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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s555 | supercontig | LSalAtl2s555:158054..228428 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008926 >EMLSAP00000008926 ID=EMLSAP00000008926|Name=EMLSAP00000008926|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=624bp
MKKVVLIFLSASVFSCALGIDLSKLYEIYNKREAMRREFKDCEAFEPFRC PKENKCISIQYLCDGAPDCQHGYDEDPALCTAARRPPVEETASFLNSLLA SHGPNYLEKLFGSKARHRLRDLGGVESVAIALSGKVEPPESNLIRKNRHK ICAIFGCKSPDGVIYHNFPKNMVRQRIWKNLCKRKDTFKAENAQVCSMHF NDGSYRRDLEHELLNLTPRKRLNTDTVPSLLLPTPTVPKPEDQCDKKFPK NLHSSTSSQTPSSVDNQAEDQVDIVSPRSMREIRRQNKQMVTNLLIKEPE QKNKDIVIQTEHSLFLENNDNLKGELKKTKADLCKQKVKVNILTKKLERL EATEKKHSKILKPLHIYCKEGARQRVRLAAQVLXNTXAIAFTIHSQSKEA RAKENTVEIINNWFDVVNRRQIYDKVKLRCALMCNFEDQFIALDKMELFL DTCKVSNLAVLIEKEYDICRIEEEEEKESVTKQITGDILDITIGEESYSE FEFTFDISHEVHVDIAINHQLDQLKKWDLNFQGLSYESGVIAHKMKLLYP DLGKKTSDIYLNDHGRTPWIYHLSRGGLMMPSDYFLKDCEVFVQKFKEFH FSLLDHHPKVMERFCLVLEDSFGG back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s555:158054..228428+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008926-704773 ID=EMLSAT00000008926-704773|Name=EMLSAT00000008926|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=70375bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s555:158054..228428+ (Lepeophtheirus salmonis) CCGTCTCCGTCCTCACCTTCCTTTCCCCGTGTTCATGAGGATACGCTTCT
TTTTCTTCTACCATCACATCTCCTTCTTCGTGAAAGAAACCCACTTTTTC
CCACTATTTTGGTTTTGGACTCGGAGGAATAAGGAAGAATAAGAAGAAGG
ATCTTATATTTTTAATAAATTATATTTTATTTGTGTACTCAGAGCAGTAG
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GCATCTGTGTTTTCATGTGCATTGGGGATCGATCTGAGTAAACTCTATGA
GATCTATAACAAAAGGGAAGCCATGAGACGGGAATGTAAGTTATTTTTAA
TATATTTGAGTAAAATCAACCCAATTATATATTATGTTGTGTAGGATCAT
TACCAAAATAGTTAAATGTATGTTCAGTGGGAAGGAAGTAACACAAAGGA
TCATACAATAAAATGTGTATTTATGTACAATATATAGATATTGATTTATT
TATATCGAATGTACCCTTCCCTACGAAATCTTTCGTGAAGAGGTATACAT
TTTGTAGGATTTGAAAGTCATTTCTTTTATGAAAAATGTTTACATTACAA
TTGTGGACAACAGCCCATATACTTCAAGTGAATGACGAGTCTCAAGTCTT
TGGCACACAAGTTCAAGTCCTTGAATATTTTCTTCATCGAGTTCACCTCA
AGTCTTTAGAAAATAAAGTGTACTTTAAAGAGAGTCCTTTATATACTGTG
AAAAAGATGAAATGTTTGACAAGTCCAAGTTAACCTATTCCTCATCTCTG
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GGGAGCCGTTCTGAGTCTACACGTAGTTACCCTGCGGCTAGTTGGTCTTC
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GGACATTTTCTTTTGTTTCTGCAAGCCATTGGTCTTTCCAGCAGTTGGGA
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TGGTATATTAGTCATTTTGTAGGAGTGAAGTTAAGATCTGAAGTTTTTTC
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TTGTTAATGGTAGTTGTTTAGTTGTAATATCAATTTTAATGTAGGGTATT
TTTTGGAGCTAACTTTCACAATAAATCGAGTATATTAGTGTAGAAGTGAT
AATTAATAAATAATAGGGGGGAAATATGTATATTTAGAGGTATAATTGAA
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GCTACGTTTTTAGGTGTTGTCTCACCTTGCCTTTATACCCAGCTACTCTT
TGACCTCAAATACTAATATCCCACTCAACACATAACCGATTAACTTCATA
TAACTATTAAGTTAACCACAAATAATCATATTTTTATAAATTAAAAAGTG
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TGATTATTCATCCAAAAGGAGTAATGCCAACTGATCACGTGTTKAAATTA
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AGCTAGTTTCTCAGTATTTCCCCTCTCGAAGGAATGAAGTAAGAGATGAG
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CCAATCTGGGTAGGGATAAGAATAATTGAACATAATTTTACTTCTAAAAA
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ATAGCCATTTATAATTGATATTGAATGACTTTAAAAGGAATGAACTAATA
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GTTGGCTGAAATTCGCTTTGAGGGTCTCTGTGTTTGGAAAACGGAAACTG
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AAAAAAAGAGTTCAAAAGACTCATTCAAAAGGATCTTGTAACTGAAGAGA
TGTGTTTCTTTCACTGCTGATGTCAAAAGTGTCCTTTTCACACTCACAAG
GCTATTTCTACCCACTTTTTTGATAGGTCTCTGGGCCGTCTAGTGTGAAA
CTCCGAGATCTCTTTCATGGGCCCTCATGGACTTGAGGGAATTAGCCTGT
CCTGTTTTCTTTAACACCTCCGAGTCCAATTTGGCATTTTTGTTAGAGGT
CTTCTTCCTCCCCAACGTTTCGGACTTTCATCATGAATTATTGAATTACT
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ATAGTAGCTTATTTGTAGTTTTACCCACTATTTAGTAATGACTATGGACT
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ATTATAGCGATTAGAAAAGAAAAAAATGTTGATGTTTGTTCTCTTCTTTT
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AGAATTCTTCCCCATCTTTGGTGTATATTGATTTAAGAAATTGATAAATG
GATAAATTTATCGGGCCACCCGTTATTATTTACTCATCTCCATTATATAA
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GCTCATGATGGCGACTAGTCAATGTTTTTCTTAGCTATCGACAGCTAATA
ATGTGTTCTACAACATTGAGCATACGAAAATTCTAAAAAAATGATCTCTC
AAATTTGCATAATAGAGATGTGTAAATACTAACAGTTGGTATATGAATTT
CAATATAACTATTATATTTTCCCTGCACTAATGCTATTTTATAAATAAAA
GGTTCTCCTCCTTATAGGAGTAATTCATTTTCCCCCCTCAAGATCATATG
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TCGGAATGGATGGGGAAGTTGTCATTTCCAGAAGCAGATAATTTTGGGAT
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TCCCTCCAGGTTGCGGCAGTTCTTTTGCTTACTTCTTATAGAGGGATTTC
ATGTGACGTCCCCCATTTTAGGGACCTAAATAGACAAGTTTTATAACAAT
GAAACCACTCTTTTCATTAATATTAAGGAAAATAGTGAATTATTGGTTAT
TAAAATGAGATCAACTGTGCAAAAGATATAAGCCTTAACCCTACCCCCCC
CCCCAAAAAAAAAAATCCTCTATGCCCTAGTTTGATTACATATCTGACCC
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CCATATTGCACATAAAAATTAACTATTACAACGGAAATAATAATATATTT
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TATGCAAGTGTTCAGTCTTTTTTATTCACAAAGCCATTTGATGAAGTTCC
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TTTCTTTTTTCTAGGATGTCATCTTTAGGTAGCACATCTTGTTCAAAGTT
TGAAAGGAGATACAAGCTCTTTATTTCGTGAATAAGAATTAAAATACAGC
ATTAATTAACTATTATTCTAACCTATATATATATATATATTTCTAAAGCT
ACCCTATGTATCAAAAAGAGCGAATAACAAGAAAATTTAGATATTTCGGA
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TTCCTACACTTTTCTTCTTTTTTTGTTCCATAGAATAATCTTAGAAAAAA
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AAGTAACTAAAAATTTCTTTTAAGTATCTATATTGACTATTGACGTTTGT
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TGTGGCCGCCCTTCTTTCCAGATGTGAACCCCTTGAACTACTCTATCTAA
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AAAAGTTGTACACATAACTATTTTCAGATGGTTTTGTTGATAAATATCCT
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GAAAAATGAAATGCAAATTCTTTGATCCATTTTTTCAATAACATAAAATC
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TTTTTTATATATTGGTTTAAATATTAAACAATGGGGATTGGGATTATTTT
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CTTTCATAATTTCATAATATAACAGATAGCGATTTAAAAAAATTAACATT
AATCAGTAGTACTATATGTCTTGCTCCCGCCCTCTCCTTACACCCAGCGC
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GCACTTTATACTTGGATGTTCCCTCCTCAAGAATGATAGAATAATAACAG
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ATCGTTTTAGATCGTATTTTTACAATTCTAATTATACTAATGCTCTCTAA
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AAGTGATAGCTGTGCTTCCTCAGCCATTTGAGCGACCTGTCTGAGACATG
ACAAAGTGCTGAGTCATGTGAAACGTTCCTGATTAGGATGCAAGTCCCAT
TTGAGACCTCCTAATTTGAAATCGCTATGTTGGTGTGGACAAAAATCATC
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TGGAGCAACTGTCGCCATAATTTCCAAAAATTCACTAAAGTTTCTTGATA
CAACAACATTTTGGCCGGCAGAAAAAGAGACACCATCAGTTTGCTGCATT
ATAACAAAATCGACGGCGCACAAAAGTACTGATATGACTTTTACACCCTT
AATGCCAACTTAAAAAAAAAAAAATCGAAACAATCCATCTGTATAGCACA
AAGTATATGACNACTCCATCTGACCTAGGAATCACTTTGAAATCCATATA
TATGAAGTATATTTCCTCTTCTAAAAAATGACCGGGTCGCGTAACCTACG
CACATTGAGTTTAAGAGAATAATTTTTCCAAGCGCGTTGTTTTCTTACAT
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TGTTTTTTTAATAGAAGGTTTGAATTTGAGAAAATACATACCATATAACT
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AACTATTATTTTTAAATATTACATAAGTACTCTTATTCCGAGTGATCCAT
AAAAATTTGAAAAATTTGAATTTTAAGCTTAAACAAGTTATAATTTATTA
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GTGCTCTCTTCATCATTAATTTAGTCGCCCTTAGTGGCAAAGATGGTATC
CTGGTGGAGGCGGAAGGCGKAACACACACCGCAGATCTAGCCATCTGATA
CGGCGTCCTAGTGCTAGTTGACAAGGGCTTTGATGGCCTCGGTATTTTGA
TGACGGWCCCTCCAGGCCTTCCTTTCAACATGAACCTAAAAGTTGTAGTC
GAGGGGGTTGTAGGGGGATCAAAAGTGTCTAAAAATAATTTAAAAGAACT
AAAAAAAACTCATTCAAAAAAGTCTTGCAACAGAGGAGATGGTGTTTCAC
TCATTGCTGTTGTCAAAATGGCCTCTCAATCCTCACAAAGCACTTTCCAC
CTACTTTCTTGCTAGTTATCTTGATAGTCTGGTGTAAAACTCCCTTTCAT
GGGCCCTGATGGACTTAAGGGGATTGGCCTGGTTTTTAAAAAAAACTCAT
CCGAGTCCAGTTTGATTTCATTTCAAACGTTTTGGATNNNNNNNNNNNNN
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TTTTTTTGTTAACTAATTGTATATTCGTTAATATATGGAAATAATTTCAA
TCTCTCAACATAATAAACTATTGAATTAGAAGGAGTTCATATTTCAATGG
AACAATCCGTATGTCATATAATTATTTTAAAGCTTTTATGAAATGAAAAA
AAAGTTCCACTGATCTGAAACACGAAAAGTTTTGACATCTTTATATAATG
AAATTTTTAATATATTATATATGTAACACAAAAATAATCTTTGTCAAAAA
TCAAGAAAAGGAGAAATATCCAATATGTTTTTTTTTACATCATATAGCTT
GTGTTGTGTCAGTCCTTGTTTTTACAATCAAGTCCAGGCTAAGGTCCAGT
CAAAGATCAGTCAGGCTGTCTGTCATTCAGACAATCAGGAATAGAACTGA
TTCTAAAAGAAGAAGCAAAGTTGCAAACCATCATCATGGACCAAACATGA
TAAGTTTTAGGACAAATATACAGGACCGAGCTTTAACGACATTAAACAGA
ACCGGACTTCAGTCTTTAGGCCTAAAAAGAATTAGCACAACACTACANTT
TAACTTAACAATCTAATATCTCATAGACACATTTTGTAACACTATAGGCT
TTGTATTCCAATTTATGGGATGGATTGAGTTACCTGAGTATGTTAATTAT
ACCATCACGCCTTTATTTGATTTATAAAACTTAATTTGACAACTCTATGG
TTTTTCAAACATATTCTATCAATTTCTAATTTGCACTTTTGTTCATCCGA
TCCAACCACTGCAATCACTTGAAGGCTGGAAAGTTTATTTTTCTCCCCAT
AGTGTACGTGGGGTGAACCCCACATGCTGAGGTAAGGTAAAGCCTGTTTC
TGTTGACATCATCTCACCAAGGAAAAAGGGGGGTCTCCTCTAAGTACAAG
ATGACAACTCTAAGTGGTTCTTTCTTGAGGGGATTCAAATACTTTTTTCT
TAGTGGAATCCTTTTCTTGCAATCCATCGGCTTRAGGGCMTGTCTTTMTG
TCCTTTTMTATCTCAAAAGCCCTAGATCATCATGGGCAAGCCTCCTCATT
CATGTCCAACGTGAAAATCAAATTTTTTCTCCTCAATGGTAGTTTTAATT
TACTCCACAATCTCATCTGGCCTTGTTGGACGTAGCCTAACCCTCTCAGG
AGCCTTAGAAGTTCCCTTCCTCAAGTTCCGAGTTCCAAACAGTCTGCATG
GCAACACTGCTGATTTCTGTCGAMGCATTGCCTCCATAAAAAAGGGCTAA
AGTAGCTCCCCTGCGTTCAATCTGAGTCGTCGGATTCAAGTTAGCCATGA
TGATAATCAGGATGAAATTATCAATCGGGAGCCAATAGCAATGCAAGTAT
CCTGTACAAGTTTGCCTGCACGTCATGCTTTCTCTTTCTATCTCAAAATT
ACAAACAGCGACAGAGGATAGTTGAAATTGAATCCTCGCAACTTTTTAAT
AATAAGGAAATAACTGGTGCGTCAAGCGTAGGACGTGAAGRYAAGAATAT
ATTMACTGAGGAAGAAGTTGGAATCTCGAGAATTTTCGAGGGACGCAAAG
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TCTACCATGAATCTTGACAGTAGAATTACTTTTTGGAATACTTTACAGGG
GAGTCGTAGTGTGCAAATTCCTTCTTAAAGAAACTTAATTATTCGTTACC
TTATAATAAGTCTTAATATTATATAATATTAATTAATATGTGATGATTTT
ATCGATCATAATTGTTGGAATAAGTTTACAAGTAGGATTATATAACCATA
AAGTATTTTACTGTATATTTCTATATCTAACGACTTTACAATAATAGTAA
ATAAGCAAAAACTAAAAAATAAACACATCTATTATTAATAATGTAATTTA
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CATTCATAGATTACAGTCTATAATTATGTCCCCTGTTCAAATTTTATTAT
TTGTTGTTTGCCTAAGTGATGAAGTCTTAATATATAGTAAGTATCACTGA
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TTGGAGATCGCAATACTGGATAGTAGAAATTCAATTATTGCAACCTTTTA
ATAATAAGGAAATAACTTTGTTAAGGTAACCAGCGCGACGCAAATAGTTT
GAGGGAAAAGTAATTTCGTATTTCCCTCCCTTTTTTTAACAAAATATATT
TTGTTCATTATTGGTCCTATCTGATCATACACTAAACGTTGTAAAGGTGA
GATTGTATACTAAAAACGCTTTTTAGACAGTATTGTATATGGCCGGKTCA
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CCAAAATTTAAATTTTTACTACCTGAAAGGGAAAAAAGCATCAAAAGCAG
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TATCATAAAACAGTTTTGAACGATATGCAGAATGTTGTATATAAGAAGAA
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ATATCTTTGATGACGTGCCAGAACAAATTTGCCTCAATAGAGACCTGTGA
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AAGGGCATTATGAAGTTGGATTCTCGTTGTGAGCAAGTTATCGAACAGAA
CGGGACATACTGATATTATTTGATTGTAACACTTCTTATAAGGCATGGGA
ATAGAGCGAAAAGTTATGAATATATATTTTTTGTCCCATCCTTGAATTTG
ACTAAATACACTTTTTGGTTTTAGAAATGAAAACTGTATAAATGTTTTTC
CCCCCTTTAGACATTTGAAATATTTTCCATATAATCCAGTAATAGAGTGG
GATTAAAAAAATTATTAAATCTCCTTTTTCACATGGGAAGGACAATTAGC
TTGTGCAATATGGGTGAAATGTCATATCATTTACTGTCATATGTCAAAAC
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GCTCAATATTATATGGTCTTATATATAATATATAAGAATTATCATTCCCT
CGTATTGTGTTGCAAGACCTTCCCCCATGTTGGTTTCTTATTAGTTATAT
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CTTACATTTTTAATCCTGCAGCTTTTCTAATTTATGAATTGTTACCTACC
TACGCATAAAAGCAATCATATAATTTTTACTTTCTACTGGAATCTTCATT
AATTTTCCGTCAGTGAATACAACAATCCAATAAGTATAATTACTTGAACA
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GGACATGTTAAAAAACAAACACAACCGAATATCAACTTGGCTACCTTGAC
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TGACATAAAAATTCGAAATTGTGAGAATAACAAAAAATAATTGATAATTT
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