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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s108 | supercontig | LSalAtl2s108:230431..251826 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000547 >EMLSAP00000000547 ID=EMLSAP00000000547|Name=EMLSAP00000000547|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=205bp
MKVSIVPLLPHQTYYLPAETGNYSVAGFRMVLTRKISHYMITYYLPSGLF
VVVSWASFLIPSDDIQGRMALLVTLFLVLVNIFNAITTNSPKADGLNALQ
AWVITCIFFVFGALSEYAIILLQVKIRNIQGHSGDYPSCIPAALPIPNGN
PAIQTHVQNRLRIAAINKLTKKEQLMARLDITCLIVFPILFLVFVLIYGL
CVQFL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s108:230431..251826+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000547-696394 ID=EMLSAT00000000547-696394|Name=EMLSAT00000000547|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=21396bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s108:230431..251826+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAAGGTAAATTATTTACTACTGAAAACATTCAATTATAAATATTTTGT
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ATTTTGGGGTTTGCATATGTTTTCTCAGTTATTATGTGTACATATTAAAA
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ATATAAGTTGTGTACGAGTTATAATGTATGTACGAGTTGCAGCTAGTAAT
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TTTTCAGAGAATTTTAATATGATATTCTTTTTTAGTCTTGACTATAAGAA
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TTTCCTATAAAAGACCATGAAGGTCTTTTAAATTCTTTCAATTTTAGAAT
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GTGCACACTTTGATAAACAATGTACTTGAGTAAATAGTAATGCATTCATT
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TCCTCTCCCATCGTATACAATGGTGCAAAGGAGTTTTGCAGGTTACAGCT
GAAAGACCATATCTCTACCAGCAAGACGGTACACCCGCTCATACCAGCCA
TCAGGTACAAAATCGGCTTTCGGACAATTTGACTTCTCTGAGAGCCTCCA
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CTATTAATCTTAAAAGATCAATAATCTTTGAGGTAATATTCGATTATTGC
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GTAAAGAAAAATTGAATTTTGAAATATTTCATTTGATTACATTAACCAAA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCAAGG
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ATCCCCACTCAGTGTCTCCAATTTCGAGATAAAAAGATAAAGTATGACGT
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TATAAAAAATTAATAATTTATCATGTTAACTTGATTGCAATTCCTAAAAA
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ATGGCTCTGAATCGAAATTATTCTCTAAAAACGTGATTTTTTTAAAAAGC
TCTAAAAGTCAAACAATGTATGTTTGTATTGCCATTTTTGTGTTCTACGG
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AAATTTGTAAATCTACTCCTCAGACCCTGTAGATAAATATACTTTGTTTT
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AAACAGCCTTCCTTTATTTTGAATGTTTCTTTTAACGGATAAAAGTCAAA
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CATTTTCTAGGAAAGACATGTAAATTATAGTCTGATCTATTTCATACTAT
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TGCGCGTCTAAAACTGAACACTATGAAATTTTTAAAAATAGTTAAATAAT
TCTTTAATTTTTAAAATGGTCGACGAATTAATTTATTTAACATGAAAGAT
GAGAGTCTTAGACACATCTCTATGGCCGCCCACGTTCTCCACTTCCAACT
CCACCCTGGACTGGAACTTGATGCATGACTTGACAATGAAGCTCTAGTCG
AGGTTGGCTCAGGCATTCTTGAGGGCAGACTTCAGTTGGTCCTTGGACTT
CTATTGGACTCCCGACAGCATTCCCTTTAAACACCCAAATACTGCGAAGT
CAAGCGGCAAACAATCAGGCGAGTGAAGCGGCCAAGAGTTCTGATCGAAG
AAGGCTGGAGTCTCGACCTGAAAGAACTCTTGGGTAAAGTTGCTAGTGTG
GCAGSTGGAATCGTCCTGCTACCACCACCACCTGTCCCCGTAAATAGCCC
TGGTCCATGGAAACACTTTGTCCTTCAAGTATTAGCAGAACGTCTCGGAG
TTAAGCCTCTCGTGGTCCTCCAAGAAGATGAGATCACATTTCTGACCGTC
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AATCCGTTGTCGTTGGTCAATATTTTCGTGCTAGGGACAAATAAAAACGG
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TCCGAAATATGAGTAAAAACTGTTCTTTATACATTTTATAATATTCGGTG
TATCAATTACAACCATTGTGCACCTTGGTTTTAATCATTTCAGCACAATA
AATGATAAAAATAATACAAATTTAACCCTAGTTCAAGTGATAGTTGTTAA
ACAAAAGAAAGGACATTATCTTGTATTATAAAACAAGAAAACTGATAATT
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TCTACCCCAAAAAACGGCGTCCGAGGCCTGAAACGTTGTTAAAGTCAGTT
TTATTTGTTCCCAGTATAAAATATTTTTGTGCAGAGGTAGAAAAATACTA
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GCATTATAAAGAAACTTGAGAGGATATATTGAATCTATTTTTTGTTATTA
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TGGAATTTTTGTTCTTGTCTTTTTCTTAGTAAGCAATATATGAATTATGT
CATTTTGTATTACAGCTCTATTATATGTACAAGTAAAGCTTCTTACTTTC
ATATTTTCATTTCACCAAACATACAAATAAAACTTGCTAGATAATATAAT
ATATTGTATTTATAAATATTTGAAAATGGTTAACAATAACTCCTTACGTA
AAGGGAAGAAAACATAAGACTAGAAAAGTAGACAATGGGATTACAAAGTT
ATGTCTAATATCTTCATGTTAAAGTACTTATTTAAGACCTTTGTTGGGTC
ACATGTGAAAAAAATAGGTTTATACTCTACTTGGTAAAATATCAGGTATG
ATATAATAATATATTTATGAGTTATGTGAAGGCTTGTAAAATGTAAGCAT
TTTTGGTCGTTAAAAACTAACAACTGAAAATAAACAGGGGGTAACCTAGA
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ATTAAAATAGCCGTGAGCATCCATGAGATGAAGGTAATATACATAAGTCC
CACTCCAAATATAGCAAGAACATAGGCTGTCATTAATCTTTTTTCGATCC
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ACTCTTCGTCATTCATGCTTACTCGTGGTTTCATTGTATACTTTCATCTT
CTCTCGTCAACAACTAAAGAAAAATAATAACAGCTTTGGAAAATTAAAAA
ATATGTTCAGGTAGGCAAAAACAAAACTCCTATACTAAAAAATGCTGAGG
ATTTACAACTTTCATTCATCATTGGTTTCGCTTGAGTTCCCCAGTGTATT
CAGTAGCATGGTCAAATAATTGGGTTCTCATCTATTATGGGTTATCCAAA
GTGCCTATCTTACGCTGATATCCTAACACTTAATCATTGTGGGAAACCTT
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TCCTATATCTCAGGATTAAAGATCAAATTTGATCAAACAGAGATAATGAG
TCCTTACAGCAGCCTTATTGCAAAGGTTTGGCTAAGTTTCCGAACATAAA
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