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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s126 | supercontig | LSalAtl2s126:190035..200554 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001546 >EMLSAP00000001546 ID=EMLSAP00000001546|Name=EMLSAP00000001546|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=566bp
MKRNRKDEGSDMNFSVLGIYKEKKDPMWMDGSKYYFSDESHVYGGSLGSG
GLSMRRSFSLPRWMDQIVHGRMTSTQLSNMVNKPLRRSSLALHRMNSKIK
NGGSSSSSSGVSSSSGSSSYASHRSSNNEAAFEEIRTYIKSGSEFTKDLH
HILQERSEAENAYAKSLSKLSAKLLKSTRDLGHSSSSVINAWHFIAEDME
FTADIHKSIASILIEECVKPLKTFSDIQHKSRKSIESLVDKRAKLYSETR
TLETKYKVKSYSACRDNERVQDQALDCKLGRGKALSEKELSKLHLKRQKA
EESARKCDGDYYTSCLKAERSRLDWESGIIRGCSIFRQMEENRLVQLQAL
SETYQSALSENLPKLVSASKRLQEPIRSSDVERDMDASKAKFELDGNVRC
GDSILPDTYAEDATNAMNQERRRQAINEILKRVDMDIEKEKKGRSGVENL
AKALTETPKFGGEDSLVDIQEKISHMSSMISYLEACKFKTTNSLNYVDGK
TMIKQVSSSTMGQCSAIYDYQANLHDELTIFAGDIITIHDKQNDDWWLGE
VRGAVGLFPSTYVEIK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s126:190035..200554+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001546-697393 ID=EMLSAT00000001546-697393|Name=EMLSAT00000001546|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10520bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s126:190035..200554+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAAGAGGAACAGAGTTCAAACATGACAGACGGTCATTTTAAACTATAA
TTAAAACGAGATCAGCGCCATCTGGCGATTGATACGGTATTATCAACAAA
ACATAATATAAATAAACATTAAAAGAAAMGAGGACAATTKCCAGTKCCCG
CCCGCCCCTCCGTCATTGCGCTCTCATTGATTACTTCTCTGTCTCATAAA
TATTCGTCAGACAATTAAAATATTTCCCCTTTTGTTTTTTATTATTTATC
TTTTACTTATAGAAAGATGAGGGGTCGGATATGAAGTAAATATCCCTGAA
TGAGCCTCCTTAATGACGAATATTTATTGTAGCATTTCCTACTGTTCGGC
GCGCCAAGGCAGTAAACGGATGAAATTAACCGAATAAAAATTTCTTTACG
TTAGTAGTGAATATACTTCTCTGGGGAGAGACTACATTTATTGTTGAGTT
GAATTTTTACTCACTATAATATCATTTGATAGCTTGAGGCTTTTATTTTG
TATTTTTTATTTATATTTAAAAAATATGATCAAATAATAATAGTTGTGTG
TATATTTTCGTAAAGTGTACTTTTATCCGTACTTGGAACAACTAAATGGA
ATTTTAAAAGAGAGAAGAATTATTTGACTGACTGACATAGAGTGGACCCA
CAGGAAGAAATAAAATATTTATTTCCATTTTTAGTTTTTCTGTACTTGGC
ATATATAAAGAAAAGAAAGACCCAATGTGGATGGACGGATCCAAGTACTA
TTTTAGTGATGAGAGCCATGTGTATGGGGGATCTCTAGGTAGCGGTGGAC
TCTCCATGCGTCGTAGTTTTTCACTCCCTAGATGGATGGATCAAATCGGT
AACAGTCAGGATTAAAATATATTGGTTATTTGCATGTGTAGTTACTTGTT
GTTGTTGTTGGGGTTACGGGTCGCACAATCCATTTCACTCACATGTCCAG
TTCACACCTCTTCTATCTCAATTGATATCCTTAATGTTATAAAGTACTCG
CTGACCACATTTGATTTTTAATTGTTCAGTACATGGAAGGATGACTTCTA
CACAGTTATCCAACATGGTCAATAAACCCCTTCGACGTTCCTCTCTTGCA
CTTCATCGTATGAACTCCAAGATAAAAAATGGAGGATCTTCTTCTTCATC
ATCAGGAGTATCCTCCTCCTCCGGCTCTTCCTCATATGCTTCACATCGTT
CATCGAACAACGAAGCAGCCTTTGAAGAAATACGGACTTATATCAAGTCA
GGAAGTGAATTTACAAAGGACTTACATCACATCCTTCAAGAACGTTCTGA
GGCAGAGAATGCCTATGCTAAAAGCCTGAGTAAATTAAGTGCAAAACTAC
TCAAATCCACAAGGGATTTGGGCCATTCCTCATCAAGTGTGATCAATGCT
TGGCATTTTATTGCAGAAGATATGGAATTTACTGCGGATATTCACAAATC
CATTGCATCCATCCTAATTGAAGAGTGTGTGAAACCTCTCAAAACTTTTT
CTGATATTCAACACAAGTCTCGAAAGTCCATTGAGAGCCTTGTAGACAAA
AGAGCTAAACTGTACTCAGAGACTAGGACCTTAGAAACAAAATACAAAGT
TAAAAGTTATAGTGCTTGTCGAGACAATGAACGTGTTCAAGATCAGGCAC
TTGACTGCAAATTAGGTCGTGGTAAGGCTCTCTCTGAAAAAGAACTATCT
AAGTTGCATTTAAAACGGCAGAAAGCGGAGGAATCGGCACGGAAATGTGA
TGGAGATTACTATACGTCATGTTTGAAAGCTGAGCGTTCCAGGTAAGATA
AAGCAGTCTAATTAGTGTCTTTTATAATGAGCTAGAATCATCAATATCTC
CTTGAAAAGATCGATTAAGATGCATTGGGAATTACTTTCCAGTTTATTGA
TTCCTTACTTTGATAAAATATAATTAGAATTTTTAGTTAATGAATTTATT
TTTAGGATGGCAAAGACTTAGAAAAATGATATTTTTTAAAATATTAGTAT
GAATACTCTTTTTGGAGTAATTAATACAAATGTGCATTAAACATCATTTT
ACCATGTGTGTACCTCCTGAATTACAATATTTATGAATGCATCTACTTCT
ATTGATTTTAATTATTTATGTTTTATACAAGTTGTAACTTGTATAAGCAG
ATTGTACAAACTTATTTCCATGTTTTAGATCAAAATTAACTATTACAATG
GCAAAAATAAGATATTTTCCTTTAATTATTCACTTTTCTTGTCCATAATT
GATCGAAAAAGAAAAAAAAATGTACAAATTTAGACATTAAATAGGGATTT
TCAGTACATATTACTTTGATTTCATGCAAATATGACTGTTTATCACTTAC
ATCAAGAAGTATTCAATGCAGATGTAAATTATTTTTTTATTCTTAAAACC
TCATCAAGATTTTTTGAAATTTGTCGATTTTATATACTACAAAAATCATC
TTTGAGTTCCCAAAATGGCGTCTTCTTCAATTATGATGCAATTTATAACG
TCAGTGAGAATGTTTTATTGTTAAATCAGGGATTGACATTATAAAGCATC
TAACCGGTTATACAATTAATCAAAGACCGAGAAAAAGTTCTTATACTTAT
TGAAATCCCAAGTTGAGCYTCACGTATTGCTCACAAGTTCTTGAATATTT
CCATGGAGGACTCTTCAAGTTACCTCATATTCCTTTCAAGCCCATAATGA
TAATATATGATCCATAGTGTTAAAACTTTTTTGAGTTCCGTATACGAGGG
TTGTCGGAAAAGTTGTCAACCTCACAAAGATACAAAAAATGTATTCTTAA
TTTATATTTTTCAGCATAGCCTCATTTGTAACTCACCACACTTCTCCCAG
TGATGCTAGATAGAGATGTGATTAGTCTTAATTTACGAGTGTTGCTATGA
TCACGTTGAGACTATATTAAGACCKCCCTCGTATACCTACTGGCTTTTGA
GTCTTTGATTGTGAGATCAAGCCGAGTCGCATGTCTCCAGTCCAAGGCCT
AAACATTTGCTATTAATTTTTTTGGAGTAAGGGATCATTGAATCCAATGT
ATGTACGTAAATAATTGAATTGGATATAATTATATTTCATTGGCTGYCTT
TATAGTGATGATATTAGAATGATTTAATTACGCAGAACATCAGACACGGC
TGATACGTACAACCAACCACTGTGGTTTTTTTTAGAAGAAAGTTTTATTA
TCCAGTAGGATGTGTAGTATAAGAGTAGTTTTTAAGAAATTAAAGTTAAT
TTCTCTCTTGTATGTTTACCTTCAATTGGGATTCTCGGTTTTTGTCTTTC
AAAATATATAAAAACATGTAGGCACATTCAATCGAAAGAACAGACAAATA
TGATCATAATTCATTATATGATTATATCTTACGTTATTATTTAAATTCGT
CTATTATTCCATTTTTTCTGAAGCTCTATAATTTGTGTTGGATTGGTCCT
AGGACTGATTGTCTAATCAGTCTTTTTTTATTGGTCAGATCTTTTTTACC
ATTCAATGGTCCTAAGGGCCGATACCTCGTTCCTTCATTCCTAGAGTCCT
AGCAATCATTATAGGTATTCTTCACTCATGGGGAGGATTGAAAAATATAA
ATACGAATAAAATAATGAAGGATACTTAAAACTAGTGTTGAGACTCGGTC
CAGTAACGAATTTTTTCCCCGGTTCGGTCTAAATGGATTTTTCTAGACTG
ATTTTTCGGCCCAGACCGCGGTCTTAGACCGTGAAACGATTTGGTCCCAC
TTAATGGACCAATTTTTTTCACTTCCATATATTATGAGAGACCAGTTTTT
TTTTCTAGATCAACTGTCATTCATTTTTTTTTTTAAATATCAAAAGTGCA
CAATAACTTCTATAACAAATACTGTATACATATAACGAGACAACGGGATC
AAAATGAATCCAAGCTAACTCTGTTTAAACTTCGTATAACGTCATTCTAC
TTTTAAAAAACATGATGTCATATATCTGTAAAATCGGTCTAGACCGATTT
TGTTGGGACTGTACTAGACCGACTTTTTATATGAGAGTGGTCAAGACCGA
GCTTTCTTGTTGGACCAAACTAATTCGGTCCAACAAAAAATATACGGGTC
TCAGACCGGTCTAGGATTTGCAGACTGAAACCCAACACTAGTTAGAACGT
ATATTTATTAATTAGTGTTGGATTGGTCCTAGGACTGATTTCCCAACTAG
TCTTCCGCCATTTCTGGTCTTTTTTTATCGGTCCTATCTTTTTTACAAAA
AACGGTCATAAAGACCGATACATCGCTCTTTCAGTCCTACGGTCCTAGTT
ATCTTTTTATTTTCTACACTCCTAGCTAGGATTGTAGAATATGAGACTTC
AGAAAAATAATTAATGAAAGCTAGAACTTACGTTCTAGTCATACACCTCC
TACCTTTAACTTCAGGTATATTGTCTCTTTGAAGGAGGTTATGAAATATG
ATGAAACTTCAGCGACTCAAATGACGTAGTTATTAGTAAATTGGTGGAAT
GTTTAAATTTCAAAAATGAATTGCATTTTTTCCCCTTCAATTTATTTTTC
ATAAAAACCAAAAAATCCTTGATTTGGGGTGGGATGCTACAGTCCATCCA
CCCTCTACCCCTGCGAACGCCCCTGGTACTGTTGGATTGGTCTAAAAATT
TAAAAGACCGCAGTCGTAATAAAAATTTTCAATCCTATGACTGGTCATTA
TTGGTATTTTATGGAACCACTACCGCTAAAATTTCATCATAATTCATAAC
CTCTTTGTAAGAGACAAGATACCTGAGTGCTGGATGTTTGTGACTAGAAC
GTATTATTATACTTTCCAGCTTTCTTTTATTAATTTCTTCGTTTTTATAT
TCTTCAATACTAGTTATGAGTGAAGAAAATAATAAGATAGCTAAAACATT
AGGACTGAAGGACCGACTAATCGGTCCTTCGGACTTTTGATTATTAAAAT
GGATCCGAATATATATATATATATATATAAATACTTAAATGGGAGGAGAA
GACTTATTAGAACATCAGTCCTAGGACCTATCCAATACTGTCAATGTTGC
TACTTAAAGTGGCGCTATCTTGTGACAAAATAATATAAATCCCTAGCTGA
AAGATAATATTATTATTTTTTAAATAAGATATACATATCTTTCTCACATA
GAGGACGTTGTCAACATTCTTCTGAGTATTCGCCATTTTTTTCAATAACA
AGCTACAGACTGTCATATTAACTTGCGTATAATATATATATATATATATA
TTTACTTTTCTCATGGCCTATAGAATTAGTTTATTTGAACTTTAAGGATC
TTAAAAACACGTCAGTATTTTGCCATTATTCTTCATTTAGCTATAATTTA
AGACTAAATTGGACTTGTTAAAGTTATAGTAGATTAATTTATGATTGGTT
GGGAATAGGTCAGAAATTAACAAGATCAATTTGGAATTCAACAGATCAAC
AACGTTCAGAATACTGTTAATGGAGAAAGTAACAAAAAAATCCTCAGCTG
AAAACAAAATTCAATGTACATTTTTGTGTTAGGAAGGTGACACCATGTGC
AAATTGCATTTGGGTTTTGTGAACTCATTAGAAAARACTGAAACGACTAT
AGAATGACATCTGTTTTTGGTCTGCTCTTATTTTGACTAAAGGGGAAAAT
AATTTTCTCATATTAATAAAGTAAATCGAACTTTTAAAAAAAATTATCTC
TACTTTCAAAGAAAGATGAATCATTTAACAATGATATGGAATGTGTAGTA
TATATATTTTTAATTTGACCCAATTTTTATAACGAAACACATTCATTACG
TACACTGTGCCCTTAAAAACTGTAAATAAATGGAGTTTATTCACAATTCA
TTCAAACTTTTGAAAGAAAAAATTAGCAGCTGAATAATTTTTTGAAACAC
TTATTCTTTTTATTTGCATGACATTTAGCCTAAATATTTAAGAATTTTGA
TGCAATGTGATCGAAAGAAGTATTGAGCATTATTACTTTAATGAGAAATT
CATTTGCTATCACTTATTAACAGAAATTGGGTTGAATACAATTTGTGTAT
ATTGTAACTATTAATGATTATAAGCTAAAATGAAAATAGCTAAATGGAAA
ATACATTGCTTCAAAAAGTTAGTCGTCAATATATATAACCAGTGATGTAA
AAAGTCTGTATTTTTTAGCTATCCCGTTTTTTTTGGAATTGGTAATCTGA
AGAATGCATTTTCTTTTTCTCATCTGTTATCATTATTATTTAACTCCTGA
GTAATTCTCCTCCTAATACATTCACTTACAGTCAAACCTTGATTGAGCAT
TTGGGAGCTGCGCTCATCTCAAATTGTTAGGATTACCATTATTATTTTTG
GGGTTTTTTTAAAGCATACCAACACATCATAAATTTTCACAATTTCTAGT
CCTATGTAAGGATCCTCACGACACTAATTATAATCCATTATCTCTTTTAC
TTTGGAGAAGGTTAAATCATCAATCTGACAAGTGCTAATTACATAACTAT
TTAATTGCTTCTATTTCAAAAAGAGAGGGGTTTTAAGAGTAAAATTCATG
TAATCGTTTATGGACCTGATTACCCAATATCTTAATTTTAATTCATTATT
ATTATGTTAGTGTAATTGCAGAAGTTTAAAAATTTGCTATATACATTGTA
GGTATAACCCCACTCATTTGATCTATGCATGGGTCTTTGGAAAAGTACAC
TTTCTTGAGTCTACCTTCTCTCTTACACAATTTATTTGTAATGCGTGGCA
TTCGGTATTTTAATTGTCATTATATTCGGTCATTTTTTTCTTTATAAACC
TTAGGAATATATTATAAATTGTTAAAACATATATATTTTTTTCAAAATTG
AATCCAGCAAAAATATATTATCATTGATACTAACACATGGGCTGAAAAGG
CTAGGGCTTAACTAAGAAAACACGTTGTATTTTTTTTTGGTTCAAATTTG
GCATTTTTTTAAATTATTATTATATTATTCGCTTTATTGAATGGAGTCAA
ACACTTTTCAATCCATTGCTTAGCTTAAACAGTATATTTTTTACATCAAG
AAGCAGTCTAAAATTAAAACACGAAATTGTTTTTGATCCATTGTTTTGGA
AACAACAAAAATAGCGTCACGCGTAGGTAAATAACTCACAAATTGGAGAA
CATATTATCAAGAAATTGTTAGAGCTGTCTTTTAGAAGGTTGATAAAAAA
AAATAGCGCCGTCTCTTTGTGAAGCCCAGGGCTTTTCAGCCCATGTAGTA
CTACATTATTTTAACCGAATCTCATTTTTCAACTTTGATTGGTTGAAATA
AATATTTTCTAGACTTTATGAAGACTACTCAATAGCTAGATGTGTTTTTA
AAATGTTGTTTTTTGTCAAATGAGGAGGTAAACAACTAAGCCAGGGAATG
GAATATTGAATAGTTAGTTATGAAAATCGTGTGTACTTTATGTATTTCAG
GAAATGAAAATTAACATAGTAACCCTGCCAATTTGTAGAATATTTTGTAG
CTTAGCTGTTCTATTATCGTTTTATTTGATTAGCCACAATCAGCTGTGGC
AAGGGAGGAGGGGAGAAAGAAATACACTAGGACATTGGCGGAACAACTAA
ACATTACACACAATTTACATCACTATGAATAATTACTCACTAGTGATGAA
AATCAGGTTTATTTTTTAGCTTCCCCGTTTTTTTTTGTAATAATAATCTG
AAGAATGAATTTCCTTTTGTTCAGCTGTTGTCATTATTATTTAACTTATC
TTACTGAACTCCTTTTTGACTACATTCAAAACCTGATAGGACATTCATGT
ATTTTTATACAAGACGGAGATAATCTTGAGGATTTGTTACAAAGTTATAA
TTGTAAGTCCTTTTTGGAATGGAATTTGGAATGTAGAATGGAAGATAGAC
AATTCTTGGCAACGTCATTGTTAATTTCCTTCTCCCCTCCTCCTTTGTCA
CAGCTGATGTAATGTAACTGATCTAATCAAACGTCATAACAGCGAAGCTG
TTCTCCTCCCAAACAGTTTTCAAATTATCAGGGTTACCATGTTGATTTTC
GTTTTTTTTAACATGCCCAATATACACAGGATTTTTATCATTATTACTTA
CTATTTGCTTATATAATTAACAGAATTACTCTTAATATCCCTCCCTCCAA
TTAAATTTATATAAAATGGATTATAATTTTAATTTTTATTATGCAGGTTA
GATTGGGAATCTGGAATTATTCGAGGTTGCTCCATTTTTCGCCAAATGGA
AGAGAACCGCCTTGTTCAATTACAAGCTCTATCTGAAACTTATCAATCTG
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GAGCCGATCCGAAGCAGTGACGTCGAGAGAGATATGGATGCCTCAAAAGC
TAAAGTGAGTTCTCTATAAAAAATACTTCAACTTAGTATGATTTGTAATT
TCTTTTGTTACAGTTTGAACTTGACGGAAATGTGCGCTGTGGTGACTCCA
TACTCCCTGATACCTATGCTGAAGATGCAACAAATGCCATGAATCAAGAA
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TGAAAAAGAAAAAAAAGGTCGATCTGGTGTTGAGAATTTGGCTAAAGCGC
TCACGGAAACACCAAAGTTTGGAGGAGAGGACTCATTAGTAGATATTCAA
GAGAAAATTTCCCATATGTCTTCTATGATTTCCTACTTGGAAGCATGTAA
ATTTAAGACGACTAATTCATTGAACTACGTTGATGGAAAGACAATGATTG
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TCTCATCATTAAAGAGCCCCTAGAAATAAGACTTGGGTTAAGGATGCTTT
GTTTTAAAATTTGATGACTTTTATAACCTCGTGGAGCTCTTGACGATTCA
CAGAGGAGCTCCGGTCGAGAACAACTCTTATGGCCTATCAATTGTATAAG
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TTGCATAGATCTAACAAAATTTAAGCCCGGAATTGATAGCGTAGACATGT
AATACACACAAGCATTTAAAAACTTCACCCAATTTTTTGGGACAAGGCTC
AAAAGGGTAAAATATACAAACGTTGGACCCATCCCTATAAATATGAACGA
TCAATATCATAAATAAGTATTTTCCTTTCTTTTAGTTGCCTTCTAACGCA
AGAGGTTTCGGTTCCTTAGACACTATTCCAGACTCGTTTTTAACTTCTGT
TCAATTTTGTGATAGAGAAGGATCATCGAGTGGTGTGAGTGAAGTGGGCT
CTTCTCCCACGGCTCCTCATAAAACAACGGATGAATTAGTGAATGATCGA
CATCACCATCACCGACACCATTTCCACAATCATCKCCACCACGACATCGG
TGATGACGATATCGACGATGAAGAAGATGTTGATGACGACTTTGACAGTG
ACGAAGATGATGACTATATTCTTAGTAGAAGTCATCACCCTCTGGACATG
AGTGGCGGCGMCAATGGGAGMAGTGTCATTCCCAGTGACTCCCAAGAAAA
TGAAATATCCGAGTTTTATTATCAAGAGAAGCAAGTCTCATCATCCACAA
TGGGCCAATGCTCAGCAATTTATGACTACCAAGCCAATCTTCATGATGAG
CTAACGATATTCGCTGGAGATATAATTACTATTCATGATAAGCAAAATGA
CGATTGGTGGTTGGGAGAGGTTCGAGGAGCTGTTGGACTCTTTCCATCAA
CATATGTTGAAATTAAATAA back to top
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