EMLSAT00000008459, EMLSAT00000008459-704306 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000008459
Unique NameEMLSAT00000008459-704306
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s51supercontigLSalAtl2s51:1311671..1338820 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000008459 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000008459EMLSAG00000008459-691225Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000037558EMLSAE00000037558-746486Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037559EMLSAE00000037559-746487Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037560EMLSAE00000037560-746488Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037561EMLSAE00000037561-746489Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037562EMLSAE00000037562-746490Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037563EMLSAE00000037563-746491Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037564EMLSAE00000037564-746492Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780623auto780623Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000008459EMLSAP00000008459Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000008459

>EMLSAP00000008459 ID=EMLSAP00000008459|Name=EMLSAP00000008459|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=606bp
MEGSQRRLVMMAGDGESGEXCRTFVFKGENHTLGNALRTVILQNPEVIFC
GYSXPHPAEDQMLLRIQTVNSSPAQEALKKGLEDLKDTSHINYEDVYEPA
EDSYLMLDVLEKQLKELKPPTICVEIGSGSGVLIGGVASALGSVNAAYFA
TDLSPLACIATVQTGNTSSVPLNVLCTDISFGLDRLKGSVDILLCNPPYV
ATPFEEITAYKDDLIKASWAGGPRGRNVTDKVIRLCKDLLSPVTGRAFIV
LEQCNDVDSVMEFTTEEVGLKADICATVSCPSPITEAAFHMLGSTILTRL
FTLCLVSSLFLSSSLCQNIDFSDLPSLLGDYDDEFISRNQLSDNEPTDDY
SNLEDNYEEVPHPVGVYYWGKDLKLGQVSGVAVDERNRPVIFQRGPVTWN
HKSFDRNYVLQDKTPIEEDTIMTLHPETGEILRSWGKDLFYMPHGIAVDS
LGNTYVTDTGLHQVMRFPLGSKEPDLTLGNRFEPGNGRNQFCQPSSVAVS
DITGDIFVAXGYYGDWDIIHSITLFEDENIFCIANRNGQTIECFSTGLKR
PFGQKMMLFEGGISQPHDLAISQYGDVIYVVEMDPEKTNKVLKFEVINRM
KDMDLF
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mRNA from alignment at LSalAtl2s51:1311671..1338820-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000008459-704306 ID=EMLSAT00000008459-704306|Name=EMLSAT00000008459|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27150bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s51:1311671..1338820- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGAAGGGTCTCAACGGCGCCTCGTCATGATGGCTGGGGATGGGGAGAG TGGAGAGAGKTGTCGKACGTTTGTCTTTAAAGGAGAGAATCATACTCTTG GAAACGCACTTCGAACTGTGATTCTTCAAAATCCTGAGGTTATCTTTTGT GGTTACTCCMTGCCTCATCCTGCTGAAGATCAAATGCTACTTCGTATTCA AACTGTTAACTCTTCTCCCGCTCAAGAAGCTCTTAAAAAGGGTCTTGAAG ATTTAAAAGGTACTCTTAATCCAGCCTCTTATCTTAGAAGTTTCCATACT GTTTTCAGTTTSATTATTCATCTCGTCTATAGATATTTATATATGTTCAT GTTATTTTTTCGATTTTTTTACAGACATGTGCCACAACGTTTCCAGTAAA TTCAGCSCTGCCATATCCAAACATCAAGAGTCATGAACATCCCTACTTTA GACACGTCTCATATCAACTATGAAGACGTATATGAACCCGCAGAGGATTC ATATCTCATGCTTGATGTCCTTGAAAAACAATTAAAAGAATTAAAACCCC CCACCATTTGTGTTGAAATAGGCTCTGGCTCCGGTGTACTCATTGGAGGA GTAGCATCTGCATTAGGGAGTGTCAATGCGGCTTATTTCGCAACGGATTT GAGTCCATTAGCCTGCATTGCCACTGTTCAAACAGGGAATACAAGTAGTG TACCACTTAACGTTCTCTGTACGGATATTTCATTTGGGTTAGATCGATTA AAAGGTTCTGTAGACATTCTACTTTGTAATCCTCCTTATGTCGCTACTCC CTTCGAAGAAATCACTGCCTATAAAGACGACTTGATTAAGGCATCTTGGG CTGGAGGACCTCGGGGAAGAAATGTGACGGATAAAGTTATTAGACTCTGT AAAGACCTTTTATCTCCTGTGACTGGGAGAGCTTTTATCGTATTGGAACA GTGCAATGATGTGGACTCCGTCATGGAGTTTACCACGGAGGAAGTGGGAC TCAAAGCTGATATTTGTGGTGAAAGAAAGGCTGGAAGAGAAAGACTTTAT ATATTGAGAGTCTCAAATGAGATTTCTTAATTATTTATCACTGATTCCGT CTTATATCATATATTTGATTTTTTTTCTCTTATTTTTTGTTTAACATTTA TTATTGTATATTAATAAAAAGTTGTCTTCCAGTTGTAATGGATTATAAAA TATCGCATGTGTAATTATTATCATTTGTCTTCAAGGGATGCAGTTTCTGT TGTAAGTCAAAAGTCAGTTGCATTCATTGCATACATACTATATAGTAATT ATAAATGATACAAAAGGGGGTAGGGTAAGAGGTTAAGCCAGAAGCTGTAG AGCTTGAATAATCGAATTGCTACTTACAAATCAAAGTCGCTTTACTATTG GAATAGCTCCTTCAATGGCAGATAGATACCTTACGTCATTGACTTTCTTT TTGTGAATATGTATTATCCAGTGAACATACATGCGCATTGAAACGTTTTA GATAAGTTCTTTGAATTAAAGAGGAAGGTAAGTCTCCCACTTCGTTTAGA AAATTTGTCGATCCTTTTCGTCTCTATCTATTTATTCCTCATCTAGTTTG TTCCTTGAATCCACTCCATATATTACTTATATATTTTATTTGTAGCTACA GTAAGTTGCCCATCACCTATCACAGAAGCAGCCTTCCATATGTTAGGAAG TACAATTCTCACAAGGCTTTTTACCTTATGCTTGGTATCTTCATTATTCC TCTCATCCTCATTATGCCAAAATATAGACTTTTCAGACCTACCGAGTCTA TTAGGGGATTATGACGATGAGTTTATATCTCGTAATCAATTAAGCGATAA TGAACCTACAGATGATTATTCTAACCTAGAGGACAACTATGAAGAAGTAC CCCATCCTGTTGGAGTATATTATTGGGGGAAGGACTTAAAACTTGGACAA GTATCTGGTGTTGCTGTAGATGAAAGGAATCGACCCGTCATTTTCCAACG CGGACCCGTGACATGGAATCATAAGTATTTTTTTTAATATTTAAAGAAAT CGTGGAGTAAAAGGCATCATATGTACACTATGCATGTATTTTTAGGAGCT TTGACAGGAATTATGTCCTACAAGATAAAACCCCAATCGAAGAGGATACA ATCATGACATTACATCCAGAAACGGGTGAAATTTTGAGATCATGGGGAAA GGATTTGTTTTATATGCCTCATGGGATAGCAGTTGATTCCTTGGGTAATA CATATGTCACTGATACAGGCCTTCATCAAGTCATGAGAGTAAGACTTTAA ATATCCAATATCTGTACCTAAATAAAAATAATCTATTATATCGATTGATG ATTCATATTTTACTTGGATATGAGCTATGATACTCATAACTTATATTTTT TTTCTAATGCTAGCTTTTTCTTCTTTATATATAGTTTCCTTTAGGATCAA AAGAGCCTGACTTGACATTGGGAAATAGATTTGAACCAGGAAATGGACGA AATCAGTTTTGTCAACCTAGTTCGGTTGCAGTCAGTGATATTACTGGTGA CATTTTTGTGGCAGRTGGCTATTGTAATAGTCGGGTCATGAAATTTAACA AGGATGGAGAACTCTTAGATGTTTTAGGTAAATTGATTTGTATTCATCTT TTATGAAACTTTAAGAAATTTTGGCTATCATAAGCTATACCAATTAATAG CTACGCCTTTAATTAAATGTTACTAAGCAATAATATAATAATCTAACGAA TAAAATACAGTATACATTTAAATATTACAAAATATATTTTAAAAATGTTG AAGAAATAATATATGACGGTGATAGTCTAGGAGTACATACAATAGTTGGT ATGATTGACTTATTTGGCTAACTACCAGATGATTTCGGGCCTTTTTTCTG TTTTTTTTGTGAAAAAAAGTTGTGTGATACAATAAAGAAACACAACGAAA AAGGGACGAAAGTACGAACGTCTAAATGAATGTCATTCAATATTTTTTTT CTGCTATCCATTCATTTCTCCTATTTAGGCGCATACACGCTCAAAAATGG ACATAAAATTAGTATGGCACTCATTATTACTCAATCTCCAAGTCTGAATG TCATATTAAGTATATGTTCGAAAGTATGTAGATTCTAGGTCTACGAACAT AATTATAATTATTGTCAGTAATGAATATGTTAATTCCGAGAAAATGTTTA TTTTATTTTTTGCAGATGGTGATTGGGATATCATTCACAGTATCACTTTA TTTGAGGACGAAAATATATTTTGTATAGCGAATAGAAACGGCCAAACAAT CGAATGTTTCAGCACGGGACTTAAACGACCTTTCGGACAAAAAATGATGC TATTCGAAGGAGTAGGATGCATTTTTGGAATTGTTGCAAAGGGAACAGCA TTAGTTGGTGTGATTGGAAAACCAGATTCATCAGGAATAACCATTGATAC TTCTCCTAACAAAGGACGAATTATTGATACCTGGGGTAAAAATGAGGTAA ATATACTTTGTTTTATTGTCATTCGATGTCAAATCGACCAAAATAAATAA AAATGTCACCCGATCCTCTCAGATTTGGATAATTTTTGGCACAAAAGCTC AAATTCATGAGTAGATAATGTGTGCCAAATTTCAGCACATAATTCTGAGT CGTTCGTCTAAGAATTTTTTTTTTTCAAACGTCGCTTTAATGTCTTATTA CCGAATGTTACTTTTTCTCATAAATTTTTACGAGAGCTCTAACCTCTTGA AATTTCGTACTTTAACTATTTTGAAGTGTGAGAATTCCAAAAATAAATTC 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GTCTAAATGGACGATTTCCATTATTTCATCGACATTTTCGACGTCCATAT TACCAAAAATGAATAATTGGAACCACCGCCTTTCGTTGCATTCGATACTG TATCGAGTCCATAAACATCACAACTTTTATTTGTCGCCTACTCCGCCTTT TCACCTTGGTCGTAGTAATTCTGAATAATGTATAAAATTATCTCTTTTTT TTTTAAATTTCCATTTTCGAACGCTGTAATACACAACTGGATTCACCAAA CACAAAACTGTAAATGAACTTTTTTAAGCGTACGCTGAACCTTTAAGCAT ACTTTAAGTTTTTTTTTTTTGATGGAATGCTTTCATTGTGACATATAGCT CCCGAAAGACATCTAGTAAAAAACGATCAGAACTTTTTGCATAACTTAAT ATTAATAATCGAATATTTCTAGTTCTAACTATCATTTATGATTTTTTTCG TTTTTATATTCTTCAATTCTGGCCAGGAGTGAAGAAAATAAAAAAGATAT TTAGGAACGTATGACTATTAAATGGTAAAACCTATAAAAAAAACTGAAGA GGGGGGGGGGGGGATTGATTAAAGAGTCAGTCCTAGGATTGATCCAACAC TAGTCATGATACAAAACGGATGTAACATTAATCCATAAGTAATGTTATTC CTTTTATTACAAACTAATTTGTGATAACAAATCCTCTTTAATTATGAATT AGGGTTTGTGATTAGAATGTACTCGTTTTTTATTGTTATTTTAGATCAGT TAGAACGTGATGAAGTAACACGTGTCTATTATTTCAATTCATGGTTAAAG CAAGGAAGGGGACACAAGCTATCACGGCCTATCATTGATCTGCTATGGAT GCCTTGGACTTAATTTCAAACGGGTGTGTACTGAAAGAGAAGATTTTATT CTTGTGGGGTTGTAGAACACCTGACAAAGAATTGTAGAAGGAATCAGGGA 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ATCGCCTTCAGATCTATTTTTTTGGAATCCTTTAACATATCTATATATAT ATATCTNTCCGTTTCCATTGAATAAATATTGGAAATATTGGCATCACTGA AATTATGAGAAAAAGTTGCATGAAATAAAGTTAATCATCGCCTTCAGATC TATTTTTTTGGAATCCTTTAACATATCTATATATATATATATATGCTAGA AAATAAGTCATTTGACTGACTGAAAAAAAAAAAAATACTCGTGTGTCATC ATCGTTCATAATTTTCATACGAGGTTTTACAGTGAAGACACAAGATAAAT AAATTATATTAGAAGGTGAACCTAATCAACCTTTATTATTTATATTTTAT TACATTTTTTTTAAATGGTTGAGCTCTACATATCAACTTGAGCACATTAT TGGATAAAAAAAAATGGTAATAGTTTATAGCAGTCTTGGCATTTTGGAAC TTATATAATGAACTTTGCTATATATATCCTGATATGTAAAAGACGACTCC TGTACATCTTTAACAGTGTCGAGGCTTTATCAATAACAGCAGATACCTAA ACTTCAAAAATAAAAATAAAGACTTGACCTAGATGAAGATATTAGTCTTT GGAGAAAATAACTAATCATTATTTGTCCATAAAAACCATCCTCAGAAAGT TAGTAAACATAATATTAATATAATATTGTTTGTTTGATTTTAAGCGAATA ATATCAGCATATTTTTAAAATACTAACAAAGAATTTTATGACAATAAAAA TAATATTCAATTAATCCGAACAAAATTGTGGTTTATGAACAGTGAATGGA TAATGACGATAATTAATAAATAGAATGGGTATACATTTAGTAGGCATGTT ACAAAGGAGGGAGTGTTCTAATTTTTTTTCTCCGCCACGTATTAAGCTGT TCAAACAGGTGATCGATAAAAATTTTCGTGACGTATAAAACGCCATAAAT 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