATCTTAATCTATGAACTGATAT
TTTCCCTTATCCTCATAAATGAGTTGTACAAATATGATTTATGCTAGACT
TGTAACTTTGTATGACTTTATTTTTGCCTGAATACCAACTTTAAAATACA
AATAATCATATTAAAAATTCTTATAAATGTTTTAAAATCGAATCGGGGCA
TTTTTCAAAAATATTTAAATTGTCACTGAGAACACATTTTTCGGCGGATT
ACCTTGAAAATTAGCTTTAATTGTACATATCAATGTTGAAAAAGAGCTTA
TTTAATGTATCCACCTCCATCATCAATCACAACCTGGATCTGGACCGAGT
AGTAGGCTTCTACAAGGTAGTTCCTTTGTTGGGCATTGTCTCTTGGATGG
ACACATTCCTTTGATGGCATGAAATGTTCGATTTGCTGTAGATTATACGA
AGCTCCGGCAAAATTATTGTTCAGATTAAAATCTATAATTCTGCCGGGCA
ATATTTCCGTCCCAAAAAAAGGCATAGCATTGTTCACTCAGCCACTTCAG
GGACCTGTCTGAAAAATGACAATTTATTGAGTCTTGTTGCCAGAACCCAA
CGTCAAACTCCCGGGTCATATTTGAGACTTCCCTATTTGAATTTTCCGAA
TTATTGTGAACAAAAACATCGTCACCCTGCTACACCGTTCTTCCTATATA
AATTCAATCTAGGGCAGCTGTTCCCATGATGCCCAAAACTTCACAACAGC
TTTTGACAACAAAGTATAACTGTTTTTTGTTTTTTTTAAAGAGCGGTCCA
GATCTATTTTTTAATAGTTTGGTACACTAAAAGTATAACGATCTCAGACA
AATCCAGGATTTTCAGACCCARGCAACACACTGATACTTTTTTKGGTATG
TACCTACACATAAATTGTATATTGGCAGAAATTGTTCAAACTGTMTAAAT
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GCTGMCTTTTCACCAATCTTATGGATTTTCTATTGGAAATCATTCAGAAT
AAAAATATAAAAGGGAGATTGAATATGCTCGTACTTTGTAAATATATTAG
TATTTATTCAAAAGAGGAAGTTGGGAAAATGGTACTCTTGACATTTTGAA
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TGTGTCTTCAATTGTTCAGAGAGAGCTACACTCATAAGGTATAAGTTAAC
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ACAATCAGTTTTCTCAAGGACGTTGTCAATTTACTTTTTACATTTACTTT
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AATTAATGTCTAACGACGTATATACCAAATTATTTATATTTTAAGGCAAA
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CTAATATCAAATCAATGATGTATTTGACTTTGTTTTCAAGCCATGATGTT
ATCTAGATTTTTATTTCAGAATGTTGTCTTGATTTTGAGAATATTTGCTA
AATCTCTGTCGGTCAACCAATTTCTTTCTGCAGTTTTAATGTTCTTAATA
CATGAGATGAACAGCTCGGACCAATATGTATTGCCCCATCCCATGCATTA
TAATTTTCAAGATAAATTTACATTAACATAACTATTTAAAATCAAAGAAG
GGGGTTCCCTCTATGAAAGGTTTTCAAACCTTCACCACTTTTCAGCTCAA
TCTGTTTAAGTTATTAATCGCCTTGGCTTTATCACCCACATATCAAAATT
TAAATTTTAATCACATTTATAAATAAAATTTGCCTCATGTCATATTTATG
TTATAGGCCTTTACATTCGGCATCTGTGGTCCTTTGGCACTCCAACCCGC
AGCTGCTATCATCATTGACTCATGTTATAATGGAGGATTCATGTGTGGAC
GAATTGTGAGCGTTGGATTAGCGGGAATTATTCGACCACGGAATATGATC
TACATTTGCCTATTGTTTGCGTTTGTTGGA back to top
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