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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s122 | supercontig | LSalAtl2s122:55127..66093 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001357 >EMLSAP00000001357 ID=EMLSAP00000001357|Name=EMLSAP00000001357|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=216bp
MNWVSFFDKSKTFRPKKKFKPGTLRYSLHKQAQASLNSGVNLRSVVKLPP
GETLEDWIAVHVVDFFNRVNIVYATVVEKCTVLSCPKMSGGVKYEYLWAD
GILYKKPTRLPANQYISVLMDWIEAQINDESSFPVMKDVSFPKNFIPSCK
KIITRLYRVFVHVYVHHFDRLMNIGAEPHVNSCYKHIYYFGVEFDLIPEK
EFEPLKELTARICNDI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s122:55127..66093+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001357-697204 ID=EMLSAT00000001357-697204|Name=EMLSAT00000001357|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10967bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s122:55127..66093+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTGGAAGTCTTCCCTACACGCGTTCAAAAGTTTTGTGAATGAAAAGAAGT
CGTAAGTCTCCCGTTATTATTTATATAGTCCCAGGCTACAGTTAGAGAAA
CAAATTCTTTATAGTAAACATCGAGAGACAAGATGAATTGGGTGAGCTTC
TTTGATAAAAGCAAAACGTTTCGTCCTAAAAAGAAGTTTAAACCTGGAAC
CCTACGGTATTCTCTACACAAGCAGGCTCAGGCCTCATTAAATTCTGGAG
TTAATCTACGTTCTGTTGTTAAATTGCCACCGGGGGAGACTTTAGAGGAT
TGGATTGCAGTGCACGTCGTTGATTTCTTTAATCGTGTTAACATTGTATA
TGCAACTGTAGTTGAGAAATGTACTGTATTGAGTTGTCCAAAGATGTCAG
GGGGAGTCAAATATGAATACTTATGGGCCGATGGAATTTTGTACAAAAAA
CCTACTCGATTGCCCGCCAACCAGGTAGGTGGGAGCAATGCTCAATCAAC
AATCKCCCTTTCATATCACTTTCTTCCGGATGCTATTAATAATTAGATTA
TGTCTGGAAGCCACTTATTATTTTATCATTTCCCTTAAATTGCAATTAAA
TGTCCCATAGATCAACAATATAATTCTATAGAGTTTTACTACAATGTTAT
GCTAGATATTGATGTTTTTGTTATTGTTATAACAAAATGTGTAATAAATC
TCGAGGGAATGATATCTCTGGGTTCAATAGCAGTACTAGTGAGGAGACAA
GGGGCGAATGCCCCGGGCCCATCACTATCAAGAAGCCCACTTTTTTAGCT
ACTTTAGATTGAAGTACTAAGTTAACTTAATCACTATTAAATATGTTAAG
GGAAGCACTTCTAGATTGACAATTTTATGTTCGACTAGTGCCACTTAAAA
AAATGTTTTCTCACTTCCAGTATTTCTCTATTTAAAAAATGTATTAGAAA
GAGGAGCGAAAGAATGTGCAACTCGAGGAAGCAATACAAACCTTGATGAG
TCTTTTAGATACTTTATGGACATACGGAAAGATGGATACTGAAGCTGTTA
TGCAAAGTTTACCAACAATCCTTATAGTTTTAGAAATGATTAAAAGAGCA
CAATTTGACCTGAGCAAAGACTGCACCTGAAGCAGATGGTTTATGAAACA
AGTTACATACTTATGAGTTCCATTTTATAATGTATTTTTGGAATATGTAT
CCAGAAGATAGATATTTTGTCTAATTATCTCCAAAAGGAAAATATAGATG
TATACACCACAGTTCATTATTTGACGGTTGCATTGTGCAAATCAATGAAA
TGTTGACAGATTTCTCTTATTAGAAAACGCTTAAATTGACCAAAAATCTA
GTTGAAACAAATTTTCACTGATTTCAATAGAAGGAATAGTTAAGAGAAAC
TATTTCATGATTGAAGTCTTCAAGGACGAATTCATTGAAGTCTAATTTTA
CGATTCAACATTGATTTTTAGTTCTAGAATAGTTCCCAAATGGAGAAACG
ATTGGAAGATTATCGTCATTTGGTAAATATTTCTTACATTCTTAATACAA
AAAAATTAAGGCAATGAGGCAGCCGAAAAAATCGGAGAACTTTCAAACTT
AATACCTTTGACGTTTCTTTTATTGATAAAATTATTGACATTTTTTGTAT
CATTCTGTGCCATGTTGAATGAGATTAAAATAAAGATTCAAAATATCGAA
GGTATTTTGCCTAAAGATATTTCCCAATATTGTTATTTTTCATCGTCTTT
ATTATACATTAGCAAAAGGTTACCTGGCGTTATTCAGGCCATGGAAAGAG
CGGGAAATCACATTGACAATGATCAATTTTATTTCAAGGAATACTAAATC
TACTGGAAAGAAAATAAAAATATTGAACTCACCCACTGGCCAGCTCTTTT
TTTCCGACAAATACAACTACAAAAATGAGAAATGACTTGTATGAACATTG
ATTGATAAATTTATCGGACTCGTAAAAATGTCTCACGATCTTAAATTAGT
CGATTTCTTAACTTATCCTAAATTATATTTATCACTTAGCTTAATAATTT
CATTTTATGCTCAGACAAATTACAAGATTATTTTCATTACTTTCGATATT
CATTTAGCATATATTAGTTTTAAAATAGCTTCTATTTAGTATGTAATGAT
AAAAATATACAAGTCAAATATCAAATCATCTGTTTGGTCGAATGCATTTT
GGCATTGATCCTTTTGTTATATTGATGTTGGCAAATATTTTTAGCAAAAT
ATACAAGGTTGAAAAATTTAATAAAGTTATAGGAATATAGGTAAAGAAAC
AGTGAGAAGATTGGGAAGTTGTTGATAATATTTGACAGGATATTAGATAA
CTTACAGGGTAAATACTCAATTACTCTTAACTTTTTGAATGTTCTTACAT
TTAGTTTAAACACATTTGTCGTCGTAATAAGCATTCCTGATCATTCCTAA
AGACTTGATCGTATCTCAATTCTACATATGTTTCTTTATTTTATGTTCAT
TAAATATTACAATTCTAGTTGACGATATTACGATAGCTTTTGATGGGTAG
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AGAGATATATATTTTGAAAGATGTAGCAAGCTTTTGGATAATGAGATATT
TCTTACAATATAAAATACTATTTTTTCTTATCCTTTTTTCGGCTTTGTAT
ATATGGACTTGAGCAAAGTGAATTGTGTCAAATAAGAAAATTATTTATGT
TTAAGTAGTATCCTTTGGATATTTGTCAAATACAAAGTTTCTCACTGCAG
AACAACTGAGTAAATTCACTAATTTTTACTATTAGTATGGGCATCACAGA
TTGATAAGATAAGAAGAATTCACTTTTAGTTTATTTCTTTTTGCACTGGC
TAGAATCATATTGTTATATTAGGGGCAGATATCTTAAATTGATTTATGTA
TCATACAAATTATTTCTTGTTAACCACAGTGCATTCCTGCTATTGTAACT
CATAGAACCGTTTTAGAAGTTTGATTTCGAGAACTGACATTGTCCCATAT
CAAAGCAAAATCAAGAAGCACAGAAGTATATCTTCTACCTTARGGGTTTT
TATAAGATGATACATTTGCTCCATTATCAATGAGAGCTTAGAATATTGAA
CCTGGTCCATTTCTACTGAGTTGAAGAAGTTAAGAAGCTATTCACAAATA
TTTATTTATCTGTTTGATAGTCTTGGGAGCCCAGAAAAGCTGCAATGTTG
ATGGCTTTAGTAACAGATTCCATTTTAATGTCTGAATTTATGGAGTGTGA
TACTAAGCTCTTATTTAGTTCGATGTTGTTATAGAAGATCCTGAAGGAGA
TGCTTTCTTTCACCTCCAGGCAAGCTCAATTTGACAACTTCAACTTCTTG
AGTTTTGATTAACAAGAACCCTGAGGGCAATGATTCCGAAGAAAGTTTGG
GATACAGATCTTGTGCTGACAGAACTGTCTCTTCCATATAAATTGCATAT
TCCAAAGCTTCTTGTATTTCATTCTTTAACTGCAATCCTTTGTTACTAGT
TGATACCTCTATTGGCTTMGAGGMGGMGATGAGAGCTAGCTTGCCACATG
GGATACAATCATCTTTCAACTGCCTGTGAATTTATATAATTTATTCGTAA
CATTGATTACTATTTACTAAAATAACAAAATAAGATATTGAAATACTAAA
GTCTACAATGTGCGGCAACGAATCATACAGTAGGATTTAAACTTGTTTAG
AGCTCGTATGTCAAGGTGGCAGAAATTGTCAGGATCGTCGGTTACTCGGA
GAAGCTATTCTTCAAGGTGAAGAAGCTAAAAAAAGATGGGCTGATCCTAT
GGAGTCCTGGCAGCGGTAGTCTCAACAAAATTTGGTCTCCAGCCTTTTTG
GACTCAGTGAGGGAGAAGATAGACAGGAACCTGTTGAAGAGCATGAGAAA
GATGGGCAGTTTTTGAAATTTAATATTTGAAATTTTATTTCCAAAAATAG
CAAGGACTTTGTGAGGAGGACGTGCGTGGTCTTCCGCCCCAGGATTGATG
CTATGCTGGCTGCCAAAGGAGGCTATTTATAAAAATGATATAGCTAATGA
CATCCTAATGAACCACTAAAAATTTCAATTCTCTGCCTCTTTTTTTTTCG
AAAATCCGGGCGAAATTGTACACGGGAATCAATTACTGCACGATTCGCTA
CCGCASACTGTGACTGTACTTTGTTTCGCGTTATCCTTCATTATNAATTA
ATAAAGTATAGTAGGTTATTTTGGCCTCTGTCTTTATAAAATAAATGCCT
GCTTGAAATCATTCCTATCATTCCATAATACAGGATCAGCTTTTAAAAAT
CCATAAGGAAGCTCCATAATTTTCATAAAATTTGTGTCCCTATCTGTGAC
AAAGTCTTCGGAATTTTTATTTATATCATTTTATACAACTGTTTTTGCTA
TTTAATATTTACTTTTAAAGAGCTCAGCGTCTGCCTGCAAACTTACCTGA
CCAGCAAGAAATGTGATTCCGACAAGTTCCTTCTACAAGTACCATAAATG
TCTGGAAAGTTTTTTACGATGTTGATTTGGAAATTTGATTATTAATAGTT
GAGTATTTTATTAATTAATTCATTGAATTAAGGTCATTGTAAGGAGCATC
TGAGGACTTAGATACAATTGATCCAAACTTTTCTATATATTCTTACTATA
AAAACACATATATCTCGTTATTCTCGTTCTTCTCAGTAAGTTAATTTAAA
TTCAGATTTATAAATCCAGATTTTCAGATTATATAAAAACTTTTAAAAAG
CCAGATATCATTAATTTAACTCCTTGCTCAGGAGTAGCACCAAGAAATAT
TATGACTATCTCTAAGAATTCCTTACTATCGTCCCTTGGAAATTTATTTT
CGAGATGTTCGTTAACAAAGTAAATTGTGCCTTTTCGTATGTCTTCAACA
AACCAGCTMCCCCTTTATCCGCAATTCTGTATTCATACTTTGTTTTATTG
ATCGATTGTCAATTTTATTTGAATCTTTTAAATAATGGATGTTCGGGAGA
AGATGTGTTACCAAAACACTCTTGGAAAACAGTCCCAATATTTAATTCCA
TGACATGGTGCCTACATGCCAATGGAATATTTTAAATTTTCGAATGGTCA
GAATGTAAGATTAAAAAATGTTGTATTTGTTTAAAAATGTAATTTGAAAA
TTTTGAACTGTTTTGAAAAATGATGAGATATCCTAAATTTTTGAAACATT
GCATGTCCTTGCCATCGGCCTCAAATGACCNNNNNNNNNNNNNNNTATTT
TTTTATACATTTAGCTCCTACTAAATTTTTGTTACAATATTTTTTTTACT
TCGCACAATTTGTGATTTATTTGATAAAACTTGATTATATACAAGGTTGA
AAGAAATACAAGGTTAGATCATCATGTAATCGGGCTTGCTAGAGTTTTCT
ATCTGATGTATTGTACCAACTGCTGAGCAAGACAGGCAGATTTTGAGAAA
ACATGCAACCACTTACAGTCTATTGCTAGAATTTTCAATTTAATGTATCG
TACCGGCAAGACTAACAAATTTTGACGAACCACACAACCACTCATCTACT
ATAGTATCAATGGTGGAAGTCAAACATCAGTCGTACACGCGTTATGGTAT
AACCTTGTATTTATATTAACCTTTGTTATGTTGATGCTTTTCCTTAAAAA
AGGTCATAAAAAGGTTACCAAGGTTAAGGTAATCAAAATTATTACTTTTT
TTTTTTGGCTAATCTAATCTAAGTAAAAATTTGCAAATTTTTTGAGATAT
CAKTAGCCGCTAATTGACTGTGATACGCAGAGAAACATACACATAGACAA
GAAGGCTACATTTCATTTTAACATTTTTATTGTTCATTAATACTTGTAAA
AAGGATTTATCATAAACTTTTTATAAAAAACTTTTGAGAAAAGTTTAACT
TAACTAAATTTGTTACTTTTATTAACAAGCTGCAATATCATAGTATACGG
ATGATATTAAAGCCAAATCAGTTTTTTTTTTCTTCAAAAATATGAAAAAT
TTCAAAACTATAGGCTTTAAACATTGATAGAAATTGTTCAAACTATGTGA
ATCGTATTTTGTTATCTAAAGGAACACATTTGCACCTTCAATTTTTTACT
TTTCACAATAAGTGATTTTATTGGCCCCCTACTGACTATACAAGATACTG
AAAAGTGAGACGTCATGACGTGAAAATTATTTTTAAAGAAGGTGTACAAA
TATTCTCGTTGCGAGAATAACGAAAAGAAGAAAGGTATAGAATAGTTAAG
AAAAAGCCTCACCGACTGAAATTGATCATATGGATGATACCAAAATTCGA
TATAAAGTTCAAAATCCGCACGATCAAATTATTCAAAAATCCTCTTCAGT
TTTTCATTGAAATTCTTATGTTATCGCCACACACCTATCTTTGAATTAAA
TTTTCCTGAAGATAATTAGGAGGATCAGAAGTAATTTTCTAAATGGAACA
GAATCTCTATACTCTAACGAGAGAATATCAGAATATATCAAGAAAGACTA
CTTTAAAGATAACAAGACCATATGGGATTGGAGGAAATACATTTACAGAC
ATGTAAGGAAGAGATCGTCTCTTATGTTCATAAAATGTGAAACTTTATGC
AAAGGAAGGGATATCTGCAAGAAGCTATAACTAAAAGATGAGTTGTTCTG
ATACCCAAAAAGGGAAATGGTTTGCACCTTGATAATTGGAGGCCGATCAC
TGTACTTAATTAAACTTACCGAATACTTTCAGGGGTGATTGCAAGTCAGA
TTGAACCTATTCTAAATGAGAAAATTGGCCTGGAGCAAAAAGGGTTCCAT
AAACGAAGAAAAATATCTGAAAATTCCGGAATATTTATACAGCGATTGAA
GGAGTGGATAAAAAAAACATTTTGTAGCTTTTATTGTGATTTATTTTTCA
AAATCATTCGATTCCCTTTCTCATACTCACATTTTGAGATCGGTAAAGAT
ACTTCTMCNCAGCCACTCTTTTAACCCAATCAGGGCGCTGCTGGCTACGG
GATCTTGACAGTGATTGTTATAAATAAAGAGAACATACCATTTTAGTTAA
GTAATTGATCCCCTGCTCTTTGTGGCTGCAATAAGAGAGCTAAGAACCTC
CATAGCAAAAAAAATATTTAGGATTTGGTGTAAGTTTTGGAATAATTATC
TAATAGATCTTTGTGCCAATGATGTGACCCTAATGAAGGAAGCGAACTCA
GAAGCTCCATTAAAAAGAAGGATTGAGATTGTTTTATCTTATTTTAATTA
TTCGACAGAAAGACGGGATGGAAAATCAATTAATCAAAAAGGACCTATTC
TCCAATCATATCCGAAGAAAGGGAGGAAAATTTCAGATTGTTTTATCAAA
GAAATTATAAATGTTTCGAGGATTCAATGTGTGAGCTCTGGCCCTTCAGA
ATTAAATAGGCTGGAACTAAAAAAAAGAGTCAATAATTTTTTCAAAGGCT
GGCGAAATTTTAACATTAAAAAAAGAAAAGACCTTTTCAACACTTTCCTT
GTTCACAATGTTTCGTATAAGGCTATTTCATTATTAATATTGGTGGTGGT
GGTTGCTATAATGGAAGAAAACGTTTGGTTTATTAATCTTTTTCATCTGA
ATTATATTTCAGCTTTAAAGACACCAAGAAATTGATTGAATGGTGGACAT
TGGTAGGTTTTGTGGAAATAGTCACGAAAATTTATTCAAGAGTTTTGGTT
GATATAACGAATAATCCTAATATGGAGTGGAGATATGTGATAACGTCAAG
TACGTACTATGAATATATTATCCTTAGAAAAAATCTTATAAATGGATACA
TCGAAGACTTTCCCCCTTCTCTTGCCGCAACACAAAGGTTATCTGGAAAG
CAACTCCCACTTACGATTATGTAACGGCCGTGGATATTATTTGTAAGAAT
CATGGAAATAATTTTTTTAATGTTCCTTTAATTGGGCATATGGTGTTGCA
CTGATTATAAGTGTATGTAAATAATATAGTATTACAATTACTCCATCCGA
CCTAGGAATGGTCTTTGAAGTCCATATACATTAAGTATATTTCCTTCTCT
AGGAACGACCGAGACGCGAACCTACCCACATTGAGTTTAAAAGAATAATT
CCCCCAAGCACGTTGTCCATTTAGATATGTTGTTCTTTTTTAAGAGCTTA
TGTGATCCTGTGGCTTTGGAATAGGGTGCACTCACAAAAAATCATCAAAC
AATTCGTGATATTATTGCTGACTCTCTTTTTATAACGGGATGTTTACTTT
TCTTCTTAAAAGATATGCCAAACTCTACCATGTCCCTGTTCCTTGCCATT
TGAAAGTTCATTTTTCTATTTAAAGGGAAGATTCTGATTTGTCAAGGTGT
TATAGATGTATTATGGAATTGAATCTGCGTAGTAATTGGATGCAAAAGAT
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TTCATATAGCTACAGGAATTATGTTTTTTAGTATTCCATATAAAGATAAC
GGTTTAGTATTCAACAACATAACACACGCTTTGCTGAAATRATGTCCTCA
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AAAATAATTTTAAAATATTTACGGGGACATACTCCTAAAGTTAAAGCTAT
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ATAGTAGCGGAGGATATTCGTGCAAATTTAATTTCGGKGGTTGTGTTCAA
AATTATGATTCCCAATGCGATTTGATGGTGCTCGAGAATGAGCCTCTGAC
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AAAATTTTCTCTTTATCTAAAGAAGAGTGTCGTTTTTCATAATTTTCAAG
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AAAACACTTTTATAATAATAAAAAATCAGTTTTATTCATCGTAATTTTGA
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GAGATCAGTTTTGAATTATGTGTTCAAAGATAAATTCTATTCTTGGCTTC
AATTCATCAGTAGAAATTTTCTGTTACGCAGTTTAATTATTTTATTTTTT
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CCGGCCATGGTCAATATAGAGATTCTGATCGTTTGAGGATCCGAAGTTTA
TTGTTTGGCTACAATTTGTTTTTCTTCAAAATGAAAAATAAGGATAATAT
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AAAAAATACGCATTCATGGGCGAAAAAGTTTTTTTCATTCTTTTAAAATA
TGCTCTTGCATCCGAAAAGTTGGGCTAAAATTTAATTTGTTCATTTTCAT
AAATTAACCCTAGTGTTAACGAGGTTTTTACTATCACTCAGGATCATATT
TTGTTATTATTTAGACAAATAGAATGGCTATTTTTATATGTGTTCAATGT
TCATAAGAATTATACAAAGTACAATTATTCAGTTGATTTGTTTTTTATAT
TTCAGTACATATCTGTTCTTATGGATTGGATAGAGGCTCAAATCAATGAT
GAATCCTCTTTTCCTGTCATGAAAGATGTTTCCTTTCCTAAAAATTTCAT
ACCATCTTGTAAAAAAATCATTACACGGCTCTATCGCGTCTTTGTACATG
TATATGTGCATCATTTTGATCGTCTTATGAATATTGGTGCGGAACCTCAT
GTAAATTCTTGTTACAAGCATATATACTATTTTGGAGTTGAATTTGATTT
GATTCCTGAAAAAGAATTTGAGCCATTGAAAGAGTTAACAGCAAGAATTT
GTAATGATATATGATTATCTTTTATTTATTAAAATCAAACGATCGTCATT
ATATTTTGATTTATTTGTTAAACATTTGTGTAGATTTCATCATTTAAGAG
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