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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s290 | supercontig | LSalAtl2s290:493651..518008 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005406 >EMLSAP00000005406 ID=EMLSAP00000005406|Name=EMLSAP00000005406|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=351bp
MKNIATMSWSTNKQQQYCLKWNNYAASVTSTFKNILDGEDFVDVSLVASK GHALKAHRVVLAACSVYFREILKGLSLWQHPVIVLKDVPFTDLQGIVEFI YHGEVSVDQDALPSLLKSAEILKVKGLTEEDPPPFRPDEPFESTSQKLSK NRLYISNKHNHIRKNAHPIQIRQSCPEKEENEVDNTICKGKIEPNKNDLG YKCNKSEVIEKEIDDTEDGDIDRLSNPINRSSTPFAYSSLDTDSFSQIIN YSKTINSNSLTQKKTCPHCFQQLSWHALSRHVRDMHRNQSNYVSCKFCHK MFRNKNSLGCHMWRFHKDSKDNKDSINSSXLTGTXVTKLASTTFNVKQDE Y back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s290:493651..518008+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005406-701253 ID=EMLSAT00000005406-701253|Name=EMLSAT00000005406|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=24358bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s290:493651..518008+ (Lepeophtheirus salmonis) ACTTCGCGTACATGTATGTCCTGCTTGCAAGGTTTCTTCAATTTATGATG
ATTTTATGTAATCTATTGACAAAAATCATTTAGTTTAAAAATAGATGAAG
AATATAGCAACAATGAGTTGGAGTACCAACAAGCAGCAACAATATTGCCT
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TTTTTTTCCTGTTGATTACTTAAAACTTTTAAATAAAAACATGTATATCC
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TTGTCAATGTTCTTGTTTATTTCCTTCCTCCCCTCCTTCCTTCTCACAAA
TGATTGTAGCAGATAGAATAAAGCGTCATGAAAGCTAGCCTGCTGTTCTC
CAGAACATTCTTCAAATTATAAGGGTTTCCATGTTGATTGACGGTTTTTT
TTAACATGCCCTAAAAAACATGATTTTCATCACTACACATAAACGGTATT
AAGAGGCTAGTAAAGCTCTCACTGAAGTCAGCCGGTGTTTGTTAGCATGA
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ATTGTTCCCATAGTCATTCTTTCCTCGATTAAAAAAATCAGTCACATGGA
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GAGTATTTTATGGAAGGAAAGGATTCCCCCCGTTCTTTTCATTCGATGTG
AGTATAACTGACTTATTAAAATTTATGGTTAATCCAGAACGTTTTGAAAA
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TTAGTTTTTTTGATATTGCAGATTTTTTTTTTCAAAATGTTGTCTCACTC
CCTTAATGGCTATCAAAAATAGTGATGGAAAGAACAAGTCATCTTGTTTA
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CAAAAGTTTTTTTAATAATCCACAAATAAAGTGGTGAAATCGCCCTTAAA
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ATTCTTCATAAATATCTGCTGGGGTCGTTGATAATGTGCGGAAGAACTGC
CATTAGTTTTATTATTAAGGACTGCATCAGAATTTTGTATGAAGTATAAA
GTAAAGTTATTGGTCTATAGATATCAATATCCAGTCTACCTTTATCTCTT
TTAGATATTAAGTCAAAATTCCTTCTCTTATAAATTGTGGAATAAAGCCA
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AACAAATCCATTATAAAATTCGAAAGTAAGTCGGATATTCCTGGCGCTTT
TTACCTTTTCTTATAGCCCATGATATATGCAATAATTGATTTTTTAGAAA
TAAAAAGCCCAAGCTCCCTAAATATATCAATTAGTAACGATAACCCGGCA
TCTATGATGTCTTTAGGTAATAACTATGACCATATATCATCCATTTAAAA
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ATTCGACAACTCTTTTTTCTATTCTTGAAGGGTCTGTTGAAACTTTACTA
TTATTTAGCCTTAACGCCAAGATTGTTCTTGAGTTTTATTTTTTAATGCT
CGCGGTGAAGGAAAGTACTTGATAATTGCTTCGGTTAATTTGGATTTAAT
TTTGACAATTTAAATTTTCTTCTAATTCTCGTTTATGTAGCTCTATTTCC
ATCAGAACTATACAGTCGCTGAACACGTTGAATTAAAGCTGGTCGTTTTT
ATGTATTTTCTCCCATCTCCCACAAAAATACTTTTGGCGAACGTTTCCAC
TCTTTTCCGCGCTGAGCTCAGGGTTACTAAACAGTTTTTGAGAAGCCACA
AACTATCATCATATATTTTTTTTCCACTTTGGGGTATCGATTAATAGTGA
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TTGCAAGGCTAGGTGAGTGGTCCGATATGAATGAACGGAATTTGATAAAA
TACGTCATATCTTAAAAATCTTTAAATATCTTAGAGAAATTTCCTCTTAA
AATATATTCAGAAACATTTCTAGAAAACGTCMCAGCCGGGCATTCGGTTT
CAAACAATACTACAGCATCCTCAAGACTACMCTTCGCCATTATTCTTTCA
AGACCCTATCCAATTTTATTATTTATCGAGCAATTATAATTTTGAGATTC
TCTATCATCCTGCCTGGTAATTTTAAATTTTTATTGTGTTAATTCTAACA
TGTACCTTCCAAATATTTAGTTCATAGCTACATAGTTTCCTTTGGAGTTA
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TAAATAATTAATGGGGCATACTGCTTATGACTTTTGAACAAGTTTCCACA
RGAGCCGATATCAGGGAATCCAAGTGATTTAAGGTATGTGAGGACCGCTG
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AAATTCATATTATGAAAACATCACAACTGTTCGAGTACAGGTAAAACATG
AGGTTCCGTTAGGTCAATATCGCCAACTCTTTTCGTTCCAGTTATAACTA
TTGCATATATTTCAGACGAATTATTTTCTAACCCCTTTTGAAGTACATCA
CTTTACTATCGCTCATGCCTCTAATACGTAATGGTAGTCCCAATTCCGTG
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AGCAGTTTCCAAATAAGCTTAACCGGATTTTTCATTAGTTCCATAATATT
TAAAAAGTTCAATCGTTATATCCATTTTTTTTTAAAGGAAAAAGATTAAA
TAAGCTTAAGCTGCATTTCATCTATAATCCGTGTACACACAATTTATTTT
ATTTTATTTACATTTAATATTTTTCAAACTTCATCAACACTTTTTGGTTA
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TGMCAGCCATATTTGTTGAAATTTGAAGATAATAAAAAGAAAAGTTTGGA
AATATATTGTATATAAGCGTATTAGTTGTACAATGTACACACATGATAGA
TGTGATAACTATGTATGTGAATATAGGCTAATTTGAGGTGAGTGTAAAAA
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AAAATAGATAGGAATAATTATCAAGATCATTCATACTTGCTCTTAACAAA
ATATAATTTTTTTAAATTTAGACTATCCTCAATCAAAATGTCAATTTCTT
CATCTATCAGAACTCAACGTTGAATTGAGTTCCATATTCAATAATTAATT
TCTGAGTATGACTACCACCTATAATACCACATAACAAATTTTAGTCAAAT
CTGTTTTCTCGTGGAAGGACCCATATATATATTAATAATTTCTTCGGATT
CGGAAGTCCGAAGATACTAATAGTTACTAGATAATATCTTACATTTTTAA
TTCTTATGTTAATTTGAATAAAACTTATGTAATAAGTCATCTACTATCAT
CCTGAGCATATCACCTTTCTTGTTTTAAACCTGCATTTTTGAGTCAAAGA
TACTTGTCATGTTTTCGTTTAGAGTTCGTGATATTTCATATTCAGCCATT
GATTTTAAATTGATTAAATTATAAATCAATTATATATATATATATTATCT
AAATTGTAAATTCACCCATAATAATTAATAGTTGGGTACACAAGAAAAAT
ACAGAAGGCCATATCCTTTTTTTCTCATTTTAATTTTACTTTTTGAAAGT
TGAGATAGCGAGTGAACAAAAAGCTCGTCTGGAATATTGAGAGGTCTTAT
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AAGATGCGTGGTTGAGCAAATATACTAATTGGGACAAAAACTATTTGGGA
AAAAAGTATTTTTTGTTTTTTTACATTAAGTGGTTAATAACATAATTTTT
ATAACAATCGGTAATTCCAACAGCAAAAATTATATTCAACTCTGTTCGAC
TGTGAGGGTGTAATAAAAAGTTAACAAAATCCATTTTTTCCTTTATTTGA
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AGTACGGAAGGGAGACATATGGTACTAAGAATTAAAGTATATTTAAAAAA
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TTTTTATAAATAAGAATTTTCTATATTTCCAATAACACTACAGGTTAGTT
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GTACAGATCTCTGCTATTTTTTCGATTATTTGAAGGAACATAACTTGATT
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AAAATCTTGGGAACTGTTTTTTCCAATTTGAAAAAAATATACAAATACAC
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ACCAAAATATACTTAAGCAATTTTACTGGGTGAAAAAAGATTTTCTTATT
TTTTTATGTTGTAAATTTACACAATATCTCCAATTCTCAAGCAAGTTCAA
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TTTTTTCAGCTAAATCAGATGAACATACTTTCATAAACATAGTTTTCATG
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GGCATGAGCTTTGTTCATATTTATAGAGATAAAAACATTTTTCACATAAT
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TGATGAGTCATAAACAGTTCATAACCATAAAATATATTACAAACAAAAGA
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ATAATGAGACTGCTCATTACTATGAATGATGAATAAGTGTCTTGTATTTT
CTCATTTTTCAGTGTTAAAAAATAAATAAACTTGATCTTACAGATATTCG
TTTATGGTGGACTATATGAAAGTCCTGAATTAGTTATTTAACAAAGTATA
TGATTACTATCTTGGAATTTAGACTTTAAGAAAATTTAGCAATATCAGTT
TTTAATACTACGAATAATATAAAAAGTGTAATTCGAGGTTTTTTTTTGTG
TGTTTTGATTTTTCCTGCATTTTTCTACGTTTTTAAAATTTTGCCATGAA
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TTTTTCTCTTTTTATTTTCGGTCCTGCCATTTTACGAGAGACCTTACTTA
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CGTCTAAATCTTTCCGAAGGAAGTTGTATCTATTGAACTTTTCTATTAAA
GGAATAATGTCTAATTAAATAAGCATGCTAAAATTATGTTTCCTTGTCGA
GCTACCCTTCCACAGCATATTGACCTGGATATATGTTTATAATTGCAAAA
AAAATCCATGGTCTCTTTCACACATACATGGCTAACACATACCTTCGGAT
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GAACATTACTTTAAATTTTACGCCATGCCCATATTCATGATTTTATTGAG
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AACTCCAGTAAAATCTAAATAGCAACAGTGAAACAMCAGCCGATAATATG
GAGAGACGTCGAGTCGCAATTTTGGAACTTTCCACGCGTGGCAAACTCCC
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GGTAGCCAAAGGGACTCCTGAGGTGACCACGAGATCTAAGCCAAGACCTC
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TCGAAGATTCTTCTCAACAAGCTTAAGAAAAAGCCAACCGATGTCGTCGT
TTTGTTCAGTGATGAGACACTCTTTAGCCTAGGCGAGATGGTAGGCCAAT
GACACCGGATTTTATCTGGTGGAGTCTCTCGGTGCCAGGGATGATGATGT
AGGTAAGGAACGGCACTTTGCCAACCTCGAGGTCTTGGTTGTACTTGCGT
CCGACGGTCAGAAATGGGATCTCATTTTCTTCGAGGACCAGGAGAGGCTT
AACTCCGAGACGTACTGCCAATACTTGAAGGACAAAGTGCTCCCTTTGGC
AAGGGCTACTTACGGGGACRGGTGGTGTTTGCAGCAGGMCGGTGCCASCT
GCCACACTAGCACTCTACCCAAGAGTTCCTTCAGATGGAGACTCCAGCCT
TCTTCGATCGGTATTCTTGGCCACCTCTCTCCCCTGATTGTTCGCCGCTT
GCTGTTGGAAGTACAATACAAGYCCAATGMCCAGCCGAAGTTATCCCTCA
AACATGCCTGAGCCAACCTCGACCAAAGCTTCATCGCCAAGTCATGCAGC
AAGTTCCGGTCCAGGCTGGAGTTGGTAGTGGAAAACATGGGCGGCCATAT
TGAATAGAGAGTGTTATTCAATCTCTCACAAAAAGATCCTTCATACTGAT
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CCCAAAAAGGCATAGCCATTCTACACCATATAATCCAACCTGTAACGATC
AAATAGAACAATATAATGAAATTATATGAAAGTCCATTCAGTTGCTCCTG
AGATCGAGGGATTTAAAAATAAGTCAGTGGGAATATGTTAACCATGATGC
TTTTCATCCTATAAGGAATCGTCTATGAACAGCTGCTAATGAAACTTCGC
ATGAACTGGATACTCCCCCCCCCCCACTATGGTTAATGAAGTCCAGACCA
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GCAGAATGGAAAATAATCTTTTGTTTTTTTCTTAATATATAACTATATTA
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TTTGATGAAATATAATTTAACATTATAGTTTAAAATTTATTCACCAGATA
GGGGCTTACAAGCATAAGTAATCATAAGCTAATTTAAAAACATTTGCATC
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ACATGCATCAAGCTCTATCATGGAAATTAGATTTTCTTTCGCAATTTCCT
AAAATGATGATATCTTATAATATGAGAGGCCCACTTTCAAGCACCTATCA
ATCATCTTAAGAACCTTTAATTCTTACACCCCGGTCTTGCAACCGTCGAA
ATTAAAATTGGACKAATGTCTTGAGAACCTATAGTTATATTCTTTGAACG
GTAACCCTTAACATTTAAAAAAAAAAAAATTATAGGCATAATTGCATAAA
CATTATTTTCCTATAGACTCCCATGTTTAAAATAATAAATGATCTTCAAT
ATGTAACTAAGGGCATTCCAAAACAAAAAAAAATTGTCTTATGGTGTTTA
ATAATTTACCACAATCTTTACATGGAGTGCTGAAAAACATAATTCCTGTG
ACTATTTGAAATTAATCTGTAAATTTTCTTCCATCAGCTATTAACAAAGT
TGATGACATAATCCTATGCATTCAATTACTAGATAAAAGTAATTCCCTAA
TCCATCTATCATTCCTTGGCAATGCAGAGTATTCATTTGAATTAGAAAAA
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ACCGAAATATCATGTATTTTTTATTGATTTTTTGTGAGTGCCTCCAATTC
CAAAGACCTGTCTTTAGAATGTTTCATCAGTTCTTTAAAAAAAGTTTATT
TCTTAGATACTGACGAATAATATCAATGTCGTTCTATAATCGTAAGTGGG
AGTCGCTTTCCAAAGAACCCTTCGTTTAGCAGCAAGTGAAGGTAAAAAGT
CTTCGATATATCCATTCATAAGATCTGTTCCAAGAATAATATATTCATAG
AACGGACTTGATGTTAAAACATATATCCTCTCTATGTTTTGATTTTTCAT
TATATTAACCACAATTTTCAAGTAAACTTTTGTGATTATGTCTGCTAATA
TTTAGTTCTATTGAAAGAGATTCACCAACAAAAAAATTTCCTCCAACATA
GCAGCCTCCCCCAATATTGGTAAAGAGATAACCTTATACAAAACATTAGG
ATTAAAGAAAGTGTTGTAAAGGTTTTTACTTTCTTTAATATTAAAATTGC
GCCAGTTTAAGGTAAAATGATTAACTTTCGTTTTTAGTTTCAGCCAATTT
TGATTCTTCTTTATAATTGAGCCTTGCAAGTCGCTTCTATTATTACGGTA
ACATAACTTTCATAAAGATCTATAAGNCTATAAGATGATGTTTAATATCT
CCAAAACTCACATCGAATACTATTTTTATTTTTTTTGTCATGGGGTTCTT
AGCTCTTGGCAGGGGKGAAGGCCAACGATGCTAGCAACTTTTACTCAAGT
TAATCGATATACCTTCTTTTATTTCGCTTGCAGTGCCCTGGCCTGTTTAA
AAAAGGTGTTTTTTTTTTCTGTTTTTTCACCGACCTCAAAATATGAGTGT
GGTAAAGGGAATCGAAAGCTTATCAACAGTCTATTGCAATAATAGCTCCA
AACGCTTGGATAAGAGACAAGTATTTGGAGCGATTATAGCTTTCGATTCC
CTTTTCCTTTAATTATTGTTTTTGGCATATATCCTTTCTTTTCCATAAAC
TTTTATAAAGATATGGAATGATTTATTCCCTGCATGTCGTAAATATATTT
CGTCCTATCCCATCTAAAGTGTTCCTTATGTATTCTGTTAATATCTCGTT
ATAGAATATAGAAGTTCTTTTCCTTTTACTTTTAGGGAAATTACTTCTGA
TCCTAGCAATTAACTTCTGGAAGGTTCTACAAAATGCTTCTGCAATGTAA
TCTTGATCTTCTAAATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTTTG
TCGGTAATGTTTTTAATCCTTCGAAGGGGATTAATTTAATTTCCTTTTTT
AGCCCTCGCTTTTATCTATGGCGTTATATTTTATTAAAAAGTAAAACTAT
GCTCAAGGTGCGTTTCAAATTATCTTTAAAATGATTAAAAACTTTTTTTT
TACTAATGCATCCTCTGACAGTGATATGTATTAGGCGTATGTTTTGATTG
GTTAGTTTTGATTTTATTTATGCATTTTTCATGATCAATCAACCACTAAA
GTAGTTTCCTGGACTTTAAGAAGTTTCGATATTAAAACTCACCACCACTA
TTTTGTGATCTGACAATGGTTCAGAACGATATAATGTATACTTAGTATTT
TTATAGATCTGTTTTGTTGCACGTGATAAATCAATTATTTTCCATGAAAC
GCAATCCCAGTGGCTAAAATATCCTCTTAAGTCAATCAAATTTAATTGAT
AGAAAAGTTGCTTTGGATTTTTATTTATTCCGATATGAGCTGCTGAAACT
ATGGAGGTCAACGTTAAGGTCTCCTAGGAGTAAGATTGGTAAATTATCAC
CTTTGGAATTGTTAATAATGACCTGCAAGAATGATTGAATCTTTAGGTTT
ATATCATAAGTTTTAATTAATTCAAATTAAGTATTTTCAGTGCATATTAA
AATTTTATGCCAGTCACTCATACTGGAGTAAGATTTGCTCCGTGTGGGAT
CACCAAGAGATTTAGAAACTGATAACCTATTGTGTACTTCAAGTCTACAA
TAGGCCTGTTTTTATTAGCTTTAGATGGCAAGTTCTTCTTCAGAGCTTGT
AGATAGTTCTTGCCAACTGTATTTCCCTCTGAAGACATACTCATATTTTC
ACTTGTAATTCTACCAGTGTTATTATTTCAGTCTATAAACCTCGAATTAC
ATATTTTATATTAGAATGGGCCACCCAGAGAGGGCCTTCCCGGTAATGAT
ACTGCCAAAACTTTTTTAAAAAAACTACCGTCTGTCTTCTGGTATCTACT
GGATATTCTTTAATACAATCACAAATGCTCTAGTTTCCCGTGAAATTAAA
TTTCAAAACAAGATGAACAAAAGATAGAGATGATAGTAAATAACACCAAA
ATTTTATTTATTGTAAGCAATTAGCTCTATTGAAAAGACCATACAATATT
CAACTCTTAGTTCTGAAAAAAAAAACCAGAGAAAAACGATAGCGGTAATG
AATTAGACAGTAACACTAAAAATTCATGTCGAGGTCTGGAGATTTAAATT
TAGGAAAATAATTGGACAATAGAGAAAACATTTCTCTTTTCAACAATTTT
TCAAACGTAATCTAGGAAAAATTAGTCTTCCGGACGTTTCTTTAGAGAAA
TTAGACAGCCTGATAACTTCCAAAAAGATGCCTAAGAAGTAAAATAGAGA
GAATGTGATTATATCCTCTAACTGTCTCTATCTGTTATATATATTTATTG
GTAATATTGAGTTTATATTAATTATGTCTATTTGTATGTAAATATGTATA
GGTGAATATCTATCTAATAAAGCTCTTTAAGGGTATATTACACACTATTT
TCACAACTTTGTGTCCTTCACAAGTTGAGTGATTGTGACATTGTTTGTCC
GATAAAGGAATACAGTATTTATCGAGACTCGCTAGTGGTATTTGACATCA
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