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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s111 | supercontig | LSalAtl2s111:55855..93761 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000752 >EMLSAP00000000752 ID=EMLSAP00000000752|Name=EMLSAP00000000752|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1597bp
MIQWGLRQSAEVENFMTSVERVVEYGELPKEKGLESDIKLDPSWPDKGVV EFSNVSMRYSQHQPNVLKGLNFKTNSFEKIGIIGRTGAGKSSIISALFRL AEPEGEIFIDGLDICKVGLLDIRKKISIIPQDPILFNGSIRKNLDPFNEF TDVQIWNALEQAKLYDIVVDLGHGLDSVVLEFGSNFSVGQRQLFCLAXAI LRRNKVLIMDEATANVDPFTDSLIQEAIRKEFKDCTEFGTPKDLLKDPNN LLSRMVAQSEPNTAHTLRHLASGIIDSIEESQLEENISVNVSSKCLYTNT NKCLEILFDDLIGFQWISNRNISRRLIQSPKQISSRIFYFCKAIIFIKWT IPFIRKGQKEDFDVHDLYKTLREDYSRELNDRLEKEWQKELSKVKTFSGN YHPSFAKAAIRTFRLQTLLSGXFVLFEECVLRIAQPFAIFKIIGYFSSGG TXMSEXELYFWSGILVGAGVIFVLFDQRYWYLSLKTGMQLRIAASAIIYR KALTLSKASLGRSSIGQMVNLLSNDVNRFDNSTVFLQYLWVAPIQFICVM LITSYFAGIEAVAGGALLIFFIFFQTYMGKMFSKLRLMTASKTDIRIQIM NEILDGIKVIKMYAWETPFVQLVTNARNRFVLLPVFLLMVLFGVEINAQK IFLIFGLFDAIKLPLTHFFPSAISASSEALVSMKRIEEFLLLNELRDVQS KINHVILPGRYEPLTVEVTKISGKWLDSSNEFTLKNISFSVEIGELCAII GPVGCGKSTIIQSLLGEFPVSYGEINIKGRISYASQEAWIFSGSVRQNIL MGKPLIDKRYREVIRVCALEHDVREWPDGDYTFVGEKGISLSGGQKSRIN LARCVYASADIYILDDPLSAVDPHVGQQLFDTCIQKFLSDKTVILVTHQL QFLKNANNIILLNSDGEIEASGTYEKLMSQSGFVTYLEATSEEEDSDLLS DVLSDVKSDGEYMRSQKKKLKKGVRSRRSSTSLLVPVPYIGGSTERDTFP EEKGSQEWKMGSKETIIEGSVSLSLYHKYFVAGGGFFKFLCVYFLSLITH TLFVVSDWWLRLWTNAADARKLGPLPPTFYFSEYQDMTLQITADFQVDFF NFIYCSIYLSLIIILLFSAQLSVRQLFMSCMRSSQTLHDRMFEKVAFTNS RFFDLNPNGRILNRFSKDIGSXDELLPPALLSGSGIFILISMTNPLIVVG IVVLLLILLTIRKYYLNASRAVKRLEGITRSPVFSQLASSLDGLTTIRSM KIEEMLIEEFDYLQDIHTSSYYSFLVVNRFFAFCGDLMLSLFTASMVSMF LFYNRDATGGDVGLSLTLSLALCGMIQWGLRQSAEVENFMTSVERVAEYG DLPKEKGLKGDIKLDPSWPDKGVIEFSNVNLKYDGTTPYVLKGLTEPEGK IFIDGVNICRLSLQDVRKKISIIPQDPLLFKGTIRKNLDPFDEYGELAIW HALEQAKLSVAVSELEGGLETEVSEGGNNFSVGQRQLFCLARAILRKNKV LIMDEATANVDPMTDSLIQEAIRTEFKDCTVFTIAHRLYTVMDSDRILVM SDGEIKELGAPLDLLSDPSNIFYQMVNQLGPSAAERLKKIAQGLQSP back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s111:55855..93761+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000752-696599 ID=EMLSAT00000000752-696599|Name=EMLSAT00000000752|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=37907bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s111:55855..93761+ (Lepeophtheirus salmonis) TTCTCTATTAACTATTCACCCCATGAAATATATATAGAATTGAGTCTGAA
GGATAAGAAAGTCTCAAATAGTCGAAGGAGCAAGCGAAGGAAACTCATAT
TTAAAGTAAGTAGTTTGTATTTAAAATGATGCTTTCAATTCCATTGCTTA
CTAATTGTCGATTAAGATGGAGTTGTGTTATTATATATAGGGCGAAAGTG
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TCTATTCACCCAACTTAATGTGTAAGCTCCTGTTGTATGGGTTATTGTAA
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GTGTGTTAGCTGGTACATGTCAATTTCAATATAGTAAGTTTCTACGTGCC
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GTGGGACAAAATTGTTCTGGGAAATATCATTTTGAAGCAATATGATTTTG
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TCTTTGAACCTCAATTGCCCCTTTTAATATACGCTCCAGGGATCTCTCTA
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GGTAGACTCGGAGTCGGAAAATTTGTACCAACACACACACATAATATTTG
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TTATTGCACCATCATTTTAAACCGTGTATTACAGGGTTGATCATATCTTG
TGGTGCACATTTTATTATGTTCAATCTGGAAATACATTGGTGCAAAATCA
CGGAAGAGGACATCAAGACATCTTAACTCTGAACAGAGATAAGAGAACAT
CTCTGAGCCACCTATAATCTAGCAGCGGCTACATTGATGATTAAGAGAGC
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ATTAATAAATTATATGTAGTTGAATTTTAAAATTCAAAGTGTTCAGATTT
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ATCCTTTTATTGATTTAAAAGTCCAAATTTACATGACTATGAGCAAAATT
AATACTGATTTATGGCATGATTCCTTTTGAGATAAGCAGTAAATGCTTAT
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ATTTTTTTATTTGAATAGATAGATGATAATCTCTTAATATACATTTGACA
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TCAACTGTCGATGCTCTTTCTTTTAATTTCCATAATCAGTGTCCTGAGCG
TTGATTGGTTGCATTAAAATTAAGAAATTGTTTAGCTCTGAACAATTTCT
AATAGCTACTAAATTATAATTCCCTTTTTGTCTAAGTTTGCTTGCATTTA
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GAGATATTCAGACAATTAATGCGTTAGAGGATCATAAAATTAGATGGAAG
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ACAACTTCTCCAATTTTCAAACATAGATATATTTATAAAGAAATGAAATT
GAAAACAGGAGTAATAATAAAGTATTAACATTCATAATGCCAAAAACTTG
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AGGGAGGGGTGACATCTTGTTAAAAAAAACAACTCCATGTATGATCAATG
ATCATATTATCAGTAATAAGAGTCCTTGCTTAACGCATTTTTTTGTCTGG
GGACTTTTTCAGTACTAAAACTCGTAAAATGGGAGAAATCCATTTTCCAA
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GTCATTTCAATACTGTAAAATTTAAAGGATGATCACTTACCCAACATTTA
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CGTTTTTTTGAGTGAAAATTGCTCATTTTTCCAGACTGGTATGAAATAAA
TAGAGAAAATTATGAATCTAGTTAGATTACTCAACAGCTTTGATAAAATT
TTTCAAGTGAAAATGTACATGCAAAATCCTTTCTTCATTAGGCGGGAAAA
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ATCCTTCAATAATGTTATAAATAGCGCTTGTAATGAATTTTGAAATAACT
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TGCAGCCTACAAAGATATTTGTTCACTGTCAAGCACAAAAACAACCTTCA
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TATGAAAATATWCTATCCACAAAGTCTAATTATAATAAAAATTTGTACTT
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GTCCAAAATGTATCGTTTTGTGGCATTTCTTTTTAAAAAATGAAGAAATT
GAAAAAAAAAAATTTTCAAGTAATATATAAAATGATTGATATTTCAGTTA
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TTTTTAAGGTGCAAAAAAAAAAAATTGACAATGGAATATTGGATTCTTAG
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TAAATACTAAAAATATTGCTAAATTTCGTGAAAATATCTATAAGAAGTAA
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ATCTGCAAGGAAGAGACTCAGAGTGCAGATCATCTTATAAATAGAAGTCC
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TGCCAATTGTGAACAGTAAATAAAATTTTAACTAGATTATTATTTAACCA
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TAAATGTAAGTAAATAAAGTTCTTTAAGAAGAATATGACTNNNNNNNNNN
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GTTACCTTTATTGTACCACACATACTTTCCTCGAAAAAAAAAACTAAACA
GAAAAGAACCTCAAAATCAGTTAATAATTGTTCAATTCTTCCGGTCTATT
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AAACATCGACAGTGGACAACAAAATACTTTGGTATTTTTTCGTTAGCAAC
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CGATATTTCAATTATACTCAGCAACTTATCTGATAGTAATTTGCTTCGGT
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GAAAAGGAAAGATCCTTCAATCCGACGTATTATCAAAATAATTTATGTTT
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ATATTTACATCAAATGGGCAGAAAAAAAAAGTTGTATAAAAGAAGGTTTA
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CATTAAAAATATTTAATTTATGTTTAGCTTATTTATTTTTCATTGGCTAT
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AAAAAAGAAACCATAAAGAAAAAAACTTCAAACTTCTACAAGCCAAGTCT
ACTCAAAGCAATGCTCCGTACATTTGGACCACAATCCCTCTTGAGCTTAA
TCATCGTTCTATTTGAAGAGTGTGTTTTTCGCATTCTTCAACCCTATGCC
GTATTTAATATCATATCCTGTTTCACAAATCCAAAAAGTTCAGACACAGA
GTTGTATATATGGGGCTATGTTCTCATTCTCTCCGGGATATGTTTTGTTC
TCTTCGATCAAAGATATTGGTATAGATCCCTTAAAACGGGGATGCAAATA
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TCAGGGGCAAATGGAGGGGGAGAGCTGGAGCCCCCAAATTAAGAAATTTC
TACTTTTTACTAAAAAAATTATACTTGAAACATAATTTTTGATGTTTTTC
ATACAAATTAAAATTTAACTTTTGAATTTTTTTTAAATTTTTTAAATTTT
TTTGAGAATAGCTATGGATTTTTGAAATTTTATTTACAAAAATTTAATAA
TCTAAATTTGTATTGAAAAAATATAATATTTTTATTTTTTTTTTGAAAAA
AAATTGATATTCTAAATTCGTTTAGAAAAAATTTATTTTTTTGTTCATGG
ATAAACAATAACTATGTACAAAGATCATTTATTTATATTTTAAGGGGAAA
TATCCTTTGAGACAAATGACTTTTATGGGAAAAATAACCTTTAGTTGTTA
AAAAAAAGAGAAAAAAAGCGAATAAAGCGTAAAGAGAATTCCTTGCCTAT
TCTCATCCCCATGTTTCTGTTTCCTATCGTTTAGGCTCTGACACTATCGA
AACGATCCTTGGGACTCAGCTCTGTAGGACAAATGGTCAATCTCTTGTCT
AATGATGTAAATCGCTTTGATAATTCTACAGTTTTTCTCCAATACCTTTG
GGTGGCTCCACTTCAATTTACAATTGTTTTGTTCGTCACAATTTATCACG
TAGGTTCTGTAACGATTCTTGGAGGATTCATTCTCATTTTCTTCATATTT
ATTCAAAGTAAGGTTCCCTACATGAATGTATCTTATGTGTATAGAAAGAT
CAATTATCATGGTTGACTCCTATTACCTTACTTTCAGCTCGAATGATTAA
CATCTTTTCAAAATTAAGATCTAAAACGGCGGAAAAAACAGATTCGAGAA
TACAAATTATGAGTGAAATCTTAAATGGTATTAAAGTGATTAAAATATAT
GCCTGGGAGAGCTCCTTTGTTCAGCTTGTCAATAGTGTTCGGAAGNTAAC
TCCTTTAAAGCTAAAACAGAAAATATTTTTTTAATGCTATATCTTTCTAG
GAATGAAATGGATGTCATTCGTAGGTCAGCCAGCTATAAGTCCTTCAACT
ATGCCTTTTTCTCCACTTCAAGTCGTCTTGTCCTTCTCCCCATATTTTTC
ATGATTTTAATTTTTGGAGGAGTGGTGAATTCACAGAATATATTCCTTGT
CTTCGGTCTATTCGAGACTCTCAAACTACCTGTGACGCATTTCTTTCCAA
GTGCCATAGCCACGTCATCTGAAGCATACATTTCTTTACGAAGAATTCAG
GTATGATGGAATTGGAATATTTGTGTATGTATATTATAAATCAGTGCTTC
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ATATCTGTGTAACACCATTAGTGTTGTGTAGGTCCTTATTTATTCGTTGG
AGTCCAGTCTTAAGATGGGTCCTAAGGACTATCAGTCCTAAAAAGGATTA
AAAAAAAAGAAATAAAGTTTAAAACCGTAAACAAACATTAAAAGTTTTTA
GGACTAATATACAGGGCTGAACTGGACTGAACCAAGACTGTAATCTTCAG
TCCAAAATAAAACCTGGAAACAATACTATTTCCTATATCATGACAATTTT
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CACATACTAAAGTTTAAGGAACACTGATTTAGAGGATAACAGAACAACTA
AACTCTAGAAAGCTGATATCCCAAAAGTATATTCTTTCGAGCAAGGGTTC
TCAAACTGTGATACGTTTAGTCTACTTTAGGTGTAGCCAGAGACTTGAGA
AGGGACTTTTTTTATGGGAAAAATATCATCCAAAATTTTACAGAACAATA
TGTAAAAAAATTTCAAATCTTAAATAATAATGATACTTGAAGATTATTTT
GATATTTACTCAACTGGTACACATTGTAAAAAGTTTGAAAATCCCTTATC
TAGACCATTCACCCAGGGCGTCGGGTTTAAAGAAGATAATTGGGACAAAT
TTCCTAAGCTCTGTGTTTTAACGTTAAAAATAGGATATGTACAGGGCCGT
CAGAGTTTTGGAAAATGGCATTAACTGCATTTTGAGGGGGTTTGGTTAAT
TTTATGCAAAAGTTTCATTAAAAAAAAGAACAACTGATTCTTTATCTTTT
GAACATTTTACTTACCAAGTCTCTAAGATAAATGTTAACGAAAATGGAGC
GGTAAAGGTATGAAGTGGGTCGTTCAGTTCGCCCAAAATTTAGCGCTTTT
GCTATTGTAAATACCCTTAATGTCTGCAGAACCCCTGTTGGGAGGGTCAG
GGTTAAGGTCAACAATGGTGAAAMCATTAATCATCGTCATAGAAGTGGAA
GGACGATCAAATTAAAGCATGAAATGGCAAAAAACCTTTTTTGAAAAATC
TGAAGATGACGATGGTGCACTTGGAGAAAAAAATGGTGGGCGAGCTATTC
GACGGMGTCAAATGCCGTAAAGAGCTGGTGGTAAGTCTCTCCGATAAATT
GAGCGACCCTTGATCACTGAAAAACAACAATTACAATTTGATGGGTGCAA
AAAGTATTATAATGACCTGAGATATCACGGAAACCGAATTTTGTTCTTCT
CGGACGTGAAGGCATTTACAGTAGATCCCATCTACAATAGTCAAAATAAT
CAGGTTGTATGTTTGGGAAAAGTCCATTTGTAACCTCCATGAAGTGTTCA
CCACCAAACACCTGGCCTCAGTGATTATACTCGGCATTGTTTCATCCGAA
AGTCACAAAAAGAATCTAATTTGTTTCCCTGTTGGATATAGTTTGACTAG
CAAGGATAACATGATGGTTTTACAAACAAAAGTGTTTCCCTAGATTTGTA
AGATCACAAAACAATCAAAGAAAACCGATTATTCCTTTGAACTGGACGGG
ACTCCTGCACATACGGTAAAAATTGCGCAGGATTGGATGGGAATAATAAA
TAATGGTTTCTTTTGTTTGGGGTATCAGAAAAATAAGACAAGCTAACCAA
ATAATTGAAATATTATTTGGGGGTTTACAAAACTCCACCAGCTCTGTTTA
TCTGGAACTTTCGGTGTATATTTATTTATATCATTTATTGAAATGAATCT
ATTGAAAAAGTATTTTCTCCACATTTTCCCCCCATGATTTCGAGTATCAA
AAAATGGCAAATTACTTCTGTNNNATACTAAAAAAATAATTTCTCCTCCT
GATATTTGCTGCGTATGTAAAAAAAMMAAAAAAAAACAAGGATGCCAGCA
GACCTCAAAAGTGCAGTGCGACCCGAMATGTGCACACCCATGTACAAACA
ATATAAATTAGGTTGTTTCCCATGAGTCTGATAAAAAAAATGTAGGTTTA
TAATTAATTCATAGTTGAAATTAGAGAATGGGGGATTGATAATCTATACT
GACAAAATTTAATAGAACAATAGAACCAAGMCMCCGCGTCTTGGTTCTAT
TGCACCGGATCCAATTCTAACGGCTATGACCGCTATATTTACAACTCTGC
TTAACATAGAACGATAAGTGGGGGAACCACATCCCAACTCGAAAGAACCA
CAACTCTCATTCATAGAACAGAAAAAATGATATTCCTCAATTACTAGAGT
GATTCAGCTCTCTTTGATGAAAATAACTTCCAGTTACATTGCTAATATAA
ATACTGATTAGTGGGGAACCTATACTGCGGCCCTTGTAACAAACGAGAGA
ATAATTTATTATTTTTAATGGTCCATTTGCTTACATTCACTGCCAAATGA
TGAGCCTCTGCCCAAGATGGTCAAGTTCATATGTATGTTTGAGTTAAGGT
AGAGTACTAGAAATGTTCATTTTCGTCTTGAAAAAGAGCCCCCTCAGACC
TTCCCCCCATCCTACTTCCTCAAAATAAGTCTTCTTAGCGTTATCACCTC
CTCCATTCATATTTAAATAAGTAAATAAAATATAAACTTTTCTTGAATTT
TTTTGAAGTACTAGAGGAACAAAACGCTAAAATAATATTTTTAGCGTTCA
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GGGGCCCTAACAGATTATTTGATCTTTAAGAGGAGGAAGAATCCTGATTG
GGGTTGAGTTTTGTTCTAAAATAAACTCCTTATGGAGGCTTTGTTCACAT
GGATATATACTTTATTATTTGGAAGTGGATTGATTATTTCATTAATGGCG
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CCGTAATGAACGATCCCCTCCATTACCTCATCATTATTTTTTGGATATGT
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GAAGTCATGTTGACCTCGTTTGGCTATTGACAAGGGATACTTGAGACGGA
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TGGGTAGCCCCAATTCAATTTATATGTGTTATGCTAATAACATCTTACTT
TGCTGGGATTGAGGCTGTAGCTGGTGGAGCTCTCCTCATTTTTTTCATAT
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