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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s512 | supercontig | LSalAtl2s512:170722..178990 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008379 >EMLSAP00000008379 ID=EMLSAP00000008379|Name=EMLSAP00000008379|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=252bp
MCDSDSDDEGVLTNVNKLVIRPPGHTGKAKKGHVCFDSGFETMNLGRVDF
ISDQEYDLYIRPDTGNPRHRLWFYFTIDNTQANQKVIFNFINLSKYYLLF
REGLTPVVKSCSRPIWQRIPKPDVFYYKSSIHSGRYASIFESPQGKNWQG
KSRIKYYIPNKPRKWVVKIFAPWDINRFMFDFHVSDGPIKHLNGALDLGA
ICNVVLQFPQKIPRGKNYLLYFENRFTSSPLVKNLAQKKIYALGTFKQSQ
LK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s512:170722..178990- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008379-704226 ID=EMLSAT00000008379-704226|Name=EMLSAT00000008379|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8269bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s512:170722..178990- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTGCGACTCCGACTCTGATGATGAAGGTGTTTTAACAAATGTCAATAA
ACTCGTCATTCGTCCTCCAGGGCATACAGGCAAGGCTAAAAAAGGGCATG
TCTGCTTTGATTCAGGATTTGAGACAATGAACTTAGGAAGAGTCGATTTT
ATTTCGGATCAGGTAAGTGGGAGGAACTCTTTGCTAAGATCTTTATTTAG
TCACTTCTCTTGCTTTTATAGGAATACGATTTGTACATTCGCCCAGATAC
AGGGAACCCTCGACATCGCTTATGGTTCTACTTCACAATCGATAACACAC
AAGCGAATCAAAAAGTCATCTTTAACTTCATCAATCTTAGTAAATACTAT
TTGCTCTTTAGAGAAGGACTTACTCCAGTCGTTAAATCCTGCTCACGACC
CATATGGCAAAGAATTCCAAAACCAGATGTTTTTTACTACAAATCTTCGA
TCCATTCGGGAAGATATGTACTTAGTTTTGTATTTTGCTTCGATTTGGAA
GATGAAAAGTATCATTTGGCCTTGGCTGAACCCTATTCCTTCTCAAGACA
CAATGTAAGTTCCATCATGTACAATATTACACTAACGCGTGCGAAATATT
TTTTAGTTGGCCTTCTGAAGAGTTTTTATTAATTTAACAATGCAGTTATC
ATTATTTTTTTTTAAATGTTCCTCTAATTGGTTAGATGGAGTATCTCTGA
TAAATTATATGTAAACATTATAATATTACAATTATTCCATCCATCCAAGG
ATTTTTTTTGATGTAAATAGAGTGTATTTCTTAGGTGACCCACTTTTTGG
GATAAGTAATCCGAAGAAGAAATTTTTAGCGGTGTAAATAAAAATAAAAT
TACTAAACTTTTTAGGTAGTGATCAATTTTAACGACATCCGAGTAATTCC
GGTCTATGCCCTTGATAAATATGGAGTGATATATACTGATATAAGCCTTG
TGTAGTTTTTAGCTGTCCTTATTTTTTTGGAATTGTTATGTGAAGAACAA
AATAACATTACCTGAGCAGTTGTCATTATAATATAATAACCAAGTAGTGA
ACTTCCTTTTCCTATACATTCAACTATTTTCAAAACCAGATTAAACATTC
GTGAGTGCTCATATAAGACAGAGAGTAATATTTAGGATGGGTTGTTGAGT
TATAATATTTAATCCTTGTTGGACTCAGAGTATAATTGGGGATCGATATC
GGAGTAATTCTTTGCAATGCACTTGTTTATTTCCTTCTTTCCCTCCTTTC
TCGTCGTCACAGCTGCTTTTAGCTCATCTAATGTAACCGAATGACCGTTA
TTATATTCTTCTTAAAAAAAACTTTAAACTGTCCAGGTTACCTTGTTGAT
TATTGGTTTTTTAACATGCTCGTAATACACACGATTTTCATCKCCATCTA
TAAATATATAATATTTATTACTATTACACACCTTATGTGTACACAGAMGG
GATAGCCACCTCTCCTTAAAGCCACAGAAGCCCCAATTAAATGTGATAAC
CCGTGTAACATTTACCCCTATGACTGGGATATATTTTCATCTTCTCAAAT
CCCATCTTTTACAACAAAGTTTATATTACCAAAACATGACTTTAAAATAG
TCTATAGAAATAACAACACTGATTTAAAAAAACGTCCTTAAAAGATATAA
CAGCTTCAATGTAGATTAAAATTTCTTTTTTATTACACCGGGTATTCCAT
ATTTACCTCCGTATAACCTCCAGGGCAACACACTCTACAAATAAACGAAT
TTGAGTCTCAGTTGTATCTCCACACAATCTGCATGATAAACCTTCCACCA
TTCCCATGACCTTTAGATGCTTCCTTACGGGAATATGCCCTTTAATGAAG
CCAATTATAATGTGTATAGATGCTCTCCTGTTGAAAAAAAAAAATCAATT
CCAAAATAGGCCCCTCATAAAATAATTTTGCTTGCATGTTCTGTCTTCTA
TTCATTCCTATTTCCATGTTTTCCTTATGTACATAATTATCTCGGACAAA
GCTGCATTTTTGGGAKCTTCCACTTCAGATTCTTCCAGAATAGTTCCGCT
ATTCTCGGCAAGTGCATCTGCATATTCATTTCCATTATAATCCCAATGAC
CCTTTATTCATGTTATTGTCACATTCCTTTTCAAACTAACTTGTTAACCC
GTGAAGAAGCCTTCATATTTAGCTGGATAACTAATGTCAGCTGAACTATC
CAGGAAAATTTTGATAGGCATTTGAACAAACTTTCCAATATTATTTAGAG
CACGAAATGACTTTAAAATACCCTCCAGTTCTGCTTGAAAAACGGTGTTG
CACTATTTTATGTTACCACAGCCTTCCATGATGCAGGTATCTTCATACGT
TATAAACCACCCATATCCAACTTTGTCATCAATTTTTGAACCATCTGTAT
AAAAGATGAGAAATTATGAACTAATCGTTCCTCTTGCATTTCTATTTCAA
GTGAAATATTATGCCAAGTTTTTCTCAGTAATCTCTATTGGTGCTTCAAA
GATACTTAAAATTGATTTCAACTCTTTTTGGCCCTCTTTTGGTTATATTT
TTAGGGATCGAATTTATACTAATATCTTTTTCTATTCTCCTACGAGTTGC
TAATGCTCGTCGTTTTATGCTTAAATGTAAAGGTTCTGCATTGAGCAAGA
TTTTCATAGCTCTAGTTGGTGAAGATTTCATCACACCCCCAAACAGTTGA
CCATCTAATCTATTTATTCTTRTAGCCTCTATTATTATGACATGTTTTTT
ACGAAGCGCCTTGCTTTCAACTTTATCTACGACTTTTTCTATTGCCAAGT
CTGTGGACTTTCCTTTTCGAAATCCAAATTGATTTATCATAGTAACGTTC
AACTTCAGGGACTCAATATGCCAATAAATCACTCATCTCAATTCCTTTTA
ATATGGTACTAGTTAGTGTCTATAGGCTTTTGAAACACTGTTGTCAATCT
AATAAGGCATTAGCAGAGAAATTATCAATGCATTACTCCAGATTTTTGGT
ACATACGAAAATCTAATTGAAAATTTATACAAAAAAGACATACTCTCATA
ATACTCATCAGGTCCAGCTTTTTTAAAACTTTTAAACGATTTAAAAACAT
TCCGAATCAGAAAAACAGTTATTTCATTCCGCCATTTTGTGTTCATGTTT
TCAAGTAATGCATTCGAACTCCAAACTTTATATGTTTCATCTGACCCATC
TATAATTGAGTCACCAAAATGCCCTCTCACTAAATCATTTAAGCTATCCA
TTGCCGAAATTCTCCATCTTTATTACTTAAAAGTCCTACACTCGGTCCAT
AATGACAATTTTGTCGCTTTATCGTAGCTGATATTGCAGTGTAGGAATCC
AGCTCCGTGGATCTCTCCTTCCAATGCCTTCGTCTCTCCAGTTGATTACC
CTCCTATATTCTGTTTACATTTGTAATTGTCAATTTCCATCTAGAAAAGC
CGTCCCCGCTTTCTAGTACATATTTTATACACCTCTAGTGATCAGGCTAA
GTCTTTGTTGGGATTACAGTACAATTAATGATCGGAAATAATTTTTGCCT
ATGTCCTTGCTAGATAGAATTTGTGTTTATTTCCTTCCTCTCACGACTGT
TCGTAGTTTATCCAAAAAAACGTTATTACAACTAAGTTGTTCATCTCCCA
CATATTTTTTAAACTGCCATTTGAGTTATCAGTCTTTTTTGTTTTTACGA
TTGTCTCCCATTTATATTAGACTCTGGAATGTGACCAGTCACATTCCAGA
GTTGTAATCATTTTAAAATCATGTTGTTCATTCATCTTGTTTGAAGACTT
GTTGGTTAATACTTTACTTGAAAGAAAAGACTGACTTGTAAGGGACAAAT
TTATTGGAATATAAATTATTGCATATTTCATAAAAGTGGTATTCATTAGT
TAAATTCCGGTATAGTATTGTTTGCATGATGACCAGTTTAAAATAGAGAT
ATATTTTTTTGGAAGACAAACTTGACAGGAAAATGACTATGTACTGGAAA
AATCTTATCTTGGATTTAATATCTAACGTAATTACTATGTTGTAGTTTAA
AAAAAAGAAACTGTAAATTAAAGTGGTAACCCTGGCAAAAATTTGAAGAA
TTTTTGGAAGAAGGGCAGCTTTGAAATAAAAACCATAACATGAGATTAGC
TGCGATAAAATATTGAAGGAAAAAACTAAAGACATGTCCGACTCCATATA
CAGACTGAGCGTAGGTGGGAGTTACTCCGTTTTTGATCCTCCAATCTACT
TTGAGTTTAGCAAAGACTTACATTGATATATCCAAAGCGTTACATACTCG
AAGTTACTCATTAATAGATAAAAAAATGAAAATAGTTAAAAGAGCTCTAG
TTTTTGTAGTTGCAAACCTGAAAAGATACTTGTCATTTTCCACAGCTGGT
ACCATTGTTCTTGAAGAGATAACCAGTAAATATAAATTAATCACTGTTGT
GGGAAAGGCGAAGAGTTACACTTATGATTTGTTGTGGAGTTTTAAATATA
AGTGCTATTTAGACTTAGAGTAGAATTAAGGATCGACATCGGAGTATTCC
TACCTAAATCATCTGTAGATGCGGAGTGGGGGTTGTGTTTATTTCCTTCC
TCTCAAAGGTAGCTGCTTGTATCTATTCAAATAAAGGGCCACGACAGCTA
AGCTGCTCTCCTACCAACTATTGTCAGGATCACCACTTTTATTTTTACAT
ACTGGCAGGACGTCTTTTATACAACTCTATCCATACACTTTGTTCAAGTA
AATTAATAGAAATATATTTACTTGTGAACCTATGTATATCAGCAAAGGGT
TTTGCACTCACACAGACGTCTATAATTAAGTTTAATAAATTATCTTAATT
AGTAAATATATACATCCATCTTGAGAACTATTTACACATGGATTACATCT
ACTAAGAAAATAAGAAAACATGACTGAAGAGCTTTTTAGAAACTGACAAA
TCGAATTATTTTCATTTATTTACGAACATAATTATGGTTTTATCTATTCA
AAATATTGTACATGTTTCCTCTTAGAGTTGTAATTCATATGKCCTGCCGG
TATGTAAAAAACAAAAAAATACCAAAAATTATCAACCTCACTTTTTTGAA
ATAAACAATGATTAAGAGTATTTTCGAAACTCTTAGCTGTTTTCATTCAC
TCTAAGTACTATAAACTCAAAAAAGATATTACATACTCTGAGAATTTGGA
TTTTTATAATAATTTGTATCAATCAAGGCCCTTCGGTTTGAAGTTCGTGT
CAGTTTTATACACTGTCGTTGATACATACTTTGATAAATTATCAATTCAA
TGTATATGCTGTGTACAAGTTGGGAATTCGTACAAGTTGTAACCTGCATA
AAAAAAGAGTACAAATTATAAGTTATATAAGAAAATTGTACAAGTTGCAA
CAAAAAAATGAGAGGAATAATTTTAAGGGAAGGATTTACAGTACTTGTTG
GTATGTGTAAAAGATTCTTTACGTTTGAAATTTTTCCCTTTTTTTATCCC
AAAGATTAATTTGACGACTTTGAATATAGCTATTATCTTGTTGATCTAAC
AGCTAGGAATACTTTGAACATTTGACACTCCTTTATTTTCCTTTTCTAAT
TGAAGTTTATTGACCATAAATAAGTACCTTTGTAAAACTGAGTGCTTCCT
TACTCAATGACTTTTCTGATTGGAATTATTTGCTAAATTTTATTAATTTA
TTCCTCCTTTACTAGTATTTTTAATAGAGTTTCAATTGTATAAAATTCTT
TACGTTTGTCCATTTGGGATATTTTTGTATGATTTTTTAACGACTTTAGA
ACTTATAAACATTCAATTTTTTTGAATTATCTTGATGGATAATAGTATGA
TGATAACAAACACCACTGATTAATTTAGGGAATTGCTGGCTCCAATACTG
AGTAGAGTATATGAGGACTGTTTTGAAAAAGGACACCTTCAAACTTTTAT
GGCGAAAGGTTTAATTTCTTTAACACCAAAAGGGGAAAATGATCCCTGGT
AGGTACAAAATGTTGGAGCGATTACTCATTTAAATAGTAGTTGTAAAATA
ATGAACGGAATTCTAATTGAAAGATTAAAAATGGTTTAAAGCAAAATTAT
ACATCGAGAGCAGAATCTTACATAAGTGGAAGTGGTCAACTAAGACATTT
CAAGATTCAATGTTCTTGTACGCAAGGAGATCCTTTATCTGCATATCTTT
TTATCATTGCACTAGAAGATCTGATTGATACAATAGATAATAATGACCGA
ATATATGGGATATTGGTCGGAGACATGAAGGTGAAGACAGAAATTTATGG
AGACAATATGCTGTCTTAGTACCTTCTCAAGAAAGAGAAGCATCAATTTT
AGAATTAATGGAAGTACTAGAAGGCTTTGGATGTAAAAGTGGATTAAAAA
AAAGAAAGAAAAAGACTGAAGTGGGAAACCGAAGAAAAAAATCACAACTA
AGAAAAACTACATATACTAAGCTATTAGGTATAGAGGTCGGGAGAACAAG
TTACCTAAACTTCGAAGAATTAGAAAGTAGAGTGAAACAAATGTGGTTTC
ACTTTCAAAATTACTGTTTGGATCTTCCTGTAGGAGTACTTATAAGGAAT
CAAATGATCGTGTCCAAGAGTAGTCATTTGATGTGTTTTGTTCCACTCTA
CTAAAGAAAACGAAAAAATAATCGAGCAAATGAAGAGAAGATTCATCGTC
ATTGGGAAAATGCGTGGCACAATATCATGGACTAGAATTTATGAGAAAAG
TTATTGTGGGGGTATTGAAACCAAGAAACGCTGGATCATGAGTAATTTCA
GATGGTTTAGAAGATTAAATGGGAGTAAAAGTATATGGGCAATCATCATA
AATGTGCATATGAAAAGAATATATGGTTATGATCTTCATGACTATCCTGA
ATATGGTCATACCGACCTTATTAAATTATATAAAGTTAAGGGAAGCTTTT
GGAGTGGTTTAGGTGCTGCATGTTTGAAGGTCATTTTATAAAGTATTCAA
AACCCTCAGATTTTCTATTACACATGGTGGATAAATTATAGGCTGATTAC
AAATTCACTACCTACAAATAATGGGTGAAAAGGAACGGTGCAAGTATTTG
TAGACTCTGTGAGGACGGAGAGGAGGATGATATTCATTTATTCATGAAGT
GTCCTTATTACCAGAATGGAAGAATAAGAATTAGACAATATTTAGCAAAT
TGTTGATGAGGAGGATATCTACTTATCGTCAGACTTAATGAGAGCTAATA
TGATTACATTGAAATTTGTGTCTATAGTTTATAGACTATTATCGATGAAA
AGAAGCAAAAAGCTCTGGTTGGAAGTTTTATTGATTATGAATAGTCTATT
TTAAATGACAAAGTAGTTTTTGATATGTAAATATTTTATGTAGGCATTTT
ATAATTTATGTTATTTTAAACATCTGTATGTTGGCTATTTGAGTATTTAT
TTATTTTAGAGGGTAGTTATGTCGCTGTTGCTTTTATGTCTTTACTTTGA
GGACAATAAAGAGACTGAGAGTGAGAATGATGATAATCCACGAATAGCAA
AAAATTTATGGAGCTCCAAAATGGAAAAATATCCATACCGATTCTGTGAG
GGCCCTTCCAATATGCTTGAGAATGATACAAATGTAAAAGAAATAAAAGC
ATAGGTCCAATACTTCAAACAATTTTTTGACGAGAAAATAATGGATCGAA
TGGTTGAAAAAACCAATCTTTATTCCACACAAAATGATTCTACAAATTTG
ATCAATCTCACTCAAAACGTGTTATTTCAGCTTTTAGAAGTCTTATGGCA
ATGCCTTTGTTGAAGATTTCGTACTCGTGCTCATATTGGGCATAATATCT
TCTAGCTGTATAAAAGGCATCCATTTTTGAATCACCTCAAGGAAAAAATT
GGCAAGGTACCCATGCCTCAAATGCTTTGTATTGATTAACTGTTAGTTCT
ATTTAAAGGGAAATCAAGGATAAAATATTACATTCCGAATAAGCCTCGTA
AATGGGTGGTTAAAATATTTGCTCCATGGGATATTAATAGGTTTATGTTT
GATTTCCATGTCTCCGACGGTCCAATAAAACATCTGAATGGGGCACTAGA
CTTAGGAGCAATTTGTAACGTTGTTTTACAATTTCCCCAAAAAATACCTA
GAGGAAAAAATTATTTACTTTACTTTGAAAATCGGTTTACCTCAAGCCCT
TTGGTAAAAAATTTAGCGCAAAAGAAGATTTATGCTCTTGGAACTTTCAA
ACAATCTCAATTGAAATAA back to top
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