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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1988 | supercontig | LSalAtl2s1988:215..18844 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003620 >EMLSAP00000003620 ID=EMLSAP00000003620|Name=EMLSAP00000003620|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=379bp
MGKSTIILLVLLASDTLARCPWEQNSLFEDLQTHCECEVSSELGLSVACI DVDFFNLLKGLREYSQNSVIEFLTIKNSTIPNLDDFIFKNLKIISLEINA CELKSVSDHAFRGLENTLQSLSLHNNVLRSVPVGALRHLRLVSVLDLSKN RIKYITNNAFVTLRLKTLKLSFNNATLSESALRGLENSLNYLHLKSCQLT GLPNAILGLSGLNFLDLASNNIRSLPPGHFQNMNSLSALNLEKNIIQSLD PLVFLGVNDTLTSMSLLNNLITEYPFQAIRSLKNLKVLDLGFNLLRNIPP GSFRGLNSLTLLAVDGNPIPTLNRIVFEDVRSSIKGLSLGGRFLVCDCKV AWISEWILLQNLQVTSREENPQFCGSPQH back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1988:215..18844- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003620-699467 ID=EMLSAT00000003620-699467|Name=EMLSAT00000003620|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18630bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1988:215..18844- (Lepeophtheirus salmonis) GGCTATGGGAAAATCAACTATCATACTGTTGGTCTTATTAGCATCTGATA
CTTTGGCTCGTTGCCCTTGGGAACAAAATTCTTTGTTTGAGGACCTTCAA
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GAATTAGTTAAAATAATATCTAAATTATACTTAAATGCAAAATAGGACAA
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GCACATCATTTAAGGAAATTATGTAATGAGAACAATGACAAATATCTCTA
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GAGAAGGCCGAGGTCGTCCTGAAGCAAAAGAATAAGCATCACACCTCCAT
AATGATCATGGCTGMCGTCTCGAGCGATGCCTCCCTCCTTCTTCGGGTCA
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GACGGCAGTCAAATCGAAGAAAATGTTATTTCTATGCTTAAATTGTTAAA
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GTCAAACTTTGTTCCGATATATCTGCTAGAGACGGTATGGTATGTTTTTT
ATCAATCTGTCCGTATGAAAAAATATGAATCATTAACCAATGTCTTTATC
TTAGTACCAGTGACTAAGGATTTATATATTTCATGAGTAGAAGTATGTAT
ATCTATTTTAGTAGTGGCGTCCGCAGGGGTGGGCTGGAAGGAATGTATCC
CCGCCCCCCCCCAATAAAATATATCTATATAGATATTTTTTCTTTGACTA
GAAAATTTAATATTTAATATTTTTCTTTCAAAAAAATTAATATTTGAAAT
TTTATTTAATTTACTGTGAATTGCTCTGGATTTCTGACATATTTTCTCCG
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AGTTTTTTTTTGTGAATAGCTGTGAATTTCTTAAATTTTATTCCATAAAT
TTAATATCTAAAAGTTTAATTTTTGAAAATTTTAGCTTAAACATTATCAA
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GAAAAAATGTATATTTGAAATTTTTTTTCGAAAAAATTTTAATTTTTTGA
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GTGTGGAAATTTAACTTCATACTGTTTTTGTTTCAATTAGCTTCCTTTGA
ATAGTGAAAGATGAATGATTTTTACCTCTAAGTAAGAGGGCATTGATTAA
AACATAAGTCTACAATATTTCACGCCATTACCTTACTAACACAAAATATA
CAGCATATGTATTTTGTTGTCAGATGTCGATGTGACTGATTCTTTCTCCC
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TTGTTGGATAACACAGGGGAACAATAAGGGTTGTGGAATCTTGTACAAAG
GAATTGAAGGCAATGATCGACTTTATCTATGAGCGCAGAATCCAAAACTA
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GCAATTCGGGACTATTATTGTTCAAAGTCATATTTTAGCCTTAAAACAAT
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TGGTTATATAGTGGTTTTATTGATTCTGTATCCTGATTTGAACGAGATTT
ATTTCCATTTTTAGGCGAAAAAATGATGCAAAATACACTCTTCATAAGTT
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GTGATCCCATTTTTTATGGGGGCCGTACAAGCAAATAGTCACACTAAATT
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AATCTGAATACCAAAAAAGCTTCAAAAATATATTTTGTACCCTTAATATA
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CCGTTTTTTTATTTTTTATTTATTAAGCCCGAAGTAATTTATATTATAAT
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ATGCATAAGATTACTTTTTTCCCATATATCTTAATTCAACAAATTATGTA
TTTACGTCCTACTACAAATAAACTCCAGATGACGTCGCAATATTTGCAAA
AAAAAAACACCTTTCAAGGTTTTCTAATCCTTTATTTTTTCGCTCTCTCA
AATTCCTTGCTATACTAATAATCCCTGATGATAAAATCACGACTTTATAA
CTTTTCTAAATCTTCATCACGTTGAATTTCCATCCTCATTTAAAACTACA
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AGCCAATTCATTTTACATCATATACCCGGTTTACCCGGTGTTACTCAGGC
CAAGGAGGGAGCGGGAAATCACATTGACAATGGTCAATATTATTTCTTAT
AATGTTTAGAACTCTTCGGTACGGGCGCGATTGGAATTGTGAAAAGGAAC
ACAAATATACCAAGATTTTTTTTTTGTACTTGCAAAAAAAAAGGACATGG
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AAAAATGATAAAGTACATTGTTTCAGAAATTGAAAATAATGAAATGTAAA
GTTAGATTCTTAATTTTTTATTTATTACAAAAAGCATTGTTTTTTGGTAT
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AAAAACGATTAAGAAAATGACAGATATCTCATTCAAAAATCAGTTTTTAT
GTGTTAAATTTATATGCAAATGAATTTCCAGACAAACTTCTACAAAATTT
ATTAAAGAATCCAAAAATTCATTATCAAATAATTTTTTTACACCCGAAAC
AAAAAAACAAGACGAAATTACGATTGTCACCGCTTTCTTTTTTTATCATA
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GTTTTTGCATTTTTAATTCAACCCTCTATCTAGTCTCCTGAACTCCGAAA
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ATTTCATAATGTGACCATTATATAAAATTTGAATACTCAGTCAGTTTATA
ATATTTGACTGAATATTTTACATATTTGTTCGTTTACAAATAAAGTTCTT
GATATTTGTCTTGAAAAGTTATTTAAAAAGTAACAGTGATTCGACTTAAG
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GACTCCGTCCAGCACATAATTTTTTTCCCGGTTTGATCTTAAGTGATTTT
TTCTAGACCGATTTGTACCGATTTTTCAGTCGAGACTGAGGTCTCAGACC
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GCAATTTATGGACAGATTTTTTTGCTCATAAATTATGAGAGACCTTTTTT
TCTAGATCAACTGTCATTCATTTTTTTTCAAAAAAATCTCAATAGTACAC
GATAAGTTCTATAACAAATACTGTATACTTATTAGTGACGGTGGGATCAA
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GAAAAAAACATATTATATCCTATTATAAAAAATTTATTTGTAAAATCTAG
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GTTCTCTTCTATATCATTAAAACAAAATATGTATGTGTATAACTACGGGC
AATTCGGCTTACTACCCCTAGTAGGAATTTAGAGTAATTATTACAATAAA
ATTCGTTCAAATTTGATCCCTTTCCAAAAATTGTATCCCTAAAATTTCTC
AAAAAAGTTATTTGTTAAATTTGCCATGTATAAAAAAGAACCATTCTGTC
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CACTTTTGTTGATATAAATTAAAAATCATTTGTCTAAGAATATAAATGTA
ATATAGACTTAATTTTGAGAAAAAACATTATGCTTGGATTTCTTGCGACG
GTCAACATATATGTATAAAATTTACTAATGATAAAAACAGGACGAGCAAT
TCAGGTGAAAAAAGACAGAAACAACTCTGTACAAAAAAAACATTTTTGAT
GAACAAATTTCGTCCTATCTTTTAAGTAATATACTTTTATTTTACTTAGT
AACCTTTATCAACCGTAAGATTTTTTATTTCTCACCCATATGTTAAAATT
TTCACAACATATGTTTAAGGTAGAGTTTTTGTTTTTATTTGTATATCATT
TCTTTAGAACCATTTTTTTTCTCATACCTTATAAACCACTCGTATTATAA
GTCGAATCTATGACAAATAGACCTCATCATTTACAATATCAATTAATAGT
AGTACTATTATTTATTGATAATAATAATGGTACGTGTCCCCTCTCATGAG
AAAATATTTATTGGTGTTGGGAGTCAGTTTGAAAATCCTAGACTGGTCTA
AATCGGTCTCAAAAAAAAAATTGCTCTCACATAAAATTCGGTCTTACCGA
TTCTATAGATAAATTGTTTATGACGTCAGTTATGAACATGGATGAGGAAG
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AATGATATACCTTATAGCTCTATTTTACATAAATTTTTCTCCAAAAAATT
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