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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s33 | supercontig | LSalAtl2s33:1290324..1326449 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006213 >EMLSAP00000006213 ID=EMLSAP00000006213|Name=EMLSAP00000006213|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=296bp
MIPIIDISDISLNLKEKSCNYDAVGVQIREAMTGVGCMYLSNHGLDENAL SEAFSSAANFFDLPFERKNHYYRLSTKSQGYSELGREKLEEADITEIKES FDVQRLPENYFEKKDLEIIPNFQKDISNLSXATKELALRILVCMAKVLNI NDSQEFLDLHSNIFVKENGSTIRFLHYPAKEGISDETERVDEVGGLQVQN LKQEWMDVPPLPGMIFVNIGDLMEFWSGGKFRATPHRVLGNKFETARYSM AIFIHPNDKTQIDPIDGVDEKSSLCGITAGEYLIRRLRETYERTSS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s33:1290324..1326449+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006213-702060 ID=EMLSAT00000006213-702060|Name=EMLSAT00000006213|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=36126bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s33:1290324..1326449+ (Lepeophtheirus salmonis) CCGATATTTCTTTTACATTTAGAGCAACAACCGGTTTTATTTTAGGATAA
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AGCGCGGAACTTTGCACAGCAGTTTTTACAAAGCTCGGCTCTAGGAATTG
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GTGAACACGCAATCTGTATTCGAAAGGGAAAGTATTTTGCAGAAAGGAAG
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GAAAATAAATTGTAATTAAAATTTTGTAGAAAGGGAATGTTTAATATATA
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GTACATCTAATCAAATCTAAAATATCGGATCGAAAAGTATTTTAACCATG
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TTTACTTTATTGAGATAGGATTTTGTTGTTGGCTTTTGTATGTTTTTTTT
TTCGCGCCCATTTTATGTATATTATAATTACAATATACTCATATATATTA
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GTATATACTGCTTCATTACGGATAGCATAAAAAAATATTGATTCATGTGT
ACATAGGGCATTGAACGTGTATAAGTGGTACACTGTATATAGTACTCCTC
GATATAAATAATATTAATATTTTTGATATAAAAATGATAATGTAGTTGTA
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ACAAGATTTGAATAAAATATAAACAATTAATTTTGTTAGTTTTTATTAGT
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TCTGAAGGAAGGAACAAGCCATAGGAATTGATATAACTATAAGTATTGAG
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TTTTACCTAGCAGTTGCCATTATAATTTAATTCCTGAGTAGTGATAATTG
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TTATTACCAACGTCCTTAAATACTTCATTTTTCCCTCCTCCCTTGTCACA
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GAGACCCTTATATTTTTTGTTGGGCCAAATTAGTTCGGTCTAACAAAAAT
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ATTTATATCATGTTTTTATAAAATATTGTTTATCAATATATTGTAGACTA
AATCTTGAATAAATCTATATTCATTCCAAATTGTAATTTTACCTTTATTA
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ATTGAAAATTAGGGGGGAAATTTTACTGAAATATAATAATTTATAATTAT
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AATATTGATGAACTAAAATAAAAAGATCAACCCAAAAGATATTATAATTC
CTTTTCACACTCATTTCATAATTGTTTTTAATTCAATACCCTATTTCATT
TCATAATGATTCTTTAAAAAAAATGTATTTTAGTTGGTCCACACTAATCC
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ARATATTTATTCCCCCCCCCCCCTTACCAATCCTCCCGATCAATTTCTTA
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TATTTAAGCCGTAGAAGACAAAAATGACTATTAAAACCTTCAACCGCAAT
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CTCAATAGCCATCATCTGATGGTTCCATCAGACATAGCCATATTATTATT
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CTAGACGTTTGCCTTGATGCCTTACAAAAGACGAAAATTCTCTCTTCATT
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TAACGACTTACGTTCCGTTTTCTCCTACCCATATAAGCCATAAGTGATGC
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CTTTACTATAATATTTCGTAGAGTACTAATTGGGAAGGCTCTGAAGAAAC
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TTTCGTCAAAATTTAATCATGTTAATTTTTTTAATGATGTTCATTTATAT
ACACGGTGTATGTATTTTGTTGTCAGCTGTCGGTTCCCTTATCTCACTTA
ATACGCCATGGCAATTTTACATTTTTTTATTTTCAATATATAAACGATGT
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GGGAGCAAGACATTTAAGTTCATTGTTAGTATCAGCTGCCTGTTATATGA
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ATTTAAAATTTGATCTAGATTAGTGTTGGATCAGTCCTAGGACTATTTGC
CTCTTCATTTCTTTCCGCCCTCCTTTCGGTCTATTTTTTTTTACAGGTTC
GATCTTTCTTATCATTCAATGGTCTTAAGGACCGATACATCGGTCCTTCA
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CTCTTATAAGAGGTTATGTTGAATAGTTGAAAGGACATAGTCAAAGGTAC
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CTGCAGTGTTTTTAGTTTTATTTTAGATAGATCCAACACTAGTCTAGATC
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TTCACCCAATCCTGAGATGTGACGTATCATCTAAATTTACAAAATCAGAT
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TCCAAGATAAAGTTTTTTAAGATAATTCGATTAATTAATTTTCAAATTTT
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AAAAAGAATACTCTATAGCAGGGGTTACCAACCTGTGGGCCTCGATCCCA
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TGTATATAAGATATTTTAAGAACTATTGCTTGCTACAAAATGGGTCGTTA
ATATTTAAAAGTTTTGGAAAATATTCTGTTCAGTCACACAAGTAATTTTT
TTTAATGGTTCCTTATGATTATTAATTAATATTAAGAGTCAGTTAGTTAG
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TACTACAGACTATAAAAAGATTTTATAGACACTTTATCACGCCTTTACAG
ACACACGCCGTTTATTATAAAACATGTTCTTGACCTACATATTCTTGATT
TACATTTCATGAACAACTAAATGTACATTTATTCACATATGACCGTATGC
TCCTCTTGGGCTGTAAAGGGTTAAATGGGCTTAAATTTGGTTATATGCAT
CCTACCCATATTAAAGATATAAGCTATAAAACATTTAGAGTGGTGTTAGG
TCTGAACATTCTAGAGCTGTCTGAGACCATTATGATTTTTAGTGAAAATA
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TCCGCCTGGTTTTGGTCTCATTTAAAATAATGTTGAGACAAATTCTGTAG
ATGAATTGTTGCATAAATTCTATTTATAAAGCTCATAAATCAGGAGTGGG
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CCCAAATTAAAAATGATTAAATTTGGTCTATGGTCTGAGATCGCGGACCG
AATATTGGAGANNNNNNNNNNATTACAAAAKATAAWTTAATAAAAAATGG
AGTTTTCTTCAGTATTTTAAAAATCCATGACAGATTTAAAATGTGGGGAA
AAGTCCCATTTTTACAATAAAAAAATAAAATGTGTTATAGTTTAAAAGTT
TAAGTACATATATCTCACGATTGTTGTGTTTAGACATTCAGGAAGATGAG
TCATTTTTGATTTACATGCACTTTAAAGTCATTTTCTCCTCTCATTGTAA
GAGTAATGAGCTAATCTTACGCCTTGAGACTTATGACAATCCTATCGGTA
ATGACACTCTCCACCAAAGATAAAAGAGATCTATTTCTATCACAAAAATA
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GGTCCGCAGTGATTTGCTGGTGAATATCGAGGATATCGTCAACCTATATC
TAAATCAATTTTGATATCATGTAGTGCAGGGGTTTGAGTGTATTATTCTT
GGATTGATTGCTTCTTCTTCCATACCATTAATGTTCTTTATTGGGGTTTG
CCACGAACAAACTAGGTATAGGAAATTAGGAGGACGAGTCAAGGAAGTGA
CCTCTGCATAAGAATCTTATCGGCAATGTTTCCTGTGAAATATTTCAGCT
CCCTGAAATATTAAAAAACATTAAATCCGCAACGAAGTTCAACGGATGTT
ATGTTATTAAATTTAACTTTTGTTACGGCAAAAGTTATAGATCGTTTTTC
ATCTAACTTGGTACAAAGATTATATGTGACCAAAGTAAGAGGCCTTTAAT
TTCTGATAGGTCAAGGCAACATACAACTAGAATAAGCACTCGCTAGAGCC
CAAAAGCTCCCCCTAAAATCAAATTGAGTTTTGTATCTCAATTTGATTAA
AGTTATAGTCGATTATGCATTTTTTATGTTTTGTGTTATCTTGACATTTG
AGAATCAATCAGTATCCTTGCCGTAATCCTGGTGACTAACACACACACTT
TATTGGAGGAGGAAACAATGCATAATCGACATATAATTGGGGGAAAATAA
CTTAATTTGATTTAAGGTGGAGGTTTACCCCTTTACCAAGCGCCCATTCT
ACATAGTTTAATTAATTTTTGTCAAAATGTATTCTTACTCATTTAAGAGA
AAGTTAAGTTATATAATACATATTTTACAATAGTTGTCGCACCATTATCT
CACGATGATTCGACTATTGTGTAGGGAAGGGGAACCAAATCTATGAAACA
AAGTCGTCAAACGCCCTTGTTAGCTCGAGTAAATTTTTTGCCTTATTGGT
ATCATTTTCCCTCATGATGTTGATTAATTATAACAACGTCAACTTTACAG
AATAAGTATTTATATATAGGTAATTTTTTTTACATTTGGATGATAATAGW
AAAANATCAACTRAAATACATATATMCCGGGKGGAAACTTGAAMCAGACA
CMCCTAGAAAAAAAAATMSCCTGCCATTCTTTAATTATATATTTAACAAA
ATATTTATTAATCTTTTTCTGATAAATAGCCAATATCAAATTGATTTATT
CTACTTGGTCGCCATTGCCTGTACCCAGCGAAAAAGGTTGGCCTTGAAAA
CGTCTATGTACATTGCTGCCGTGAGCTTTTAATCTTACGGAAACCAGACC
AGGGGTACCACAATGTAGTTAGAGGTAAAAAAAATGACTGATGCTGTGTG
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CCATATAGTTTTCTAAATGCGTATAGTTGTCCCAAATATTGATTTGAAAT
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AGGAAGAATGTTCACAAGTCGGGAATTAAAAAATAATGAAAACTGTTAAG
GAAAAGAAAATTCATTCGTCAGATTACCAAAAATCACTGGATTTACATCA
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