EMLSAT00000005406, EMLSAT00000005406-701253 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000005406
Unique NameEMLSAT00000005406-701253
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s290supercontigLSalAtl2s290:493651..518008 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000005406 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000005406EMLSAG00000005406-688172Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000023583EMLSAE00000023583-732511Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023584EMLSAE00000023584-732512Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023585EMLSAE00000023585-732513Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023586EMLSAE00000023586-732514Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023587EMLSAE00000023587-732515Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778150auto778150Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000005406EMLSAP00000005406Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000005406

>EMLSAP00000005406 ID=EMLSAP00000005406|Name=EMLSAP00000005406|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=351bp
MKNIATMSWSTNKQQQYCLKWNNYAASVTSTFKNILDGEDFVDVSLVASK
GHALKAHRVVLAACSVYFREILKGLSLWQHPVIVLKDVPFTDLQGIVEFI
YHGEVSVDQDALPSLLKSAEILKVKGLTEEDPPPFRPDEPFESTSQKLSK
NRLYISNKHNHIRKNAHPIQIRQSCPEKEENEVDNTICKGKIEPNKNDLG
YKCNKSEVIEKEIDDTEDGDIDRLSNPINRSSTPFAYSSLDTDSFSQIIN
YSKTINSNSLTQKKTCPHCFQQLSWHALSRHVRDMHRNQSNYVSCKFCHK
MFRNKNSLGCHMWRFHKDSKDNKDSINSSXLTGTXVTKLASTTFNVKQDE
Y
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mRNA from alignment at LSalAtl2s290:493651..518008+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000005406-701253 ID=EMLSAT00000005406-701253|Name=EMLSAT00000005406|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=24358bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s290:493651..518008+ (Lepeophtheirus salmonis)
ACTTCGCGTACATGTATGTCCTGCTTGCAAGGTTTCTTCAATTTATGATG ATTTTATGTAATCTATTGACAAAAATCATTTAGTTTAAAAATAGATGAAG AATATAGCAACAATGAGTTGGAGTACCAACAAGCAGCAACAATATTGCCT TAAATGGAATAATTATGCGGCATCAGTTACATCAACATTTAAAAACATCT TAGACGGAGAAGATTTTGTGGATGTGAGTTTAGTAGCGAGTAAAGGTCAC GCCCTTAAAGCTCACAGAGTAGTTCTGGCCGCATGTTCTGTTTATTTCAG AGAAATTTTAAAGGTACGATAACTAACATTATGTTATAATTTTTACTATT AGTACAATGAAAGGCTTCAAATAAATGTCATAATAATTACTTTAAATATT ATTTATATAGGAAAATTGTAAATTATGTGACTACAAAACCTTTAATCAAG AATAAACTTATTTGCCTAGAGATTTGGCGGTTAAAGAAATTATGAATATA CTTAATAATTAAAAATCAACATATAAAATTATTTTATAGTTGTTTCGTGA TTTTTTTCCTGTTGATTACTTAAAACTTTTAAATAAAAACATGTATATCC TAATCGTAATTACAATTTTTTATATTGAATAACGTAGTATTATTAAAATT TCAATTATTGATTGGATTTTGAGTTAACAAAAATATTCAATTGAATAAAT AAATATTTAATTAATATCTAAAGGTGTAGTTTATGGTAAAATTAAGAATA TCTGGAATTGGAAATTAACAAAATTTCTCAAAGATTTGATTCAAACTAAA TCTTAGATTTAATATTTAACTTGGGTCACATAGTAATATGGTATATTTTA TACAAGGTTGACAAAAATATATATATAAATTATTATTTTTTATCTTTTTT ACATAAATGCAAATGTAAATGCGTACTTGTACTTGTTATACTATGGTTTA AATATATATGTATATGTTACAACACATTCTTTTCCTTTAATTTCAGTATT ATGTAATAGTTTTCCTTCAAAATTAAGTAAAAATAATTTCAAATTGAAAG TACTATTCCATTTTATTTATTGTTCATATGTATGTTGTCTTTACACACTC GAATATGATTTAAAACACGAGTCATATGCCTATCTTATACTAGTAATATT TTTTTATACACTGAGTATTCACGCATTCCCAGTTTAGTATTCGCGGATTT AATCATTCGCAGTTTTATTTTTGGAATAGAATTACTCCTTATTCGCGGTT TTTTTCATTTCTTATAAATTACCAACAGCATTTGTATATTTATGTAATAA TAATAATAAAATTATTGCTGATAAACATTTCTACAAAAACGGTTTAATAC TTTTAGTAACCGGCATAGGCTATGCTGGACGAAAATAATGTAGTTTGTTA ATATTTTAACTACATTTGTAATAATTTCCTTAGTTCCATCAAGCCAAAAT GTATAAGGAATGTTCATCCTTCTTCTATCAATGATTCTAATATTATAAAC CTTCTTAGAGTAAGCAAATATGATATGTTGAAGGGTGGAATGTTCTTTGC CGACATGGTTAGTTACTACAATTTCCTTGGGAACACTGTACTACATGTCA TTAAGAATAAAGAAACACAAATCTGAAAGAACATTTATATTACCGTGAAC TTTAATGCAATTATTTCAATTGTCTGTTATGACGATGGAGGTATAATAAA TTGTTTTATTTTTAATGTATCTACTGTGTTCAAACAACGTTAAAACTAAT TCATTAGTAATAATAGTTCTGGTTTTTATCAGCAGTGAATAATGAGGGCT AACTGTAATTTAATCAATGATATATAAGAATATGTATTTAATTGTTAATT AAGAAAAACCTTCACTACTGGGTTACCTTTAAAAAATTTTGACTGATTTT TTCAAAATTATATAATTCCAAGACAATCGTTTAAGATATATAGATTTTTT TGTAATGTTTTATACGAATAAATTATATTTCAATAGCCATTATTAGGAAC ATATAAGCAGGGATGGGACTTTTGTAGAGTACAATGTTGTTAACATCAGC TTTATGTTATATGAATTTGAGAAGATAAAATATATTATCGTTATAGAAAA CTTTCTAAAGTTTAAAAAAAAAAAAAACATTAGTGCAGACAGAATTATTG TTGGTCTTAATGCCAAATATTCCAAACAGTCTCATATTACACATGACAGT TTTTCTCCAAAATGTAACAATACACCCCCTAGTTCAAACTAGATAATAAT GATAATGTGTAGGTATATACAAACGTTTGCGCTTACAATAAGACAGTTTA AAATAGACCACAATCTTTTTCAAAACTGCTKTATCCGTATCCAACAATTA TTTTATAAACGTATACATATATGTTTGAAAATACATTTTTAACGTTATTT ACTACACGAGTAATCGAAAAATTGAGTGATTATATCAAGAAAGATGTTTG CACCACTAAGATCTAAAAAAAGGGAATATTTCTGTAAAGAAAGAATAAAA CTTCCAATCATTTTTCTTCTTTCATAACATAAAACAGTATTTTTTCTTTA CAAAAATAACATCACTATTTATAAATGAATCATGTTAATGTGATAAATTT ATTTATTTAAATGTTTTTGAGTGTTTAGGGGGATTACAACATCTATTATG CGCTTAAACGCAATTTATTTCCAAGTTCTTTGTGTATAATAATCTTCAAA CCTCAACAATTCTCCACTAATACAAAAGAAGTTCTCTGATCTAAAACGTT TTTTGTTTGGGAGGAGATAATGCCACGTCAGTAATTTTGCTGCTTCCAAC ATTCCATTTAACATAATATTTCCTTTTGTAAACCACCTTAATAATAGTAT ATGAAAGAGTTAAAGTCAGTTCTAGTGTTGAGATAACAAAGTTACTTGAA TTATAAATATAATTTTTACTAAATGCATATGGGTAATTCCATAAAAAATT TATCCACCATGAATTGTTATTACAAAAATTGCCTTTACAAAATCCCCCTC CCCGAGATAAAAAAGGAAATCTGCATATTCCAGTTTATTTCAGAATTAAT TAATTAAAAGCCCTGCAATTATTCATATTAACATACAGCTACTAAGGAAG TAAATAATTAATGACGAGTATAAAAATCCAATAGTATACCCATATATTTT TTACGAATAATTTTTAACGATGAAAATACTTAAATTGAATACATAAAATA ATACTTAGCCTCTATTGAAGGACTCAAAGAAAAGAGTAGACATAAATAAC GTAAAATGAGTAATTATTTTCTTCTTTTGTCATATAGGCTTAAAAGAGTA GGCTTTAAATTTTGGAATTTGGAGCATATTTAAGAGACAAAATTCAATTT TTGTCAATGTTCTTGTTTATTTCCTTCCTCCCCTCCTTCCTTCTCACAAA TGATTGTAGCAGATAGAATAAAGCGTCATGAAAGCTAGCCTGCTGTTCTC CAGAACATTCTTCAAATTATAAGGGTTTCCATGTTGATTGACGGTTTTTT TTAACATGCCCTAAAAAACATGATTTTCATCACTACACATAAACGGTATT AAGAGGCTAGTAAAGCTCTCACTGAAGTCAGCCGGTGTTTGTTAGCATGA AATTTTCATATTTTGTATTCCTTGCTTTCACACATTAGAGGGGAATTTTA TAAGGCGAACTATAGACAGAGTTAACAAAATCAGTTAATTTTGTTTCTAA ATTGTCAACAACTCCATCATGTCAAAATAATTAGTTGACTTGTCAATTTA TTTCAAGAGCTCCAGAGTCTGAATTACGTTGGAACGGGATTGGCACTAAT 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