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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s160 | supercontig | LSalAtl2s160:410135..460472 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002783 >EMLSAP00000002783 ID=EMLSAP00000002783|Name=EMLSAP00000002783|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=685bp
FCYWFGEGSPWPFHVVNIFLHLSSTHWLSIICTSVLHLKRGTQFVIVTLF ALHPIHTETVSGIVGCADLLSANFLLISFITYTRSSTTNFPEEKISWRTI SLISAILSLLSKETGISALVINLTFTIFREASIKSPSISPKRIPIDIFSF VCLLVSRLAIQKQSLPEFSEPDNPAAFHPDSTTRLYTFLYLPVHNFWLLL CPAYLSYDWQMGTIPLIKSILDFRNILSIIFYGGITRLILLSTVQENEIG KMGIKANNNNRPVLTGMLFLILPFLPATNIFFPVGFVIAERILYLPSIGF SILIGIGFERVYSVLKRFSFPKYFLHVSLILLCFCFTSKTVRRNYDWTSR ESLFKSGLINSPRNAKVHYNFANVKRESGDIISAVYHYKEALRLWPRYVP AHNNLATILSDEKQVEYHLREALEVNPRHPNSLYNLAALLRNQDNCEGAI PLLERCIEANHYDQVAYTLLFDCLRETKRIDSSFITERPNRSRTSHDDYS RDVKLRQDLVPKEAARSVSSEKNIDFLSQMAEIYISLTKYSKAATALYWI LDIDPFHKLSLYQLSQVYLEQNRKEEALKIIDRADHLCSYGEDLCFDIYC QKLCTRILIQKGDHYTLALERSPSEPSLLLSLGALHHTLGEWESAWKRYR ECLQLDPRNTDLLSNMEKLLRAQNMSEERHNSTFN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s160:410135..460472- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002783-698630 ID=EMLSAT00000002783-698630|Name=EMLSAT00000002783|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=50338bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s160:410135..460472- (Lepeophtheirus salmonis) TTTTGCTATTGGTTTGGAGAAGGCTCTCCTTGGCCGTTTCATGTTGTTAA
TATTTTTTTACATCTTTCTTCAACACATTGGTTATCCATTATTTGTACTT
CAGTACTTCATTTGAAACGTGGAACTCAATTCGTGATAGTGACACTCTTT
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TTGACATTGGAGTAATTACTGCCAATGTCCTTGTTTATTTCCATCTCCTG
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TTCTTACATTCACTGCAAATTATCCAATCCCTGCTAATGATTAATATTCA
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AGTAAATATGTAACTCATCTACAATTTCCAAATATTGTCTTAAGTCTCAT
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AGGGCATTGAATGCATCATGGCATTTTTGTTAATCCTCCATCTCTTTCTG
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TATGCATCAACTTACATAACCATTAATGTTCAAGTAGAAACCATAAGACT
TAGTTAATTACAAAAATCTACTTGATTCTACTTTCAAGAAGTTTTATGTT
GTATACATAACATATATGTATGTAGGTATATTTGAGAAAGAATTTAGTTC
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TTAAAAATGAAGAGAACTATCATTCTAAAAAATTTCGAAATAAATTATTG
GCTAGWTAACAACCAATTTTTGCTGAAACATTTGTTTTTCATTTTTCAAA
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ACATACTTATGTTACATATCTTTACTCCTTTTTTTAAGAAAATGATTGAT
AAATAAAAGGGAAAAAGTCATTCAAGCAAAATGCTTTTGAATGGCCCATT
TCCGACTTCTATTTTTAGGGGATTTTTCCTTATATTTTGTTCGTACTTTC
GCTCAATTTCTTTTCTTTTTTCGTGTTTTCCCCTCTTTTTTCTCTTACAA
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TTTACTTCTTCCAAAATTGGCTTTTTGAATTTATTTATTTGCTTTATGGA
GCAGAGCTTCAATAAAACTTTTCAAGGCATTGCTTAGCTTGATTGGTATT
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AAAAAAATTGGCGCCATCCATGTGTGAAGCAAAATACTTTTTAACCCATT
TGTTAAATATTGAATCAAACTTGGCTACATTGGTATTGGTTGTTGTATCA
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TATTAGTTAGTCCATGTCAGCCTTGACACAAAACCCAATTTAGGCTAACC
ATAGTAACATCAATGAACTTATTTTATTATTAATAATTTTTACGGTCTAT
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ATTTAAATCAACTCCATCAAGAACAACATGTACTTAGTATCGGGAGTATT
GTTCAATAATGATTATACTTTTTAATATCAACAATGTGCATATATTGTAT
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GCTTGTGTTGTACATAACAATTTGACCACAGCTTCATGACTGCATTCCTG
ATAGCACCTTCGCTGATGCTAAGTCTTCAATGACAACCATATTGTGACTT
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CAGGGGGGGGGGGGGGATAAGATCTGCAATCCATGTTTTGTTTTTTGCCT
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GAAATTAAACAGGTATTTTCTTTCTTTAATAACACTATTCAATAATTATC
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ATTTGTGGCCTCCTACCTCTCCCGACCTTAATCCTTTGGACTATTTTGTC
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GATGCCAACGGTGATTATATCGAATGAATGGCTACTCTATACCTATATGC
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TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTATATTTTTTAATT
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AAAAAGGCAGTTAAAAATGGATTGTTCCTTAATTATCGACTGTAAATGAC
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AAAGTAAGMCTSCCCAACAACCGCTACTCATAACCTTATTATTCATTTAT
GATGTTAACCCCCTATCGTTTAGTAGCTGTACTTCTCAATAAAAATAATA
AAAAAGTTTTATTAGTTAAAAAGTTCAGGGGTTAGATGGTTTGGGGAGTG
AAATTCTAGGTGTTGAAAGGATGAGAGATCCTTGCTTGTAGGTGAAATTA
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ATGTTGATTTATTGAGCTTGAACTAAATCTTATAAGGCTGTGAACATATT
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ATAAAAAAAAAGTCTAGGAGATTAAATCTTTAATCATTATTCAATGAAAC
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TAAAAAATAAATTTCTTACCTTGCTTTTTTTACTTATCTATCCATTTTTA
ATATATGTTTATATGAAAAGAATTGCCTTAAGGTTTTTAAAAATTTGTGC
CCGGAGAGAACATAATATATATTTACATACATGTATACTAAAATATATTA
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AGAAAGCTTTCAAATATATTAATTATTTATAATATGACAGTATGTATTTT
ATAATGTATCTAAGGAAGGAAATGTAAATCTATCTAATGAATATTCTTGA
ATGATTGTATGGGTACATTGTATAAGTTTGTTCATACCCATTTTGAAATT
GTAGGCAGACACAGTGAAAAGTTGAAGTTCAATAATGGCAAAACTATATA
CGATAAGGAAAATGACTCGGAGTCTATCAGTAGACTAAGGGATTACACCA
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TCATAAGAAACAAACTCACCACCTTTCACTCATAATGAAACCTTCCCTGT
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TCACTTTTGAATTGAGACAAATATTTTTTGTATCACGTTTACGAGACAAA
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GAAATATTAGCTTGAATAGATTTAGACGAATCTAAATGTAACAGAATAAG
ACAAAATTATCAATGATTTCGAGTAATCTTGCATCGACCACTCTAAAATT
GACCTAAATAATGTCACTTCTTGATGACGTATTTAAAAATGGCGTAAGTA
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TGGAAGAACACCCCCGTTCAAATAAATGTTCTCCCTAAATCCGAGAACAA
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ATTGAATTTTTCATCTAAATTTGATAAATTAGCATAATTTAAAATTGTTC
ACAAAGTAAATAAAGCTCAAATACATGTCAAAGATTTAAAAAAATATATA
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GAATATATTTAGATTTTTATTACCCATATATATGAGCATACAAGTATAAA
TTTAATATAGTACAATATTTATTATTTTTTTCTTTATTTTATAGGCTATA
TACGTTTCTTTATCTACCGGTTCATAATTTTTGGTTGTTATTGTGTCCTG
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ATTTTGGATTTTCGAAACATTCTTTCCATTATTTTCTATGGAGGAATAAC
TAGATTAATACTTTTATCCACAGTCCAAGAGAATGAAATCGGAAAAATGG
TGAATATATATTATAAGTTTATTATTAGAGTTGTGAAAATGTAATAAATC
CTGCCAAGTGTAAATTTAATATGTATACCGGGTGGTTCATCGAAATTTTA
AGACTTACTAATTCCATAATACCTGTAGGTTGTGTAACATGACTATTTTA
AGAAAAACGTAACTTTTATTAAATCAAGAAGAGACAATTCAAAACCAATT
TGTAATATGTTGAAATACTAAATTTAGCTATATTTTTTCGAATATGTCTT
TTTGTAAAAATAATAACAACCTTGACACGTTGCAAAACTATTTGGCAGTT
CTTGACGATAAAGGCCGTGTCCACAGCGTACCACACTTTCATAATGATAA
AACAAATTTGAATGAAAGGTGCGGGAGAAATTTCCCCCCCCCCCCCAAGA
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GAAGCATGNTGRAAGCCATATTGTAGCTCCAGAAGTTTTTGGTTATTCCT
AGCTGTATCACTATAAAACAACCTTCCCATCCTGAATGGGCTTCTTGATG
CTGTAGAAAATCATGATATATATATCAAAGGTCTCTTTGTAGTGTTTTGG
CGCTGACACCGCCGCGTTGCATTTTTGTTCTTAATCATACTTTTTTACAC
TTAGAGACATGGGATAAAAACAAAATTTCTTATTTTGTTTTAGGTGTGGT
TTTGTTACGTAATTAAATCTCGAAATAAAAAATTACTGGGATAAAATCGT
CAATAAATGTTGCTGCAAGTTTTGAGTCCGCACTCTGTATATATATATAT
AAATATATATTTGTTGTTAACCTGCAAAATTTTTGTGCTCTTTTTAATTA
TTCCTTCCAATTTTGACCATTCAAAGATATCAGCAAGCAAGGAGGGCTAT
AGTTTATAGAAATTCCAATTAGACAATAAATCGTTTCTTAAATTTACCAA
ATTATTATGACATGCACCAGATTTCTTACTATTTTCACGTCTCTAATTAT
TATATTACAAGCAAATGTATTTTTAGTATCCAAAAACAACATGTATTTTG
ATATATTTAAGGGAATCAAGGCCAATAACAATAACAGACCAGTGCTCACT
GGAATGCTCTTTTTGATTCTACCATTCTTACCAGCAACAAATATATTTTT
CCCAGTTGGTTTCGTGATAGCTGAACGAATACTTTATTTACCAAGGTAAG
AGAAAAAAGTTGAAATATTATTTAACAATGTTCATCCCATACTTTTGTGT
ATTTAAAACTTTTCATTTGGTATGTGTCTACAACTATTTGAGTGAGTTTC
CTCTTTGATGATCATTCTCTTCGTGTGGAATATTTGATTACAATGAATTT
AGCTTATTTTCTCTCAATATATTTGTCTTAGTTTTGTTTGCTTTCCGCTC
AAAATGGTTAGCAATTTAATATTATCTTTTTCTCTCTTCGATGAGCATCT
AAGTACTTTACTCTTGAATTTCTGATTAGTGATTTATTACCGTACATAAA
TAACATTATTATCGTCATAGTTGGATTCTTGGAATTGATTAATTTTTATA
TATATACTGTAGATAGTCCAGTATTTAACCTATCTTTTAATATAATACGT
CAACAAACTAGTAACATAAGTATTTATACTGTCTTTACCCAAAATAGGCC
AATAGTTTCATCTTGAACACATTAGTCTTTTCCTTATAACATAGGGTTCA
TAACCAGATATTTTATAAGATGATATGTTATTGATGCTGACAAATCTGTT
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