EMLSAT00000001232, EMLSAT00000001232-697079 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001232
Unique NameEMLSAT00000001232-697079
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s11supercontigLSalAtl2s11:92808..120237 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001232 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001232EMLSAG00000001232-683998Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000005365EMLSAE00000005365-714293Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005366EMLSAE00000005366-714294Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005367EMLSAE00000005367-714295Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005368EMLSAE00000005368-714296Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005369EMLSAE00000005369-714297Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005370EMLSAE00000005370-714298Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005371EMLSAE00000005371-714299Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005372EMLSAE00000005372-714300Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005373EMLSAE00000005373-714301Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005374EMLSAE00000005374-714302Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005375EMLSAE00000005375-714303Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005376EMLSAE00000005376-714304Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000005377EMLSAE00000005377-714305Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771930auto771930Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001232EMLSAP00000001232Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001232

>EMLSAP00000001232 ID=EMLSAP00000001232|Name=EMLSAP00000001232|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1082bp
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LWSNTHRHSGSDFYYNLTSIIDENGEEDDEFFNGDLSRGPRVHGFENKKF
DANYVPSIMHRPDSELVLKVMDSDFPQQDELIGVISLPLEEVCHRSVKEY
SCLILHEKNKSGDMINVTDAAKLNFKISSLRDEITELKKKLNYSESVLAM
LRTQNDKLRVDAIESVLYFDQNQEEVEEPIDGKKDDKTRVYSLLKSLKFS
LEDKDEEISTLKTQVAELKSLLVTSSAIWGQLELGLSYFALGAKLRIDII
SARNLKPVNLFGNHSDPYVKLKVHLDRSHRMNSRPSSSMSALNIRKMSAS
WDKWEFHTKTCWKTRTPSWNEHFIIPDEITTRDLDHISLEFIVKDDARIR
KELQPLVNLRTFTSNMKHDYFPKDCPLSQVQFEIVTGFVFTSPDDMLDSR
PGTLMLTDCIELCKQNSTCKSANFETGLCVLFQSSANEFPEGLTTSQFPV
FTLYIQKVCLRTGSESCKRAWSFEKIDGYSLETYAKKRIISSGRSNCEEL
CLLERDFPCRSATYDPLTGNCLLSDMDRHTVAGTPGTYIYSKDFIYLENN
CVDDPVKLCDFQLLKHKIMKTVDSVYQDVPTMEACRDLCLAAPYRCHSFD
YGDTGDRVCRLSHHTSNTLILIKEPYLIIDDIVGTYELSSCYNVTIDCRT
SDMVATVRTNKIFNGKIYAKDNPNSCVVDVQNGIEFSIKMAYNDIECNVK
RKSDGVYANEVIIQHHDRIVTSTDLGLALNCQYDLTNRTIQNDFDLSIKG
AIEPSLFREEVVESPNVLMKVTGRGGNELNSAQVGDPLELRFKISDYESP
YEIFVRDLVAKDGNDQTEISLIDSRGCPSEGNIMGPLRSVQGAKIFTLAA
EFDAFKFPTSEIVHFRAHVTPCIPKCKPVRCNAYEGGHHIEVDSYGRRKK
RYAPREEEEXNQGSKMLVTQAFYVSDKFKGERRRSSSSPQRNQTNTDHFF
NDETMDSSSSTKESVHRESNDICMNLTGIMVAVGVFILIQIGLGLVWNHI
RSRRNISKQQENGDFNSNAVIFNPYNHHSRHR
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mRNA from alignment at LSalAtl2s11:92808..120237+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001232-697079 ID=EMLSAT00000001232-697079|Name=EMLSAT00000001232|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27430bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s11:92808..120237+ (Lepeophtheirus salmonis)
ACGACATTGTCTTATCACTTTTCCTGTTTGGCGCATTATTTCATCGAATA AAAGGATATAAACTTTTCAATTGTTCCAAATGTACTATGGGATTCAAGAA ATGTAGACTTCGAATATCAAATCTATGGTTTCAATTTAAAAGCTGCCTTG GTTGTTGCTACGTGAGAGTTGAGTCAATTACTAAATAAAATAAAATATTC TTAATTTATTTTGCAGGATTATTCCTTATCAGACGAAGACGAAGAGGAGG AAACAAAAAACGGGAAAGGCATTAAGAAAACGTTAACAAGACTTTGGAGT AATACTCATCGGCACTCAGGATCGGACTTTTACTATAACCTAACCAGTAG GATTTTTTTTATTAATAACTTTGATAATTCGGTCGTAGTGAAAATATTTG ACATTCACATATAGTTTTATTTATTCAAAATAACATTTTTAAGGATTGCT AAAAATAATATAATCTTTTTAGTACTTTCATGTTTCTCTTCTGTATAAAA TTCATATCAAAATTTTCTTGAAAAATGAATTTGTTTAGACTCTCTGTTTT TCACATCTCTAACCATGTAAAAGGTGATAAAAATGTAAGAGAAAAATTTT TCGAGTTCAGAATTTTTATTTGACCTAGGAGACAATTCGGATTCTTTTTT TTTTACTTAAATACTGTTATGTACTTCATAAACTTGCACATCTTAAAATG CAAATGATATCCTAATATTTACCAATATAAAATAAAATTAAAGTAATAGA AAAAAATGTCTGATATTTTGTTCTTCTAAGTTTTATTTCTACTACTTGAT GTAGTTGAATAAATATACTTAATTCGACAAAAAGATTCCTAACTATACAT TACTTTTACAATGAAGCAAAAATGAACACGTTTAACGTTCTTTATTAAGT GTTTTGGATAGACATGGTACATAGTTTCGTGCATTAAGAATATATTCAAA CTTTATTGCCTTGACCAAGTGATTCATTCTTTTCTGGTCCGAAGATCTCT ATAACAAGAGATGAATATAATTATAAATCTGGTCACAAATAAAATTTATG TAAACATACTTGGTTCAATTTGACCCCTTGATTAATCATAAAAGGATTTG TGGAACACCTGTAGTATATTTACGAGGCATCCATGAATAGTGGAACCCTG GCTTGTACCTCATTTTCTCATTATGAAAGGAGGAAAACTATAATAGTTGA TAATAAATGATAAATGCAAATCATTTCAAGGGAGCTGAGTTTATACAAAT AGATTCTCAKAAGCCGTATGAATAAAAGTATTTTCATAAATGGAGAAAGT GGCTGCAAAAATATTGACAAAACCTAATAAATCCAAAAAGCTTGTAACTA TTTGTGAATATTTCATATCCTCCAGATCAAAGATGAGATTTATCCCTAAG ATATCAAAACCTGACTCTGGGTTATATCCTGACAATAATTTAGCATCCTT AAAATACATATGGCCTTGTCTTATCATATTTGTTATTGTTATTTATTTTT TATTATAATGTATTATAATAAACTTCATAATCAGTCAAGTCAAATGACAT TGAATTGTTACATCTGTAGACCATATTCAGATGACATTAAAAGGAATTAG GGTATGATAAGAATAGTTTCATTATATGCACACTAGATGTGGGTGACAAC AGGTATCGAGACTTATGTTAATGGAAAAGATTATCGCTCTACAACAAGAC ACAATATGCTTACAGAACTTATGATCCAAATTGTCCATTATGCCTTCCCT GAAATTTTAAATTGTACTATACTGTTGTATTTCTAGGGAGTATCACTTGT GTTGCTAAGTCAATGGGGAAATCAAAATATATTAAAGAATAATTCAATAA AACTTAGGAGGGAGTGGCACCAAATCCAAATATCATCTAATGTATTTGAA 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TAGGTAAAAGCTTTATTCAAGAATGTCCCGTATTTCCGTTATTGTTTGTG GCTGTAATGGAACAATTAAGTTGTACACTCATGCGGAAATATAGAGGTTT TGGTGTTTCCCTAGGAAGTAAAAGGCATTTGATTGATCTATATGCAGATG ATATTACANTGGATGTTGGAGAAAAAATGGACAGACAATTAATTGAAAAA ATCTAGATGTTACTTCCCTATTTTTATAACCTTTATCTATTTTTGAGAAT AAAAATTAATGTGGAAAATATTTCCATCCTTAATATTTGGCAATGGTGCG CTGTGCCTCCATTAATGTTAGGAGGCTGTAATGTAGTTGAATTTGTAAAG TTTTTTGGGAGTAGAATGCAAAAGATATCAACAATCTCGATCTAACTTTG TGAAGCTAAACTCTCAAGCCCACAAGTGGTGTCAGGTGGGAAGAATTTTT ACTTGCAAAAGAGAGTAGATTTATACAGCTCCCCATTAATTGCTCAAATT ATTTATGCGGTTTTACCCTCGGTAGGCGAGAGTCTCTTAAAGGATGAAGA AAGTTGGTTGAATACATTATTCGATAGGATATTAAAAACCACATAAGGAA ATTACATCTTCTTCAAATATGGGAGAAAATGATTATGTGTGCTTTGAAAG GCATCAATGATGGCCGAAAGAGAGTTTTAGACTTCAACTATTTTGATAAG GTTTGACTATATTCCAAAGACTGGGGACGAATATACTAAGATATCAAGCA CGCTTTTTTCCGCTATCAAGTTCTGAAAATAATTATAAAGATTTTATACT ACTGAAATTCCAAAATATTGTAGATTTTGAGCAAAGATAATGATGATTGT TTGTGCTATTTGACATTCTGACTAACAAAAAGCAGATGTGATATGAAAAA ATGTAATTAGTGTAGCTATCAGTAGTTGTAAAGCGTTTATTGATAAATAG 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GTGCCGTTTATTAGAAACAAGGATGAATACCCATTCGTTTATACAGCAAA TATTGAAAATCCTATAATTAAAAACAAATTTGTCAATTGATAAAATTTCA TGAAATGAGGTCACATTTCTAAAGAATACATATTACCTGTTTGTTTTCGT TTTTTTTGCACGAAAATAATTACTTTTGATTTGCATGTCTTGCTTATATA TGACAACTCCAACAATGGATTTCCTCTTCTTATTTACTTACTTAATAACA TACATATGTGCTTTTTTTATTATTCGTTTGTTCGTAAAAGGTACATGAAC TTGGAAGTTAATGTTATGTATGTATGTACACTTTTTGATGATACTTTTTG TATTCAAAATTAACGATCCTTGCATTCTAATTTGCTACTCATTTTAGTCT TGCTTTTGTTCATTAAGAATCTACTCTTTTTATGCTCTAAATGCATGTTT TGTCTTGAAAGAATGTCCAACAACATTTACGTACGTTTTTTAATGCTTAT GTCAATCCGAAAAATGGACGTGAATTATAGAATTTGATGAATTTTCGAGC AGAACATATTATCTATAAATAAGTTATGAATGCCGAATTTTATCTCGCTA AAATCATCTCTATATGAGATAACTATTATAATAATTTATTGGAGCCCTCC TTCGTCTGCAATCCCATTGCATTGTAACCCAGCAAACACTCCGTTGACAT ATAAAAATCTACGAGTATATGCATGTATAGCAATTTTTGTACGTTTGTGT AGTGTTTTACAGATATATACCAGCGTTATTTAACCATTAATTGATTCTTA TCTATAATATTAACTATTTAATTGTTAAAATATAGTTAGAAGCTATTTAA CTATATTTTTAACACTAACAAAAAAATAACAATAAACTAGCCTTCAAAAT AGAGCAACAACTTTTATCTAGCTATATCCTAGAGTTGATAATTGAAATGT 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TGAAGATATTTATCAAATTTATTTTTTATTTGACTAATTTTTTGATATTG GTTATGTTTTGCAATAATTTTTTATTTAAATTTTTAATAATTTTCTTTTA CCTTGTGTATGTACTATGACAAAAAAAATTAAATTAGAAATGCATTAATA TTATATTACTGTATAAAATACTTATGGCTATAAAAATATTTAATAATAAA GTTCAAAAATTGAAACATTCAATTCTGAAAAATTAAAGTAGAAAAATCAT ATTCTTTCAAGAATTTTCCTAGAAGACTTAACTATATAGGTATATATAGG TTTTGTATCTATTAAGGCTGAAAATTTATATAATGAATATAACTGATTGA TCGTTTTTTTAAAGCAAATTCATCAAAAGCAGAATAGAGTACATAAACAA NTAACTTTAACTTCTATGGGYCTCTATTAAAAACACTTTTCTATAAACTA TGTTAATTAGAGTAATTCCTCTGTTTTACATAAATTAAATGAAGTTGCAC GCCGAATATATAATAAATATATTATTATTCAGAAATAAATCACAAAAAAT AAGAATTGAATATATAAGTCACAGTCTAATAACTCGAAAATAGTAACAAA ATATTTTTAGTCTYTGACAAATAAGTATAGATTAACTATATACTTACAAG ACACCTAATAAATTATTATATGTACAGTGTTGTCTAGAATTAAAGTTCAA TTAACTTTAACCTCACTAAATTAAGAGTATTATGTGTACAAAATTCGTTA GTGAGTCAAAAATATTGCCACAAGAGAATAGGGCCCAGTTTACACTAATG GAAATAAAGTACGAGTAAAGTAAAAAGACAATATATATCACTTTAGGGAC AAAAAGTTTTGGCCCTCCTCTTCACTTGGTCTTGACTATGTATTGTAAAA TATGGTCAAGAGTAGGCCAGAGAAGTTTCGAGGCTCAGTATGGACTCCCT 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ATATTGTTTAAGTTGAAGAGGTATGTTTTGGAAATAATAGGTAGAATTAT CCAATGATAAGTTGCAAACATACATCACGGCGTTACCTCACTAATACCCC GAGTATTTTGCTGTCAGCTGTCGATTCCTTAATCTCACTTGATACGTCAG GGAAATGTTCCATCTCGTTTTAAACCATTTCCTNNNNNNNNCTGTATTAC TTTCGACTCCTGTCATCATTCTACTTGGGCACTCTGATGTTCCGGACTTT CCTTACGGTCATGCCAATAATGCTTGAAATTATTTTGGATCTACATCCGC GTCGAGAAAATCCGGAACCCTTTGCTTTAATTATTCCTATTAACTCATTT TTCGTTCGTTTTTGTTCAAATTAAAAAGTGCACCAAAAAAACCACAATAC ATTTATCTCAACATAGCTAGAGATATAACCTAAAACCATAATTACCGCAA AAAAAAATTAATTTAAATGACKCGKAWAAYTTCACCTTTGCACTCTGTGT AGTATACTTTTTTGTTTGCTGTTGATTTTTCTGCTTATGTTCCCCTCATT AGTGTTCTTGACATTAATTGATTGAATTTTAATTATCTTTTTTATAGCTG CGAACAATTTCGAACAGTTATAATTGAATAACAGTTCCATAAATGGGAAG TGTTGTCTAATTACTCGGAAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTTT GAACTCATTTTTCAGAGGAAAGGTTGCAATGTACAATAAATTTAATGACG 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