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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s56 | supercontig | LSalAtl2s56:477026..514584 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009074 >EMLSAP00000009074 ID=EMLSAP00000009074|Name=EMLSAP00000009074|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=773bp
MYSRIRSGSPNLPITNDDNPFYFRRKNLGQKVSYRNETLRDVATKNRSNY RRLRKELEELTDRGLLMLKSLQRPDANVLCKQLDQAWTYFNRSWKMQDHI YVQYLELNTFQHQFRELANAFAENERESRSIPVSGNTNEEINVALDRLDS CVQTLAIDGSKARDLVKVGQELLADHNFVDCIQPKCTELKIMCQKLEILL MEKRRXLHKFLDLMDSVDSMNKWSSAAGDHLXRKKSVDETDRDDNIFSLI RQIDYLLSKSRDLKIRTRVDFEELFDEIKDLMSAQTLFRVDDALEQLDSV THRVITRREELRSQATRSEKKFQNGDFTNSPNSNSESMKTRRENIISELL STESRYVSDLESVLLNYRDKLVIANNKANIIFGNLDEIHDFHSNILYPDL ERCGVXPAAIARTFSACCQDLKTLYCAYCQNMPSARQAVAELGGEATPSI LYQCQTEAGHQLPLSSYLLKPMQRLTKYQLMLRDLVESSNVVCGKEDLDD ALSSLLNVIKVVNDSLNEVNIKGLPKAVSPLGSLVAHDVFQVTSENKSQS QILFRNRSQRRHVFLYDNHILICKPVNEKTQNYQFKFSLGTSSLGMSSIV KGEDKKIELWVHGRGELYSLEAKTKKSKEDFAAELRKVIIRQKEQRSNSM KPQIYYDTASSSTTTTTTNSSGAESTHDSRLTRSRSLESSRVSNTMRSRS LDYAGDRSSDEEDEDGVRRRHKGRYLVLADYMALTSREIDLSEDDSVELI KSLKKKMNPVFYNHIYRMASFSF back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s56:477026..514584+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009074-704921 ID=EMLSAT00000009074-704921|Name=EMLSAT00000009074|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=37559bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s56:477026..514584+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGTATGTATATATACAAAATGTGTGTGACGTCATATGACAATGAACATG
TTCTATTTTTAATGGATTTGAATCTCTTAAGCAGACATTACATCTTTACA
TATTAGTAGTAGAATATTTTAGCATATACATAAGCTGCCACGTATTTTAA
GTCGGTCACTGTACTAAGAGTCATATCCAGTTTTCAAATTTAGAATTTTC
ACCAAATAGAAAACCTGGTTTAAGAGATCACCTGCACAAAGCAGATATTT
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ATTAGTGATACGCAGTTTTGATTTTCTAAGGCTCCTGTAACTTTTTAATT
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TTTAGATTCAAAATTCAAATTGTCCACCATCTGCGGCCACACATCCCTCA
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TGCAACAAATCCTATGCAAAATTTTATTTGGACACACGAATATTCAATCC
AATTTTGTATATAATTGACTGTGGTAGAAAATGAAGTTTACTACTCGGGA
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AATCATACTTCATTTATATTTTAAGGTTTTGTTTTTTGGAAATAAAATAT
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ATATCTTATGTAATAGCTTTATTACAGTGTTTTAGAGCTATCAGTACTAA
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GAAACGCACCTGTTAGATTCCTTGTCTTATTAATATATACTTTGCACGCA
AGATGTCTCTTTTTATGATAACACCTACCCATTTTCAGTCATTTCCCCGT
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TGTTTTTCAAATTTTTCATTTGCCGTTTGACAGTCGAGGTTGAGAGTGGG
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ATATAGTTGTACAAATATTAATTCAATCAAATCAAAAATGGTGTATTATA
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GTATTCATTGTTTAATTGTTGAAATAGAAATGCCTGATTTTGTAGCAATA
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CATTTTTTTCTATTTATAGGTGCTATGCAAACAACTAGATCAAGCTTGGA
CATACTTCAACCGCTCCTGGAAAATGCAAGATCATATCTACGTACAATAC
TTAGAGCTTAATACCTTTCAACATCAGTTTCGTGAGTTGGCGAATGCCTT
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CGGYMCCTTCATAAATTCCTTGATTTAATGGACAGCGTTGATTCTATGAA
CAAATGGAGCTCTGCTGCCGGGGATCATCTTGKTCGGAAAAAGTCTGTGG
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TACCTATTATCAAAGTCACGCGATTTGAAAATACGAACTCGAGTGGATTT
TGAGGAGCTTTTTGACGAAATCAAGGATCTTATGTCTGCTCAAACACTTT
TTAGAGTAGATGATGCCTTGGAACAATTGGACTCTGTTACTCATAGAGTC
ATTACTCGAAGAGAAGAGCTACGATCTCAAGCAACAAGGTAAATATAATT
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CCACAATTTATTCATCTTCCTAGTGAAGGGGGTTAAATCACTCCAAGCTC
AATCTTTAATTTCCGTATTTTTATTTTTTTTTCTTCTTGTGGGATGTCAT
TGTTTTTTTTATGGATAAAAAATATTCTGAGTGCCTGTGTGAGGTATTAA
GAAGTCATGTATGTTGAGAGGATTATACTTCCTATATCCTAGAAAATAAA
TAACACTATCATATGAGAACACTGGTGACATATGACATACAACATGACGT
TTGTGATCATATATTTGACCCATTTTTGTGACTTCCAATCAATTTTAATT
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GTTTGATACTATTTATTGGAAGAATTCAATTCTACTTTTATTTTAAGTTA
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AAAAGTTTTTTTGTTTTGATTTCATAGTAAGTTTAATTCTTTTTTACAGC
TATTATACAAATGTTGTATCTACAATTTGTTTGATGTACATGAAAATGTC
CCTGTTGCAATTGTTTTGTCTTGCAAACTGTCCTCAGTATCTTCTAATCA
TATTTCTAAGTAGTTTTAATTGTCATTTAAAAATGTATTTTGATCCATTT
ATATCGTATAATAAAATCCTAACTTTTTATTAACGGAAATGAATTTGCAC
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TACATACAAACCAAGATTTTATAGACATATTTTGGTCAATAAAATGCTTT
ATATTNATTTCTGAAAAGAGTTGAGATACTCAAGAGGGTTAATATTAGTT
AAAAACCTTGATTTGATTTATAAGACTTAATTTGAGTTCGATATTGTCCT
TTAAATACATTAAAGCTGTCAATGTAATGTTATTGTAATAATCCATTTAG
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TTGTTCCTTGTTTTTTTTCTTTGCCATGAGAATTGATGAATATCCTTGTA
TATACATTAGTGTGACAGGCACTACTATTAGCAATTAATTAATTGCTCTT
TTATGGGTAAAAGTATCTATAGTCACTAGAAGAAGGAAGTTATTACTATA
GACTGAAGTCCTTGAACTCTATGAATAATTTTATTCATATTATGAAACTA
CGTAGTAAAACTCAGACCGAACCAAAAAATGTTCCCACCATTTTAAATGA
ATTAACGCAGTTTTTACTTCATTATTATACTGAAATGACTTTTTTTCTTA
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ATGATATTAAATATTTTTCAAAAATATAATTATTAATTACTTATATTTGA
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CGTAAATAGTACGTACTAGGAACGTAATTGATCCTTAAGTTGAGGCCGTT
TTTTTAATCAAAATATATTCCGTTTTTAATAAAATTGTCCCAATTGTACA
TGTGAATTGCACAATAAGGCATGAGGTAACTAAAGTATATATATATTCCA
CAAGGTGGTGGGACAGTCTGTAGCTTGTTATTTTAAAACATGCTTAGTAA
TATACAGCTATATTTCTTTATTAATCAATATTATTATTCAAAGAGCTTTA
TTTTATTTTTTTTTATTCTTACAAACCTCATGTCCTATTGGCTATTATCC
TTCTTGGAGTCGTTTTATTTCCATGGAATATGGCGCCACTCACTGAAGCC
CTGATAACAAAGTAATAAAAGTTAACAGCGCTCATGCCCAATTGTATCCT
CACACACATAAAAATGCGCTCATTTTTACTTATCCACAACTGAGCTGTCC
TCCCTAGCCGTCTTGCCCTTCTCTTTGTTTAGTACAAATTCACAAACCGG
TTTATTTTGAAATAATTGTTATTTTTACATATTGTGAATAACCTGTTTTA
ATCATATTAGCGGTTGGCGAATTGGTTCGAGCCTGCTACATCACTAGTAC
CTACTATAACAACCAGTCTTGACTGACTATCTCATTCTTCCGTAGTGTAA
GCAAATAATATGATTTTTATTAAAAAAGAAGAATATCGAGGAGAGTGGAG
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GTAGCCTATTGACTAAAACATTTCAAATCATGAACCTATTGACCAATTTT
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AATTGAGCATCGACATCATAGAAATTCCTGTTGATATTTTTACTAGATAC
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AATTTGAACTGCCCTTAACGACATTTTGTTGTATTTTTTTTTATAGTATT
TATACACCTTTAATAGTTACTAAATTCTGCTCCCCTCGCCAATAACAAAA
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AATACCAGAGCTTTAAGTGAAAAATGTTAATGTCCGATTATATTAGATAG
AGTAGTGTAATAACCAAGTCTGAAATTATGTAATAAAAATAATATGGTAA
CTCTGAGAGACATCATATCAGCTCATATGCCGTTCAGTAATCTTTTTTTT
TACTTTTCTTGGCTTTTTCATCTTTCACAGCATTTTTGGGATTTATTTTG
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AAATGTGTATTTTGTGCATATTTTTAATCCTAAGAATATGAATTTAAACA
TTATTAAGCAAATATAAAAGTGTGTATTTTTTAGCATCCATATTAGATTA
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GTGACTGAGTAATTTGAATTAATTCTACCATACCTTTCTTTAAATATTTA
TGAAATAATAATTTTCCATGCGAATGTATGTCCTTAAAGGCACACATATT
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GCCTTTTATACATATCTATGCTCAACCATGGAATTTGTCAATGATACAGA
TTATTTAGGGGTTAAAAACTGATAGTAATTTGTTCGTCAAACGGTTCTAT
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GACAACTGCATAATTTTTATCATCATCATAATTGCAAGGACTTTGAAAAC
TAACATCATTGTATTTCTTTTCTGATAATTCCTAAATTATGGATTCAATT
TGGTTAATAGTAATTYCCAGTGATAAAAGGATTTTATTTAAGCTGTTCAT
TTTTTTTCTTTTTCTTTTGATAGTACATCACAATTAAAAGTGATGTCACA
TGTTTTAAATTTCATAAATTGCTAAGGTCAAAAATATTAATTGAGGGTGA
AATAACTTATAGAAATGACTGTGTTCTAGTCACATTTGTGTTTGCAATGG
ATGAGTAACTAATAAAAAATTGGAATGTCATTGTTTAAACTCCCACTCTG
CTTCCATATCTCTGTTTCATATTTATCCTAGGTGTTACATATAAATAATA
GGAACGCATGCAAAATATTCTTTGAAACCTCGATGATAAAATTAAAAATT
GCTAAATAACTTTGGAACTTATAAAGTATCAAAAAATTAGATACAGGAAC
TACATTTTGATATCAAGAATTTATATACATAGAAGGTGAAACAAAAAGAT
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CCATAAATGAATCTAGTCACCTTCACAATTTGAAAAATGTTTTGGAGGAG
AGAAGCTTATGACATTTCATTAAATTAAAATATGACTATGAGAAATAAAA
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ACTCAGATGTCGATCTTCAATTCTACTTTGAGTCCAACAAGGACTTACAC
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AAAGAATAATGAGAACACCTGGTGAAAATAAAGAACATATGTTTAGGTAG
CAACTACAAAAAGACGGGTCTTCTTCCATTATAGTATTATTTTCATCTAT
GAATGAATATGKTATACAAAAGATATTACAAGGATATTTCAGTCTATGAG
GTTGATAAATACTCGAAGGAAGTAACAAAGTTTTAAAGGCAAAAATCAGA
GCCAAAAAAAAAAAACAGACGTCTGCTGATTATTGATTGATTTTAATCTG
CCTAAAATCAACCAATTTATTTAGCTATGGAATTATTTATAAATGAATGT
AGTCAAAAGTTCCAGCTTCATATATAGATGACTCTATTATTTTTAAATCA
CCACATTTACAGTTAGCTCAAACCTTCAAAAGAAAGCTGTCAATTTTTTT
TGTTTTAATTTGACACTGCTTCTTGATGGGAAAAAATACCGCTCAAGCTA
AGCAATTACTTGAAAAGTATTCAGGGGACTCCACTTTATCAGAAACAGCA
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CTACTGGCTGTTTGCATACTTAAAAAAATGCTTGCCTGCAAGAAATTTCG
CCCCAATGAAGTGGTTATCTCTGAAACTGAGGACTATTTTGAGGCAAAGG
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GTAAAGCCCGGAAATCTTCAGACCATATGCTGTGCATGCTGTGGTATTAA
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GAGGTCCGCCTCAGTCCAGGATTCAACTTTCCCCATTCATTTTCCACGTC
AACACTTATTTATATATGACTGAACCTATCTAAATATGTAGCATTGATAG
TCTTATGCGTAGATTTGAATTTTAGATGTAATAATCAACCAAAAACAATC
AATGATTGAATTTAAATATCATCAATAGTATTAATCAAGTTCTCAAATAT
TTACCAAAAATATGCTAATTTAATTAACATCGCAAACAAACACAAAATTA
CAGTGTTTATTTTTAGAAAACGTTCAGTCTACAGTATTAGATGATGTCAT
AAGTCATATGTCCTACATCGTATTAATTTGTATAGCAGCATAACTGAGGC
TATGGATTAAATTAGTCTTGGTATATCTGGAAAAATACTTATTCAGGGGC
TATCATTAGTATGTAAATATTTAGTTAAATATGGGGTCTTCAACAACACT
ATAGTTAACTAGAATATCTTAACCCAAAATTGAGTCTTGATTACATTTGT
GTTACGCAACTAATTATCGTATATTTCTGTTAATAAAATATCTTGGGACG
CACCTAAAATTTGACTCTTAAGTAGTGTTGTGTTAGTCTTCTCCAGTTCA
CTCAGTCTTGTCCAGTTTAGTCCTACAGATCAGTCCTAAAAACTTATAAA
GTTCGGTCCTTGATGATGCCACTCAATTTTTTTTTTTAGTGCTGACAGTC
TGAAGGACAGGTCCCAAGGACTGATAGGTCCGGTCCTAGGGCTGTACTGA
CACTTATAAGCCACTAAAATTCCCTGTCTTTTGTTRCCGCAAGCCAGCGG
TTGTGTGGAATTGATGAACTGTGAAAATCTTTTTGTTCGAGAAAATTTTA
ACAATTTACCCATTTTCATTGACCCCTCGAGCCTCCTGGTTTTCAATCCC
TCTGTTTGAAGGTGGTGTGAGGTCCTTGTGAAAGAAACTAATACTACATT
ATGCTTTATTGTCCTCCTGATTGTCCGAGAAGCCAGAGAGTAGTCGTTGG
CGAAGAGATTTATCGACTTAGTGGGATCCTCCTTTATATTCTTCTCCAAA
CTTAATCAGAACTTTGTATCCCTCTTTAAATTATGCCCTCCAGTTCCTGA
CATTCAGGAGAGGACTTCTCCATTTTTTTCATCTTGGCCCACTTTAAAAC
CATGCTCCTAGAACAATATCCGTAATCTTCATCACATCAACTCCAGCATT
TAGGAGACCTGAGATGCATACCCTTTTTGCTTGTCAAAAAATAATCACTT
TCATAGTAATAAGAAAATAAACATTAATTAAAAGTCCACGTTTTGCTGCC
CTGCACAATGTTAACTTGCAAATTTACATAAAGGAATTCAATAATCAACC
CTTGAGTAACCATGCAAAAGATACACATATTCGAGATCCATACTTATACT
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GTAAGAAAATATTGAGTAATGTAAAACGTTAAATACAATTATGATTTAAA
ATGAGAATAGTCTGTATGAAAGAATTACCTAGCTACCAATTGATTTTGGG
ACCTTATATATCAATTAGGAGAAACTTTGTTATGTCAACAACTCTAGTAA
AGTTTTGGGCATCAGGGCGACAGCTGTTCCAGATATAAAGGACATTGAAT
TTACATAGGAGAAAACGTTACTGGGGTAAGAATCCGTTTCGTGCTAATGA
TTTGGAAGGTTCTTTTGGAGACTGATGATCCAAGACAGGTCGCTGAAGTG
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ATGTTCGAATCTTAATCCAATGGACTATTTGGTCTGGGGATCCGTTGAAT
CTATAACAAATATAACATATCATTCCATTAAGGAGCCAATTACCAACATG
CCAAAGAACTAGTTCATCAACGACTCCTTCTCTTTCCGAGCCCTGATCTA
GGTTGTGATTGATGCTCGAGGTGGGTACATCAAAGGAGCTCTGGTTCAAC
ATTCATAAAATCAATTAAAGCCAGAAAAATGTAATCTCAGAAACAATTTA
AAGATTTTTAAAAATGCACGAATTATATCTTAAACCCATTATATCTCACC
CTTTTGCAATTGTGAGATACAATAAAGATAACGTCGTCTTAAGGATCGGG
TAACACTATAAAAGATGTAATTTTAATTAGTGGCATCTAAATCTTTTACA
ATTTGTATATGTATGGTAGGMATATTTACCTATATAAGTGTATCCTAACA
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AGATTCTCTAAAAAACGTWTTACGCATTTATGAATAGACGATGTTCATTW
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