EMLSAT00000006363, EMLSAT00000006363-702210 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006363
Unique NameEMLSAT00000006363-702210
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s348supercontigLSalAtl2s348:125017..171411 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006363 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006363EMLSAG00000006363-689129Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000027788EMLSAE00000027788-736716Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027789EMLSAE00000027789-736717Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027790EMLSAE00000027790-736718Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027791EMLSAE00000027791-736719Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027792EMLSAE00000027792-736720Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027793EMLSAE00000027793-736721Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027794EMLSAE00000027794-736722Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772745auto772745Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006363EMLSAP00000006363Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006363

>EMLSAP00000006363 ID=EMLSAP00000006363|Name=EMLSAP00000006363|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=594bp
MSYCKSLLLAIFGISLVQSDIRLPSYGSDGNIKPGGVDFSDCKPQPDGMC
CVYQTSQIQSISKDPILECNHKQVEKCHYTYVTQFESSQEEICDENFEKK
CQITFKQVAVKEKIKKCYKPMIKKCGKEAALEYNRNVETKCETVYETSCT
TRYVQKRSGKFVGDTNCEKIPIELCGKGCTITEGPEECHDKVLDSLACDL
NPQKTCRFATKLVPKLKPKHECTTIPKEVCALKFSQPKQVPKPLTTKWCI
DPNGQTIKDTGSYAESEGAPLITDFNAVGGFGQSPSGFGGNSGSRGSGSS
GIRGGSSSSGSGFGGSGSSGLGGSDSLEFGGSSNSFGSGFGGSSSSEFGG
SSSSGFGGSSSSGFGGSGSSGFGGSESSGFGGSSSSGFGGLGSSGFGGSG
SSGFGGSGSSGFGSSSGGIGGSSSSGFGGSSGSSGGFGSSSSNGFGGSKA
SSGSFGSSSGNKFVGAGSTAFGGGNTATFGGSSSGSRQQIGGGSFEGAAS
ASNQYSSQSSFATGPSVSSFGSSSLSGSQSGGVNGATSLDSYGISQFPVS
SSSDFASESFDALPSASSSQSSFSNEIPNVAPSSFSIIIKMHDS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s348:125017..171411+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006363-702210 ID=EMLSAT00000006363-702210|Name=EMLSAT00000006363|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=46395bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s348:125017..171411+ (Lepeophtheirus salmonis)
CTTGAATCTATAAATGTGTAGTCTAAGTCTCAAATCAACATTCGAATCGT AGACTTGAATATTAAGTTGAGTGATAAACTAATATAAATTCATCATCTAC ATATTTATATGAAAGTACAAAAATAGATTGATTTCAAATAGCAGTGAATT TGAAAATCTCTGAAAAGTGTCTCTGAAAATATGAGTTATTGTAAGGTTCG TAGAAAAAAGATTTTTTTGTTAATTTGTCTTTGTAACTTTTGAAAAATTC AATTTTATTTAATAAATTTTCAATGGTAGAATAAAAACTTGTTTTTAGAT TTGTCCTCATTTCTCCTCACTTTATACTTGTATTTACAAATAAAAGGTTA TGTGGAGTAATAATTTTGAAGTCACACCCGATTCAAGGACGTTTACTCCT TAAGTGCCCCTCATATATACATATATGCCATTGTAAAACTGGATTTATAC TTTTGTACAAACATGTGTAATAAACTGCATTTTGACCATCAATTATTATT TTTTCCCTTTATAGTCCCTTTTGTTGGCCATATTTGGCATTTCTCTGGTA CAATCTGATATTCGTTTACCTTCCTATGGCTCTGATGGTAACATTAAACC TGGAGGAGTTGACTTTTCGGATTGTAAACCTCAGCCTGATGGAATGTGCT GTGTATATCAAACCAGTCAAATTCAATCAATCTCTAAGGATCCCATTCTA GAATGTAATCACAAACAAGTGGAAAAATGCCATTATACCTACGTCACTCA ATTTGAGTCTTCTCAAGAGGAAATCTGCGACGAGAACTTTGAGAAGAAGT GTCAAATTACCTTCAAGCAAGTAGCTGTCAAAGAAAAAATCAAAAAGTGT TACAAGCCCATGATTAAGAAATGTGGGAAAGAAGCAGCCCTTGAATACAA CAGAAATGTAAGTCCTCAATCAGAGTTTTCTTTAGGTTTGCTATATAAAT TTATTTATTTGTTTGTAAGGTGGAAACAAAGTGTGAGACTGTCTATGAAA CCTCTTGTACCACTCGTTATGTACAAAAACGCTCAGGAAAATTTGTTGGA GATACTAATTGCGAAAAAATTCCTATTGAACTTTGTGGAAAGGGATGCAC TATTACTGAAGGACCTGAAGAATGTCATGACAAGGTTCTCGACTCACTTG TGGATGTTCCAGAAGAGGMAAGAACAAAACTTATGAAATATGATTGATAT TTGGACTGAAATACTCTTTACTTTTGTAGGCCTGTGATTTGAACCCTCAA AAAACATGCAGATTTGCAACAAAATTAGTTCCCAAATTGAAACCCAAACA TGAATGTACAACAATTCCCAAAGAAGTGTGTGCACTTAAATTCTCTCAAC CAAAGCAAGTTCCTAAGCCTCTTACAACTAAATGGTGCATTGATCCCAAT GGACAGACTATTAAGGACACTGGATCTTATGCTGAGTCCGAAGGAGCTCC ATTAATTACTGATTTTAATGCAGTAGGAGGTTTTGGACAAAGTCCCTCTG GATTTGGAGGTAATTCCGGTAGCAGAGGGTCAGGTTCATCAGGAATCAGA GGTGGTTCCAGTAGTTCTGGAAGTGGATTTGGAGGATCTGGCTCATCAGG ATTAGGTGGCTCAGATTCTTTAGAATTTGGAGGTAGTTCCAACAGTTTTG GAAGTGGATTTGGAGGATCTAGTTCATCAGAATTTGGAGGATCCAGTTCA TCAGGATTTGGAGGGTCTAGCTCATCTGGATTCGGAGGTTCTGGTTCATC AGGTTTTGGAGGATCTGAATCATCAGGATTTGGAGGCTCTAGCTCATCAG GATTTGGAGGATTAGGTTCATCAGGATTTGGAGGTTCAGGTTCATCAGGA TTTGGAGGATCAGGTTCATCAGGATTTGGGAGTAGTTCCGGAGGAATTGG AGGTAGCTCTTCAAGTGGATTTGGAGGATCATCAGGCAGCTCAGGTGGTT TTGGAAGCAGCTCTTCAAACGGATTTGGAGGATCAAAAGCCAGCTCAGGG AGTTTTGGAAGCAGCTCAGGAAACAAGTTTGTAGGAGCAGGCTCAACAGC TTTTGGAGGTGGTAATACAGCTACATTTGGAGGTTCCTCAAGTGGATCTA GACAGCAGATAGGAGGTGGAAGCTTTGAAGGAGCAGCATCTGCGTCAAAC CAATATTCTTCCCAGTCATCTTTCGCTACAGGTCCCAGTGTCTCCTCTTT CGGTTCTTCTTCACTATCTGGATCTCAGTCGGGAGGAGTGAATGGTGCCA CTTCTCTTGATTCCTATGGAATTAGTCAATTCCCAGTCTCATCTTCATCA GATTTTGCATCCGAATCCTTTGACGCACTTCCGTCAGCCTCATCTTCTCA ATCCTCTTTCTCTAATGAAATTCCAAATGTAGCCCCATCCAGTAGTTTTT TTAACTCTGGGCCCCTTCCATTTTCTACAGGKCCACAAGGATCCGGAAAT TCATTTGAAGGAGCGGCTTRTMTAGCCTCTGCACCCGTTTCAGAAACTTA TMCAGTAGGCCTACAAGAAAACAGCGTAGGAGAAGAGGCTCAAGCTCCTG CTACTGGCTATGGMATCGGAGCTCAAGCTCCTTCTACTGGTTATGCCATC GGTGGMCAACCTCAATCCTCATATTCCTCCATTTTTCAATGAATTGATCA AAGTTAAATTTAATTGATATCCTACATTTGTTATTTATTGCTAAATATTT ATTACCAAGTCTATTGAATACCCTGCTTTTCTGTTCATGAAGAAATGTCT TATTATTCACTCAATTATTGCATGTTATTGTTGTTCAAAAAATCCTAAAT ATTCGAAATATAAAGTATTTTGACTACATTTGAACGGTTCACAATTGATT TATTCATTGTTTTTAATCAATCTACGTTTATAAATGCATATTTTATGTAT GTTATATGATCAAGTTCATTAGTTGGTTTGTAAAATACTTCCGTAAAATT TTTTTGCAAATATCATGTCTGCGGTTACAATAGTTATTGCCATAAAAAAT TTACATAAGTCACTAAGCGATTATTATTTAAATAGTCTGAGTTATGTTTA AATAACGTTTACAATCATGATATATTTATATTGAACAAAAAAAAACTTTT CCCTGATAAACCTCTTACATATCCAGATATTTCTTATCAATGAAGGACGA TTGTGTAAAACTAGTTGTGAATAGATTGAAGGACTTTTCGGAAAATAAAA AAAATGAAATACACCTCAGGACACTTTTTTCCCCTTAAAATAATCTCTTT TTTTGCAGTTGGCCTTAATCACTCAAAGAATTATTATTAATTTCAATAAC ATAATATATAAAATTAATCAGAAAAATACATTTTTGATGTTATATCAATT ATAACAAATAGTATTTAATGGACCTTAAATGTTTCGCTTAAAAATGATTT TTTTGATATTTTATGGTGTTTTGTTTATTTACATACAACGACTTTTACAT TACAGAATAGATTGAGCTGAATATTGACATGTTAACTTTTTGGGACACTC CACGTAACATAGTTTTTTTTTTTATCTTAAGTACATGGTGACCTTTGGGA CGTCTACAAATTACCATTAATTTCACTTTATACTGTACTCTTATAATTTT TGTCAAAATATTTTTCTATCGAAAAATCTGGACAACACACTATTACATTC TTACCTGAAAATTGTGATGATTAGCTTTACAAATGAAGTATATAGTTCTT GATAAGTAATAACTAATATAATTTATTTAGAAATTTTTGGAAGGGATTCA CCCCAAAACATGGCGTGATATATCATAAAATAAATGCTATAGTTATATAC GGGCTAATAAGTATACCATCCAAGCATCAGGGAGTTTTATATATCTAATA TTTTGTTCTTAAAATATATCTTCAAAAATACTTGAAGAATCATATNAATT TTATAAAAAATTAATTTAAAAACGCCGGCTAGCGGGAGAAAAAGTAGCCT ATGTTCAACGAATTATCAAAGGGGATTCACATACCAAATAACTTANNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAATTAATCCATTT GACAAGAAAATTCAATGGGTATAGCTAATTTGTCGTATTTGGACTATAAC TCCAAAATATTATTGCTCGTATTAACCAAATTCAAAAATTATTTATATTC TGTAATCAATAGACCATATCTATTTCTTTTTATTCGATGTTAAAAATAGT ACGATTAACTCCACTATGAAGTAATACCAGAGATTTAGTCACATTATACG TACTATTTAGGTACATATAGTACAATCCGGAAGAACTATAATGTATTGTG TTCTACAATGAATATATAAGGTATTATTATTGAATTCTTTCCAATAAAAC TTTGTGTTCATATAAAATATTAGTTTCAAATTAGCGTACAGAGTGGTTTA AAATTTAAGTAATATTAAATTTGTGGTAATTCATTTAACAGTTTTTTGTA ACAATATTCTTTCCCCAGTTAAAATTTTTTACAATAAGTATTGATAATAA AAATTATGACATTGAGASCCCCAGCCACACTAAAACTTAAGTCCAATTTT GATGAAAAGAAAATTTTGGGCACTTTTGGCCCTCTCTTTTAACCTAATCT TAAACCCTTGTAAAGTAGTATATAATTAAAGAAGAGCAGCCTTTTACAGT TTCCAGATTAAGCAAAAACTGTTAGATGACAGTCATGGAGGCTACAAGGA 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TTTAAAAAAACATGATAGTTTTTACTTATTTCCGGCGTATTTTTAATAAA CACATATATCAGATTTTTTAAAATACAAATGTTAGATGTTAGTACAGTCT ACATATAGTATTCACTAACCTTTTACATAAAATGATAGTTTATCCTACAA AAAGGAAAAATCCTTACCAATTTTTTGATGACTTGCGTATAAGGACCACC TGTTTTAATGCATTTAAATAACTTTGTAATATATCCCCAAGGGTTGGAAG AATATTTGATGGAAAATCTTCCGGCTGACCTTTAAGTGGAAAATAAGTTT TGCTGCTTGAAAGGCAATTCTTTTACTCTGACATTGTAACCATTGACACT TTTAAAATTAACTAAAGCTCAGTTTAGAATTGAGAAGGAACGTTTATATC GCCGTTTCTTTGTGAGATCAACCAAACCCAAAAAGGAAAAAAAGAAAAAC TGTGTATATTTGTTATATACGTAATGAGGATGTAAATCAATTTTTCAACT TCATAATCAGTTAGTCGTGCTTTTAGATTAAATTCTTAGGTTATTGAAGA TAGACATTGGTATGAATTTTCCCCTGCTGCAGGATAAACTATCATTTTAC GAAAAAATTTAGTAAATACTATATGCAGAATGTACTAACATCTAACAATT GTTTAGTAAAAAATTCAAATACATGAGTGTGTCAAAAAAAAAACTAATAA TAACCAAAATAAGGGAAAATTATCTTTTTTTCAAAAACTTTGTACAAAAT ATGACAACTGAAGATGAAATCGTAGAGCGATGAAATTTTGTGAACCTTAT TTTCATACCCCAAGGCAACTTTTTCGCTCTAAATGTAATCAAAATTCGAA AAAAGTTGAAAATCTAACTAGTTTAGATAGTATGTATGTACTTTGTACAT ACATACAGGTATCTCAAAGTCTTAATTATTGATAAATGGAAGTAATTGTA ACATTTCTTGGAAGTAATTAAATACTACCTATAAAATTAAGTTGTTTACC CTTATAACGCCGACATGTCACGTTATACATCAAAAATCCTTTTTTTTCAG TTTCAAAACTTTTACTTAAAAAGTTTATAAATGAAATTATAAATATATAT GATCAATTGGTCATTTAAGAGGATCAAAATCCATTTTTTTTATTTATGAA CTTTAATTGTGGTAGACTTATTACCTCATCGAAAAGATTAGTAATAACAG TCGGTCATTTACATTTAAAAAAAACATATTAATCAATTTTTAATTGATTG ACCCAATAGAGTTGCACCAGTTAAGTTTAAGTAAAGTTTTAAGTGTTTAA TTTACTCTATCTGGTATAGAAAATGCATTTGAAGTCAATATACATAATGT ATATTTCCTTCTCTGTTAGCGACTGTGAATCAAAACTATGATTGTACAAA AGTTCACCACCAACTTTTTACCTCTAAAAAGGTCCACTTCCCTAATTTCA TCTCATGACAAGTTCATCTGGATGTAACTTATTCGTTATGAAAGCTCACC AAAAGACTAGTTCATTCTGACGAAAAAATACATATGTAATATTTGGAATG TATCTCAATGAAAAAAATAAGATAGAAATATTAACTATTTTATTTTACTT TTTAATACAACGATTTTATTATTCTATAAAATACTCATTATCCTAGTAAA GAAGTTCCCAAATTAAATATGACCTTATGTTACCAGAACAATTTATTTAA GCCTTAACCACCGATTGAAATGAATTTGTTACATGACTTTGACATATCTT TGAACTGAATATTGATATATTACTAATTTATTTATCACTCCTTGTGATTA TTGTCTCAAATCATCTAGATTTTTATTTAGAAATATATTTTGAGCTCGTA AAAGTAAATTATTCAATGCTTTTATTTTACAAACTTTAATAATGATATTA 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AATTGTTACAGCAACCGATAGAGATGTACAAGGTGTAGTACGAAGGCGTG CGTGCCTTCAATGGTGTAAATATAAATCTATAAGTGTGGATAAAAATTAT TTCTCTACTGAAAAATTATATTTTTAAATTTGTGATCTTCTTAGTGTTTC TTTGGGTGTTCAATGAAGGTTTTGGTGTGGAATTAGGTTCCTTTATTGTC ATTTTTCAGTATCCCGAACTCTTCATATAATATTCATCGATTTGGTAGTG GGGGGGGGGGAGTTTCTCCCCCATCTTTAATCTTACAAGTAATCTTATGC TAAGTACGCTCTTACTATTTTTTTTCTCTGATCTAAGCAAAGAAAAATGT CGTATGCTAAAGTTCTCTCCAGAAGGGACAAAAACATTAAAGAAACTGTT CAAAGGATAAATTTGAAGACAACGTTCAAATGGGAAAAGTTTGTTACTAC TTTAACAGAATCACATACAAATTGTGTATTCAATATTGTTAATATGAAAC AACTCATGGTTTCAAATGCTTTTTGGCTTTACAGATAATGAAATTGCTTG GGCTCAAGCTCGATATGGGGTTGGTTATGCATCTTTCTATACACATGAAC CTATAGATGTGCACTCTCGGCTAGAGCTATTAAAGAAATCATACAAAGTG AACATAGAAGGGTCCAATGGTATAATAATATCTGTATATATGAAAATAAA GGATATTCCGAACTTTTAGATGGAAATAGAAAAAAGAAGTACCATTACCG ATGTCAAGCCCTTCAAAAGAGATGGCGAAAGTAAATTGGGCGAATGGATT TCAAAGTTTTATGAGGTCGTAGATTCTTATTCCGGTCCTAACCCTGAGGA TCCTGTTGCACAAAGATAATTTAAAAACTGCAAGTCGGTTTGGAGAACAT CAAATTTCAAATATGAAGTGACATGAGCCCCTTCAAATATCCCTCAAACT AATGGCATTGGTGAATGTCTAGTTAACTTAGGGCTTGTTCGCAACCAATG CCAAAAATACTTCCGCACTCTTGCATGATTATAACGGAAAATGGTTACAA CTTTTAGAATACAGATCGGTGCTTTTGCATAATCTCAAAAATTATTAAAA TAACTCCTCTATTTCCAAGCCTCGAGCTACAAAATATATCTCGTCTATTA TCTCTTTCTTCAAATTCATTGATGCTTAGGAAGCAMCATGAAATTTTTCT CATACATTCTTTTCTATTGACAAACAAATGAGACTGTGAGACAAGGATCG ATTTGGTTCTTTTCAAGGGATTTAGTAAAGATGCATTCTAGCTATACAAA GTAATAGACACTAGGATATCAGAACACCGAGGCCTGATTGTATATCTGAA ATCCATTTAAAAAATAAAAACATATAAATCATCCTGGAAACTCAACCCTA CCTTAATTGACGATCCTAAGGTTAATAATAGGATCATTTAAATAATTGAA ACTGCCAAATCTGAAGTAACAAATGGTGATGACATTTTTTCTTGTGTAAA AAATACGCGTAAGTTAATCAGAAATGTTTGTTGTAGAGCTGGAGCAAAAA AAAAGAAGCCAAAATTAGACAAAAAAGTCTTAATCAAATTAAGAATATCA ATGATGATGAAATATCTCCTCAACAAAAACATTATAAAATAAATCAAATT AATCGTGAAGCTGATCTTCTTCATCGTGTCAAACTTAAAATTGAGCATAT AGATGATTTTTTTCACCTCCAAATTGCATTTTTTAAAACAAAAGATTAAA AGAAACTGAAACAATGATTTGTCCTTAAAGACAGAATCTGGTGTGACATC CAGTTATCTTGTATTTGTATGTAATGAAATTTTATGTTATTATTTGAACC CCTACAGATGTATTGACTGTTAAAATTTTACTCTGTGTATCTCCAATTGC 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