EMLSAT00000000933, EMLSAT00000000933-696780 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000933
Unique NameEMLSAT00000000933-696780
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1162supercontigLSalAtl2s1162:40054..58981 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000933 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000933EMLSAG00000000933-683699Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000004101EMLSAE00000004101-713029Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004102EMLSAE00000004102-713030Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004103EMLSAE00000004103-713031Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004104EMLSAE00000004104-713032Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004105EMLSAE00000004105-713033Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004106EMLSAE00000004106-713034Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004107EMLSAE00000004107-713035Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004108EMLSAE00000004108-713036Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770274auto770274Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000933EMLSAP00000000933Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000933

>EMLSAP00000000933 ID=EMLSAP00000000933|Name=EMLSAP00000000933|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=750bp
MVGGCCVCSDERGWDENPLVYCDGVCCSVAVHQACYGIVCVPTGPWFCRK
CESQERSARVRCELCPRRDGALKRTDSSSWAHVVCALYIPEVRFGNVSTM
EPIVLGLVPPDRYIQSCYLCVKGGRQNRASCGACMQCNRPGCKQSFHVTC
AQSQGLLCEEAGNYLDNVKYCGYCEYHYSKINKKVIKTIPAYKPVSSSIS
SLSPCSSPDKMEIKSCATNTSTFNKKNKKSRCHRSGSVPYTSNISTITLM
NSITDNSRASTQLVTLDSTPSSKSSQVFISDLQPANEEIRMCATSLSSKF
SELDQLVCSRSTKEEDSGSEVNEVLSIENSTVFKIDDVGPVSQSTKNDGK
LISSEKLEVRDVSNKVINEPNSNDSKISAKQGSEVHLNSVDILKTSPVPS
SSTCKELELLVSQNANMQSTSVPPVFTSSPQTCDSSINNPTPSIISSSVV
TQISSEVPINAKSEEVSRTTVHSEISTVLTDVINHSDDLNLEKAVIESTD
EYAFSQENNAKDLSVRSLYNGVNKRGIGRPPGKGAQIPSDSISTSGLVEQ
FSYSSDNQTARSPISSPELESASSLKKKRKRLSNCIKLPTSVSNTGNEKA
STVWMMGTSINPTSNVAKEMNVVLENEITSHSSYEGLFQENLVGVSVPIK
NEKGMSDISSKRYHIQPQSLKDLLERQWEQGSHFIMEQASHFDIASLLSS
LNQLKEENVELEHNVDKLIQRRDHLLAVRARLMAISINNVQSSGMCQFSE
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1162:40054..58981-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000933-696780 ID=EMLSAT00000000933-696780|Name=EMLSAT00000000933|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18928bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1162:40054..58981- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGTGGGAGGGTGTTGTGTTTGCTCTGACGAGCGTGGGTGGGACGAGAA TCCCCTGGTGTACTGCGACGGGGTGTGCTGCAGTGTGGCCGTGCATCAAG GTAAGGTGTCTGTGTATTGTGTGGGCCAGTCCAGTTTCTTTGCTTGAGTT GCAGCCTGCTATGGAATCGTGTGCGTGCCGACGGGTCCTTGGTTTTGCCG CAAGTGCGAGTCCCAAGAGCGTTCAGCGCGAGTGGTGAGTCATGTGTGCC ATGTGTCCCCTGTTTGCTCATAGCTGTTTGTTGCAGAGATGCGAGTTGTG CCCACGGCGTGACGGAGCGCTGAAGCGAACGGACAGTAGTTCTTGGGCAC ACGTGGTGTGCGCCCTCTACATCCCGGAAGTCCGCTTCGGCAATGTGTCC ACTATGGAGCCCATTGTCCTGGGTCTGGTGCCGCCAGACCGATACATCCA GTCTTGCTACCTTTGTGTCAAGGGCGGCCGCCAGAACCGCGCCTCCTGCG GGGCTTGCATGCAATGCAATCGACCGGGGTGCAAACAAAGCTTCCATGTC ACTTGTGCACAAAGTCAAGGTCTCTTATGTGAGGAAGCTGGGAATTATTT GGACAACGTCAAATATTGTGGTTATTGCGAATATCATTATTCCAAAATAG TGAGTCACTTCTTTCCTATTTTCAGTATTCATTTACAAATTTGGAAATTT ATTATTTCTTTTCAGAACAAAAAGGTTATTAAAACCATTCCTGCTTATAA GCCTGTGTCTTCCTCAATATCCTCCTTAAGCCCTTGTTCAAGTCCAGATA AAATGGAAATTAAAAGCTGTGCAACGAACACTTCAACTTTTAATAAAAAA AATAAAAAAAGCCGTTGTCATCGTAGTGGATCTGTTCCATACACCTCCAA TATTTCTACGATCACATTAATGAATTCTATTACTGATAATAGTCGAGCTT CAACACAGTTGGTTACATTAGATTCAACCCCTTCTTCTAAATCATCACAA GTGTTTATCTCGGACCTGCAACCTGCTAACGAAGAAATAAGAATGTGTGC AACATCTTTATCTTCTAAATTTTCTGAGCTTGATCAATTAGTTTGTTCAA GGTCTACAAAAGAGGAAGATTCTGGGTCAGAAGTTAATGAAGTTCTGAGT ATTGAAAACTCAACTGTATTTAAAATAGATGATGTCGGGCCAGTTTCTCA ATCAACCAAAAATGATGGAAAGTTAATATCTTCTGAAAAATTAGAAGTAC GAGATGTGTCGAACAAGGTTATAAATGAACCAAATTCAAATGATTCAAAA ATATCTGCGAAGCAAGGTTCTGAAGTTCATTTAAATTCTGTCGATATTCT TAAAACATCTCCAGTTCCTTCTTCCTCAACTTGTAAAGAATTGGAATTGC TCGTATCACAAAACGCTAATATGCAATCTACCTCTGTTCCACCAGTATTT ACATCATCACCTCAGACTTGTGATTCCTCAATTAATAATCCGACTCCGTC TATAATATCAAGCTCTGTTGTAACTCAAATTTCTAGTGAAGTACCAATTA ATGCTAAATCAGAAGAAGTGTCTAGAACAACGGTCCACTCTGAAATTTCA ACTGTCCTTACTGATGTAATTAATCATTCCGATGATCTCAATCTTGAAAA AGCCGTCATTGAATCAACTGATGAATACGCGTTTAGGTAAATTAATTAAA GTCATGTCTCCATAGTCCCAACTCCTATTCACTTTTCTTTACTTGAGAAA TACCCCCCCTGATAAAATCAGCCAGAAATTTTTCTAAAATAAAAAAATCT TACAAAATAAATTCAGTAGGAGCCATTTTTATAGAAATGTGACCTCTTTG CCCAGTTGAGCGCGAGAATATGGAAGTGTTAAACAATATATATCATTTTA CTATTACTAACTACCAAAATAGAGCAGAGATTAATATAAAAATATTTAAT GTAATTCTTAATATTTACAATTCCATAAATGCAATATCACTTTTTATTGT TAGATGGGTTAATGCATCTATCGTGTGTGTATGCATATATANNNNNNNCT GTAAGTATATGTGTGTCTGAGCCCTCTTTATCATTAATGTAGCCGCCCAT AGCGGTAATGACTGCTTCCAATGCGGGGTGAAAGGCCTCTTACCCGCTGC AGATGTAGTCATCCATCATAGCGTCCCAGAGCTAGCTTACYGTGGCTTTG AGGGCCTCAGTGTTTGTATGACGGGCACTGCAGGACTTTCCCTCGACATA CACCCAAAAGGTGTAGTTGACGGGGTGGGCATCAGAGCTGTAAATGGGTC AAAAGTGTGAAAAAGAATTTTGCAATGTACGAAATGGGTTCTTTCATTGC TGGTGCCAAAAGAGGTATTTCCACACACAATGCTATTTCTGTGAACTTTT TTTTAGCTCTCTGAACAGTCTGGTGTGAAACCCCCAATCTCTTGCATGGA CTTGAGGGAATTTGCCTGGGCTGAAACTCCTCCGGGTCCAGTTTGGCGTT TTTGACAGAGAACTTCTTATGTTTTTCAAGTTTCAGACTTGCTGGATACG CCCAACTGCTTTAAGTGCACAAATGGAAATTCGCAGATCACGTTCAAGTG TCATTTTCTGGACTTGTACATAAGCTAGAGAGCTCAGGTTTGTTTCGTAA TTCACTATTGATACTTAAATATATCGAAATATGAATTAATTTACATCACT CAACCTTCATTAATGATTGATTTAGTAAGTGTTCAGATTTCAATGGTCCA CTAGGTATACTCTTAGACGTGAGCACGCACGATAGATGTGGTCACCAGTC TTAAGCCAATATTTATTAATGTTATATTACATTCTTGCATTTTCTTATTT TGTCGTATAATTACAATTTAGGACGTTTGTTTTCTAGAATTTGGTAACAA ACGTCTATGATCTTCGACTACCAAGAGGAAGAATTGCAATTATGATTAAT CCAATGTTCATAAACCACTGTATTCTTGAATCAGACCAACTCCACCCTTG GCTAGATTATTAACAACTTTTAGTTGTTCTAAAGTATATTAAGCCTCACT ATAATCATTTTTGCCAACTCCATACCTTTGGGTTGACCAAAGGGAATTGC TGAATTATTTTAATCTTAGGAGAAGACGTCGATCACATACATGCTTAAAA ACATAACCAATTAAAAGTTCTATAATATGGTGTCTATATGCAAGGTGCAA GATCTGCTTTCCAATTTTTTAGACAAATACAGGCTGCAGCATTCCTACCT GCATTTAATTTTTTGTGTCATAGCACATGAATTTAATACTGCCACCTATA GTCAAGTCTTGAATTTTTTCGTATACAAAATAAGCTTAAACCTCACATAT TCCGGATGTAAGCTTAGCAACGTGAAATAATTTAGAAATCTTATTACCTA AAATCGATAGGGGCTGTGCATTAACCTTATTTTCCCATACGACACCTTCC AATTCATTCTGTTGAATTACAATAACCAGATTACTTAGGATATCTGTCTT TATTTTAATAGCTTTTGCTCGCCGAAACTCTGTTCGTTTTCAGTGACTTG TGACTCAATGGTATGCAAATTGATCATTTTTCTAGTCCATGGTTTTATAT GTATCTTCTAAAATAAACACAACTTTTCGATTCTATACTACATAATACAT TTATATTTTTAGTACGTCATTGCTTTTAGCCTCAAATGACCGCGTCGTCA ATTTCATATAAAAATGAATCGTACAAAATTTATTTTGTAAAACTTTTTAT TTTACAAAAATTTCTGACTTATCGTTTAAAATTTATATATATATAGGTAT 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