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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s348 | supercontig | LSalAtl2s348:125017..171411 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006363 >EMLSAP00000006363 ID=EMLSAP00000006363|Name=EMLSAP00000006363|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=594bp
MSYCKSLLLAIFGISLVQSDIRLPSYGSDGNIKPGGVDFSDCKPQPDGMC CVYQTSQIQSISKDPILECNHKQVEKCHYTYVTQFESSQEEICDENFEKK CQITFKQVAVKEKIKKCYKPMIKKCGKEAALEYNRNVETKCETVYETSCT TRYVQKRSGKFVGDTNCEKIPIELCGKGCTITEGPEECHDKVLDSLACDL NPQKTCRFATKLVPKLKPKHECTTIPKEVCALKFSQPKQVPKPLTTKWCI DPNGQTIKDTGSYAESEGAPLITDFNAVGGFGQSPSGFGGNSGSRGSGSS GIRGGSSSSGSGFGGSGSSGLGGSDSLEFGGSSNSFGSGFGGSSSSEFGG SSSSGFGGSSSSGFGGSGSSGFGGSESSGFGGSSSSGFGGLGSSGFGGSG SSGFGGSGSSGFGSSSGGIGGSSSSGFGGSSGSSGGFGSSSSNGFGGSKA SSGSFGSSSGNKFVGAGSTAFGGGNTATFGGSSSGSRQQIGGGSFEGAAS ASNQYSSQSSFATGPSVSSFGSSSLSGSQSGGVNGATSLDSYGISQFPVS SSSDFASESFDALPSASSSQSSFSNEIPNVAPSSFSIIIKMHDS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s348:125017..171411+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006363-702210 ID=EMLSAT00000006363-702210|Name=EMLSAT00000006363|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=46395bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s348:125017..171411+ (Lepeophtheirus salmonis) CTTGAATCTATAAATGTGTAGTCTAAGTCTCAAATCAACATTCGAATCGT
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GTTGCGTGATACAATAAAGTTGGCGACGTGCAAAATGGTATTGTTTTGAC
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TAGAGGGGGGGGGGGAAGACTTATGGTACCATTGTTTAAAATGCTGATGT
GATTATATGTTGCCTACTTTATTATGATTTTTGAGGGTATAACGAAAGCA
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CGTTTTTTATCAGTTCCAGTAGATTTTAAAACGTCACACTCCATGAAATT
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GCTTAAATAAAATATAATCTACATACTAAAAAATAAACCATCATACATTT
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ATTTTATTGTTCTGACATGAATTCAGTTAAATCTGGCATTACTTTAAGTT
GCTAAACACAAGCCAGACGTGGATTTTAATCAAAAAGATCATCACCCTTT
TTTCCTAATGTGGAAGTTGCTATATGTAATTGCACACAGGATAGATATCG
ATGAGATCTAAATAATTATTAATAATAAAATAAATGTCAAAATCACAAAA
TTAGACAATAAATATACTAATAAAAAAATGTTAGAAATAAATCCATTCGG
AAAGATTTAGTGCAAAAGCTAATTATGTAGTAATGTCCGGCGATATTACT
CCATATTCAGGACATCAAAAAATATTTTTCCCCTGTTAGTTATGCTTATT
TAACATCATAGTCCCATCATGAAGGATACGCACAATAGCTAATTATAATG
CTACACCCAATGTAACTACCCCCGTTGTTGTGACCATTTAAGCAGGGGTT
TTTCCCCTTTTATGAGTTATCTGAATACCTTTTCTTGGAGCTTATAAACC
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TTGGGAAACCTAATGATCATACATAAGTCTTTAAGTGAAGAAACTAGTGT
CAGACAAACTATTTGCGAACCATCTAAAACTACTGGTCCCGTTATTATGA
CCATTTAAGAAGTTTGTTTTTGCCATTTAATGAGTTGTGTATCATAATTC
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TTACAATGGGGGTATTTCTAAAAATGACATCACTACCAACATTCTCCATT
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ATGAAATATGCAATAAGCATCTTTGTGAGATCAAAGTTAAAGTCTGACTT
GATATATTCATTGTTAACTTGATTTTATAGATGAATATCTATACTTTTGA
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GTATTTTTCAAATTCCTGGCCTCTATTTTCAGAAATCCAGACAGAAGGAG
ATGTTATTTTAGGCATTCTATTCAGTTTTCCATCNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGATTTATKTTWTTTAATCAATSATGCC
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CCTCCGCTCTTCAATGGAGCATGGAGTATGTTATAGGAAATATTCTTTTT
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TCTCAATATATCTAAGATCCTTATTAGCTTTTGGGATCAAGACTATTCTG
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