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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s317 | supercontig | LSalAtl2s317:460477..469382 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005858 >EMLSAP00000005858 ID=EMLSAP00000005858|Name=EMLSAP00000005858|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=359bp
MEEEEGREDSLKFKIHSKFAYRQIWTSFIANLLQVMQGSVLALSSIILPQ
VINNKDSSDISFTDEEGSWFASIYCIGYVYGGQASGSGTVSISIYICEIS
HPNVRSITGIIATCPILGSLLLLTCYESPIWLLRNGKDEAAMESLVYFHG
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ATIMCVIMCIFAYFFLPETHGKRLDEIEDNFLKSDVLNSQEINVEEEEIL
KLRWTVPEI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s317:460477..469382+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005858-701705 ID=EMLSAT00000005858-701705|Name=EMLSAT00000005858|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8906bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s317:460477..469382+ (Lepeophtheirus salmonis)
AATAGATTAATGGACCATTTCACATATAACTGTGAATCCGAACATAATAT
TGGGAAATGTAAATAGTAAATGTGACTTCATTGACTTTATTAGGCGCAAA
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ATGGATTTTACAATCTTTTTCGTATACAATTAAACTTTCTATAAAGAAGG
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AGATTGCTTTTCTTTTGAGATAACAATTGTTTTAATTTATCTTACACAAA
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TTGAACACCACATATTATAATATATGTGACGACTGAAGAATGTGCATTAT
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AGAAAACTTTAGAATTTCACCACTAGAATGAAAAGACAACTACTCCATTA
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GGGGGTACAGGTTTGATTATATTTACATAAAATGGACTGAAACAACTAAA
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GGTTTTACAATAGAAATTTACCTATTATATAATTATAGTTAATAGTAAAT
CGTTTTAGTTTAGAATTTAAAAATAAATAAGCTAATTGTAAATTAAATAT
TTTTAATTTTCATTAGCTACCTTTAAGATTCGTTCTAGTAGTTTATTAAA
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GAGTATTGAAGATCAATTAAGAAATTGGGAAATCCTTTAACTTAAGAGTT
AAATAACTTTATAGATTTATAACTATCTAAAAAGTTGGTTGAATAAATTC
GATTATTTTTTGTTCATAAATTCAAAATGGTTTATTTAACGTTTGGAAGT
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TCTTGAATAATAAGCAGTTGCTAAAACCTAGTTATATTGAACATCTATAC
TCCAATTACACCAAATCTCACATATTGCATTAGCGTACATAAAATATATT
AATATGGATTATATCTTAGTATCATAACAAATCGTTAAATATTCTAGATT
TTATTTACATACGAGTATATACATGTTTGTAGCATGGGTTAATTATTATC
ACAGACACGTTTCAAATTCATTTCCACAGCTGATAACAAAGGAACTTTAT
AGCCAGAATGCTCATTTTCTACCTGGAGAAATCTAGTAAATCAGTAATAC
CTGCAATAAATATCCTGATATTAAGACCCATAACTATGTGTTAAAGATGG
AAAAGGCGTCAATATGTAGTCGAGTTTGATCAAAGGAAGATCAATATCAG
TTGTTTATTATTAACCTATCCTCTAACATCCCCATGTACTCGATAATTTA
ATGTTGACGCGCCTTTTTGTTTCTTCTTAAATATTTATTTTAAACAAGGG
GACCATACGGATATCGCGGCCTACAAGATTCCTATATCTATTATGTATAG
TATTAATTAATTATATTATGTTTTATAATTTGTCCCTCAATAGATTTGGA
GGTTTGGGAGTACACCTTTGAGGGAATCCTTTCTACTGGAAATGGATAAT
TGATATTGATATTTTTAAATTAAGCCACTTTGTGTCCATATTTACCGTGT
GTGAACACTTTGCTAAATGCCATTTTTCCGAACTAACACATAGCCCAAAA
AAAACATTTAATCTTTTTAAATTAGAGTAACATGAATGTAATTATGATTT
CCATTCATATTACTCTAATTTAAAAATATTAAATGTTTAATTATTTGCCA
CAGATTGCCATCCTTAAATGCTCCATAACTAATAATAAGTTGATTTATTT
CATAATTAAGATATTTGGCTCGAACTGCAATTAGAACCGCAGTAACAAAA
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TATACAATTCACTTTGATGTCCGTTGAACGTCGATGTTTGGAATTCTTGA
GTGAATACTGTCTATTGCTTTTTCTAGGAACTTATGATCCTTGTGTAGTG
TTATTTTTTTTTCAAATCCAATAACAAAACCGTCTTAAGAATAATAAAAT
CAGAGACTTTAAGAGAAATCAATTAATGAACGCTTAATCATTGCAAATGC
GTGGCATATAGTTGAACATTTTATCTTTTAAAATTGGAGTAACAATAATG
GAAATAGTAATTACTTAGTATTGGACCATGAATCATCCATCATCAAGTAT
ATTTTTTTTTCTGCAATGTGGTCATTCAGCCAACTTTCTGTTCGACAATG
TGGTCATATGGCAAAAATTTATGTTCGGCAAGGATGCTTTCGTCAGAAAG
TTTTCCCCCCAAGGTGCCCTGGAACCCTTATTTACATATTAAAGTGCGGC
GGKGGAAATGTTTTTATTTTGAAAATAACAATATAAATATTGTTATTATT
ATCTGCATAGACATTATCATAACATTATTAATAGCGTAACATCTTGGAGC
TGTCGTATTTTTTTATTATCCTGTTTTTCCTTTTACTAGACGCTCCACAT
GAGTTTATTCATTAACTAATACTTGGTGATATGACTTGAAAGAGTTGTAC
AAAAGATTTCATAGTGATATACAATAACTGCAGGAGCTACGTTTTCATAC
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TTCTACGCACACTAACAACTATTCAGTCATGGAGGAAGAAGAAGGTCGAG
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TCAGATATGGACATCATTTATAGCAAATTTATTACAAGTCATGCAAGGTA
GTGTATTGGCTCTATCCTCCATCATTCTACCTCAGGTCATAAATAATAAG
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GGTATTATTGTCAAATAATTTAATTAATATATATATTTTTTCTCTATTTT
TAGCAAGTATATATTGTATCGGATATGTCTATGGTTCGTTACTTGGAGGK
CTACAAAGTGACTTTTTTGGTAGAAAAATATCACTTCTAATTGACTGCCT
CGTTGCTACTACCGGGATTTTTCTCATTGCATTTTCTCAGGACTTTTACC
TCCTCATAATCGGAAGACTTTTGTGTAATAATATCATTATCAATAAATAT
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TAATTTTTATTTATCGGGATATAGTTTGACCACAATTCTTGGAAGCTTTA
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ATTCATCATTTTGGAAACCCTTTTCTATTCTTTTTATGATTGTTCCTGTT
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TTAGGAAACAACCAATAAGGAAGATTTACATTATAAGTGTGATTTTTATT
GGCTTGGGAACATCAATAATATCAGTATATCATTATCTATTGAACAATGT
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TTTAAAAAAAGGACATTTTTATGTTATTTTTTTAAACCGTTTTTGTTCAT
ATACTTGTACAAATTTAAGATTACATAGCTACTAAAAATATACAAAATAT
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