EMLSAT00000004287, EMLSAT00000004287-700134 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004287
Unique NameEMLSAT00000004287-700134
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s224supercontigLSalAtl2s224:572617..599340 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004287 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004287EMLSAG00000004287-687053Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000018625EMLSAE00000018625-727553Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018626EMLSAE00000018626-727554Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018627EMLSAE00000018627-727555Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018628EMLSAE00000018628-727556Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018629EMLSAE00000018629-727557Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018630EMLSAE00000018630-727558Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018631EMLSAE00000018631-727559Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018632EMLSAE00000018632-727560Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778665auto778665Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004287EMLSAP00000004287Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004287

>EMLSAP00000004287 ID=EMLSAP00000004287|Name=EMLSAP00000004287|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=584bp
MSSWGEKMTSVVTACGTTHGIPYARRLEKVKFGVPLDQVCKKDIPGPLLV
MLLKLNKEGPFKRDVFRAPGHQGNMRKLVHFLQQGRLVNIHTFSVNTIAS
VLKKFLRKIPGGIFGPENEKELFTIIRMENTEAKLERVHQLLLDLPIYSQ
HLLVLLFGTFRVIHSNSVKAQTGMSAEALGXSLATKVTTFFIEHFGIRNL
FGRDNYEYYAKLTGRILKVEDEWIFFTXPPVILGGSRDDMXPSLNRIPSD
DEGCGGGTRSLEKTGSLEIIPENCPLDPQGRLSISLDDHQQNVSSPSSCG
SPLEPLHNLNTIASPISGRNTIPGRSEFKLLNLGGVDLSPSFFMCSFDKK
SFFPLFTPWLGLIKKWDLHRRHSISFYSLMMFVVQDDSPSPTISDHDEHE
GNRCMEQQVHERQTERMKHRSEWFLSDPSGLVTVKCRPGPLALPLQTVSA
TTGWRICNERPSSLPGQVKNPQVTNVSTGSSSCNLRRRLSDKERRLVRRS
SSKRKDKENGGGPSLKRAGSADSGSGGGVGSTSNTTNNSSSTRNNHGSLR
RTGSQETSGALTTTPPPSSHTNSNESLARTLPRI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s224:572617..599340-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004287-700134 ID=EMLSAT00000004287-700134|Name=EMLSAT00000004287|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=26724bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s224:572617..599340- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAGTTCTTGGGGTGAAAAAATGACTTCCGTCGTTACAGCCTGTGGAAC TACACACGGAATTCCCTATGCTAGGAGATTAGAAAAGTAATCATTACGCA CACTATTTTTATAACCAGGGATAGGGGCTCGAATCACGACAGGATTAAGT CAATACTCATCGATTAGTCCTTTAACTTGCAACGTTTCAGTCAAACAACG ACTAAACATAATGCAAATATTCTCGAAACTACTAGTAAACACTCAGGAGT GCATATTTTTATGTATATAGCTTGATATATGTCGCTTCAGTGTTAACTTC GTTAGTTATGATAGACAAAATGTATTCGTCAGGGATTATTTTTTGCATGA CGAGATAAAGACGGAAATAAATTTTTTTTCGAATGTTTCGTCTGACTAAC AAAGTTCTTTTCTTGACAAGATGAAGATGAANNCGAAGCATTTTTTTAAT GTTTCCTATGTTTAATATAATCTTTTCTAGAACAGATTTAAACGAAACAA AGCAATTCTTTAATGTTTCGTCCTGACTAAAGCAAATATTTCTTGACGAA ATGAAGGTGAAACYAAACATTTTTTTGGAATGTTTCGTTTAAAAAAGCGT ATTGACGAAGTAAAGACGGGATTAAATTTGACGAAATTAACACTAAAGTG CCGTAATGAATTAATTTATCTGATGCAGGTCTTGTGAGATTCGAACCCAC ACACTTGTTATAGCTAATATGATTTGTATTGTAGTGTAGTAGTAATAGCA AATAGGTGGAATCATTTCGTTTCTTCATCAACATTCTTAGATTAATTATG ATGATGAAATTTGACCTATTATACTGCTGGTAAAGCAGTTTGATCAAAAC GCTTCCTTTATACTCTTCTTCTTCATTGTTATCATCAAATTATCATAGAT ACACATACATACAATTCAATTATTATTATTTTTTATTTTTATTAAATAAT TGTACTTTTTTTATTATTCAAATGCAGGGCGTGTTATAAAACTTATAACT ATATATGTACAAAAAAGAGAAAAATCAAGCTGAACAACGACAAAATATAA AACTAGTAATAGGAAAAAAAAAATCATTATTAATAAGAGAGAATAAATCT GGTCATAATATATCGTTTTTTGATTTGGATATTCATAGTACAAAAAGAAG AGAAGAAGCATTTAAGTTTTGTGTTTTTTTCTTGTTCTGAAGTTGTGTTT AACATACATTCAATCACTCATTGAAGGAGCCACGTTTTTGGAATGGAGAT AAGAATTTCTTCTAATTTTTTTATTGCGTACATTTATTTATATATGATAA GAGAAAAAACATAAAAAATCATATTCCTTATGGTGTCGGTGTGTCAGCAG GGTTTAGGTTGTACATATACTATTATTGTCGTGTATGTAATTGAAGGAAA TTAATCACCATTTATCTGTGGCTATTAGTTAATGTGCAAGAGTGCTTTAT TTATAATTGTATATCATTCTCCATGACACTCTCAACAGACATGGCTTMCT GTGTCTTTRCTGACTATACTCTACGTCGACGCRATTCATGTTGCAGGGTT AAGTTTGGAGTTCCTCTGGATCAAGTGTGCAAAAAGGATATCCCTGGACC TTTACTTGTAAGTTATTTATTTCCTTACTGTTTTTGAGATTCTTTTTATA CATATTGTTGCTATTTCTTTCAGGTTATGCTATTAAAGCTTAACAAGGAA GGTCCATTTAAAAGGGATGTGTTTCGAGCACCTGGACATCAAGGAAACAT GCGTAAACTAGTTCATTTTCTACAGCAAGGAAGACTTGTGAATATTCATA CTTTTTCTGTCAATACAATCGCATCAGTTCTTAAAAAGTTTCTACGTAAA ATTCCTGGAGGGATTTTTGGACCAGAGAATGAAAAAGAACTATTTACCAT AATTAGAATGGAGAATACTGAAGCTAAATTGGAACGTGTTCACCAGTAAG CTCTTCAATATTATTATACAAATCTTCAATATATATTATTAGTAGTGACT GATTGCCCTTCAAAGTGTTCACATATATATTCACCTTATGCTTTTTAGTC ATTTCTTTTCTATTTGTATTTAAGCGGAAAAGTGTTTGAATCTACCGTTT AGAAAAGGTATCAGGAAAATTGTAAATGCAACTTATTTAAAAAAAAATAA GAACTATATTCTTGTTATTATTGATTCATCTCATCAGTTATTAAACTCAT ATGTGATGATTCCTTGAATTTCTTAATTTACATWCCTTTTTTTTTTTTTC TCTTTGATTAGTGTTACATCTTTTAAAAACTCNAAGTATAAATTATTATA TAAGTCATAACAATAGATGTGATAAGCCTTTAACTATACCATGTTTTGTA CCTTAGTAGAAAACAAATATGGAACAATAATATTTATTGATGATATTATC AAATTGGTTGATGCCATAACAGAGACAATTACACTTTTTCTATCGTTATT TGTAAAATAATGGTATACCTAGTCCTGGAACTATATCACTTTAAATTGAA GTTGATAGGGATGGATCTCAAGTATATAAAAAAATGGATAACTCAGTCCA GTTCTATATAATTGAGAATAACTGAAAAATAAAATACCCGATTTATTCGG ATTCTAACCCAAAAAATGTTAAGAACCGTTTTTCAGGGGGAAAAAAACAT ATAATTTCGTGATTCAGTGTTAAGTTTCCAAGACGAGTCTTGAGTCACAA GCCAGCTTAAAATTGAGTCCTAGTCGATTTGTTCATCTTAAACACGTGTC AATTTGTAAAATGAACCTTGTAGGAACAAAAATAACTAGAATGTGTTTTC TGTAGAGAGTAAGCCTCCGCCCATGGTAATTTTTCCTGAATTTGATTTTT TGTTTTTATGAAACATCATTATTGAACCTACATAAGAACATCAATTCGAG CTTAGTACCTCAATATGTTCCTAAGTTAGGATCAACTATGTAATTTTAAC GTTTTGTGCTACATTGACCTCTCAAAATAATGGTATCTTACTGTGACCAT ATATAATCTGTATACGAAGTTAGATCAAAATCGATTTGTCACTTTTGCCA TAATCCTGGTGGGTGACAAACAAACTAACAAACAAAATTTCACGTTTCTA GCATCGATAACCGAAAAATCTAGGTTGTTCTGTTTTAGTACTGAGAAAAT TATTCAACTTACCCGTATATATATAAAATTAAGATTCTAAATCCATCACT AGAAATGGATAAATATAGTCATTTTACTCTTCGCTTTAATTTATTTATTG TCAATTCCTTTGTCTCATTGCAGATTACTCTTGGATCTACCAATATACTC TCAACACTTGTTGGTTCTTTTGTTTGGAACATTTCGAGTCATTCATTCTA ATAGCGTGAAAGCACAAACGGGTATGAGTGCCGAAGCATTGGGAGMTTCG GTAGSTCCKTCTTTTTTCCATACATGCGTTGCTGCTGGTAAGACAGCCAA AATGGAAGATGTTGAACGATTTAAGGTAAGAGTAATTGTCATATTATTGG ATGTAGTAGTAGTAATTGAATCTTCCTCATATTGAAAGATATAATTAATA CGTACGACTAAATTTATTTTTCTATATTTCTTCATCCATGCATTTAACAA ATTATCTTTTTTTTTGTTTTGTTATATCAATTATATGACGCATCCGAAAC ATTCTATCTAACTGTGAACCAATGGCGTGATATCATGAGCAAATCGTTAT TTGAATATTGTTATTTTTCTCCCCTTAATATTTCCTGTCTCATGTTATTA TGTATTTAGTAGAAACTTATTCGAATTAAATTGGAGAGGAGGGGAGGGGG GGGGGGAAGACATTAAAATTAAAGTTCTCATTTTATCCTCTTTTATTGAA GTTCATCCTTAGTATTGGAAGCTGAGATATTATTACTCTGTATGTTAAAC GGATATGACTGTTAATATTGATATACTTMCATGTCTCTGGAAGTGTGTCT TATAAAATAGGATAATTTTGTCTTCTTCCTCAACTCTAATAATATGTAAT TAATTTGAATACGTCTTCTTTTTCTTCCTCACTCCCAGATAAATAAATAA AAAACACTTATGTACATATATGTATACAAATATTTTGTTACGATTCAAAC TCTTGCAACCTTCAGTTTTGATGTTACATACATAGGTAAATAGTATATTA GTGTTGAGAATCGATCCGAGACCGTATTGTTTCATGGTTCGGGGATTTTT TCATTACAAATTTGGACCCCAGTTTAAAACTATGAATCAAAATTCAAATC AAAGATCTTAGTTCTAAAAAAAATGACCTGGGACCAGATCAAGATTGGAT TTTTTTGTAGGTCAAATTTAACTATAATATTAGTTAACAGGCTCTGTGCA CCTATTTTATGAGTGGAGGGMCCAAWAACTAAAAGAAAAAKGATTTTTCT TTGCTGATGTTGGATAATTGTAAATTCTTAAACAAGTGGTMTAGCCACAG CCTGCTGTTGAGCTGCCCCTGGTTTAGTCATAACAGTTTCAGACTGGTCT AGGATCTCCAGACCGAAATCCAACACTAATACGTATATTTCGTCAACATC TTTTTGATGTGTTTTTTTTTAAAAGATGTTAATTATATATTTGATTGTAT GAACATAATTACATAGATATAATAACTGTACTATGTTACAGCTCTCTGGA TATATTTCATTAATAATAGTGATTATTTGATTGAATTAACGGGAAAATCT AGAGTTACGGGGTGATAACATTATTACGTAAATTTTGCCAATATATTACA 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ATATGAAAGGAATTTGAAAAGAAACATACCGGAAACTAGAATGGGCACTC GGTAGAATGAAAAACTTCCGTCTAAAATCAAATTGAGTTACTTATGTATA TCAATTTTTTACAAAGTAATGGTCAATTATGCATTTTTATATTTTGTGCT ACCTTGACTTCTCAAAATGTAATGGCCTCTTACTGTGAGCATAGATAATC TTCGTACCAAGTTAGATTAAAATTGATATTTATCTTTTGCCGTAACCCTA GTGACTAACGAATAAACAAATGCAAAAAAACATAACCTTTCTTCAACTTC GTTGCAGATGTATCAACAAACCAACAGAAGCAAAAATCCTCATGGGAATT CTTCATACTCATGAATTCCTATGAAGTTGATACTAAAACAAAAGGAAGAA AAAGTTGACTCTATGCGGATTTTTACTTTATGTTTCTTCTGTGCAAAGTA GTTTATGCAGTAAAAAATATGTATCAGAGAGAGAACGCTGACTATAAGGG TACTTCTATTAATTCCGAATTTCTCTGTATGTCAAAAACCTAATGTTGAA AGATAAAAAAATATATTTTTATAACTCGAGTCATCTTTTTTTAAGACTGG AATGACCGAGATGTCATATTTGATACCCTTGCATTTTTAAGTCATTTTTT CCTTAGTTCTAATTGAAAAGAAACTTTCTTATATTTCATGACATTTATTT CATTTTAATCTTAAAAAACAAGAATAACAAAAAATGATTTGAAAAAACAA CATTTATATAAATAGCTATTATTAAGTTCATAATTTGTGTTTAAAAAAAT TAATATCTTATATAATAAATCACATTTCATTAAAAAAATCTCAAGTTTTA ATAATATTTTGAAGCTCGATGTCATTTTTGACATCTTGGCCATTTAAAGG AATGCAAAAATAACGAACATTAAGATAGAAAAGGTGTTTCTTTTTCTTCA GAGGCACATAACTCCAAAAATAATTAATAATATAAAGGGTGTGAATTTTA AATCCGGAAAATTTAAGGATTATGCATTTTTCAATTATTTTACCTAAATT AATTTAGGAATTCACAAATCTTTTGATCTTGCATAAAGTCAATCACTCAA ACTAGCCCCTTCCAGCTTCAACCACTACCTCCAACCTAGCATATGCCTTG ATGAAGATCTCCTTGTTCATGTTGGACACAACTTTGAAAACAGAAAAAGG AGTAGTCGAAGGGGTTCAGATCTGGAGACCTAGGAGGCACCATTTCCTTT GTCCAAACCATGTCTTTAAATGTGTGTTTGTCCGGAATAAATCCGCGTCT AATTAGCAAATTTGGATAAACTGCACCAATTTAAGACCTCTAGCATTCGC GTATTTGGGCATGACACACAATAACGGATGCTCGCCGTTCTTATTCGGAG GATCGATCTATAATGATGTATTATTTCTTCTACAGTTTTGTCAGCTGAAT CTGATGAGTACACTTTTAAAAACAAATATATCAGGATTGCGAAGATATTG AGGTCTAAACTTGTTCCAGATTTTAAATCTCCACCTCGAATATTTAGTGT GTATGTCTCTTCATTTATTCGGTCCTGCCCGTTCTTAGGACCAGTCGTTA AGACCGTAGACTAATAGTACTAGATCTGATTTAATAAAGAAGAAATAAAG GTGAATAACGTCATCAGGGAACAATTTTTTTGGACTGATATACAGGACTG AACTGAAAGGACTGGAGTCTTCAGTCCTAAAAAAGGACATTGTGTGTATC ATTGCATAGCTGAAAGTCTGAGCTTGAATTTTAAAACTCCCTTCAAAAAA GCTTTATATCGTTGTCAAGTTCATATTTGAAATCAAAAAATATAACTCGT ATTAAGTTCAACCTATTTCGATCTCAGGGGAAACACACAAGAGAAAGAGT GTTTTTGTTGGATAGTGTTATTATTATTTATAAAAGAATATTTGAAACAC TCACAAATTATGTCGAAACATTTTATAGAGATATATCTTGGTATTTTTTT TTTTTTTAAGGATTGTWTTGATGAGTGTTTAGAAAAACTATTGGTAAGTT TTGATTCCCACAAATTGTATTGTAATTTTTATAATGATATCACATATGTA GTGTTGATTGTTTTCTAATCTGTCTTCCAGGATTTTCAGTGTCATTTAAT TTAATTTATTAATATCCTACACATCAACGTTAATAGAAATACAAGGTTAT ACCATAATGTGTGTACGACTGATGTTTGACTTCCACAACGCTTTTTAATA TTGACGTCATAGTGTATGAGTGGTTACGTGTTTTATCTAAATCTGTTTTT CTTACCCAGCAGTCGGTAACATTAAATCCAAAATTATAGCAACAGTGGCG TCATAAACTATGATTGGTTGCTTCTTTTGTCAAAATCTTYCCCAGATGTC GCTACGATATATCAAATTAAAAATTCTAGAAGCCCGATTACATGATGGTC TAACCTAGTATTTCTATTAACCTTGCCTACACATTATATTATAGAATGAA ACACCATTTTGAAAAATGAATTGTAATTAAAATTTAAAAAATACATTAAT GTGATCAAAATATCATTTAGTCTATTAACATAATTGGTGATGAGACTAGG TTTTATAATAAAAAAACAAAAAACAAAAAACCTTTTATAATACGTCTTAT ACATATTGGGTGAGTTAACGCAAAAACAATCTTGAACAGAAATCAAAAAG AGGGAAAATATCTAATTTATTTTAAATCACATGTACAGGGTGGTCTAGAT AAATTTTGAAAATCTTTAAAGGCTTGTAATGAATTAACTAAATGATGCAG AACCATAATTTTGTTATTATTTGAAAGCTTGATATACTTGGTCACACAGT 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