EMLSAT00000000642, EMLSAT00000000642-696489 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000642
Unique NameEMLSAT00000000642-696489
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s10supercontigLSalAtl2s10:144553..177864 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000642 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000642EMLSAG00000000642-683408Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000002802EMLSAE00000002802-711730Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002803EMLSAE00000002803-711731Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002804EMLSAE00000002804-711732Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002805EMLSAE00000002805-711733Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002806EMLSAE00000002806-711734Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002807EMLSAE00000002807-711735Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002808EMLSAE00000002808-711736Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002809EMLSAE00000002809-711737Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002810EMLSAE00000002810-711738Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773208auto773208Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000642EMLSAP00000000642Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000642

>EMLSAP00000000642 ID=EMLSAP00000000642|Name=EMLSAP00000000642|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=319bp
GKVVLILILCPIFAFSSKNLPKKDKFLSLFHIVTFQDFICPSALDSRNGT
CLSAQKCTTNSGIPSGKCASGFGTCCVFETQTCGSKVLRNMTYITSPDYP
SMIKSSLTQCDYRIQAEMKNICSLRLDFDRFEVRGPPGRNELNGGACSLD
TFVIQGTLGSVPVICGLNTGAHIYLDVNDNALKSGIELKFQFKGXGQRRW
RILSSEIECNNPGRARPGCLQYYFESTGRINTFNFNAMGSSHLASQKYAI
CFRRNLNTCCIEYRVCEDEKEAFTLGISPNADCTEPFEIRIRTDETASVA
MALTNRGLCLEYRSIECNL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s10:144553..177864+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000642-696489 ID=EMLSAT00000000642-696489|Name=EMLSAT00000000642|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=33312bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s10:144553..177864+ (Lepeophtheirus salmonis)
GGAAAAGTTGTTTTAATTTTGATACTCTGCCCCATTTTTGCATTTTCAAG TAAGAATCTTCCTAAGAAAGATAAATGTAAGTTTGTTTATGTGCAATTAT TGTTATTATTATTAATTACTCTTTTGATTTCATGGCAGTTTTAAGTCTTT TTCATATTGTGACTTTTCAAGACTTTATTTGTCCATCAGCTCTGGATTCA AGGTCAGTCGTGTTTCATTATATTTACATAAAGCTGATATGATATTCATT GATTACTCGATTTTTTAGAAATGGAACCTGTCTTTCTGCTCAAAAGTGTA CGACAAATTCTGGAATTCCCTCAGGAAAATGCGCGAGTGGGTAAGTGTGA ATACAATTTTTTACATATTTATAGGGTAGTATTGTTACGTATATACAACA TTGTACAGGTCTATTGATTCATGTAAAACGGTAATTAACAAAACTTATAT TAAAACCATGGTACTGCAGCGCCATTTTGCTATACAAATGACTTTCTTAT AACTTAACCCACAACTTTATAAATTCCTCGAAAAACAATATGTTTTCTAC GCAAAAATTCTAATTTGCACAGTCCCCCACCTAAAAAACAAAACAAAAAA AAACTCGAGGACTGCATGTAAACTGCCCTTAACGACATTCTTCTTTGATA TCTGTAGAAACAAATCATAGAAATACCAATACTGAATTTGACACCAAAAT TGGTTCATAAATGTTAACAACATCAATATATAATTAGTAGAATTTTGCTG TCGGGAACACAATTTCCAAGGATTTCTGTGGAGTTTACCTCTATGGGAAA TCCTGCAAATATTTCTCCATATCTCCATCACAGCTATGTATTTGGTAAAT ATTTGGTGTTTTTTTAAACAGTATGGAATGTGGAAATTCATACGACTCAT TTTAAGTGTTAAATGGATTTCAGTGGTGTGCTCCAGTTGGGAATTAGCCT GCGGCTCAGCTTATGTATTTTACAGTTTAAACAACTTCCAATTCTATCGA TAATTTGCTCGTTCATCATTTACTAATGAAGATTTTTTTTTTCCGGTTCG GTTCGGTTCGGGTTCAATAATTAATATAATGGGGGTATATAAAAATAACC TGTGCATTATAAGTAATGAAGAGAAAATGAGAAAAATCAGAATGAAGAAT CGAAAGACTTGCCAAAAGTGTATCAATTCTTTAAAAATTTACAAAAAAAT ACTTAAACTTCACTCTAACGTGATCCTATCATTTCCAATGATGAACAATT TTAGAAAAATATTTTCCGGTATCCGGCTCAAAGAAAATTTCCCGGTGAAG GNNNCCCTAGTTAGTCACTTTATTACCAAAGGGAGGCTCAAGGTAAAATG AATTTTATTGATTTTTTATATTCAATGTATTTTATGAATTAAATTAGAAG TACCTAATTGCTTAACTGAGTTGTCATCCTTCAAGAGAAGCAATGTACCA ATGTATGTTCTAAATATTTCAAAAAGTCATACTTATTGCTAATTATTCAC ACCTTGATGCTTTTATAAGGATACGCTCATTAAGCAATTATTATCAGAAT GAGCATTTCTAAATATTTCCATAAGATTAATTCACGGATTGACTTATTTT GAAATCATTTATGTTTTCACTTTTAGTAATTTAAGGAAACAGTTCATTTT ATACCAAATTTGCGTATATATACTAAATAGATATAACAAAAGAGTACCAA TAGGATTTTTAAGCCGGGAGGGATTCATTATTTTTTATATTTTTCTCCTG ATCACTTTTAAATGATCTTTTTTGAGAAAATAAATTAAAAAAGGACATTT TTTAGATACTAAATTTCAGATTTTGTTTCATACTTTAACAATTGATTACA CCCTTTTTTTACTATTTTTTTTTACATTTTTTTTTCCTTTTCTTATTATT GTAAATATATGAACATTCAAATTGAGGAGGAAGGCATTGCCTATCTTGTT CCACTAATTTTGTTTATACAAAAGCCCAAGAAAATCTTGTGAGAATTTCA GTTCCTGAAAAACTAGCGAGGGGCATCTCCCATCCTTGTCCTCACTAACA GCGAACATGATATAATATATCTGACATCTAAATAACCACGAAAAACAATT AAAAGATTATACCTAAATCATAACTCTCCAGCTGTTGGGTGAATAGGGGT AATTNAGCGTGAGGGAAGGTGTGAATTGATTTTCCATAAGAATTTTTATT AGGGTGAGCAATTGATTTTTTTTTAAACAAGATATGTTCTCCTTTTACAA ATCCTATAAGAGCACATTTTGATAATTCAAGGATCAAAATATATTTTCTC AAATATTAAATAAAAATTGCCTGTTTGTTAAGTATCTCATTATAATTACG GATCTTTAGAGTACAATCCATAAACCTTTGTCTCCCATCAAAGCTATAAG AAAAGATGATATATTGATTTTGTTATTAATCTTTGGCTCCTATATGCACG GCTAGTTTTACCCCTATCAAGAATATCCCTGGCTATACAATTTTTATTCG TTATGTGAGTCATAAATATTTTATTACTAACAACATAACATCTACAAATT CATTTGCTTAATTTTGCACAAAAATATATGTATCTCTAAATGACATCTTG AAGAAAAAAGGTCGTCATATAACTAAAAAAATACTATCTAGCTAACTGAC GGCCCCATCATACAGAATATCGAGTGGACAAAGAATTTCTTGAAAAGTTT GTTATCGATTCAACTTGGCATTAGCTGTTGATAGTGGATTTACTCTATAT TTATATGTATATTTTTTTTATCTTTCGGTTGTGTCATGATTTTCAACAAA AATACTAATACAAGAATATAATACAGCGGGGAACTTATACGGATATGTCC 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AAATATTTTCTCCATATAATAACACCTCTTTTATCACTTTTTCGATGTGG CAATACATTTGCAACTCTGGTAGGGTATATGTTGGAGATTCACGTTTTTT TTTCTTGTTTAATGATCCATTGATTATATATTAACCATTGCATCCATGAA ATTTTTTTAGCCAAATAGTTGTATAATTGTTCAAATCCGGGATTTCAAAT CTCATGTATCAAATATGCTTCGTATGGTGTTAAAGATAAAATATTCTTTT TAAAGTTACGAACTGTATGGTTTTACATACATATGTACATATATGACATC ATAGATTAATCATGGAATTCTAGAAAGGTAGAATTTTGTTTTTACGTTCA CTGCGATTTCAAGATTTTTTACATTTATAATTATAAGTTGATACAATACC CAAAAAAACATTTCAATACTGTTTAATGCTAGGATTTTTCTATCTAAAGT ATGCCAAGCATACTTTATCTGCATTTAGTGTTAAAACGCTGAGTAAATAA TTACCTACTATATTATATAGTATAAATACTGAAGAAAAAACAAACTGTAG AAAGAATTAGTGCAAAGAAATGTAGATAGTGTTTATAATTTAAAGGTAGG ATATAAATTTTAAAGGCTATTTTTTAACAAATAGCTATAAATATTGGTAT ACATTTGTAAAAACTATGTGTAAACGTAAAACGTCTATTACCAATAAAGC TCTCCCTTTTAGTTCACTCTCACTGAATGTCAATGCTAACTTGATGTATA TTTGATGGAAATAGCCAAAGTTGCATAAAATATACCTTAGAAAGTGAGAG CAGCCTTTTCTAAATGAACGGGATTTTTCTTATTTTTCATGGCTGSTATC ATCACTAACTAATTATGATGAGGGAACATCAAAGTATATAGTAAAAATTA GTGTTCGTGGTCATGAAAGACTGTAAAAAATAAGAGTTTGGTTAGGAGTT 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CCGAACATGGTCTACGGGTAGCTTGTTGAGAATCCCTATTGTAGGCACAA GATGTACATATAATTATACCTATTCGTAATTTTTGTACAAAAAGTGACAA AAAAAAAACCCAAAAATCTATTAAAAATATTGAATTTTGGATCCTATCAA CTGATATTAATTTTGGTGTAAAGTTTCTATATAGTTTACATATATTAAGA AGGAAACATTGTCTCTATATTCGTATTATATATATTTATTTAGATATCTA AAAACGTCTTATAAAGATGTAAAACAAAAGTTATTTTTCATTAATATTAT CAAAGACTACTATTATTATTATTATGAATGTAAATCTGTGCCAAAAACGA TAATATCAATATCTACTTTCAGTAAAAAAAAGTGCATCAAAATTATTTAA AAAAAGAAAAAAATGAAGAAGAAGAAAAAAAAGTATTTAAATTGTACATT ATGTTTCAGACAGTTGGATATAGGTATACATAACATGTACAGGGATATTA GGAGTTATATCCCGGGACAATGATTATCCTTCTCCCGGTATTTTCGGGGT TTTATACATATGGGTAATTTCCAGGATGTTACTGCATTGATGTATTCCAT AATAATGTGGCATTTTAATTAACTTTTAGCCGGGAGGGACGGGCTGTGTT TTTCAAAAGCTCTTTCAATAATTACTCTATAAGTTTTCTTTTTGATTTCC AAAAAGCGGGTCCTGCAGGCTCTACAAATATCAACCTGCAAACGATTAGT AATTATGATAAAATAAAGAACATGAGCATTGAGAATATTTGAGAAGAAAC AGCTGAAAATGTATTCTTTTGTTTTAAAATATAAAAAATAAATACTTAAA TTTCAAAATAGTTATTATTGACTGACAGGATACCAAACTGAAAAAAAATA TTTCCCGGCATCCTGCTCAAATATGATTTCCCGGGAAATAAGAACCTCAT ATATATAGCTATATCTGCATACATCACGCAGGGGTGGTGGACAAAATTTG TATGCTTAGGTCATGCCTATCTAATATATGTATGGGTTATCTTTGGATAT GAATTCAATGGCTTATGATATTCCTCAAAAGGAGTCTTTAAAAAAAAAAT GAAATAATAAAACTATTTTATTTTTTATTTTTTTAGCGACAGGTTCTGTA TTTTTCTTTCTTTCTCTTATTCTCAAGAATAAAAACTTACCTACCTATAA TACGTGTCCATAGAAGATAAAAAAAGTATAAGGAACGCCCATTTTTATTA CAATATTATTATACATATATTTATGAGATCGAGATGCATTGAATTTGAAG TCAAAAAAATTTGTAAAAAGGTTCGTGATGTATTATGTAGAAAAAGGATT GAATCAAGACCTGATCATCTCACAAAAATATACACTTTTGTTAGCTGTTC ATAACTTTGTTTATAGATCAGTTTTCTGAACGTTCTTTGGTTGAAATATA ATTAGCTCTTGATAAGTCGTGAGCAATTCCATATAATATTTGAATAATTA TTCCATACTGGAAAATAATTGAGTAGCTGCTACCAATTGATTCTGAGTTT ATTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTACGAGAAAAATGGAGAGAAAT AATCCAGTTANTGTTTCGAAGAGTTTATTGTATTTTAATATCAAAAAAAC AATCTTATGTTAAAAATCCCTAAATTATTTTTAATACTTAATAAATATTA AGCCGCTCACRATTTTGAAATGTTTTGGTTTATTATGAGGTTTGTATTCC AATATTGAGTATGGATTGACCATAGTTTGAGTTATATAGAAACATTCTTA ACTGTTTACCAAAAGGTTTTAATTTAATTATAAAAATTGTACATTGATTT TGAAACGATTATTTTTTTACTATCTTGAGATATATTTCTTGTTGGAATCA 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