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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s338 | supercontig | LSalAtl2s338:124263..141354 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006190 >EMLSAP00000006190 ID=EMLSAP00000006190|Name=EMLSAP00000006190|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=93bp
MLIESSSKHSCLINRGGKSGVKANKLLLEPYGELLLSRSRVFKLHKEFIN
GRESIEDDRGKSAKPTKRNQNNIDLVGNYICSNRRVKIEGIAI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s338:124263..141354- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006190-702037 ID=EMLSAT00000006190-702037|Name=EMLSAT00000006190|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17092bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s338:124263..141354- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTTAATAGAATCATCTTCCAAACATAGCTGCCTAATAAAGTTATCACA
AAATAATATTTTCGACTCCTAACCCAACAATTACATAATTAAGTTTATTT
CTTTTTGAATGTAACAAATAAATTAATGATCAAATGATAAATAGATAATT
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TTTCTCCTATGTATTGATGAGCTAGGATGGGAGTTAGCTTAATAAAAGTT
CATAGTTAATGGTATAACCAATTTTTTTATGAGTTTTTGGCGTATTCAAC
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CATCTAACTCATGTTGCAAAAAAAAAGGTAACACTCATTAATAATGACAT
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TTTCCAAAATTGTTAAATGACTATAAAATTATTGTATTATTCGATATGGT
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AATTTAAGCCCAAATATTGAAGTCCAATGGGTTCAGGTCGGGGGAGCTGG
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ATATTTCCATTTACATATATACTTTTGTAAATTAGAAGAAAAAAAATAAA
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ATAAATAAATTGTACCATTTAAAAATTGTAAGCATCACAGCACTTTATTC
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TGCTTTTGTACCTTACAATGTGTTTTTAGAAAATCATTTTTGGTAACATT
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CTCTGTAGAATACAACACATTAATTTTGTGTTATTACATTTCCATGTTTC
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TTTTTGACTAGTGTTATTAATTTATCTTATAATTTCATTTTAATATAATA
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TGAGTGGTTGCGTGTTTTGTCAAAATCTGCCTATCTTGAATGCAGTCGGT
ACAATACATCAGTTTGAAAATTCTAGCAAGCCCGATTACACGATGGTCTA
ACCTTGTATTTCTATTAACCTTGGTTCTAGGTAATTTTACCGCAGACCGG
CGAGTTTGGAAGCCAAAAGTTTTGTGAGATGAAGTCGTCAAAAACTTTCA
TTGAAGCCATTTGATACTTTTTTTTATGTGTAGGAGGGAGCTTAGTCCTT
CTGCCACATGTAAGTCCTCACATTGGCAACCATGTCGATCGAGGGTTTCT
CCTTGGTAACTAGCATGTCCATTGCTGACCCTGAGATCTTGGGGAACAGA
TGAGGCATGAGGTGGCCTTTGGAGCTAAAAACCCCAAACACCATCACATG
GGCAAGGAACTTTTTCTGCATGACAACAGGCACATTCTTAGGCAGATGGC
TAACCAAGAACGTCTGATTGAGTCCCAGAGTTCGATCGATTGATATATTG
TGGCTCCTGCCAGCGATTCTAAGGAGGACTTCGTGCTTTTCTAAATATTT
GGAACAACAAGTTCGTCAATTACTTTATGTTTTCCCCTTCTGGTATAAAT
TTGAACAAGCTATCCAACAAACAAAAATGACTACCTACTACCTAAGTGCT
TGCGTTTGACAAAGAGAGCATGACAAAAAGGAGGCATAGATAATTTGCAC
ACCCTGTATAGTTTCAAAATTTACCTTTAGTCTTGACTCTTGAAACACTT
ATTTCTTTTCATCGAAGGAGTTCTAACATTTATGCAAGTATGAGCTAAAA
TCATGACTATGATTAAGGCGCCTCTAGTTCATGAGCTCTTTCAAAATAAA
CTACTGATGATCCTAGCTCTGTGACACTTTATTTTGCTTTTTTCCCCTCT
TCTTATCTATAGTTGCAATTCAATAGTAAAAACCAAAAACTAAAGCTTGT
ACCTATAAAATCAAATTAACAAAAAGTGTAGAATATGATATGCAGCAAAA
TCTTTGAGAGGAAAAATTACCAGAGGCTAAAATATATGCCGCAATATTAC
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CATTTCTTATTTATTTACGAAAGATAGATTTTCACATAAATAATAAAATA
TGTAATGTGCCACAGAAATTTTTTTATTAAAAAAGACAAATATTACTCCT
GGATCCTTTCGAGTATTTAATGGAATTTAAACTTAATTATTTATTTAAAA
TAAATGAATATTACTATATCAAATAATAAATAATTTACTTTTTATTTATT
TAATTTTAATTTAACTTTAATGATCCTCATATGAAGTATTTATAAATATA
TTAATGAAGTAAAGTTTGAATGTTTTCTCTGGAGGACTCACTTTAGAGTA
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GCTTGTGTAGCTAAAGCTCAGAACGTAATATTAATATACAAATATATTCA
AAATAAATCAGTGGTTAGTTATATGTTGACACCTTATGCTCTAGAATTGG
CTCAGATCAAAAAAATATGAACTGTTCATTTAAGTTTAGGAATGTGTTGT
CCTAAATCATAASGAGACACTTGAATCAAATGCAAAGGCTGTAATAAAGA
ACAATCTTTTCTTGAATGACGTCAAATCTGCCAGTGATGTGATCATCAAG
GAATCTTTTGAGTGCACCCTGTGACGTTTTTTCATACAAACAAASATTAA
TGTATACATTAATTATTTTGTACTCGCTAGATGGCTCTTAAGTTGCATTA
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GGAACAGATGTGTCACTCAATTTAGTCCAAATGTATCAACTCAACGATTA
CTCAAATTGAAGAACAGATTAACTCAAATGACGTTTCATCAGCTGTGACG
AGAGAGGAGAGAAGAACAAAATGAAGAAGGACATTTGCAAGAACAACAAC
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CACGAATGTTCAATCAGGTTTTGAATATAATTGAATTTATTGGAATAGGA
TGTTAACTTCTGAGGAATTAAATAATAATGATAACTGCTAAGGAAACTAA
AATTAATTCTTCAGATTACCAATTCCCCAAAAAATGGGCGAGCTAAAAAA
TACACACGATTTACATCACTATTCTGCATACTTTATAAGTTACATTTTTT
GCTTAATCCCTCGTTGTGCTCAAGTAGAAGTAATTCGATTTCTTTTTATG
TGAGCATGAAAATACAAAAAAATTAAGTTAAGCAATCAAGAAATAATTTT
CCTATTATTCGTTCGTGTTATTAATATTCAATATCATATCATCAAGTAAA
TTCAAGTATTTTTATTAAATGGAGTTTATATAATGTATATATTAGTGATA
GGACCCTGAGCTAATTTTTTTTTTTTTGGTCTTACGTTATATTTCTATAT
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AAAAATATTTATTCATCACAGTTTGAATAATCTGTTAACCAAAATAAAAA
AATTCAAGTAGAAAAGAAGCTAAATTTTGTTTTTTTTAATTGAGTTTGAA
TTGTTTTTATATTTTTCTATGCATAATATTCAATTTTTAAAAACAAATTA
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AATTGATTTTAATAATAAAAGAATGATAAATTCACAGATTTTATTTGAAA
GGTCATATTTGAGCCAATATAAATCTCTTAAACCAAATAAAGGTTTTAAA
CTCCAGCAAAAAAATTAGGAGTCTTAATACATTCCAAATATTAGAAAACA
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CTTGTCTTCATTTCTGTCCAAGATTCTTTTTACGTCGGTATGCAACACTA
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GGATTTGTAAAAAAATATATATATATTTGAGTTTAAATATATGAATTTTT
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ATTGAAGGCACATTGAATTAAAGAGAATAAAATCTTCTAAGCTTTTCTCC
AAATTTTCAAAATTCAAATATAATCCTGCAGATCCCTTTGAACACATCTG
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AGAAAGTACTTAATTTTGTTCACCATTAATACCTTATTAATATTTAATGA
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CAAAGTTTTTATTTAATTAAGCCAATTCCAACACACTTCTATAAATATAT
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ATTATTTTATTCTTATTATTTGCCCTTCAAGAATACATATAAGAATAATG
ATGACAGTTTTCGTATATAAAAAAATATTTTCAAGTAGGAATCACAAAAA
GAGCAGGGTCTTCTAATTTCATATTTTTTAACACTTCCTTATAAATCCTA
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AACAGCTTTGGAATATAAAAACCCCTCTCCAGATTACCAACTACCGAATA
ATTGTGTATAAATATTTGATGCAACCCTAACCATCAAACTAACAGCTCTT
TAATAGATTTGATGTCATTTTTTTGTACGAATGGAATACACACAACCTTA
TAAAAGTGAATAAATTAAAAGAAATTTAAGAATGATTCCTATATATGCAT
TTTTTTTAAATAGAAAATTCCTGAAATAGGTTATAGCTTTGAAATGTTCC
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GTTAACTAGGATTTAATTGATCCAGAGACTAAGGATATGGGGTGTATTTC
ATTCTTACTCAATATTTCGTTAAGAATAATAGCAAATATATTATTATCTA
CCCATCTTTATTAATCAAACCATTGTGGAGGTAGGGCACGTGATTGGGAT
TTGTCTCTGAATAGTCCAGATATTTAAAAGATTATAAACCGATTTTATAG
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TGATATTGGCCCTTTTTTGAGACCCAAACAACCAATGCTTATAACAATGA
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GGTGATAGCGGATAGTTGAAATTCAGTCATCATAACCTTATAAAAATAAT
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TTGAAGCTTGTACGGTATATGTAGGTATATTTATATATGTTCATACTAAT
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ATTACCATTTTGCTGTAATTATACCGTAATAGTTGATGGTAGATACAAAA
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CCTTAGTCCACGAATCGATACCGAGTTCTCTTTCCCCGGTATACTCCATA
AGAGACGAACTCACAAACTCTTCCACATAATGAGACCTTTCATTTACTTT
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ATTTTAATTTCAAATATCTGTTATCACAGTAGCCAATTTTGAGATAGAAA
GAGAAAGCATGGCATACAGGCAAACTCTTACCCTTTACCAACCTTTTTTT
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AAATAAATTGGCCTAAACACTGTTTTCTATCAAAAAAAGTATCCTTCTAT
TGCTAAGTTTGATTATATATCTGACCCTAAAAAGTCATTAAAAATATGTT
ATTTCATGGTAATACAATCTTAATTCCATAGTATAGCTAAAAATTCGCAA
TTAAAATGGGAGAATATAATTTTTTCACTAATTATCCAATGGTATTGACG
CTAATCGATCAAGATTACATGGAGAATCGGTTGTTTTTTTGATTRGGGAT
CGGCATCAGGAAAATAATGTTTATGTGGCATTTCCATTTTTTGTTTATTA
TTATTTATTACTTTTCTTATTATTGAAAAAAAAATCCCCCTTCCCGAAAT
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TTTTTCCAAAAAATTTAATATTTAAATTTTTCTTGTGTCAAAAATTTTTA
TATTAGAAAATTTTACTTAAAAAAGAATTAATTTTTTTGAACAGTTCTGG
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TTTTTCCAAAAAAATTAATGTTTGGTCAATAGCTGTAAATTTATTTAAAA
AAAATATATATCAATAGAAATACTCATGGAAAACAGTCCCAGTAATTAAT
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TTCCAAGAAAGAAACATACTACATTGCAATATTACTTATTAACTTAAAAA
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GGTGGTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGCTGCTTCAAAATTTTTWTTGCCAT
ATCTTTTTATTAAAAACAATTTTTCGATAAATTTAACTAAAATTAAGCTG
TACATATATGTAGGTGTTTTTTTCTCAAGAAGGGTCATCAAGGTTAAAGT
CATCCTAATTTGCACTTTTTTTTGTTAATATAAGCAAAACAAACGTATTT
GCAAATTTTTGTAGTTATTAATAGCCGCTCATACACAGATGAACAGACAG
ATAGGCAAAAAGACTGCATTACATTAAATATTGTTATCGTTCTTTTTAAG
ACATGTAAAAAATGATTTATCATAAATGTTTTAAAAAAATATTTTAAAGA
AGTTGAACTTAACTAAATTTGTTAATTATACTAAACAAGCTGTAATGTGT
GTATTATACAGGATGATATTAAAACAAATCAGGGTTTTTTTTTGTAAAAT
TTCAAAACTTTAGGGCCGTTGAGCTATCGTTAGATATTAATAGAAATTGT
TCAAACTTTTATTAATCGTATTAATTTATCAAAAAAATGCATTTTAACCC
TCAATTTTTTACTCTTTCAAAAAAACCGATTTTATTGGCACCCTAATCTA
CAATATACATAATGTTCACCATACATACATACACAAACGATGTCGAGAAA
ATACATACATATAAGCCGACAAACACAACTACTTCTTCCTGTCATCCGCA
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TTTTCATTGCTTCTTGATATCTTTTTCTTGTTGAAAGAAAGGTTGAGAAT
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ATTCCCTTGTCAACACTTTCTATAAAATTAAAAAAAAGTTTTGAATGTGA
CAACATTTTCTCTTGTAATAAAATAATCAAAACACTTTTGGGAACAAAAT
TTCATTACTATTGAGAGATTTTCTCTATATACGTACTACTACAATACGGT
CTACCTACATCATTCAAATGTATGTCAATAAAGAAAAATATTTAAAACRC
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ATTGGAATTTTCGCAAAATAACTACAAAGAAAGAAAAATATATTTCTTAA
ATTTTATATCCGTTTTGTAACACAATGTAATTTTTCATCAATTTTTCATT
TTTTCTGTTTGTTGCAAAAGTAGATATTGTATTGGAAATACTAATAATAG
TTGTTAGCATCAATATACGAAGTGTATTCAAAAAGTAAGGTGACTTTGTA
TTCGTAAGAAAAAATATTCATTTATTCATCAATATTTATGTTCTCCCCTT
CAAAGTAATATCCCCATATGCAATACACTTGTGCCCAAGCTTTTCCCAAT
CCTCGAAGCACTTCTCATAAGCACTTTTCGGTATAACATTTAGCTATTCC
AGCGATGTAGTCTTTATCTCCTTAATTCTTCTTGCAAATCTCAGTCCTTC
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ATGAATGCGGTGAATATGGTGGCTAAGGCATGATTGTGGTTTGTGTTTGG
CCAAAAATATCTCACAAGCAAAGATAAGTGAGCAGGGGCATTATCGTTAT
ACGAAAGCCATCAATTGTTATTCTTCAATTCCGGATCTTCTCTTCGTATT
GCTTCTTGCAAGCAGGGCAAAACTTCAAGATAATACCCTTTATTGACCGT
ACGACCATATGGCAAGAACTTCTAACGCACTACGACAAGGTAGCCGACGT
GCTTGGGCGTCCAGAGCGAGGGTTGTAATTCCATCTTCCGGCAATCTAAG
ACGAGGGTGTACCAATTTAAAACATTTTTTTAATCAAAACAGTTTCCCCT
CATACCACTGTAAACATTTCAAGTGTTTTAAAGCCTAATTTCATTTTTGA
AAAAAAAAATAGATGCAAATTCTTTGATCCATGTTTTTCGATAACAAAAA
ATTCTAACAGTTATGCCTCTCACAAAAAAACTAAACAAATTATATAGCTG
AAACAGTAAATATATGTTCATGGTGAGTGAACTAATATAAAAAATTAAAT
GATCAAGCGTACTCAATGTACCTTGCCCGCAAAGTTTGAAAAGTCACCTT
ACTTTTTGAACACAACTCGTACTACTCACGGCACATAGTGATGACAAAAC
AAACGGATACAATTGTACTTATTTATATCGTATAATTTATGTGCTTGACC
ACAAGTTGACGTATTTATGCTGCATTTATCCTTGAAATTAAAAAGCATTT
TCTAAGCTTTCCGTCACTTCTTTGTATTACTGTTAATCATACCTTAGTGC
ACATATCAAATATCTTATCATTCAATACCTAGGAATACCTGCTCCAGATT
TGAGGAACAAAATCGGTTATTTTTTTTCTAGGTAGGCGAATTATAAAGGA
AAGTGACCTTATTGATAATAATTAGGACGCCTCTCCCATACGTATTGACA
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