EMLSAT00000000632, EMLSAT00000000632-696479 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000632
Unique NameEMLSAT00000000632-696479
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s109supercontigLSalAtl2s109:806652..822306 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000632 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000632EMLSAG00000000632-683398Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000002767EMLSAE00000002767-711695Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002768EMLSAE00000002768-711696Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002769EMLSAE00000002769-711697Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002770EMLSAE00000002770-711698Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002771EMLSAE00000002771-711699Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002772EMLSAE00000002772-711700Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002773EMLSAE00000002773-711701Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779783auto779783Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000632EMLSAP00000000632Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000632

>EMLSAP00000000632 ID=EMLSAP00000000632|Name=EMLSAP00000000632|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=296bp
MRGGIVKNIKGCIYCSIWITSILFGYFFLYLPLLPLLFIKRKWFRRSTDI
LFVMWESFNMALTELIFNSKVTISGDYIRSDESSIFVVNHRTRVDWNYLF
VGIHKITYPANNNAKFVLKQEVRMIPGVGWTLQCTRSLYICRSWSSDEDR
MNRMLDYLSDDEEHPYQLILFPEGTNLTNKTKVCSDKYAMSNGQKPFEYL
LFPRTTGFGFLANKMRERKRLDAIYDITLSYPDVIPETERDVIHGNLPQR
VHMHVKRHPCKSIPTTLIGLEKWLLELWREKENRFATHGVMELRSY
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mRNA from alignment at LSalAtl2s109:806652..822306+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000632-696479 ID=EMLSAT00000000632-696479|Name=EMLSAT00000000632|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15655bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s109:806652..822306+ (Lepeophtheirus salmonis)
CGCACACACACAAAACTTCCCGGGATTCTTATTTAATAATATTTATATTT ATACTTGTAAATATAAAAAATGGTAATACCATTGGAAGCCCTATAAATCT CTGTGTTCTGTACTAGTCGATTCCATCAAGTATGAGAGGCGGKATAGTAA AAAACATAAAGGGCTGTATATACTGTTCCATTTGGATTACTTCCATTCTT TTTGGATACTTTTTTTTGTATCTCCCTCTCCTACCATTACTTTTCATTAA AAGAAAATGGTTTCGAAGATCCACAGACATTTTGTTCGTGATGTGGGAGT CCTTTAATATGGTAAGTGTGTTTAGAAAATAGGAATTTGATTTAATAATA CATTTATAACCCTTTTTTGACGAAATACTATTTTATATTGAATTTTCGTA CAAGCGATAAAAAATCAAAAACATTTTTGTAGCCTCATTTTTTAATAATA TTTTCATACTGGCTATTATTAGTATTTGTACTGTAACGTATAATATATGC TTTTAATTAGAGTCATGTTTTATTCGTTACAATCTCTAATTTCACAAGAT TTCTTTGGAAGGAAATTTGAGACATTACCGTATAAAATCAAGTCAACGTA ATATTATATATATTTGTATTTATTAATTAGTTATTAATTAACATATTTAC CTATTTTCAAGGAATATATTGGAGTGGTCAAATGATAAACAGATTCTCAT TAGATGTCTGTCTTGTTTAATATGTTAATAGTTCATAAACGGCTTTGTTA TTACTTATTAACGACTAAACATAATTTGTTTGTTGCTCACAATAGATTGT TAAATGATGGGGCTTAATCACATACTTAGATCATATATTAAATATTTAAT TCAATGTAGCCCATTATTCACTATGGAATACTTATTCGTTTTTCTTAGCT GATTGGCTCACATTTTTGTAGTGACAAATATCATTTATAAATTACTGTAG TCTATTTGTAATGATTAATTACTTCCATCAGTGTTAATTTTGTCAGCTAT GACTAGACGAAATGTATTCATCAACGAATCTTTTTCTCATGACAATGACT AGAGAAAGACGAAACTATCATTTTTTAAATTTTATGTTCTGCATAATAAA ACCAAACTTTTATTCACGAAATAAAAATGAGACAGGACAATATGAAATAT AATTAAATGTGTCGAAACAAGACTAAGTTAACAGTGACTTCCATATCAAA ATATTTCTCTTTTCAAACTATCACTGTTTAACTAAATGCTATAAAAAGTT GAGGATTCTTGTTATGTTACTATATACATATATATAATGACCCCTTTGGA TGTCGTGTTTCAATTATTATGAAGAAAGTTAGTGTTGGATTCGACTAATA ACTAACTAGTTTGAGTTTTTGAGTCAAGTGTAGTTCGATAAAGGCGGCGG ACAAAGAAAAATATTGTTTCATTGAATGAATCTAAGTTCAACAATTAAAT GTGTTTGACTATACCAATAACAAGGCAGTCAATTAATTAGTAATCAAATA ATGGGGGTAATTTTGGAATTATATTTATTTGCATAATAGGAAATGATTCC AAAAAGTTGTATCTATATTATCATAACCGAGCCAAAATTAGATTAATTTA AAGGACTGTCAATTCCATTTGATATGCATAATTTTGATTCTATTAATATA TATTCAAATATATCTAGTTATGAATCCAACACTAATATAATTATAACAAT TTGCTTCCTTCCAAGAAAATAAATTAGTCATAATTTTCATGGGGTGAAAT TATTTAATAATGGGATGTTACACAATTTCAATGTAGATTAAAATAAAAAA TGGTATATTATTTCAAATGTGTATTTAATTTATATATGATGTAAATTCAA CTGTTTTTCCAAAATACGAACAACAAATCAATTAAGTAATTGAGTATATT TTAAGGGATGGTTGAGAAACATCCATAACGATGACAATCCCGTTATTAAT ACAAAGATGAAAATATCTTTTAAACTCTTATAATTTCCTTTTAAAATAAA TGCTTACTTATTTAGGGATTTGAGATTATAATAGGGTGAGTTGTTTTGAG GGAACTTGATCAACTTTTTGAATTTGGAGAACGGGCTATAAGAAAAAGTA GTGCATTGGTATACGAATGATTGGTGGAAAATATGAGCTCGAGGGTGTGA GCTGAAGAGGTTCCCCAATACGTATTATACATGGGACTGCGAAAATCCTC GTGAATGTAAATAAAAAAGAAAATTATTTTCTTCACTACTTTTGACAGAC GACAAGTCTGCTGACAGAAATCACTATAAATACTAGTGTGCTCCTTGTTT GCTAATACGTTTGAATGTTCAAAATGGGGATAAATAATTAATAACACCAC TAATATCTCGGAGGTATCTTAACCACTGAAAACAAAAGATACTCACCAGA CCAAATTTTTGGAGACTATTAGGGATAACATAGAGCCCCTTGTCACTTCA GTTAAATCCTTAAAAACAATAATTAATTTTAAAAAAACCCCTTAGAAAAC GAAATTTAATAGCTATTTCCATAACACATTACNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNAACATTCCATACACAATTGCTAATATATTACTATTAAATACTA TGTATATTTATTATTTTAATGCAACCCATTAGTCATCAATTATACAAAAT ATTACTTGGCTTAATGAAATTTTAGATACTGATAGACTGCCATAATTAAA AAAAAGAAGAAGAAAATGTAATGAGTAAATTCCCTAATTTGACAGTTTAT TATGCATCTATACTTTAAAAAAAAAATACATTTTCCATCCGTATTTTTAC 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ATACGCAATGAGTAATGGTCAAAAACCATTTGAATATTTATTGTTTCCGC GGACAACGGGATTCGGATTTCTTGCCAATAAAATGAGAGAGAGTAAGTCC CGGCTGATATCCCTAATAACACGTTAATTACTTTATAATAACGATTCATT ATTCATAAAGGAAAGCGATTGGATGCGATTTATGACATTACTTTAAGTTA CCCCGACGTCATTCCAGAAACCGAAAGGGATGTAATCCATGGGAATTTAC CTCAAAGAGTTCATATGCACGTCAAAAGGTGTGTAAAACTAAGGATCTTG TGATTTTATACGTTTTTTTTTGCGATTTTGGAAAGATTTGAGCGTTATCT CGAAATCCATCTGAATCATTACTATTTTAACAAAAGTTTGTTTTTGGATC AAGAAATTGAATTGTTTTAGACTTAAAATAGGGCCTTGGCAATCTTAAAC AATCATGGCTTTTATCGTTTGAACAAGTTTTTAGTCAGTAGGTATAAAAA CAAATTGACAATAAAGCTCTTTCTGATTCCACAATTGTGGATAGAATTGA CTCCAATAACGTTTTAATCCTACTAATATTTACTATCTCCATTTGGGTAA TGTTAGTTGTTAGTTTTTTATAATTTCTTTGCAATTTTCCCCATAGTACA AAACAAAGGGATCTCGGGAGACAAATTAAAATCCTTTTTAACTCTGATAA TGAGTTCATAATGTGATAATATATCTTCAATTTTATTTTCAGACACCCTT GTAAATCAATTCCAACTACGCTGATTGGCTTAGAAAAATGGCTTTTGGAG CTCTGGAGAGAGAAAGAAAAGTATTTAGAAATTTTTTATACTACTAGTAA AACGGAAAATATGAACAAATCTTCCTCTTTTAAAAGTGGAATCAATCATT TACACTTGTCTAGCCTCATGGCATGGGCCTTGTTCTTTTATATAACATTT TCATGGATATTTAGTCATCCCTTCTACGCAACAATCTATCTTTCCTTGTC CACTCTCGCCATAGTTCTTTTGTCAAAATATACACCGGGTATTCAGGAGT TAGAGCTTAAACTTCACAATGGAGGATTTTTTCAGTCTATCCTTAATTTT TCTAAGGAGTTTTGTCATAATTATTCGAAAAAGAAACATGATTAATGTAC ATTGACTGGCTCTTATTTTCTTTTCTTTCTCGAAATATTGGGAGAACATA GTCGTCCAAGGATGTTTCTTTTGATAAAAAACGAAATTTGAAATATAATG AATAGTGTTTAGAAGTTAAGTAGGGCTATTTCAAGAGGCCAGGGGGCTTG TCTAAGGTTGTAAAAAATATGACCTCATCCCCCCAACAAAAAGAAACCGA AAAGTTACATGGTAACAATTTATTTTCTAAAGCTTTTATAATGTTTATGA TATGCTTGAAAAAGGAACATCTAAGTATAAAGTGTGTGTATTCATGAATG ACGGAGAGTAATGCTGATGATTTATTGGGGAGTTTGGGCTCAGATTAGAA TTGAGGATCCTACCTATATCATTGCTGGATATGGAGTGGGATTTCCTTCC TGTTATAGCTGTTTGTACTGCTTGTAAATAATATAATTATAAAACGTCAT GAAATAAACATTCTTCAAATTGTCAGCGTTACTACGTCATTTTTTGATTT CTTTTTGTTTTAAGGGATGTAGGTCATWTTTTCTMCTMCYCCAGCCACCA TACTTTTTTTGGAATGTAAAATAATTATATAGTAGGAAATAATAGTTCTT TTTTAAATTTAATTTATTGACCCATTGATTCCTCCAATTTCAAAAATGGT GAGCGGAGCCTGGTTACACATAAGAGGACAGAAAAAGTGCGAGCTAAACA CGGTACAACAATACTTTGTTAATATTTTTTTATAAGAAATAATAATTTTA 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ATAATTATATTAGTCATGTGCCACGACCAAAACTCTTATATTGGTACTCG AGTTGATGAAGGAAATAAAAAAAGAGGCAAAAAAACTCGGTTCGTGGTCA TAAAAACAGTGTTACTCGGAACTCGTCAAAGCTTGGGATTCTTTTTCGAC CCCATTATAACATGTAAGTCTTTTTAGTCTAACTTCCTTTCTTTGGAAAA TTGAGAATTCATGTTTCCACGAGGTAGAAATGTGTTGACTTTTCTGCAAT GTGTACCCATTTCATCCCAGTTCGTTTTAGAAATAATCTTTGTTTGTTCT TTTATAACTAGCAGGAGTACTCTAGATTGCTTGGAATTTCTTAGCCATCT GAAAACTTATATTTTTCAATATATTCTCATTCATATGCATTCACGCTTAT GACCTCGATTCAAATAAGTTAAACTAATTTATAGATTAATCTATGGAACA TAAATTAGGAAAACAATTTTGATTGYTCATCAGTACCTTATATTAAATGT ATTATAGTCCTTCTGGTATACAAGTATTATTGCTATTATAAGATCCTTTT ATATGTACATATACAATATATTCAATTACAAATAGAGAGTCCTTTGGATA ACTACACAAATTTTTAAATNGACAAGTTTCAGTAATTCGTTAAAAAATAT GATTATTTTGACTGACGAATTTTTGAAGGAGTAAAAAGTGTGAGGATGAG TATGGAGTACTCAAGAAAGTAAGGAGTAAAGTTCGTAATTCCTCGAGTAT TTTTCTTAGAAACTCGAAAATACTCATGTAGTAAAATTCAGCGCCCAGCA CTTGACTAATAATTATCATATAAAGGAGACATCAGCGCCCTCAAGCAATC TATACCTATAATATAGACCCAGGCTACAGAAAGTCACACCACCTTTTGGC AAATATATATACTTATCTACAATTTCTATCAACTTTAATTCCCCAAAATA 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AGATCCTGATTACTAGTTAGGCAGGGAAATTGTTATCATTAATTCTCTTC ATTTTTGAACATTTCATAAATCCTAGAAAGGAAACTTCTTCATTTTCTTA TTGTATTACTTGATATTTTTCATATAAGATGGTCTGCACTCTGGGATTCT TCCATACAGAAATTGCATGTTGCATTTATAATTTTGAAATGGCCCCATGA CCTGGTGTAAGCTTGTACTAGAAGTATAATCTTCTCACGTCCAAGTTTGA TACACTTTGGGGTTGGCAATTTCAGTATGATGTGTGTATGTTTCATATTT TGGTCTTTTTTATATCTCTTGCACATGACTTCGTGGAGGAAACCACGTAT CWCCCGCTTAATGAAGCTTTTAGGTACTTCAACCAACCAACTTTCCTTTT TTTTGATCCGTATTTCATTACCTTGTGTAGTGCTATCCAGAGTCGAAGTT AAAACCTTGCCAATATTCAAATTTGGAAGATCTCCATACCGCAATTGAGA CAAAGTGGCCCAAACTTCCTCAAATATGGTGCGTGCAAAGATTGACACAT TTCAATCTCGTATAAGGGAAGTAGTTGATAAAGAAGGCGGATATATCGAA TAAATCATAAAATATAGATTACAATTATTTTATCCCAGTGTTTTAATCTA CGAATAATTATCAGTGAATTAATAAAAATTGAAGAGGTTTAAAACTTATG GTGACACCTGTATGTATAACAATAGTTCTAATTTCATTCAAATCTTTCAC ATTGGGTCTCACCCGTGATAATTGTTTAATTACCTTTATTTTTTTCCACT TATAGTCATAGCAAGGTTATTGAGTAATTACGTTTAAGTAAAAAAAAGCA AAGTAACTCTGAGGAGTTACTGGTGAGATATTTTCTATATTATTAAAGGA AAATTTGTTAGTCCATCGTAATATCATTTAAATTATTTCCAATTATGTCT 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