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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s294 | supercontig | LSalAtl2s294:325441..341252 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005472 >EMLSAP00000005472 ID=EMLSAP00000005472|Name=EMLSAP00000005472|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=313bp
MGPLQRHKRHFQTLNTSILYLLYFATSYLFDVCSSIHLEAVVVPQYKFRG
QNATLLCRYELKNNEQLFSLKWYKEETEFYRFMPRDDLRIRGGFKERKLD
PHDDSIQTWKVSGIKIDIEKSRPEEVILKRVGFKSTGMYRCEVTAVVRKK
ELPKQLPTILGGEIKRTYKPGDFLNLTCTSAPSNPPAKLQWILNGREIDE
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KDVENVFTEREKIVKVLEIRESQWPNSSGSYLRSSPASFFWTFFIAMDYL
LSYNTIMSIILYR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s294:325441..341252+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005472-701319 ID=EMLSAT00000005472-701319|Name=EMLSAT00000005472|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15812bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s294:325441..341252+ (Lepeophtheirus salmonis)
CCCCGCCAGTATTCAATGGGTCTTCTTCTTCAGTTGTTTATTTCGTTCAA
ATCTCTAACTCTAATTTAGATATTTCTTCATCTTCTTCTCTACACACTCA
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CCTTCATTCGGTTAAGTTAGTATTTGAGTGACGACAATTTGGCACGAGGT
TTATATGTACATAGTAGGGTAGCAAACCGTGGACTCAATAGATGGATATA
GAAATACATCAATAATTTTACATTTTCAATAATAAGCAAAATAAAGTAAT
TTTAACAAAATATGTAGCCATTGTTTTTGTAAAACTTTTTTAGCTTAATA
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TAGAGGACTTCAACGAGTACACATTTAGGTCTGAGGTCCTCTTGGTTTCC
CTTTCCAAAGTGAGAAGGGGCACCATCCTGAGTCCACACGTACTTATTCT
CAGGATAGTTGGTTTTCATCCATGGCAAGATGGTGTATCGAAACACCTTA
TAGTAGGTTTACTGGCCGATTTTCGTCCAGTCTTGAAAAAGAACGGATGC
ATCTTCCTTATATAAGAGACTCGAACGCCGAGGATCATTGATTGGTGTGG
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TCTTCTTGTCCGAGAAATTTTTTACAATTTACCCATGTGAAGATTTGCTG
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AGGTCCTCTTGAAAGAAACCAATACCAAGTTGTGATTTAAGACCACCTGA
GGGTCTTAGGAACCACAGAGAAGGCATTGGSGAGCCGATTCATCGACTTA
CTTGGATCCTCCTTTATATTCTTCTCCAAACTTAACAAGAACTATGTATC
CCTCATTAAATTATGCTCTCCATATCCTGGAGTAGTTTTTTCCATTTATC
CAACATAAAAATCAGCCTCCTAGAACAATTAACAATGTCCGTAATCTTCA
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TAGTGATGAGAAAATAAACATTAATTAACTGTCCACGTTTTACTGCCCAA
ACATGTACACTATATTTCAGTTCATATGACGTTATTGTAGGTGAATAGTC
ACCATTTTGAAACACAACTGAGGTCATAAACAATTTGGTCAAGAACTAAT
TTTAATTAAGAAGTTAATCAATTTTTTTTACAACCAATTTGAATCGAATT
TTTTATTTGAGATCGGTCTAGACCTAACTTCATAAGGAATTTAGTTCGGT
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TAACATTTAAATTGTATTTAAAATATCAAATCATGGGTCGATACTTCAAA
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AAATATTGTTCCCTAAAACTATTTTTCTGACTCCAGTTAAGGTTTATTTG
TGTATTCGTACATTCTGCATCAATGTTAATTAATTGAGATAACTTTGCCC
AAATTATTCAATTATTTATTTATTTATCACACAGAACAAGAAAAAATTCT
ATTTTTTTCCAATAGCATAATGTTAGTCATAAAAAGTGCAATACAATATT
AATCCTAGTTAATGAAAACATCAAAGATCAGTCAGGGTTGTTCAATGTTC
AAATTCTGATATCATGTGCATAGAGAAAATCTGGACAGTTATAAAGAGAA
GAAAAAGAAAAAATCCAGAGAGGAATTGATTATTCTTCTTCTCAGCTGAC
AAACTGTGTTTATTGCCTCCCCCTCCAAAATCAATCAAAAAATGGCCTCA
GAAAGAGACAAACGAATCGAGATTGATACTGTATTTCGCCCAAATCCACA
TTAACAGAGATATAAATCTTGACTTAGAAAGCAGGAAGACCATTTACAAC
GTAAATTAATGATAATATTAGCATCGAGACGTGATTTAACAAGATGGTGT
ACCAACGCACTCTGAAAAGGTTACACAGTCTTTTTTGACGGAGAACAAAK
TAGCCACTTTATACACTAGATGCCACTTATTGTCTCTTCTTATGGGGTGC
ATGTACTGGTCAGAGTCAGCCAGGAAAGGGTGCCGAATACTCAAGCTCTC
GAGGCTTCTGTTGATGAGCAATGGCACTATATGAGCTCTAATTAAATTAT
TACCAGCTGTCAGATATCATGGCGTATCAATGCCATCATCAAAGACGATT
AAGGCTAAATTGAAGATTAAAATGGAAATACATCTGTAGAATGTTTGGTT
AATTTAGCTCCATTAGGTTCCAAAGTTAAACTTGTTAGACTTATAGATTT
AATTTATCCTTTTTTCAATTACGCACCCGGTATTTTTTCCAAAACAGGAA
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ATTTTACTAAAGAGCCAAATACTTAAGAGTATAAGAAATAGCATTTTTCT
TTTATTTGTAAAAGGTTAAATTTTATTTATTCTCATATTGGAGGGGTCCG
ACAGTGTCTCATTTATTCCTATGAATAAATGTTTAAAATATTAAGTGGAA
GATTAGAAGTAGTGGGGGGAATACTATTTATAATTTTTGTTCCACCAGTC
AAAAAAATCTTTTATCAAATTATGAAAAATATCTTTCAAAACGATAGAAC
TCTCCAAATATATTTCTAATTTATCACAAAAACAGACAATTGAATATTTT
GTAGATACTTTTTTTCCCGGGGATGGACAGAATATTTATGAATTTTGTTG
TAACTTGTTAAAAAAGGATTCCGTATTTCCTATTTTTATAAAGGATCAAA
ATTTGATAAGTCTCTTAAAGTAGAATACCTTGAATTATGGGTAGAGCTAT
GAACAAACTTTTTTGTTTTTCTATAATTCATATTTTTAATCAACCGCAAT
AGTAAATACTTTGGTATAAGCTATTGATCAAATCAAACACTTTAGATTGT
CAAATAAACTTGATTTAACTTGTATAAGCAAATGGTACAAGTTGCATAAT
TTTGTATGAAGGATTTACATAACTTCTTGGGATGCGGATAATGCAGTAAT
TGAATATTCACTGGATGATCCGTATATTCTAATGGAGTAATTTTTAGCTA
TTTTAGTACAAATGATTAAAATGTATCACATTATAAAGTTCAGATATCCT
GGGGGATATTACTCTTAAATACATAATAACTTTGTCATTCGAATAAATAA
AATGAAATGAATGTTGCTATACTTTGTAATTAAAATCCCCAAGATTCTAA
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ATACAATTTACAACTTTTTCAGATATCACAGCGTGTACACNNNNNNNNNN
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GGGAAGCTTTGTATGTTCGTTGACTCATAATAAACCCCTGTATATATATA
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ACTAACAAAGTTAGTTGTGTTTATTTTTTTATGTTTACAAATACTATCTT
TGCAAAATACCCAAATGTATTAATATATTCTCTAAACAAACTTTTCACAT
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GGAAAATGTGGGACTGATGATATCACTGATATAATTTTGAGGGCAGAAAA
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TGTATATGTAAATTGCCAATTCCACTACGAAAAAGTGACTCAATAATTTA
TCAGTTTGCAAAATTGAAAGGCAAATAGTTTATCTGACTTCATTAATAAA
ATCAAATGACTGATTTGAAAGTGTGACTTTGGTTAAAATGTAATTATGGA
TTTTTTCGTCCATTCTAAAATTCTACACACATGATGGATTTAGTAATCCC
CCTTCATTTGGGATTATTTAACTCTCTGTGAATATGTTATGCATTATTTA
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ATACACTACATATTTATTTATTTCTTCTGAATCTATGAATAAACAATTGT
TTTATGGCTGKATACTTTTGAAAAATAATGTTTTCAAAATTGAAAATATG
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TTCATTCACATAATAAATATTTTGTCAATTTTTCCCCATAATATCAACTA
GTAGAGCAATAAAAAAAAATTGAAAAAAAAATTATTCATTAGACCCGGGA
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ACCATGAGTATTGAAAATACCTCTTGAATCATCCCCTGCTCCAAGGGTCT
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CTTTGAAGAGACAAGGTAAAAAAAGTTTTGTTCGTATCCAATGTCTCCAA
GTATAAAAATGTCGGAGCAAAAACAAAAAAGGCAACGATGGTCTGATCTC
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GTCGAACTGCCTACCACATCAAGAACTTTATTACACTTCCATAGGTACAG
GCAAGAAGACCTAAAACTTCTACAGAAACAATATAACTGACTTCTGGCCT
GTCTGTATGTGGCAGTTTGGTGTTTTCAAATAGAAGAATGTCATCCAAAT
TTGAATGCACTGCCCGCTGTGATATGCAATGAACACGGCCTTACTCGCCA
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GGAGGGCATATTGAATAGAAAATATAATATTTAATTATATCACTGATTAG
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AATCATGCTACTGCAAGTTTTAGATTTTCGGACTAATGCCCAACACTAGT
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ATTTTATTAGTTATAACATAATTAGTTGTGTGTTTTTATTAAATTATTAT
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TGTCGCAAATAGGTTAAATCTATACACGACGTTACTTCGCTAACAAAAAA
ATATACAGGTAATTTTGCCGTCAGGTGTCTCTTTTTTATATTTTCCCTAC
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TTCAATAAATAATTATAATTATGGAACATAGAGGTCTGGATATTCTCTCT
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TTCTTAGAGGAAATCAGTTTTATTTCAACAATGGTTTTAAGAGTTTTCTA
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TACATAACTTGATGAAACTCTCTTGATAAATATCTTTTTTTTTGTTAGAG
CTGTTTTTTCCCCTCTTATATGGAAAAATAATACACAGTTTCCTCTTCTC
TGATCCGGGTTGGTGTTTTTCTTGACTTTTAACATAAAGATTATGAAACA
GAACCTGAATGAAAAAATGAAAAACTAAAAAACAAAAGTGACAACTAAAA
TAGGACCATTATAATGCCAATGGGCTCAAAAGTTTTTAAGAGAAGATGAT
ATTTCAAATTTATCTGAGCTCAAACACAAATTAGATATCTATTTTATGCC
TACAAAACTATTAATGAAATAATAATACTCTTTTTGAGAAAATAATTAAT
TATTAATTTGATTTAATAACTAGACTTTTATTTTATTAATGATTCATAAC
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TATATAAATATAATGTAATACATAAATATTGGGAAGTAAAAGTTGAACTT
CCTGTCACAATAAAGGATCATAATCAATTTGAAATGAAATAAATATCAAC
CCAACTTCATTATGTGCCGTGTCTTTAGTTTGAGGTGTAGCGATAATAAC
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TTGGCTTGTGTCTATACAGATGTTAAATAATCTGTCATTAGATTCCTTAA
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ATATCCAATTTCAACCAAAAAAAAAAAAACATTTTATTTCTTAATATCCA
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TGCCCATTTCTTGCAAAACAATGTATCTGTAAAAAATTTACCTTTCAGTT
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CATTTTTGGTTCCCTTGTAAAATTAGGTAGTTCTGTAGTGTAATTATAGA
TACATTAATTGTTGAACAAATTTAAAGATTGAATCAAAATTCGAATTCAT
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GGAAGCTGTTGTCGTACCTCAGTACAAATTTAGAGGACAAAACGCCACAC
TACTCTGTAGATATGAGCTCAAAAATAATGAACAGCTGTTTTCTCTAAAA
TGGTATAAAGAGGAAACAGAGTTCTATCGTTTCATGCCTAGAGATGATTT
ACGAATCAGAGGAGGTTTTAAGGAACGAAAATTGGATCCGCATGACGACT
CAATACAGACCTGGAAAGTATCTGGGATCAAAATTGATGTAATTAATGGT
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GTGATATTAAAGCGAGTGGGGTTCAAGTCAACGGGAATGTATAGATGTGA
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TCGTTATGAAGGAATCTATCAATAGAATGACTGTGGTTGGKGAGKGTAGT
TAACAATATTATCAATTATACTGTTCACTAATAAATCTTTTGAATTTCCA
TAGAGCTGCCTAAACAGCTTCCAACCATTCTTGGTGGTGAGATCAAAAGA
ACTTACAAGCCCGGGGATTTCTTAAATCTAACATGCACTTCAGCTCCATC
AAATCCACCTGCAAAATTACAATGGATACTGAATGGGCGCGAGGTAAAAA
ATCATTAAAACATTATTTGTTTGGTGACTTTTTTTTTCTCACAGATTGAC
GAATTTTTCGTTGAAGAACAGTATTTATTGAACAAACATCGAGGATTATT
TTCATCCGTCATTGGTTTAATGCTTCCCTTAGATGAAAGCCATTTTGAGA
ATGGAGAACTTAGAATACGATGTAGAGGAACTATCGCTGCAGAGTTTTGG
AAAAAAGACGTGGAAAATGTATTTACAGAAAGAGAAAAAATTGTCAAGGT
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TCATTAAAATACTCATAATTGATCCAGATTGATGTTGTACATAGAAAATT
TTATTTTTGTAATATTTTTTACAAGTACAATACACATTAATTTTGAATCT
GGCCATCAGCCTCAATGACATCCTCCAACTACTTCTGTAACCCCTTGCAT
AAATCAGCAACGTAGTCCTTTTTCAAGATCCTTCACTGCTGGTTAACGGA
GGTTTTCAGGCATTAATATTTGGGTTGCGGACTTTGCAGGCCTTCTTCTC
CATTTGCCACGAAATGTAGTAAGACTGTGGATTCAGATCTGGGGTCTGAT
GGGGCCAAAGGTTGCTGCCCATCGACTCTTGTACAATATTAGCAGTATAG
GCCGGAGCCCCGTCCTACTAGAATACGTCCGTGGAATTGTTGGAACATGG
TCTTGGTGATTTATGGGACCAAATTTTCCTTCAACAGCATCAAGTTGTCG
GCTGTGGGTAATCGTTATCCGACATCAAACCAAATTAAACGCATTTTTTC
GAGAGTTTATGCCGATCATTCAAGAGTTGTTGACATCATGGAGGTCAGGA
TTATTTTTGACGTTGGGACAGAATTTGCCTCGCAATTCTTTTAAGCTACC
TTCCTCCAGACTTTAGGATGACCTTCCCCACAGTTGACCGATGTACCTTC
TTCTTTTTGGCGTACTCTGACATCTTAATCGTTGGGTTTACCTTAAAGGC
CCCCATGATGTCTTCAGGCTTCACATTGGTGGGGCTTCCACTCTAATGTA
TGTCCTTGAGGTTGYCCCCATCAGCCAAACGATTTCTGAGCCGACATACT
GTGGCTTTGCTCACGTTTAAGGCCTTCATTATGTCCGTGATGATTCTCCC
AGGAAGGATTAAATAGCCTATGATGGGGTTTCTTGCCTCCATCACGACAT
ATACAGAATTTTCGTTTACAACATGTACATCAATCAAAAGCTTAGAATCT
AATATATGAAAAAACAATCAAAATTTCAGATTTGGTCAACAATACCTATT
CAATACTGTATTTTTGGAAGGTCTCATGGCTTTTTCTAAGCCCGATATGT
AACACAAGTATACTAATTATCTTTATTAACTTATATGCAGATTCGAGCGG
TTCATATCTGCGTAGTTCACCTGCAAGCTTTTTCTGGACCTTTTTTATTG
CAATGGATTACCTTCTGTCATACAATACAATTATGTCAATAATTCTTTAT
CGTTAGACATCCCTTTTTAGAAGAAATAATATTGTTTTATTGTTTAAATA
TTTTATAGAATAATAAATATATTTATCAAACGTTTAAAAAAAAAACACAA
AAATGTAAATACATACTAAGCAATGAACCCATTTCAATTACGTTTGGTCT
TTGGAATTTGTCAGATTTCATATAAATATGAGATTATGGATGCCAATAAA
CATAGAAAATGC back to top
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