EMLSAT00000000932, EMLSAT00000000932-696779 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000932
Unique NameEMLSAT00000000932-696779
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1162supercontigLSalAtl2s1162:218260..246386 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000932 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000932EMLSAG00000000932-683698Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000004095EMLSAE00000004095-713023Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004096EMLSAE00000004096-713024Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004097EMLSAE00000004097-713025Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004098EMLSAE00000004098-713026Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004099EMLSAE00000004099-713027Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004100EMLSAE00000004100-713028Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto774719auto774719Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000932EMLSAP00000000932Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000932

>EMLSAP00000000932 ID=EMLSAP00000000932|Name=EMLSAP00000000932|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=137bp
IIVGAPEDESFFQGEVGINRPGSVYKCNNNISGTTIDDKSLQWFGASLYS
SGEDGIVVACAPRYVYFSLNRQRREPVGTCYTATDSFSKFSEYSPCRTVA
WGFHQQGYCQAGFSCAISDDRLFIGAIGAYYAQAHIL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1162:218260..246386+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000932-696779 ID=EMLSAT00000000932-696779|Name=EMLSAT00000000932|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=28127bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1162:218260..246386+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATTATTGTTGGAGCACCAGAGGACGAATCTTTTTTTCAAGGTGAAGTTGG AATCAATCGACCCGGTTCTGTGTACAAATGTCAAACTGTATGGCCTTTTG ATTGTGATCAAATTCCTTTTGATACAATGGGTAAGTTACATTTCCTAATT AAAACTCCGCTCTCTGTTTATGACATTTGAGGGTTAAAAAACAGAGATTT TATTTTTAAAAAAACTGCTGCTATATTACTAACCCATAGTCCTCATTTTC TCGGAAATATCTTCTTCTTACGTCTTTTACAGAGCGTCCGTGGGATTTAT GAAATATCCGGTTTTGATGAGTTTAATAGATTTATAGAACGTAAAAAGAG AATATATTTCTGCAAAAGAGTACGATGGGTTTTTTCTAACTGAATATTAA ATATGCATTTACTTAAATATAAAATAAAAGTCAATTGAAGAATAAAGTGT TTCATTTTTGTATTTTAAAAAATCTAAGATAATTAACAATGATCAAATAC CTATGTATTATATTGTTAGAGAATGAAAATGTGAAAATTTGCTCTAGTGT GTTTTTTCTCAGTTTGGACGCCTTAGACTACATCTTGAGGGGTCTAGACT GGATCTTCAGCTCCTCCCAAGAACCAACTAGGAATAGACCCTTGGGCTTT GAAAAGTTATAAAATTGAAGATATTTTCTCTTTGTTTCGGCCGGTTTTTG TTTTTCTTTCTGCGAGAGTGTACTCTTAGACCTCTTATTATTGTTTAGAA AACTAATATATTTTTTCTCTTCATATGTAAATATCTTTTATAGAGCTTTG ATCAACTATGAATTACTTGCCTGTGTAATTCCTGGCTCGAATTCCTATGA TAATTTTTAAAATATATAAAAACTTCAAATAACAAAAAAGAATACCATAA AAAGTTTTTCTTGAAGAGCATCAGGGTGCATTTTGGGAAATCCTGTCTCG 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