EMLSAT00000006213, EMLSAT00000006213-702060 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006213
Unique NameEMLSAT00000006213-702060
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s33supercontigLSalAtl2s33:1290324..1326449 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006213 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006213EMLSAG00000006213-688979Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000027116EMLSAE00000027116-736044Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027117EMLSAE00000027117-736045Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027118EMLSAE00000027118-736046Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780598auto780598Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006213EMLSAP00000006213Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006213

>EMLSAP00000006213 ID=EMLSAP00000006213|Name=EMLSAP00000006213|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=296bp
MIPIIDISDISLNLKEKSCNYDAVGVQIREAMTGVGCMYLSNHGLDENAL
SEAFSSAANFFDLPFERKNHYYRLSTKSQGYSELGREKLEEADITEIKES
FDVQRLPENYFEKKDLEIIPNFQKDISNLSXATKELALRILVCMAKVLNI
NDSQEFLDLHSNIFVKENGSTIRFLHYPAKEGISDETERVDEVGGLQVQN
LKQEWMDVPPLPGMIFVNIGDLMEFWSGGKFRATPHRVLGNKFETARYSM
AIFIHPNDKTQIDPIDGVDEKSSLCGITAGEYLIRRLRETYERTSS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s33:1290324..1326449+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006213-702060 ID=EMLSAT00000006213-702060|Name=EMLSAT00000006213|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=36126bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s33:1290324..1326449+ (Lepeophtheirus salmonis)
CCGATATTTCTTTTACATTTAGAGCAACAACCGGTTTTATTTTAGGATAA GTGAGAATGTGTCAAATAAACAACACACTCACTCCCTGCATCCTTGGAGA GGAGAAAAAACATGGAGATTTATACTATGTTCTTCTACTCATATTAACCC TCCTCCATTCTGTGATCTCTTCTTCAAAGACCAACAACAAATGAATGTAA AAATAGTGTTTATTTGTTAGTTTTTTACATAAGGGAGAAAGTTTGAGCAA TTACATCATCATGATTCCAATCATTGATATTTCAGATATATCATTAAATT TAAAAGAGAAGAGTTGTAACTATGACGCTGTTGGAGTTCAAATCCGTGAG GCAATGACAGGGGTTGGCTGTATGTATCTCTCTAATCATGGACTGGATGA AAATGCACTGAGTGAGGCCTTTTCGTCAGCTGCCAATTTTTTTGATCTCC CATTCGAAAGGAAGAATCATTATTAGTGAGTTGTAATCATTGATTATTTA GATATCTATCCATGTGTCCGTTTTTATATATTGCATAAGCTTTGTTGATT ATGTAAGGGAGAGTTACTTATTTAATCATTTTTTTTAAATAATATGTCCT TACCATTCATTTCTAATTTTGGACAAAAAATAATACTTAATATATTGGTG GAAATGAGTGTATATTTTAGTGCAATTTAAAATGATAGTATGATAAACAA GTATGGTTCATATGTCATTTAGATAAATTAATTAGAATTATTTTTCAGAA AAATATTTTTTTAATTAATTATATAATTTAATGATCATTATATAAAACCA CACAGAAGTATGTGGTTCGAATGTAGTTCAAATATTTACCGCTGTAGTAC TTTAGATAACAAATAAACGCGACAACGATTCTATTGCAAGAAGTGCTAAT CACTTCTCCGTTATCATTCGACCTGATGGATTATTCAGATTGGAAGATAC TCATGGATAGATGAAAGCTTTACATCATTATTATAATATATGAGGATAAT TAATAAAAGAAATATTTTTCTGCAAAAGAAAACTAATTAATTTACATTAT ATGACATATATATAGAATATGAACAATACCAATTTATCATACTGTAATTT TAAATTGAATTAAAATATACAATCGTACATATACGTATATTAAATATCAT TTTTGGGCCAAATGTTCCTAATGGTCATTCGGTGAAATGTCCGTTTCACA AATTATATTATAAAAAAATATTTGGCCAATTTTCCTTTAACGGAGTCCTT GTCACCACGACGTTATCTTAAGGGTATTTCGCAACCTTTTATCCAGCAGG AAGGAGAAAAATGCACACAATCATTGGGTAGTTAAACAATTCTTTCCAAC AATGAAAAAGTTTAACAATTCAACAATTTTTTTTTTAAATTCCATATTCA ATATCAGTAGTTCTTGACGCCCTCATAACTAGTATTGTGCCAGTCCCGTC TAGTTCAGTCTCGGCCAGGKATTGTTCATTCCTGTATATCAGTCCTAAAA ATTGTAAAGTTCGGTCTTTGATAAAGTCACTCAACTTTTTTTTTTTAAAT CCGTTCTAGTACTGATACTCCAACAGACCATTCTTAAGACTGAATTGGAC CGGATCGAATGAATAAGGACTCACACATCACTAGCCTTAATATTAAAGAA TCAGAAAAGAAAGTATTAATAAGATTTGGAAGTAAAAATTTTAGTTTCAA AAACATATAATGAGTCATGATTATCAGGATTTGTTGAGATTGAGTGAATA AAAATCGAGTCGGACACAAAAAAATATTAAATCGACTTAGGGTTCTTTAA AGGTTTAAAATCGACTCAATGACATCACTCAACTTTATTTCTTCTTTTTT TAATCAGTTCTAGTACTGAGAGTCCTAAGGACCAGTCCATTATAATGAAC 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ATAAAGATAGTATTTTTTTTCTGATTTTTTTTTGGGGGGGGGGGKGCTAC ATCCCCTCTAGCCCACCCCCTACGGACGCCYCTGTTAAATGGTATCGAAG AAGAAGTATTTTCACAAAAAAAATTATTTATTTCTATGTATATTGTACGA TTGATAAGGTAACCGGCAATAAGACGCATATTAGTGGAAACTTGTTTGTT CGAATGTTTCATCCATGTAATGGCCAATGACTAAGCAATAAGCATGTTAT GATGAAGTATTTTTTAAATATGTAACTGACGAACTGAAAACATGTAAACA GTGAACACGCAATCTGTATTCGAAAGGGAAAGTATTTTGCAGAAAGGAAG AAATCAATATCCTTGTAGACTTCCTACATACAAATAACTTTGAGGTCTAA ATAGAGCGTTTTCCCTGACGTCACAAATTACATCCTATACCCATGCTACG ATATGTTGGGAGCCTAGAATTAATATATTTGCTAAGTAAGGTGCACTAGA ATATTTCAGAAACTTCTTCCAATGGCATTAAAAATATATATACAGAAAAA AAACCACATGTTTTAAAATTTATATCATTCAAATTGCTAGATTTTTACAA TTAGTTTTGTTTTAGAGTGATTGGATACGGGGAAATAGAATCAGGGCTGG TTCTATGGGGTTTCTTTGCTTAATATTTTTATACCAAATTATTAAGTAAC TTTTCTCTAAAAAATAAGATTGAGCCTTTTCAAAAAAAAAAAGGGCCTTA TGACTTTTTGACATTTCAACTCTCTTTCCCTTGACTTTTTTGATATTTAA TTCAGTATATTTTATTTTAAAGAAAAGTAATATTTCTAAAAAGTTCTTTT CAAAAAAAGAAAGTATATTTACATAAGGCCTTCATTTCAAATTCTTAAGT CAATAACTAAATAATTATTCCAGCTTTTTCATCTACTACAAAATACACCC 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TTCGCGCCCATTTTATGTATATTATAATTACAATATACTCATATATATTA ATAAAACAATGTGAATGTATGAATATATGAAAAAAGTCACCGGGTGGACT GTATATACTGCTTCATTACGGATAGCATAAAAAAATATTGATTCATGTGT ACATAGGGCATTGAACGTGTATAAGTGGTACACTGTATATAGTACTCCTC GATATAAATAATATTAATATTTTTGATATAAAAATGATAATGTAGTTGTA TCAATAAAATGTTGTGGGCGTGTGCGTATAACAAGAGTGTTTTTTCTGGT TTTTTTTGTTATTGATATCTCATGAATATCAGAGTTCAAATGCATATATG ACAAGATTTGAATAAAATATAAACAATTAATTTTGTTAGTTTTTATTAGT GAGCGATCTAGAGATTTTTTTTTCTCAAACTCTTATAGCTATCCTTTCAT TCTGAAGGAAGGAACAAGCCATAGGAATTGATATAACTATAAGTATTGAG TAGTTACGTGTGTGTGTGTGCTAAAAAAAAACCCGATAGTAACACTGAGG ATTTCTGGAGGGAGTAATCTTCTAATTTATTCAACAGAAATTTGTCTTTT AGCCGACGACTAATTAGTCCAGGTGATGCAGGGTAGTATTTATTTTTTAG TTTGGCCATTTTTTTTTTTTTGGAATTGGTAATCGGAAGAATGGTTTTTA TTTTACCTAGCAGTTGCCATTATAATTTAATTCCTGAGTAGTGATAATTG TATGACCATATTTGACTCAGAATAAAAATTGGGCAGCGATATCGGATTAA TTATTACCAACGTCCTTAAATACTTCATTTTTCCCTCCTCCCTTGTCACA GCTGATTGAAATTAGTGTTGGGTTTCGGTATGGAAATTCTAGACCGATCT GAGACCCTTATATTTTTTGTTGGGCCAAATTAGTTCGGTCTAACAAAAAT 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TGTGCCAATCCGAGGGCGGRGGGTWTTCAACCATATTTCAAGAGGCCCTA ARATATTTATTCCCCCCCCCCCCTTACCAATCCTCCCGATCAATTTCTTA TAAATTATAAATGACCCATTTCTATCAACATATTTATAGGTTACATAGAT TGCATTTAAATTAATAAAAAAATCATCAACACATTGAAAGAATTATACTA TGCAACAAAATTCAGGAACTCCCGCCTGCTAAAACCCAATTTATCATCGT TATTTAAGCCGTAGAAGACAAAAATGACTATTAAAACCTTCAACCGCAAT AGGTTTGTCCTAAAGAGATTTTCTTATATTTATCTCCCAAACTCACAGAT CTACCATTTTAATTGATTTTTTCAAAAGTGAGATATTGATTAGATGTTGT TCTGATATGATGTTTGAGGTATTTAAGATAGAAAAATATGGTCAAGATCA ACCATACTTTTTTATAACAGAATAATAAATAAAAAGGTTTTATGGTATTG CTCAATAGCCATCATCTGATGGTTCCATCAGACATAGCCATATTATTATT AACATTGATCTCAGACATTGTCTATAAGCCCAGATCCGAATAAAAAATGC CTAGACGTTTGCCTTGATGCCTTACAAAAGACGAAAATTCTCTCTTCATT ATTCTACCTTTACAGACTACCAAGAGATAATGAATTGCGTTTATTTTTGA GGACATAAATTTTAATTTTTTTAACAGTTACTACATAAATAGTCCAAATT TAACGACTTACGTTCCGTTTTCTCCTACCCATATAAGCCATAAGTGATGC CATCAATAAGCCATTACTAATCGGGACTATCTACTCCATGTTTATTACAG TAATAAATAATTTAATTTTGTTCCAATTAAGAATAAAGACAAAATATTTT ACAAAAATTTGAATACATTCTTATTCAATTTTCATTTGCACACTCCTTGA 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