EMLSAT00000002944, EMLSAT00000002944-698791 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002944
Unique NameEMLSAT00000002944-698791
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s168supercontigLSalAtl2s168:826273..848707 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002944 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002944EMLSAG00000002944-685710Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000013011EMLSAE00000013011-721939Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013012EMLSAE00000013012-721940Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013013EMLSAE00000013013-721941Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779854auto779854Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002944EMLSAP00000002944Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002944

>EMLSAP00000002944 ID=EMLSAP00000002944|Name=EMLSAP00000002944|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=208bp
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HHYQTSKQNLVPNNTRMNNSSLHNRNYSRYGNHQLSRKGEGMTSPPQTHN
RILVRTCNGLELRDPPYIPNSSGGGGGYLTTTTTNNAINRGNVIEDWKYV
AMVLDRLFLWIFTVAVLVGTAGIILQAPTLYDDRQPLDIRLSQIGLATAR
PMAGVNKD
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mRNA from alignment at LSalAtl2s168:826273..848707-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002944-698791 ID=EMLSAT00000002944-698791|Name=EMLSAT00000002944|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22435bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s168:826273..848707- (Lepeophtheirus salmonis)
ATCCGAGGTAATGAAAAATCCACGCTATACATTTATGACGCCAGACAATG AATATTTGGATGAACATCAGGTTGCAGAGCTCCTCAATTCATCAGACATG CAAGACTATCTTCATCAACAACGTCAATATCAGAAAATGTCCTCGAATCG CCAGTATCATCATCATTATCAAACCTCAAAACAAAATCTTGTGCCAAACA ATACGCGGATGAATAATTCTTCATTACATAATCGAAACTATTCTAGGTAT GGGAATCATCAGTTGTCAAGGAAGGGAGAAGGGTAAGTACTTTGAATATT GTAACGAATAAGTCAATTTATTGAGGATCAACAGATAATTATCATACCAA AAAAATATATATTATACGCAAAGTGTAGCTGCGATATGTAGATTGTTCTT TAAAAAAATGACAAATGAAGAGAAGAATTTTGACTGCAAACTCTATCTTT GTAATAAATATCTATATATTTAATTATATAATACTATCATTCAAGGATAA TTATTACTTTACGCAAAATGGCAGCATTCTCAGTCTCTTAGTTTAAATAC GAAAATAAGTAAATGACGTTGAAACCCCACGAAAGGATACTTATATTGTG AAATGGTGGATTTTCTGGGAATTTTCCGTAGGTATAAAATCCTGGTAAAA CAGGATTGTGAGACCCCAGTTAGTACGAGTGTTGAGAAATGGATGGAAAC CGAGTTTTTCTCTGTTTCGGTATTGAGTGATTTTTTCTGTAAAAACATTT TGGTCAATATCTTAATGAAGTGAAATAAAATATAAACGAGGTAACTGGGA AAAAAAATGTAAAAAAAAAATGTCATTCACAACAAAAAATTGATTATATT CTTTAACAAATATTTATTCTAAAAACAACTTTATTTTTATTTTGAGGAAT CGATCCTAGAACATTTTTTTGGTTAAGAATGAAAAGTACTTTGAGACCAT 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