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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s120 | supercontig | LSalAtl2s120:12114..72426 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001271 >EMLSAP00000001271 ID=EMLSAP00000001271|Name=EMLSAP00000001271|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=747bp
MNSFETKCPAQQQQQSRLLRLKKASSLPHAVKDRVFIEGAEDESFSSSMK DSGIDSANYSELDLKDRDSISILPSTSKKDLSIVVSNEIESAHDTVQTFP SAEKSNSHQGADDSHENESPPIRKTLLSAIEEVKKLKNLKATLRQHYYPE GGFILFFSFSGWLGAMSTSVSLLISPFTIAVCRLKSTRLTAVLGGLITAL GCLFTSFASQFHQLFFSYGTMVGIGVGMSRDPTTLMVGQYFKRKRELMEI FLVSGSGVGLSIMSYFIKFAIGRIGWRLGLQALTGILFLSFFLGIFYRSA SLYHPQRRAILHLKSQKRKIKNKDKEKHNITIGNRIIDDNPPFLDFSSLR SRTVQIILLSISISSFGLNVPIYFLIQQAFLEGIRGHLLDLLQIYLGLAW TIGCVVCGIFIVMSTKECRVPRQYLCQGSLFLTGLSMFSLLAIEGYLGYV FFVWTYGVCIGAYNYTLKMYIYEKVRARNFARAWGFTQFAMALPNIIGVP ISGYINSYYGKRYGYILSAVSVMIGSLVMVAIXFXRRNLRKRHRKRYHRS TKKVALSESVSIVKGIIGDTSEIKIPFDQDDDFGRGGSKASGGAVRIKER KVSFTDDHDDEIESPIALLQNSITINDILALQKKRNSSSQQKDRSGLNDI DFDDEEEGVADMDLPDELFDMEDFEEFLLDNITSCDKVENHLVLSEYEQN LILENGALNNSSNSEMSSFVAPTVKRKWSLFRQNPNIHLDNTPIDSX back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s120:12114..72426+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001271-697118 ID=EMLSAT00000001271-697118|Name=EMLSAT00000001271|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=60313bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s120:12114..72426+ (Lepeophtheirus salmonis) GTCAAATATGACAAAAATTAATTTAATAAAACATGAATAATAATTCATCC
TTAATTAAGCTTTAAACTTGTAGAAGTAAAAAGTAGATATAATGACATAA
ACCAGCGCCCAATTTCACCTTCATTACAAATCGACAAATCTATTTGTTAA
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CGAGTCTTTATCGAAGGTGCAGAAGATGAATCATTTTCATCCTCCATGAA
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GGGCATTTTAGGAATATAATACATAATTCTTAGTAGTTATTACATATGAA
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AGGTGAATTAATTTAGAGTCTAATATTTTTGAATAGGCATTAATTTTTAC
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AGTAGTGATATTATAACGGGTGACTAGGCAGCGCATTACACCAAAATGTT
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CGAATTAATCATTGTATATATAATAAATAATGTATTATATAATAAGAATT
AATGATAGTTATTTCTTAATTTTAAGTAAGAGTCGGGGTTTACATTTCTT
TACTACATTAATATAAAAATCTTAAGTGAGGCATTGTATTATGAATAGAA
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GTTTAATAAAGAAAAATGAATATAAAATAAAACCTACTGCTTGATTATTT
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TGGGTAAAGCTGGGAGTTGTATAATTGTGAAAGACCATACGAACCGTTTA
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TGAGTAGCACGTACATGCAACAATGGATTTATGACACAGTAGAACGAGTG
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AGGGTTAGTGAACTAAGTAAAAAGAATAACAAAAATAAAACGTAATTAAT
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GAATACTTGCCGAAAAAGTAAAAGAAAAAAACTCGTAATGACTTATGACT
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AAGGGGCTCTCATGATCAAAACCAACTCAATTCAATAAGCAATTTTTTAA
TCTATACTTCAAAAGCAGACTTGTAGAAAACTTTACAAATATATTATACA
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GTTTTCTACCTTTGTATGTCAATTTTCAAAATGTAAATTGATACTTTATG
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TCTATTTTATTTTTTACGTATGTTCACACGTATTTTAATACCAGAAAGGA
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AACACTAATTTTGATGTAATATTCATAGTCAATAAATATGTTACTATAAG
TTAATCAACTTCACTTTACCCATAAGACAGTCTATATAAAATATCCTGAG
CTCACAACAAAACTGTATGAAAATACAATATTATTTTTTTGAGATATCGG
TGATTAACCTTTTTAAAATCTAGATATTCAATACTGCCTATGTCACATTT
TGTGATGTAGATTTGTACTAATGGTATTGAATATTTCCTTCAAAAGTATT
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TCATTCATGTTTAAACGATGTGGAATTTGTTACCTTGGTGTATGTACTAT
TTCATACAAAAATATTTTGTATTGTTAAAAAGTTGCTTTGATCGAAATTA
CCAATTCTTATAGACTTTATGTATTTAGCTCATTGTAAATATATATAATT
TTAAAATTGCTCTTGCCTTGACGGTACAAGACATAGATAGGTCTTGCTAA
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TATATTGCTAATTAAAACTATAGTGGTTCACTTAATAAAAGATACCACAT
TTCTTTAAAAAATGATTTTATCTCAACAAACACTCTCATTTTCTGGAGTT
GATTTACCGATAAATAATTACTTGTTTTTCTTTTTAAAGAATTAAAGTGG
AATTACTTGTTACTTGAAGCAAGCTTTTGATGTTCAGAAATTAAATATAA
ATTATATTCAAAATTTATATATAATTTTGCAGAAATTAGTTTGCCAAATA
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GACAACGTATACAGGTCATTTAGAACAACAAGTTTTGCTCTTCTTTTTTT
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ATATTTAAGCTTTTGTAAGCTAATTATTATGTTCCTTATCAACATAATGA
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TCTTACTCATAACAGACTAAGTAGCTAATTGTTACTTTTATGGAAAATAT
GTTACGTCTGCATCAAATAAATATATCATATTAAGCTACATCGGTTAATA
TGGACCCCTATAAGTAGTTAAACACTAAACATCATTATAAGAAATAATTA
AATGAGCTAAAGCCCTAAAAAATAATAAACATACGGTATAGATATACAAG
CAAAGTTCGAAAATTGCAAWATTTATAATTACTNNACATAAAACTAACTA
AAAAGATTTTAATTAAATATGGAGTGACCGAGATCAATAAAGGAGTTAAT
ATTGAATCAGCCCTTACTTGTACCCACGATTCTTTTATGATCCAGCTGTC
TGATGTTATCTATTTGTTTATCGGCAGRCACGKTTTTKTATCAGCAAACT
TTAGGGAAGKTTCAGGGAWCATGGCGGSATCTGCTCCAGATATAAAAAAG
ATAGAATTTAGGGAACAGCGTTGTGCCGTGACGGTGATTTTTGTCCACAA
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TCCCGTACCATACAAAAGATTCATACGGCTCTTTTGCACCATGTCATGTC
TCAGACTGGTCACTTTAGTGACTGATCGATCACTACTCGATGTATTATTC
TGCCTAAAGTTAGTTTGAATATAGAAAAAATCGAAAATATGACGCCTTAA
GGAACCCCTTATTGCCTCCATCAAGGAGACAATGATCAATATAACAAGGG
ACAACCTCGTCAACGTTTACTCCTCCTTCTGGGTTTAAATCCAGGACTTG
ATTGATGCAGAAGTCGGATACATTAAATGAGCTCTTTTTTAACATTTATA
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ATCAAGCATGATAAGGAAAAAACTAATAATTTATTCCTGATTACTTTGTA
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TCGTAAATCCAAATTCAGACCATGGAACAAAACTTTCTATTCGAAAAATA
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CGAATTTTACTAGAGCGCCAATCTAGACCAAAGTTTAACCGAATTAGTTA
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GAATATGAAAAAATAAAATAAGATTGCAAATGAGGCCTACATACATAATT
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GAAAGAGAATCTGTAGTATTTATTTGTCGGGACCCCTAAAAATATTAATA
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