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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s57 | supercontig | LSalAtl2s57:53313..113685 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009175 >EMLSAP00000009175 ID=EMLSAP00000009175|Name=EMLSAP00000009175|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=215bp
MNLFMIQYYVSWVRHRDVNLLAVGKFVYIRDPRFKVLHESNSDDWFLVIK SVDYTDEGVYECQINTIPYRSHKFKLQIFEPTTEMLGESTLYVDHNSSLN LTCVIHSPNPPAYVFWKKNSELVEVTDENPLEPIKPGSIDSQNASSGRKV LITFLKNVFPGITSSSLWIDKVNSRQDSGTYSCIPSNSDSKTIVVHVLKD KCPALLSMHFLFPII back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s57:53313..113685- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009175-705022 ID=EMLSAT00000009175-705022|Name=EMLSAT00000009175|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=60373bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s57:53313..113685- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAATTTGTTCATGATTCAATATTATGTTAAATGTCTAAATTTTTGGCT
AATAATAATAATATTTTGGTGATGTTTTAATACAGAATGGGAGATGTGTA
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AATAGAAAGCTTATTTGTCCTCAATCATCTACACGATCCAATGTAGGGAG
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GTGATAATAAAATATAGTTTTTAGGATTATGAAAGTAAAACCAGAGGTTA
ATATTCTTCTTTTTTTTAATAATTATCATTCTATAGTATATTGGAGCGTT
GTGGTGGGAACGTTTATCCCCAAAAGAAGAGTGACCTGAGGCTATGAGTG
AAATTGTCGAAAAAACAAAAATTGAAGTTAACAAAATGCATTGCTATTAT
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TCATTGTAAATACATTTGCTAAATTTTTTGATAAATGGATGCCAAATAAT
ATTCAAACCTGATTTAAATAGTCAGCCCTGGAAACTGAAAAAGAAGCTGC
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AAATGCGTTGGCAAACTTAAAACTAAACGGTGGTTTGACCAGTATTGGCT
GMACTGATAACGTTCTCCCTCAAGTAATACCACTTTAAATGTTGGAGATT
TAACTTCCTAGAACAGTTATACATTTTTATCACTGCTATTAATATAAAGG
GCAGCTGTTGTGAAGAAGAAGTTTTTTGAGCAATAATAATAAACCTTTTC
CTCATGCTCTACAGAAGTCAATTCCCGAATTATAATGCATAAAATAAACA
TAAAGTAGGGTAGGGTTTATTGTGGGTATTTTTTCGTTTGGAAGCTGGTA
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TTTATGTTTCTACGTTTTCTACGTTACATGTCTCAGATTTAAAAAAATAT
AAAAAATGACAAAGTCATGTTCACCAATTTGAGAGCATGGGTGGGGCCAA
GTTGTTGTATTAGACTTTTATGTGTGGAACTAAAAAAATGGATACCCTTT
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ATGAAGTTACCGTTTTCTGTAGAAGTCCATCAAAAAAAAATGAAGAATTA
TTGTCATTTTTCTATTAATGAAGAATTTATCTTATTTTTTTTATATTAAG
GAAAAAGCAATATCTTTATGGTATCACCATTGCTCATTGACAGCACGTTT
GGGAGTTATTCTCTTGAACAGGATATGTGTGCGTTTGTGGTTCCTTGATA
AAGAAAAATACTTAATGTATATGGATTTCATCAAAAGATTTATTTTGATT
TTGATCCATCTCTTTCTTATAAACATTCTGGTATTTTAGGGACCTGCTTA
CCAACTCCATTAATTGAAACATTACTTCCATTATATAAGCATTGGTCATT
CATACATTATTGTCTAACCATTGTTATTCTATTTGTCCTTCATGCACTCA
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TAATTAATTTTTATTCTATACATGCATCTTCCCCATTTTTGTGATAAACA
CGTCCTTACACCAGTTAAAGGGTGCACTGCCGTCGGAGCTATGTAGCCCA
AAACACAGTTAAGCACTTCACCATGCTGTAGTANCCCGGGTTAATCTCGG
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CCCCGTTTAATCCCAGACTAGAAAAAAGGGATTTCTTTGGGTAACTTAAT
TTAGATTGGAAGAAAAGTTTATATTTCCTGAAACTCTGTTACTTAATATA
TGGAATGAGACTATGCAAAAAGTTCCCCTAATTTTTTTTCTATAAGTTTC
AGGAACTTAAATTTAGGTGATTTTTCCCGTTAATATATTTTAAAGCATAT
ATGGCCCAAGAAACTTATAATCAATTGTACATATTTGATTAAAACTTGTA
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GGAACTAAATATATTTACGAATTTTGGCAATATTATTCTTCCACATTTTT
TTTATTACCCAATTTCATCTTAACAATAATTTTTCAGAGGAGTTTTAATT
TTAAAAGTCTTAAATAAAAAGCTAACTATTTAAAACGGATATCGTTAATG
CGTTTGCTTTGAAAGAATAACCAACAAAAATGTGTCAAAATACAAATTAA
ACACAAAGAACTGTAAGTGTATAAAATAAGTATAAGAAAAAGGATATTTC
ACTCAAGTGGGAATGAAAAGGAAAACAAAATGACATCAATTGCCTTCCAT
GTATCTAAAATTATATGGCCCATAGTAACAGCTACATTTTAATTAAAACT
TTTATAACTTTTGAAATTGGAGAGTTATAAACCGTAAACWAAAGTACATC
TARCGGACCCCACCCTGCCATATTTGAATATTATAGAGACATACATAGGT
AATATTAATATCAATTTATTTTAAACAAACATATACAAATAAAACTTTTT
CTTTTTACAAAAAAAATATAAAAAAATAAACAAAGACATGAATTAGAAAG
CATTTTTCTCTATTATTTGTGAACCAATATTTGTCTTGGGTGATTGTTCA
ATTTTACTATGGTATATATATTATATATTAGACTGGTTCCTAAAATATTG
TTTGTTTCGAAACTTTGGGGGTGTATAGTTCAAAAATGTTACTTTTGATC
AAAATATAAGAAAAATAAAATTTGAGCTATAATGAACAATATTTAAATCT
ATTATTGTTGTGATAGTGTTGATTCAGTACTTATAAAGGACTGAAGACTT
CAGTTTCGTCCAGCTCAGTATCGCTCCAGTCCAGTTCAGCCCTGAATATC
AGTTCTAAAATCAGATAAAGTTGTTTCTTGAATGACGTCCCTCAACTTTA
ATTATGAGACCATTTTTTAATCAGTTCTAGTACTCAAACCGAATGACCAA
CAGTCTTAAGAGCCAGTACCGTGGACTGATAGGACCAGTCCTAAGCCTGG
ATTGGACAGAATAAATAAGGACTGATATAACAACATGTGTCGATCCATAG
CTAGGACTGAAGACTAAAGTTCTGTTCAGCTTAGTTTAAGTGCCGGATTT
TTTGACCTAAAAACTTATAAAGTAAGGTCCTTGATGACGTCTCTCAGCTT
TTTTTCTTTTTCTTTTTAATCATTATTAGTACTGATAGTTAAAAAGGCCG
GTCCCAAGGACTTAAGACTTTAGTCCTAAGACTTGGCTGGACTAGGCCGA
ATAAATATGGCCTGACAGAACACAAGTTATTCATTAAGGACAAAAAACAA
AACAATATTTGGTACATCAATATTATATCTGTCATTTTTCTAGAAGAATA
AATCACTTAGGTTATTTATTTATAATAGCTGTTTAGGATAAATTGCTCTA
TTTTGGTTCATATTGACTTTTTTTTTAGTTAAAATTGCTATTTTATTTTA
TACATTTTGAAACTTGCACCCTAAATTAAAATTGTACCCGTATAATGATA
ATCTGAATAAAATATACAAATTATGACTTAAGCTATATAACTCTTCATAT
TTTTAGAAAAATATTACTTTTGAACAATGTTTTACCAATAGTCAAATCTG
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CTTAAACCAGGTTTGGTGTTTTTGAACAATTCAAAAGTTAAAAGATTGTG
GATAAAAGAATACAARGAAGGATAAAATTTCCGTTCTCGGCAGTGCTGGG
TAGTGTTGATTCGGTCCTTCTTTTGTCTAGTTCAGTCTCTGTTTGGTCCA
GTTGAGTCCTGCACATCAGTTCTACAACTTATACACTTTTGTCCTTGAGT
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TTAGTAGGGAAGTAACCTATGCAAAATATCATTTTTCTACAATCTCATTT
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CTTTCTTTTTGTCATTCAAAAAGAATGTTTTATTTTTAAATGAACTATAT
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TCTGGCTTACGTACAAGGAGAGATAATGACACTATGACGTAATCGACGAA
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AAGGCCAATCTGGAGGAGGTAAAGAAAACAGCCTAGGCCCATCCCCTCAA
GTCTATGAGAGACAATGCAAGCCATCTTATGGTTTACAACAGACTGTTCG
GAAGACTATCAAAAAAGTGGTTGCACAGAGCCTTGCGATGGCGGAGAGGC
CTCCAGCAATGAAAGAAGCCTATCTCTTCCGTTGCAAGACTCTTTATAAT
TTGTCGTTTCCGTTCTTTTGAACTGTTTTTTGACGCTTTTAGCCCCCTTA
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GTCAGCCATTACTGGAACGTGATGACAGAAAACTACATCTTTGGAGGGTG
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AATGGACCACTTGGTATCATTGGATGAAGGGTTACTTTTGAGGGCCTTTC
AAATAAATTTGTCATTGTACATCAGTACGGGTCCATAGATTTGTTTTGTT
GTAATGTCGAATGTTATTTGATCTAATATATGAAAAAAAAGTTTTCAATA
GATGTGTCTTTTTTCGGTTATCAGTACTTGGAAAAATATCTACTTTTAAG
GGGTCCTCAACAATAAATCATTATCACTAGAGATTTGAAAAGTGTTAAAA
TCCCAGCGAAAATAAATTCTTTCTTATTTTGAAATTATCTCTAGAAACCC
TCCTAAGCCTTGAAATATATATATATATATATATTATTTTTTTTTTTAAA
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CAAAAAAATCAACAAGTTGAGAAATGTCATTTTATTTATTCACACTATCT
CTACTAATATTTTTATTAGGAGAAACTGCAAATTGTTTGTAAATAACAAT
GGATTTTGAAAAAAAAATTGCAAAAAACTTATTATTTTAAATTTAATTTG
ATTTTTTTTTTTCCAAAAAAACTATTTTTGTGTAAATAGCCATTAATTTT
GGAATTTTTTTTCAAAAAAAAGCTATTATTTGCTATTTTTTTCAAACAAT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAAAGAGCTCAAATTACCCCTTCATA
AATCATATTATTGTTATTTTCTTGCAAGGGTTAAAAACGTGACTAACCAT
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GTATGGGTTATAACAAAAAACAAATTCACTATGACTATATTAAGAACAAC
AAGTTGTTAAAATAAATCAATCGATAATAACAATTTTTATATGAATATAT
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ATTGGCTGAACTAACAGATAACGACTTGATAAATTCCTTTAACAAGATTT
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GACATCCTCCAACATAATATTGTTGTTCAAATTAGGTTTTCTGTCAGAGC
CAGGATCTATGCCCATATTGGCCTCCTTTTGGTATTGTAAACGGTCGCAT
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TAAAATGCTTTTATATGGATTGAAACATTGTTACGAGTTATTTATTTATT
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AGCAAAAGGGGACTGTATTACTTTAGGCTATTAATTTTCTCCCTATTCAA
TTAATTATAGATGTATATTAATAAATAAGGTTATTTTTGTTGTTGTAGAT
AGAATCTGTAATTATAACACTGTAGCTTNAATGAGTGGTTAAGTATTAAT
ATAATTAATAATTATAGTTCGCATTTCCTCACTATCCATGAGGTAGCTAC
TATTGGCGGYTTTTTWTAGTGGMATTCTWCTGCACTCTGTTATGTTGTCA
GTCTACTTATTGGTGAAAGCCTTTTTTAAGGGTTGTTTTATTCGTATTTA
GAAATCGTTGGAGATGGTCCTCTACAACTTGTAGAAGAAACAAATTGTTC
TTCGTTTACTTGTACCCACTAATTTTATGAATTACAAGAACATTTCCATC
TGCATTAGTGTTGTCCAAATTCAAATTCCTTATATAAGACTGGAAGCATT
ATATTCATTTTTTAAGGTCCACAAGTTTTGTTACTTCAACAAATTTGAAT
TTGTTATCACTACTTTGTAACAAATTCAAAGTTTGTTGAAGTAACAAAAC
TAGTAATCGCTTTGTTCTGCAAAGAGTCACCTATGTACACATTTATTTTT
CTAAGAATAACCTTGAATCAAACTTAGGAACATTGAGTTCAATTGAATAA
TTTAACACGAAAGCCTTTTTCATTTGAGCTAGGTCATCTTTCAACAAAAG
GGTTTGTCTTTACGTCTCATCTTCAATTGGGTTTACGGAAGTTATAAAAA
CACATTCACTCCACTTAAATCATTTTGACCCTCGTAACTTTTTTCTGTTA
TGCCTTGTATATGTATAATTACAGAAATTTTCAATTTACTACATATAATT
GGTGAATATTTCATAATTTTTTGCCCTTATACTTAAATGAACAAAAGTTT
ATATAACCCTAGTTTTGCCTGTGATAAATATAAAATAGTATACCACTAAT
GATTTACGTCTAGTAAGAGTAATTAAAAAGCTGCAGTAATTATTCCTCAC
ATATTTGGGTCTAATTAGCTATAAATTATTATTTTTTTCTTTATTCAAGG
TGTCGGTAATTTTTTTGCCTATTCATATGGTAAATGAGAAAGCAAGGGAG
AAAATGAGGATCTTAAAAGACAATTGATTTTCTCTCCTAATTTTAAAATA
AATATTCAGGAATGTCCACAGGGTAATATTGAGGGGTCTTGGTTTTTGAA
TTTTTTCGAAAATATTTCCAAAATTCCATAGCTATTCACAAAACCTTTAC
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CAGCCAACTCACTGCATACGCCCTTGTTATTTTCAGTGCCTTGAATTCCA
TGGCTCAGCTTAAGAACATCCCTTGTTGACAGTTATCAACTATAACTTAT
GAATTAAGGCTCATGGTTACATTTTAATTTATGTCAGTATCTGAAAAAAC
TCATCATAAAAACATCTCAATTTGCCAATAATCTAGTATTCAGATTTCAG
GAGAGAACCTGGTAATTAAATGAAAAAGGGAGGAAAAGTTGTTATGAACA
ATACCGAATATATATGATGATGAAGTAACGTCCATTTGTAGATTCAATAA
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TCTCATCCTTTTTTGCTCGTGTTCAATCAATATTAATGTTGGGGTTTTTT
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TGAGTAAACAATATATATTTATATGTTTTTTTAAATGGCAAAGAAATTAT
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CCTTGTTATTTTCCCTTCTACTTTTGTATTTATTTTATTGAATCCATAAA
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