EMLSAT00000007652, EMLSAT00000007652-703499 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007652
Unique NameEMLSAT00000007652-703499
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s443supercontigLSalAtl2s443:551509..578912 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007652 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007652EMLSAG00000007652-690418Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000033670EMLSAE00000033670-742598Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033671EMLSAE00000033671-742599Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033672EMLSAE00000033672-742600Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033673EMLSAE00000033673-742601Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033674EMLSAE00000033674-742602Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033675EMLSAE00000033675-742603Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033676EMLSAE00000033676-742604Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033677EMLSAE00000033677-742605Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778535auto778535Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007652EMLSAP00000007652Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007652

>EMLSAP00000007652 ID=EMLSAP00000007652|Name=EMLSAP00000007652|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=362bp
EDFVIICEESQSEYHHEKIDTIHEQVIRGNISCLENIFINDGISWINARD
HYGHTPTHKAVMANQGDVLNYIINKYPYQIEERDNEGRTPLHYAAALFGT
TSGTNKMYHYLLSGGADENVVDIQGHSAYYYQDHPQDIRHRTIQSRKPQP
IGTHLIKGDPDSATSPIPPPNRAYLRSLIHSSDLEHLEKVVLDGHGYKLL
HESTCIGKVSQFMFTLPNLMDTISILHNATVSGIVSVVQELLVNERLALS
RDIYGATPLHKAVLFYQPKLVKLISGKYCITTRAKDQHGKTAKYYVYSPG
EINLNILIARCKEMPRKREPQERIKKYSIPPYQQQAVSSFLHSNPPKGQL
KKHKLASYIKFT
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mRNA from alignment at LSalAtl2s443:551509..578912+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007652-703499 ID=EMLSAT00000007652-703499|Name=EMLSAT00000007652|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27404bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s443:551509..578912+ (Lepeophtheirus salmonis)
GAAGATTTTGTGATTATTTGTGAAGAATCTCAATCTGAATACCATCATGT CAGTACTTTATTTCTTGCAATATTCATACAGAATGGTGTCACAACAATGC GTCATCAAGAAGCTCTTCGATCATTAAAATATATCACCCAGAAATAATGT CCTAGTGAAGTAGAAGATAAAAAATCAAGGGAGAGACACCTCCATGAGTT TATAAAGCACTATAGAATGAACAGCACTATCATAGATCCTTGAATCTCAG TTAAATTAATTTATGATTAGTTGATGAGCTCAAACATGTTTGTTTATATT AAATATTATTTCTCTTTTCTTTGATTTTGTGCTTAAAAATAAATTGAATA CCAATATCAAAATTCATTTGCTGAAAATTGTGTTACTCTATGTTGTACTT AAATTTAAATAATTAAAAATACTATTAGAATTTAAAAAAATAAAAAACCT ATTTCTCAATTAAGCAAATTTTTTAGCATTTCATTTGCACTTTTTTCTTT TTTTTTGTTAAACATAAAGAAAAACATTGATGCTTTGATAAAATCAATGT TCATAGATATTTGCGATAATGCACATAGTCTTTATTCATACATATATAAT ATACGTATTTACAAATATCAAATTTAATCACAGGCAGTTATGAATGGATA TGGGTGGMTACTAATAGATCGCAATACAAGGCTTCCTCATGTGAATAGAT TTCTCAAAAAAGTTCCACAATTTCAGGTAGTTCTAAGAAAAAAGAAAAAA ATTATTATTATTTTCTATAATTAGGAAAAGATTGATACAATTCATGAGCA AGTTATTCGGGGAAATATTAGTTGTTTAGAAAACATATTTATAAATGACG GAATTTCATGGATTAATGCTCGTGACCACTACGGACATACACCAACTCAC AAGGCAGTGATGGCAAACCAAGGGGATGTTCTAAATTATATCATCAATAA ATATCCGTATCAAATTGAGGAAAGAGACAATGTGAGACAGTTTTTTATGA GAAAATAAATTAATCAAAAAAGGTATTTATCTCAGGAGGGAAGAACACCA TTACACTATGCTGCTGCGCTATTTGGAACTACTAGTGGTACAAATAAAAT GTATCATTATTTATTATCTGGTGGGGCAGATGAAAATGTCGTTGACATTG TGAGTAAAATCATTATTTTAAGCAATTCCAAAATACCTATCATATTATAC ATTTGTTATTCCAAATAAGTGTCATAATTAGTGATATCCAAATTATATCA ATAATATTTGTTAGCAGTTTTGGCTTTTATTTTTTTTATTTTGCATTCTC GATCTTTATTTGCATTTTTAAGTAAAAAATGTGTATAAGTGCAATTGTTC AATAGTAACATCCTGGCATACACACTACCTAATTTCCTACTCCAAAACAA GACAGCTCTGTCTCTAAGGTTCCCACTATTGAGTTTTATACAATCCAAAA GCCTCTCTTTCCCAAGAACTCGCACTAATAAAGTCCAACTTCAAAGTCCT AAAGGAGAGCATAATTCATCTGGAGGAAAGATTGCACCTTGTCCATCATT AAGAAGGTCGGCCAGAGCCTGAGGAGGTTCTGAAGAAACCCCAGCATTTG AGAATGTTAGTAATAGTGGTTTAGTGCTCTTTGGTGAGAATATGTCTTGT GTGAAGAAGAATCACAAGATCATAGCAAGCTTCAACTGCGCCCCCTGACA TCTGTAGACTACAAAAAAACCTTTAGAATTTTCCAGGACTTTTTCACCAA TCAGACAAACAGGTATACAGAGGACTACTGAGGGATCAGAAGATTAAAGG CTTGATAGAATAAAAAATTTAATTGGATAGAAATATTTAAAAGAAAAATA AATCTTTCTTTACTGGATTTATTTGCATTTTCAGCCTTATTATGTTTTTT TATTTGCATTTTGTTCTTTTTTTGCATATTTAGCTCCATTTTTATGCATT ATTTGGGTATCATTAGTCATAATATAATTATCATTATTCTTACGAGTATA AAAATATGTTATTAATTTTATAAAATAGTTAACTTCATGCATGGTCTAAA TGTTTCCTAGTTATGTACTGTTTTCCGCTGAATGATAGTATCTCGATCTA TATTAAACTCAATTACCGACAGATGACATAATTTGCGTTTGCATTTTCTA AAATATCAATATATATATATATATATAATAAAAATCAGATATAACATACA TCCTAATACCCTGGGAACACGAATTTGGTTCAAATGAATAGAAGGTAATG ATAGAATTTTCTTTGAGTGCAGAATCTAAAACTGTTATCTTTCAGTGCTC TGAAATATCTGGGATTATAGTAATTCGGGACAATTATAGTTCAGAGTAAT AGTTTACTCTTAAGACAATCACCAATTTAAACGTAGGAATAATAAAACTT ATGTAAAAGTGTTTTATGATTATAAAATTGTTTTTATTGATTCTGTGTCT TGTTATGAATTCGATATATTTCCTTTTTTAGACTGAAAAATTAGGGGAAA TTTAATATTCCCTATCTACAAAWAAATCCTACGAACAAGAAAGGTGAGGA AAAATACGAAAATTATAAGNNAGATATTGAGGAACAGTGATGTTAAAATT GAGATGTTAGCATACTCATCATTTCTATCTCATATTATAACATTCAAGGG AAATTAAATAATGCTGAAGTCATTGTGATCGAAAATTCAATATCAATATT ATTTTAACTTTGGAAATATAAAATAATATTGTGAGCAGAAGAGGATCAGA ATTCTGAATTCTAAGATAATTTTGAAAAAGTCATTCGTTGAACGATGCTT GTGTAAAAATGAGGAGAACTTGATGGGAGCAGTCAAAAGTACAGTACTTG TGACAATCTCCTAGCGAATCGTGAAGGAGACTTAGCCGCTTCTGGTGAGT CTAGAATAGAAGATAGTTACTCAGGACAACTTGAAGAAAATGATAATATA GTATCCAAAATCTCCTTCTGGATTACAAAAAGATGTTCCGTCTGGAGAAA ATATTTCGGTCGTAGAATCGAAGATTGGTGAGTGTCAAGATCATACTTTT TCTCAAATTTCCTCTGACAACAATTTGGATTTAGAAGGTCAAGGCAACTA TGAAGTGTCTTCTTCATCGAGCAAAAGAAAGGATAATACTAATTTAACAG AAGATATGTTTTAGGAGAATTGTCTCCTGCGAGGATGGCGTCGAGGGAGG TGTCAAGTGCAGATAAGAACCTAAAATATTTACCCAATAAACCTTGTAGC CTTGACTAGATGAATAACTAATTTTATTGAAAAGACTTTGTTCTGAGACA GTTGGGAATAAATTTTATGCTCAAAGGAAGGGAGAAAATCTCACATGCAG TTTAAGGGTACAAATGTGTCATAGCTCAATGTCATCTCATTCCCAAATTT ATCCATTGCTACTACACAAAAAATTAATGTTGAGAAGTAATTTCAATCGC AGGTAACTGGTTTTTCCCAGGCAGAATTGGAAAAAATCCTCCTCACCATA TGAATCTAATAGTAAAAAAATAATTTCATTTAATGTTCAATGAAGAAGAG ATCGTAGGTCTAGATATGCCCTGAAGAATCACTTATTAACTTTTAAGCCG AATATAATTCGCCTACAAGATGTTAAGTGTGGTGTCTCCTTGTCAAGTGA ACTTTCTGGTGCTTTTTGCTTTTCTCATACATTTTTCATTTTTTTACTGG ATCAGAAACCTTTAGATGAATCATAAACTTCATATCAAAGAAAATTGATA ACCCTATTTGTATTTAAGAAATCACTGGTTGTAGTTATTTGAATTAAAAT TTTAGTGAAATTCTCAAATTTTAAGTTTTACCTAATTAACGGGCTTGGCT CAAAGGAGAAATCGTTTTCTTATTTTCAAGCAATTAGTAATTAATTATAT AAGGAATCTTGTCCCGTTGTTATTAATAGTTGATTGTCCCCCATGACATA CATGCTTCTATGCCAACCCTTCAAGAGGGCTGTCCCATCAATCTACAGGT ATTTTAGTAAAAATAAGAGATTATTTAAATACACAACAAGGGGCTTCTGA TACAATGGGAAATTACGTTATGGTAGAGTTTGATTTTTGTGGGGAAAAAA CAACTTTGTCTGCCATCTACGAAATTAATAATGATTGAAGGTGTTGTTTC TCGAATGTTCTTAAAAAATATTTACAGACTCACACTGGTGAATGTCTTGT GGCTGGAGATATGAATATTACGCGTGGAAAAAGTCATTGGTGACCTTACT GATTTAGGGCTGCTTCCAAAAAAAAAAAAGANTCCTAAAATGACATTTAA TTCAAAAACAAAGTTATGTAGAGTGATATATGACCGACTTGCTACTCCTC GACTATCAAACTTTTTGGAACAATTACACGTTCTGCTTTCATTCATCTAT GATCTTTGCCCATTAATTTCTGCTTTCAATAATAAATCAACCAAGAAGCT TCATCTATAAACTAAATATGTTGCTCTGGACTCACGATGAAATATTGAAT TAAATTAAAGTCAGATTCTGGAAACATTTCACCGTGGAAACGTTAAAAAA TATCGTGTTAAATGAAAAAGAATATATTTCTATGACAGGTTAAAGGGGCT GCATTAGAAAGAAAATGAGKGAAGAGACGTTTAGAAAAAATACTTGACGA GCGTCTAGATACAAAMTCAAAGTTAGGGGGGGGGGGACACAACTGAATAT GAAACTGAAGGAACAATGTTTATATTTAGAAGAAAAATATTGGATCTTCA TATAAAACGCAAGTTATCCTATAAAAACCTCTAAGATTCGATTGGTGTGT GTATGGAAGGGGGGGGGGGGGGTATGACCTCTGTGTGAGGTTCTGAGGAT TAGGCTAAGATATTGGTTGAGGTATGTTGGTTTTTACGCTTTGAAGTGTG CTTGCCCTGACTGTTCCTTTGATTAATGTGTTATTTCTGCTACTGCTGTA AAAGTGTCAAAGACCCTACTATGTGAAAACAACTCTTGTCCAAATTATTG GAGCCAGTAGAACTGCAAGATATCATTTCAATTAATGAAGATATTTTTAA GAATATAGATTTCCTCAAATACTTGGACGAGATCCTGAACTTCATATAAA ATTACTAAAAAATTATAAATATCCCCGGCTTTCTGGACATCCTTTCGAGT TTTTAGGACTTCTGGTTGGCTAATGACTCTTATATTTAGAGGAATTATAA ATAGAAAAATAAATAATTTTCTACCCCACATCATCTGTCCTGACCAGAAG GCTTTCGTGTAGGGCAGATACTTAGTATATATTTGTTGTTAATAAAAAAT GAAAAAGATGACTGTTCGTCAAATAAATTTACCGCACTCTTAATAGATTT TAATAAGCCTTTTGACAGTTTATAAATTAAGAATATTTATCGAAAATACA TATTTCAACAGTGGTACTTAAATGGATTTCCCGATTAATTCGTGGATATG ATCTCGGCAATTTTGCAACACGCCTTGGCTCCCATTGTATTAAATCAGTA TGCATTGGAGGTTGGTAAAAGAAGAATTATGTCAGGCCAGGAGGTTCTCG TGTTCTAGCAGATACAAGTTCCACAAAATTTCAAGGATTAGTGTTTCCCC TCGCAGAACTAGATTTCTACAGGACCTGTAAATTAATAATTATTGAAGCT TATCTCAAGTCGGCTTTGAGAACTTTCAGCTTTCAGTGAAAGGCAAGTTG 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AGAAAATTGGCCAGGAGGCTTACTACAAGGTGATAAAGTTCACCATTCTA CCATGGCTCAAGGCCACATACCCAGAGGACAACTATGTGTGGWCCCAAGA TGGTGCTTCCTCACACACATCGGCCAAATGCTAGAAAATCTGCCCGACAA CATGGCTAATTTTTCGCACAAGGACATGTAGCCATCCTCTTCACTAGATT TGTACCCGTTGGACTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNGGAGAGGGAGGAATAACTGGACATCTCACCCGCC ACGTGGATTCCCTGCAGGCCGCTATTGTGAAGAAGTGGAACAAATAGTCC GACAATTTCATCATCAATTCCTGCAAGTCTTTCTGCCGCCGTATGGAGAT GGTGATTACTGCTGAGGGGGGGGGGCTACATTGATTGAAMATGCTCACAC AGGTCGTGTCTCAAAGTTTTGTAACAAAAAAATTTCAAAGTTATATATCA AGAAATAAAATTATTTACATTTTTCTAATATCTGTCATTCAGTCCACGTT ATGCTTCGGAATCCTGTATATATCAGGGCTAGCAACGCCATTTCTCTTCA CTAATATCCACAATAAATTTAATGATCCTCCCTACAAATTATTTTCAATC ATTAATGAAATCTAAAATAATTCAATGTTAGTGTTTGAATAAGTATTGTT CAAATGTTAAAAGATGGTTTTTTTCCTTAAATATAACTTTTTTTTCCTAG TTTTCATAATTAGAACAGTACTATAAAAATATCTGTATTAATTATTGTGC ACAGAAAACTAACAATACTGCAAAAGTTCAAATCATTTAATTACATTAGA TTTTTTTTTAGTAAAAAAATGTACACCAACCAAGGTTCAACAACAATAAA ATCATAAGAAACAATTTTCTAATACAAGAATATAAAAATGAAAATCTGGT GTAAAATTATTCAACTTAGGACTTCAATCCTTTTACGACGATTTTGTATA GCCGGACGATCCTCTTTATTGCAAAATTATGTCAAACCAAATTTAATAGA CGATACAAAGTCCCTGAAGTTACCCACCAAGTCTGAACTTTTGAAAGATA ATGCCACAAATCTTACTGAGATAGATATAAGTAATACCCTTAAATTTCTG TGTGCGTACTTTTTTTTAAATTTGAATTAATGAAAGTTTTGACACCTAAA AGTTAAAGATGTATTTCGCAACTTTCTTTCAATATTTGGTTGAATGGAAC AACAAATACAATTAAAGATATCTTTTATTTTTTTGTTTTGTTCTGTGATA TACATGTAAAATGAAAATAACTTTTGTAATATTGCCGCCAAAGACATTTA ACGAAAGAATACAGAATACTATAAAAAAGTTTATCTCAGTTTGCACGAAC AGAACAGCGGATGACGAGAATGCCTTATTAAGAAATAGCTAGTACTTCTA ACATAAAAATAAAAGTAAGCCCTAAGTAACTTAACAATTCCTAACTTCCT GTATACATGATTACTAATTTCTTGGAATCTATTTATGCTCTGAAACAGCC TGATAACCCAATACGGAAAAAAATAAAAGGAAAAAATAAAATTACTATTA CCTTCATAAATAACTAAATTAAGTAGTCTGTAAGAGTACCAAGCCAACAG AAACAGAATAGATTTCCTTAGTATAGTTATTCAATGTAAAGTTTATTCTA TTCAAGGGAACCATTTTATCAGCATAAAAAAGAGTAGGTATGTATTAGAA TGTGTGTGTAATTTTTTGAAAGGCAATTGGCTTAGTATTACCCATTTGCA 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TCAATTTGGTAGGTTTTGTGTTAAAAATCAATGCACCCACAAGTCATTCA TTTATTGAAAAGAATTAATGGTGATATTTTTATTCGTTAAATGAAAATGT AAAAGAGGGTGAAGTTGTTATCTTAAAGGCTAGTTCTTTGAAACGCTCGC AATTTTCTTTAGCCTCATCCCACTCCCCTACAAACTGGTTTAAACATGAA TGCACACTATTGGTTAGTAAGTCCAGTATGAATGATTTGTCCATTATGTT TCCTAACGACAACATACGGTGTAGACGTTCAACTAGAAAGAAGAAGGTCC CCCGTGGCCGATTTTATAGAAAGAGGAAGGCGTTGTATAGAAAGCCTTCG GAATTTTTTACGTCTATTAATAGAATGCTCCTCGACAACGTTACAGACCT GGAATTAGATCATCAAAAAGGGAATATCGAATTACACCCTATGCAGAATC ATAGATGGAATTTGCAAATGCAAAGCCATCCTTATTTTAAGATTAAGTGG GTGAAGATTGAACTTATTTGTAATCAAACTCCTACTTTCTTTGGTCAATA TTTCTTTGGTCATACTGGCTTTTGTTTACAAAGTCAAATCATTTTCGAGT AAATTTATTACTTGTAAAGTGCTAAAATATATTAAGAAATTGTATTACCA TCTCAAAAAGATGTGCAATACGATATTAGAGTAAAAATAACTTTTATAAA ATATTTATACGTACTAGAAAGATAATTTTATTTACAAATATAAATGTAAT TTTTTTCCCCTACTAGCCTTGAAAGTCACCCTGTCATAGAATAAGTAGGA CAGTCAAAAGATTCGCAACACAAATCAACCTAGTATGACTAAATAAAGAA TAACTATTAACATCCAAATATTAAATTAACTTTTACATTTTCACTTGCTT GAAAAATTACCATAGGATAACTTTTTTGGTAGATGATAAAAATAAAAACA 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