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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1246 | supercontig | LSalAtl2s1246:233521..243037 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001443 >EMLSAP00000001443 ID=EMLSAP00000001443|Name=EMLSAP00000001443|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=632bp
MGTATQKYSLKWNDFTVNVASTFRDLHSRHDFVDVTLACADGSTLEAHKV
ILSSVSTYFRDILKTTPCKHPIIILKDXGRDEASAMLEFAYTGEVNVAQE
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TREPSPIPSSHPSNTIAPPPAGLNPRTPPPKRWKRSFDLTHMNIKKESSE
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HHPNXLQXPPPQQQQQHPPPPQQLQQHSLQSQNPHQNNTQPASNVSESYD
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SLQXHRHIHRGTHRCPSCGKAFSRRWDMERHLNKSKYGCPANRFSTGSSS
SVGESSPQHHIVEVLSPAPSTVVSASSNNTTA back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1246:233521..243037+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001443-697290 ID=EMLSAT00000001443-697290|Name=EMLSAT00000001443|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9517bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1246:233521..243037+ (Lepeophtheirus salmonis)
CTCGAACGTTGCAGCTGCTCTTGAAAAGTTAAATATTAATATATTATCCA
AGTGACGGGCTGAGGGCAACGTCCCTGTTGCATACCCTACGTTTTCTTAA
AGAAGAATTGTAACCCTTCGCGTCAGAGTGTGCTTTCTTAGAGTTTAAAT
GAAGATTTCTCTCTCACTGAACATAGGGTACAAAAGGAAGGCGCTCCTCG
TCTGCGTCAACGTTGCGTAAGATTTTTTTTCTCTTCTTCATTTCATGTTG
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GAAATAGTCAATGAAATTGAAAAGCCGGGGATGATAGGGGCCATATACGC
GTGCGCTCCTCTCCTCACCTCTACGCTTTTTAAAACTATGTATGTGTTTC
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TCTTCTTTTTTCCCCCCTCTTTACTCCAGGGCCAGTCTCTTCTCTTCTTT
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CATCAACTCTGTTATTTCAGTTATGGTAAATATCACGAGTTGGACCTCNT
TAACTTTAATCCACATCAACTCTGTTATTTCAGTTATGGGTAAATATCAC
GAGTTGGACCTCTTTATTAATCCATTCGTTCGTCCTCCACCTTCCTATTT
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TCTTTGCAAATCCTATGCATCCTCCAGGGTTGCTAATTTTGTCAGCTGTG
ACAGTATGTATTTCTATTTTTTTTTTAATAGCAATTACGAGACGAAAATG
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TCTGCCGAAATTAAATCTAATGAAATGTACACATCCCTTAGCTCTGTATT
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GTAAAATGCTCTGGCCTTTTTATCATTTCAAAGGAATGTAATTTAACTCT
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GTGCCACATCAGGAGCATGAGGTTTCATTTTTGCGATTAAATAATAATAA
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ACAAAAGTACAGCTTGAAGTGGAATGATTTTACAGTGAACGTGGCTTCAA
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TGTGCCGATGGATCTACTTTAGAAGCACATAAAGTCATACTATCATCTGT
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TGTGATGTGTTAATGATTGTGTGTGCTTTAAAAAAAAGTATATTCATATT
TTGAACAATTCAATAGAGCTCATAATTTAATATTGTAATAGTTATATCAA
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TTTATTGGCGTACAATCAGACCTATGAGGACAACGTGAGCATTGTCCTTT
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GAGACAGCGAATAGTTGAAATTCAATGATCGCAACTTTTTAATAATAATG
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TTATTTAGATGATTTGTCTCCTAAAACAATGTATTAGCTTGTCTGAATAC
TCACTTTACATGCCATCTCAGTGTATTATGTGATTGATGAAACCTCTGGC
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AAGGGGGTGATTTAATTATACTCCTACTACCTTATGATTATTACAATTAT
CAAATTGGAAGAAATAATTAACAAAAGAATATAAAATTAAAATCAATGTT
GTATAAAGTACTAAAGCAAACTTGTTTTTCGAATTTTTATTTGTATGTTG
CTATGTTGACAAAGGGTATTAGGTGAAGGATATATTCATTTACATTATGA
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GGCTCAAGAACTTCTACAATCCTTTCTTCACATGGCAAAATCGTTTAGAA
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TTTCTTTAATTTGATTAAGAGTTGCCAGCGTATGGAAGCCCAGACACCTA
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TTGAACCCAAGAACTCCTCCACCTAAACGTTGGAAGCGATCATTTGATTT
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AGAGATTTTGTGAATCTGTCAGTCGAGGAAATGGCGAAGTTGTTGGCCAG
AGGTTAATACCTTATCCTCATTCCATGCCAACTAGTCCAACTATGTTTGA
AAGAGGAAATGAGATAAGGTTTGATCCCTGATTTTGGAGCTACATTTGTG
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GGTTTAATCAGACATCACTTAGCTAATGATGTACCAAGATCAGTTGCTAA
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ATCATCATCATCACCATCATCCGAATCAKCTCCAACAKCCCCCGCCCCAG
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CTGAATCTTATGATCCTTTGGATTACAGATGTTACAATGGAAAAAATAGT
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GTTTAATTTGTGATAATGTTATATTTTATAGTTGAAAAAGCCAAAATTTT
CTGGGAGTTATTTTTGGGGGTCTTGGAATTATTTCTTTAGTTTTATGTGT
TTTTTTCGGGTTTTCTGAGGCGACAATTGCTTTGTAAATATTGATAGCAT
TAAATAATAGAAGATAATTATATTTTTTTCGCTCTTATTTCGTCAAATTA
CCTTCACTTGTTGTGTCCTCCTCAACATTGTAATCATTCTGCATTATATT
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TATAAATACTTTGTAGTCGCATCATCTTTTTCTTTTTTTTTCTTCCTTTA
TCTTAGATAAATTTCGTCAAATACTTATTTTCGTAGTTTTTAACCATTTA
TTCTAGCAAAATTCAAC back to top
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