EMLSAT00000000940, EMLSAT00000000940-696787 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000940
Unique NameEMLSAT00000000940-696787
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1166supercontigLSalAtl2s1166:1016..21423 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000940 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000940EMLSAG00000000940-683706Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000004161EMLSAE00000004161-713089Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004162EMLSAE00000004162-713090Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004163EMLSAE00000004163-713091Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004164EMLSAE00000004164-713092Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004165EMLSAE00000004165-713093Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004166EMLSAE00000004166-713094Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004167EMLSAE00000004167-713095Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto768072auto768072Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000940EMLSAP00000000940Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000940

>EMLSAP00000000940 ID=EMLSAP00000000940|Name=EMLSAP00000000940|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=738bp
MGPKKNKKGGKKGADEDWGDSDKALEEKMKKLMALNDEEKPEEIGASTKG
DALKGKPGKKPTKMEGEEELSDAXAAPLEDKSSKKKSKKKDKKFDISKAM
AEAEEAENGGTVSGEKDVTPNLESVPPEEEEDEEGNDMKGKVGMSHKEKK
ELKKKKKMQEEIDRISKKGGEGHSELNENFTVAQALKTDIVIEKFSIAAK
GKDLFRDAKLQITHGRRYGLVGPNGHGKTTLLRHIGTRSLQIPPNIDVLI
CEQEVVANEMSALETVLQSDEKRTALLKECKDLEKKQENGVDVTERLNEV
YDELRAIGADQAEPKARRLLAGLGFDKEMQERSTNKFSGGWRMRVSLARA
LYIEPTLLMLDEPTNHLDLNAVIWLDNYLQNWKKTLLVVSHDQSFLDNIC
TDIIHLENCQLWYYKGNYSMFKKMVVQKRRERIKEFEKQEKRLKELKASG
QSKKKAEAKQKEALTRKQLKNQSKLTKEDDSGPTELLEKPREYLVKFRFP
ETSHLQPPFLGLYNVSFKYESQNPLFKSVDFGIDMESRIAIVGPNGVGKS
TFLKLLMGDLEPTKGEMRKNARLKIGRFDQHSGEHLTADEXPTEYIMRLF
NLPVEKARKQLGSFGLQSHAHTIKMKDLSGGQKSRVALAELTLSAPDVVI
LDEPTNNLDIESIDALGDAIREYKGGVIIVTHDERLIRDTECQLWVVEEQ
TINEIEGDFDDYRKEVLDSLGEEVNNPSLIANQAVVQS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1166:1016..21423-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000940-696787 ID=EMLSAT00000000940-696787|Name=EMLSAT00000000940|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=20408bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1166:1016..21423- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGGTCCGAAAAAAAATAAGAAGGGAGGTAAAAAGGGAGCCGATGAAGA TTGGGGAGATTCGGATAAGGCTCTGGAGGAGAAAATGAAGAAATTGATGG CACTAAATGATGAGGAAAAACCTGAGGAGATAGGAGCCTCAACAAAAGGA GATGCTCTAAAGGGCAAGCCGGGTAAAAAGCCTACAAAAATGGAGGGYGA AGAGGAGCTCTCAGATGCGYCCGCCGCTCCTTTGGAAGACAAATCCTCGA AGAAGAAGTCCAAAAAGAAAGATAAGAAGTTTGATATTTCCAAGGCAATG GCTGAGGCTGAGGAGGCAGAAAATGGAGGRACTGTCTCTGGAGAGAAGGA CGTGACCCCTAATTTGGAGTCTGTTCCTCCTGAGGAAGAGGAGGATGAAG AGGGCAATGATATGAAGGGAAAGGTTGGAATGAGCCACAAAGAGAAAAAA GAATTAAAAAAGAAAAAGAAAATGCAGGAGGAAATCGACCGAATATCCAA AAAGGGTGGAGAAGGACACTCGGAGCTCAATGAAAATTTCACTGTAGCTC AAGCCCTTAAAACGGGTGGAGCCCTCATTCAATTAGAAACNATCTAAAGA TATTGTAATAGAGAAATTTAGTATTGCCGCAAAAGGAAAGGATCTTTTCC GTGACGCCAAACTACAAATCACTCATGGTCGCCGCTACGGTCTTGTTGGA CCTAATGGGCATGGTAAAACCACACTTCTTCGTCACATTGGAACCCGCTC TCTTCAAATCCCTCCCAATATCGATGTACTTATTTGTGAGCAAGAGGTTG TGGCCAATGAAATGTCTGCCTTAGAAACTGTGCTTCAGTCTGATGAAAAG AGAACGGCTCTTCTCAAAGAATGCAAGGATCTTGAGAAGAAACAAGAGAA CGGTGTGGACGTAACAGAGAGACTAAATGAAGTTTATGATGAATTGCGAG CTATAGGAGCGGATCAAGCTGAACCCAAAGCGAGGAGACTTCTCGCAGGT TTAGGATTTGATAAGGAAATGCAGGAAAGATCGACAAATAAGTTTTCTGG AGGTTGGCGAATGAGGGTCTCACTGGCTCGTGCATTGTATATTGAGCCAA CTCTTCTCATGTTGGATGAACCGACAAATCATTTGGATTTAAATGCTGTC ATTTGGCTTGACAATTATCTTCAAAATTGGAAGAAAACTCTATTGGTTGT TTCTCACGACCAGTCATTTTTGGATAATATATGTACTGACATCATTCATT TAGAGAATGTAAGGGCATTAATTCATACATTGAGGATGATATAAAATGTA AGTCATTTTTCTTTTTAGTGTCAATTATGGTATTATAAGGGAAATTATTC AATGTTCAAAAAAATGGTCGTTCAGAAAAGGCGAGAAAGGATAAAGGAGT TTGAGAAACAAGAAAAAAGACTCAAAGAACTTAAGGCTTCTGGACAGTCC AAGAAAAAAGCTGAGGCCAAACAAAAAGAGGCACTCACTAGAAAGCAACT CAAGAATCAAAGTAAACTTACTAAGGAAGATGACTCTGGTCCCACGGAGC TCTTGGAAAAGCCCAGGGAGTATCTTGTCAAATTCAGATTTCCCGAAACG TCGCATTTACAGCCTCCATTTTTGGGGCTATATAATGTTTCTTTCAAGTA TGAATCGCAAAATCCTTTATTTAAAAGTGTAGACTTTGGTATAGATATGG AGTCAAGAATAGCTATTGTAGGTGAGTCAATCTGAAGCGTTTTAAATATT CTTCCCATTCTACGTCAGCTTGTGTTTTATCATAGGCCCCAATGGTGTTG GGAAATCAACGTTTCTTAAGCTTTTGATGGGAGATTTGGAACCAACAAAG GGGGAAATGAGAAAGAATGCCCGTTTAAAGATTGGACGCTTTGATCAACA 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ATCAAAGATAATTTCGCCTTAATATATAAGTAATTGAAGTTTATGCGTCG TTATTGTTTATTTTTGGTTGAAATCAAAATATGCAATATTTATTACTATA AAATGCATTAAAGGTATGTTTTCGGTTGGAATAATGATTGAATTATGCTT ATGCCTCATATTATATTTGTTCTTTAATCTACGAGTATTTTCTAATATGG ATACTCCATCATGCCTTATGACCATTACTAACGTAGAAGTAATTAGCAAT GGTTTGTTATTTTTTTTTCTTNATTATACTAATTTTATTACGTATTTTAT CTCTGGCTCGAATTCATTACACAGTGATCATTCTTTGTTATATGCATTGG AATTTTGGGTCATGATTACATCATTTTTCCAATAGAAAACAACCATTTAA TGCGTTTTATAGTAATAATAATTACATATTTTGATTTAAAAATTCTAAAA GAACATAAATTTTAACCAAAAATATCAAACACGACATATCAATCTCATTT ATTTTTATATTTAGGAGGAGTATCCTTGAGGCAAAATGGCTTTAAGGCAA ACTGTCCTAAGGCGAAATGGGTTTAGGCAAAATGCCTTAAGCCAAAATAG TTTAAGCGACATGTATATGTATACAACACCATTTTTAGTAAATTATATCA TCTTTAGTTTAATAAAGTAGTTATATATCCTTGAAATGTAAACATTATTA TATAATCCAAACCAAATAGTACCGTTTAGTAAAGAATTTAAGATATTTTG CCTGGTATATGCATTTTATTAATATGGTATTTATAACTGGTATAAACTAG AATTGACACTCAGAAGAACGCAGGCTTTCGCTTATGGTCACTTTTATTAA ACCTACATAAGGACAGGTAGCAGGTCAAAACGTCAAMAGATAGGAACGAT CACAAACTCCCATTTATAACTTTAAATTTGGGGCTATTTCGGGTACCRCC 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