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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s11 | supercontig | LSalAtl2s11:92808..120237 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001232 >EMLSAP00000001232 ID=EMLSAP00000001232|Name=EMLSAP00000001232|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1082bp
MGFKKCRLRISNLWFQFKSCLGCCYDYSLSDEDEEEETKNGKGIKKTLTR LWSNTHRHSGSDFYYNLTSIIDENGEEDDEFFNGDLSRGPRVHGFENKKF DANYVPSIMHRPDSELVLKVMDSDFPQQDELIGVISLPLEEVCHRSVKEY SCLILHEKNKSGDMINVTDAAKLNFKISSLRDEITELKKKLNYSESVLAM LRTQNDKLRVDAIESVLYFDQNQEEVEEPIDGKKDDKTRVYSLLKSLKFS LEDKDEEISTLKTQVAELKSLLVTSSAIWGQLELGLSYFALGAKLRIDII SARNLKPVNLFGNHSDPYVKLKVHLDRSHRMNSRPSSSMSALNIRKMSAS WDKWEFHTKTCWKTRTPSWNEHFIIPDEITTRDLDHISLEFIVKDDARIR KELQPLVNLRTFTSNMKHDYFPKDCPLSQVQFEIVTGFVFTSPDDMLDSR PGTLMLTDCIELCKQNSTCKSANFETGLCVLFQSSANEFPEGLTTSQFPV FTLYIQKVCLRTGSESCKRAWSFEKIDGYSLETYAKKRIISSGRSNCEEL CLLERDFPCRSATYDPLTGNCLLSDMDRHTVAGTPGTYIYSKDFIYLENN CVDDPVKLCDFQLLKHKIMKTVDSVYQDVPTMEACRDLCLAAPYRCHSFD YGDTGDRVCRLSHHTSNTLILIKEPYLIIDDIVGTYELSSCYNVTIDCRT SDMVATVRTNKIFNGKIYAKDNPNSCVVDVQNGIEFSIKMAYNDIECNVK RKSDGVYANEVIIQHHDRIVTSTDLGLALNCQYDLTNRTIQNDFDLSIKG AIEPSLFREEVVESPNVLMKVTGRGGNELNSAQVGDPLELRFKISDYESP YEIFVRDLVAKDGNDQTEISLIDSRGCPSEGNIMGPLRSVQGAKIFTLAA EFDAFKFPTSEIVHFRAHVTPCIPKCKPVRCNAYEGGHHIEVDSYGRRKK RYAPREEEEXNQGSKMLVTQAFYVSDKFKGERRRSSSSPQRNQTNTDHFF NDETMDSSSSTKESVHRESNDICMNLTGIMVAVGVFILIQIGLGLVWNHI RSRRNISKQQENGDFNSNAVIFNPYNHHSRHR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s11:92808..120237+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001232-697079 ID=EMLSAT00000001232-697079|Name=EMLSAT00000001232|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27430bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s11:92808..120237+ (Lepeophtheirus salmonis) ACGACATTGTCTTATCACTTTTCCTGTTTGGCGCATTATTTCATCGAATA
AAAGGATATAAACTTTTCAATTGTTCCAAATGTACTATGGGATTCAAGAA
ATGTAGACTTCGAATATCAAATCTATGGTTTCAATTTAAAAGCTGCCTTG
GTTGTTGCTACGTGAGAGTTGAGTCAATTACTAAATAAAATAAAATATTC
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AACTTCGGAAACCTCGAATACATTTGGATTTGGCAAAGAAGAGATGAAGA
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AATAGAACATAACTTAGTCATTGGAGCCCTTTGACAATTCTTAATTAATC
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CTTTAAAAAATGACATATTGCCGATATTTTGCGAAATATTCTTACGAAAC
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AAAAATACCTTCTAATACGTTTTTTAGTCCAATACGTGCGCTCCTACTCA
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AAAAATTAATGTGGAAAATATTTCCATCCTTAATATTTGGCAATGGTGCG
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TTTTTTGGGAGTAGAATGCAAAAGATATCAACAATCTCGATCTAACTTTG
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ACTTGCAAAAGAGAGTAGATTTATACAGCTCCCCATTAATTGCTCAAATT
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ATGTAATTAGTGTAGCTATCAGTAGTTGTAAAGCGTTTATTGATAAATAG
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AGTTACATTTAACATAATCTTCATCAATTGGATATTGATTGTGTCTTAAG
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TGCCTTATCTATTACACACCTTTGGATTTGAGTACCATGATTGATAGAAG
GATATAAAATAGTATGTCGTTTAAAAGACATTTTTAAGAACACTCAAATA
GTATATTAATCAAAAATGTTTAACCTTAGTTTTTTTAGTTACTACAATAG
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TTATTGAACTTTATGTTTGTGGGGTATGTGTAAAACCGTTTAAAATAGGT
CTGTTAAACGGTATAATATTTCATTTATCTCCATCAATCATGGTACTCAA
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GAAATATTTTCGGAACGTAAAAAAATGGAATAAAAATAAAAAGTAATGTG
TTCAAGTCATTTTCATATACTCTAAAAAAAGTAAAATATACATTGATTGT
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TTTTTTGGAGTCTATCCCAATACCAATTTGGGGAGGGGGGAGGTATTAAT
AGACCTATTAATATTAAATTAAGCCAAAATATTGGAATTTTTACTACGGT
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AAAATGGATATTATATACTATAATTTTATGTTGGCATTATTTTTTAATTA
TAGATTCATTATTTTTTTACTAAAGGTCAATATGGATATACATAGAATTT
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GAGTGAAGGAACTTTTAAAAAGGATGTTCTTCATTTTATAATATTCTAAA
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TTTTTTTGCACGAAAATAATTACTTTTGATTTGCATGTCTTGCTTATATA
TGACAACTCCAACAATGGATTTCCTCTTCTTATTTACTTACTTAATAACA
TACATATGTGCTTTTTTTATTATTCGTTTGTTCGTAAAAGGTACATGAAC
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TATTCAAAATTAACGATCCTTGCATTCTAATTTGCTACTCATTTTAGTCT
TGCTTTTGTTCATTAAGAATCTACTCTTTTTATGCTCTAAATGCATGTTT
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GTCAATCCGAAAAATGGACGTGAATTATAGAATTTGATGAATTTTCGAGC
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TTCGTCTGCAATCCCATTGCATTGTAACCCAGCAAACACTCCGTTGACAT
ATAAAAATCTACGAGTATATGCATGTATAGCAATTTTTGTACGTTTGTGT
AGTGTTTTACAGATATATACCAGCGTTATTTAACCATTAATTGATTCTTA
TCTATAATATTAACTATTTAATTGTTAAAATATAGTTAGAAGCTATTTAA
CTATATTTTTAACACTAACAAAAAAATAACAATAAACTAGCCTTCAAAAT
AGAGCAACAACTTTTATCTAGCTATATCCTAGAGTTGATAATTGAAATGT
TTGTTGTTAATGTACAATATTCCACTGTAGTTTACTTTTTCTCTAAGTGT
TTGAAATCCATCTAGTGCAGATGCTTGAAATCATGTACCCAATCATTTTA
AAAAGTTCAAAATCATCATATTTAATACAAATCTACAAAATTAATTTTTT
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AATAATATCTATTTTAAATACATTTGTACCTTTTTAAAAATTAATTAGCG
ATAACTCGCAAGCCAAATATTCATGAATGAAATAAATTATTGTTAAAATA
ATCAAGAAAAAGATGTTGCATTTGATATAAATATTAATCAGATTTAAATT
ACAATCAAATAGAACACATTTTCTTTCAAAATTAAACATTATACATAGTT
TGCACAAATGAATCATTGAACTTGTAATGCGGAAGAACCATAGATGCTAC
CTTATTTACACTTGATAAAAAAAGATACACCAATTAAGTTATTATTATGA
TCTTAAAGATGAAATACATACATACGTAGGTATATCATGATAATTTTTAT
GTTTTTCACGCGATTAGAGCCAATTTGCATTTGATTATCAAATAAAAATA
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TGCTCGCATTCAATCACAATAACATATAATATGTAGACATATACAAAATT
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AAAATGGAGAAGAAGATGATGAGTTCTTCAATGGCGATTTGAGTCGTGGA
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TGACCCCTATGTGGAAATATCAATTCGTCCTGGTCCCATTGGAAAGGCAA
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CTATTTATGAGAAACGGCATTTTAAAGTACAAATATGTGCACACATGTAG
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AGATATATACATAAGCCTAAAATGTGTAATTATTTAAGACTCATTTATCA
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TTTCAAAATACAAATTGATTCAAATCTACATACGAAGAAAAATTAGAAAC
GAAAATGCTACAAAATAAATTTGTTATGAAAAAACTAATAGTAAATGGGA
TTAGTGTGTCATGAATCAGGTATTAAATAAAAAATATATAAATGTTTGAC
TTTTGTAACAAATAAATTTCAAAAATATTGAAAAAATCAGGACAATTAAT
GAAAGCAACATTAGTTAGCTTCATAATATTTCTCCTCTCGTAGATATTAT
TCATTAAATAACTTTGAAAATCTAAGGTTAAACTACTATTATTCAATAAT
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AATATTATCCCATACCTACAATAAATCAATTTCTAAAATTATTAAAGAAA
GTGATGACTTTTTTATGATATCTGATGACTATTTTTAGCTATAATAAGAA
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GAGTATTTTGCTGTCAGCTGTCGATTCCTTAATCTCACTTGATACGTCAG
GGAAATGTTCCATCTCGTTTTAAACCATTTCCTNNNNNNNNCTGTATTAC
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CCTTACGGTCATGCCAATAATGCTTGAAATTATTTTGGATCTACATCCGC
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TTCGTTCGTTTTTGTTCAAATTAAAAAGTGCACCAAAAAAACCACAATAC
ATTTATCTCAACATAGCTAGAGATATAACCTAAAACCATAATTACCGCAA
AAAAAAATTAATTTAAATGACKCGKAWAAYTTCACCTTTGCACTCTGTGT
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TGATGTATATATTTAAAAAAACATTAGCAAAATCCCACTTACCCATATTT
TCATTTTGTCATTTGTTGATTATTTCTAGTGTCAGGGGCGTCAGCAGGKG
GKGAACTGGAAGGGRTGTATCCCCCTCTACAAAAAAAWACAAAGAATACA
GGAAGTTTTGCTTTTTAATTGAAAAGATAATTCTCTGTGAATAGCTATCG
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ATATTTGTTATTTTTTTACGATAAATTTTATTTTTTTGAGAATGACAATG
GATTTTCGAAATCTTTTACCAAAAAAATAAAAATTTCAATTTTTTTTTTC
CAAAAATTTAATCTTTCGTGAATAGTTGTTGGTTTCTGGAAAAATTTAAT
ATTTAAAAATTTAATATTTGGTGAATAGCTTTGAATTTTTGAAAAAAAGT
TCAAAGAAATTAATTTTTTTTTGTAATCAAATGTTGATTTTTGACTTTTT
TCCAATAAATTTAATTTTTTGAGAATAACTTTGGGTTTTCAAAATGTTTT
TCTAAAAAATCTCATATTTCAAATTTTTTTTCAAAAATTTCCGATAATCA
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TGGATGTCCAGTTCAGTCTCGGTCCGGTCCATTTCAGTCCTGTATAAAGT
TATAAAGTTTGGTGCTTGATGACGACACTAAACTTTATTTCTTCTTGTTT
AATCAGTTTTAGCAGTGATGAGGATTAGTCCCAAGGACATATATGCTTAG
GAACGGTCTTTAGACTGACTGAAACAAATAACTGACACTAAACTAATTTC
ATTACTATCGTTCTTTATTAGTGTTTTAAATGCATTTTAAAGTTAAAAAG
AAGGAGTTAATTCCTCCTAAGAGATTTTGGGCTCTCTGTTTCTTAGTCCT
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AGGCGAAAATAAATATCCTATAATGTTCTCTTCTCTTATTTTGAAATCGG
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TAGACTCAGAATTGGTTCTCAAAGTAATGGACTCTGACTTTCCTCAACAA
GATGAATTGATTGGTGTCATAAGTCTTCCTCTTGAAGAGGTTTGTCATCG
AAGCGTCAAGGAATATTCCTGTTTAATTCTTCATGAAAAAAACAAGAGTG
GAGATATGATTAATGTAACGGATGCAGCCAAATTGAATTTTAAGGTATTG
ATGACAACTACGAAGTTACATACATTTGTGTTGTTCTTTTCTTCAATGAA
TAGTGAAACTTTTTATGTATACCTTTTTATATAAATATATAATATATATA
AAATACATGTTACAAAGTGACGGAAAAGAAAAATATTTTATTGAAATATT
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AAATACTTTGTACTTATGAAAAAGAAAGTAAACATTGTCAAAATAATTAT
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AAAGAAGAAACTAAATTACTCTGAGTCCGTTCTGGCTATGCTTCGTACTC
AAAATGACAAGCTTCGTGTTGATGCCATTGAGTCTGTTCTATATTTTGAT
CAAAATCAGGAGGAGGTTGAAGAACCAATTGATGGAAAGAAAGATGATAA
AACACGAGTTTATTCACTCCTAAAGTCTCTAAAATTCTCTCTCGAAGATA
AAGATGAAGAGATTTCTACATTAAAGACTCAAGTTGCTGAGCTTAAATCC
CTATTAGTCACTTCCTCTGCAATTTGGGGACAATTAGAACTTGGTCTTTC
ATATTTTGCTCTAGGTGCGAAGCTGAGAATTGACATTATTTCTGCTCGGA
ATCTAAAGCCCGTAAACTTATTTGGAAACCATTCGGATCCTTATGTTAAA
TTGAAGGTTCCAAATTATATGTACTTTAACGGAACTTTGTTCAGTCAGTT
ATTTGTAACTTATTTTTAGGTTCATTTAGATCGTTCACACCGAATGAATA
GTCGACCATCTTCCTCAATGTCAGCTCTGAATATTCGAAAAATGTCGGCT
TCATGGGATAAATGGGAGTTCCACACAAAGACCTGTTGGAAAACAAGGAC
CCCGTCGTGGAATGAACAGTAAGTACTTTTTAAATCAATCTATAAAAATT
TTAGATATAGATAACTCAAACTTTTTTCTCTATGACAGCTTCATTATTCC
TGACGAAATTACAACAAGAGACTTGGATCACATATCCCTTGAGTTTATTG
TAAAAGATGATGCTCGAATACGTAAGGTTCGTCCTCTTGGTGCTTTACTT
ATATTTCCTGACTCAGAGCATTGGAGTAATATGATTAGCAATCAAGGAAC
TATCGTCAAAAAATATCATAATCTTGTTGAAATATAACTTTTAATCATTT
AATTACTATATACATATTTGTTTTTGTTTTTTATATCATTTATTGCAAAA
GTTACAAACAGATCTGTGTAGGTTGATAAATAAATAAGAGTGACATTTTC
GCTAATTAATCACGCGCAGCACAATTATCTCCTTTCGGATTTCTCACGAG
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ATTACTTATATAACTACATACTATACACTACATATACTCGAAGTGTGTAT
TTATACATATACAGTTAAATCAAAAGAAAATTTTTGTTGGAAAACTTTTT
TCACAAATTTTATAAGACATTCTACTCAGTTGTCATCCTAAGATCAACAG
GTTAACTCAAGTCACAAAAAACACTTCATATCATTAGTCTGCTGAAAATC
ATAAGTCCCTAAAATGTTGTTGTTGCACAGACATTTTTTACCACTTGCCC
TGTTCATGGTTMGTTTTTGGACACTGAATACAACTGCACAGGAGTTGCAG
CCTCTTGTAAACCTCAGAACGTTTACATCCAACATGAAGCATGACTATTT
CCCTAAAGATTGTCCCTTGTCCCAAGTACAGTTCGAAATCGTAACCGGCT
TTGTTTTCACGTCTCCAGATGACATGTTAGACTCCCGTCCAGGAACCCTT
ATGCTCACAGATTGCATTGAGCTCTGTAAACAGAATTCAACCTGCAAATC
GGCAAACTTTGAAACGGGGCTGTGTGTCCTCTTTCAATCTTCAGCTAACG
AGTTCCCTGGTATGTAAATAATCTACATCTACTTTTTTTTTTTTAAATAT
CCTATCCAAGGCCAAATGTTTAATAAATATTGGATTATAATTTTTTTTCA
GAGGGTCTCACGACTTCCCAATTCCCTGTTTTTACTCTATATATACAAAA
AGTATGCCTCAGAACCGGATCTGAAAGCTGCAAGAGAGCCTGGTCCTTTG
AGAAAATCGATGGCTACTCCCTCGAGACCTATGCCAAAAAAAGAATTATC
TCCTCTGGTCGATCCAACTGTGAAGAATTATGCTTGTTAGAGAGAGACTT
TCCATGCCGGTAAGGTTTTTGAACATAGTAGAGATAAGAGGCATTTTTGT
ACTCCGATCTTACAACTGTATGCCTCCTTTATTTAGTTATTATTTGTATT
ATATCATTATGTTTGCCATTGAATTATTAGGATTTACTTAGTGGTAATTT
ACTAGCTATACACTAGCGTAAAGCATTCAATTAATTATTGGTTATGTAGT
TACCAAATACTTCAAACAGTAGAGGAAATAATTATTTGATTCCATTGCCA
ATGTTGTAATTTTCCCACTGTTAAAGATTTTCTATGGGATTGAGGTCCAA
AGCCACTCCATGACCTTAGTTTGCTACCTCTTGTGCAACACTTTTGTGGG
CATGGCAATATATTTTGAGTCATTGTCATATTACAGAACACATTACACAA
CCCATTTTCAGCACCCTGTCCTGAGGGAAGGAGGTTATGGGCCAAAACTT
ATTAGTGCATAGGGGACATGCCCATTTTCCCTGTGATGCAGAAACAATCA
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TCTAGAACTCCGCTTCAAAATATCGGACTATGAATCTCCTTATGAAATAT
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CTTATCGATTCACGAGGATGCCCTTCAGAAGGCAACATTATGGGGCCTCT
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CCCTGCATACCCAAATGTAAGCCTGTGAGATGTAACGCATATGAAGGAGG
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CGAGAGAGGAAGAGGAGGKGAACCAAGGCTCCAAAATGTTGGTGACACAG
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