EMLSAT00000010439, EMLSAT00000010439-706286 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010439
Unique NameEMLSAT00000010439-706286
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s691supercontigLSalAtl2s691:147201..171146 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010439 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010439EMLSAG00000010439-693205Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000046504EMLSAE00000046504-755432Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046505EMLSAE00000046505-755433Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046506EMLSAE00000046506-755434Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046507EMLSAE00000046507-755435Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046508EMLSAE00000046508-755436Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046509EMLSAE00000046509-755437Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046510EMLSAE00000046510-755438Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046511EMLSAE00000046511-755439Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773262auto773262Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010439EMLSAP00000010439Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010439

>EMLSAP00000010439 ID=EMLSAP00000010439|Name=EMLSAP00000010439|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=632bp
MRHHKVRFSDGRSWKNPDVVGLYITISLXYIVGLLCFQKYAGLLELNIMA
PSSNSPLAWFHTNRHLLSTSFENETLNTSFSPLPNGTYDNKTSPRENGTK
FGGGSKEKDASEDEADGALFPDDIFTVNELQHGAVIFYIIGMVYMFVALA
IVCDEFFVPSLDVIIEVIGXSEXVAGATFMAXGGSAPELFTSVIGVFVAF
SDVGIGTIVGSAVFNILFVIGMCALFSKTVLHLTWWPLFRDCTFYSISLV
TLIVFFIDDTIEWYESGTLLGIYFAYVGFMKINPIAERTVKKLLFKNKVT
RVRSTDHLVPTVSYICILHSGSHFRHGLLQLMIHTIDPLHDGKVDEKATQ
LHAIASLKVLLDATKPQEGTNGTASNVLDLGPDGDINSSTNATHLSQVGS
NKTLSSNKTTEQPLNGAVTTAGLSSDEDESHPLDLSWPDTTRERITYILF
LPIILPLWLTLPDTRKSSARKYYPITFLGSILWIAAFSYLMVWWATISGK
TFDIPPEVMGLTFLAAGTSIPDLITSVIVARKGFGDMAXSSSVGSNIFDV
TVGLPFPWLLYSAIFQKPVTVSSAGMVCSITILFGMLLLVFFSILLFNWK
MTKGMGLTMFVFYFAFVAVSLGFEYDLLTCPM
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mRNA from alignment at LSalAtl2s691:147201..171146-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010439-706286 ID=EMLSAT00000010439-706286|Name=EMLSAT00000010439|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23946bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s691:147201..171146- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAGGCATCATAAGGTTCGATTCAGTGATGGCCGTAGTTGGAAAAACCC GGATGTTGTGGGCCTCTACATCACGATATCCCTCGNCTATATAGTCGGAC TCCTATGCTTTCAAAAGTACGCAGGGCTCCTGGAGTTGAATATCATGGCT CCGTCTTCAAACTCACCACTTGCTTGGTTCCACACCAACCGGCATCTATT AAGTACTTCCTTTGAAAATGAGACACTCAATACCAGTTTCTCTCCACTCC CAAATGGAACTTACGACAACAAGACATCCCCTCGTGAGAACGGTACAAAG TTTGGAGGTGGTTCCAAAGAGAAGGATGCATCAGAGGACGAGGCCGACGG GGCTCTCTTTCCCGATGATATCTTTACTGTTAATGAGCTTCAACATGGGG CTGTCATCTTTTACATCATTGGCATGGTCTACATGTTTGTAGCTTTAGCA ATCGTATGTGATGAATTCTTTGTTCCTAGCTTGGATGTTATAATAGAGGT CATTGGCTGSTCTGAGGYTGTTGCTGGAGCCACATTCATGGCAGSTGGMG GMTCTGCTCCTGAGCTATTCACATCCGTGATTGGGGTATTCGTTGCTTTT TCTGATGTCGGAATTGGAACAATCGTTGGCTCTGCAGTCTTTAATATCCT CTTTGTCATCGGTATGTGTGCTCTCTTCTCAAAAACAGTTTTACATTTAA CATGGTGGCCTTTATTCCGGGATTGCACATTTTACTCCATATCCCTCGTG ACCCTGATTGTGTTTTTCATTGACGATACAATCGAATGGTATGAGAGTGG AACCCTGCTAGGCATTTATTTTGCTTATGTGGGGTTCATGAAGATCAATC CAATAGCAGAACGAACCGTCAAAAAATTACTCTTTAAAAATAAAGTCACG CGGGTTCGATCCACGGATCATCTTGTTCCTACGGTAATTCATTTGTATTT TTTTGAACATATTTTAATAGGGATTTGATAATATGTACAATTTAAGTAAT CCCTTTTATATTATAAACGATTTAACTACTTACTACATAGAGGGCGCTAT AGCACCTCTTTTTACATAAACATGAATACATATTCATAGAGTTGCCGTCC ATTTAAAAAAAGAAGAAAAATGAATTGTCCCATTACATACTAACTTTTTT TCCCTTGTTTTTTAAGTTTCTTTGAGTGCAAAAAAAAAATAATAATAATA AAAAAACTGCAAAAAAAATCCTTTGCTTTCTCTCCCCCTCTTTATAATAA CTTTGTCTTTTGCATAGAGCATAATATCTATGGTGGTTTGAATATATGTA ATCAAATAGAAATCCTCACAAAGTACCGCATATTAAGAAGGACTCACGCA ATATCTCTTTTAATTATTGTCTTTTGTTGTTTCGTTTTTCGTTAAGAGCA GTCAAATTTGAAGTTTGTTTTATCATTAGTGCTCTCTCTGTGTACTTTCT GTTTTATTTGCTTCTTCCCATGGCTCCTTCTTCTTCTTTGAAGAAGAAGT TTGTTGTTTAGGGGGGAGTGAGTATGAAAGGAAGAAGGAAGTTGACTTTC TTCTTCTTCCGAAGAAGAATACACAAGTTTTTTTTCCATAATTCTTAATA AATAATCTGATTTATTAACATGAGTCATTTCGCAATTTGTATTTCATTTT GTGCATGTGAAAATCACGTGATTTTTTATTGACCCATGTTTTTTCTTTGC TCAGATCCCTTTGCAAAGTCTTCTTCCTTTGCTTGTTGGGAAGTGGGGAG AAAGGAAACAAAACTCACACACACACACACACACACACAAAAGGGGGGAC ATACTTAAGTCCTGCGTAGATACTCTTATAGATTAGAGACTTTAATAATA AAAAAGGATTTTGCTTTTCCACTTCTTTTACCTTCAGCTGCCTTAGTCAG ATTATGACTATTATTATTATTATTATTATACCTTCCCTCCCCCCTTTAAT TTTTCCTGTTTCACGAAAGAAATCTTGGGAAGGAGGAAGAAGAAGGTATA TCCATAAATCCATGTAGAATATAAGATATGAATGCGATTAGAATATTAAA GTCTCTGTTGATTCGTGAGGATTGACTTGTTTAATTCCTGATCTGCCTTA TAAAAAGTCATCATGCAATAAAGTATTTAACATGAACATGAAAAGTTACA ACTAAATACATGTAAAAAGGATCTCACATTTCCAAAGAATCTGTCGTGTA CTGTACATTTTTCTATTTACATGAGGTCCTCTCAAAAGGCAGTTTCAAAC ATCCCGGATTATTTTTAATGTTCCTTTAATTGGTCAGATGGAGTTGCACT GATTACGTATAAGTACACATTTTAGTATTAGATTTACTCCATCTGGCTTG GGAATCTTCAGGAAAAGTCCATCTACATTTCCTTCTCTAGGAATGAATGG GGCGCAAACCTACAAACATTGAGTTTAAGAGAATGATGTCTCACGGTGCG TTGTCCATTGAGTTACATCGCTGGGGATTTTGCATAATGCAGTGTTTGAA ATTATTCTGACTCCCCATATTGTGTAGTACATATGTTCGCCTCATATTCC CTTTTTTTATATTATTATAATAAATTATACAAAACTGTATATTGAGGTAA ACAATAATTTTTTTAGTTGTTGAGGAGTTTTTTTTTCGCACTATACTCAT ACATTCATATTAAATAAGTGTATAGTTTTGTATTTTTGTATATGGGNTTG TACAAAACTGTATATTGAGGTAAACAATAATTTTTTTAGTTGTTGAGGAG TTTTTTTTTCGCACTATACTCATACATTCATATTAAATAAGTGTATAGTT TTGTATTTTTGTATATGGGTGGGGGTCCTATAGGTGTTTGATTTGATAAT TTGGTTAACTTATTTATTAACCAAAACTTAACTTGCTGAATAAATATTGG TGAAGTTCCGATTATATTAATTAACAGTATTGAAATGACGGGATTAAAAA TCCAGTAAATACTCCATTAAGATTAAATATTACAATTATTTTCCCTCCAT CATTTTAAATATTTTAGGATGAATAAAATATTTGTATTCTCCTAACCATA CTAAAAAACAAAACAAAGGTAAAATAGTAAAAAGTGGACTTTGGAAAATA ATTTCTCCCATTTTGCGGGTTTTAGTATAAAAAAAGTACACATACTAGGA AGATTTCATATAGGGAATATTTTTCCTGCTCCCAAAAACAGTAATAAGAA AGGACCCCTGTATATAATATGTTGACTATTTAAACGGCCACTCACACAAA AACACACTCAACCTCTCTCTTTCTCATTTTTTTCCTTTTTTTTCTTTATT GTCTTTTTCTCTTTTTTTTTTCCAACGATCCCAATTAATGGGTTGATTTT TATAGGATATAAGAAGGAGCAGCAACATTTTCGGAGGAGCAGGCCCCATG ATTAATAAGSGAGCCAGCCTTAGGAGGGCATCTCTCTATTCCCCCTCCTT TGGMCGACTCAATTCTCTAGCCATTTCGACGAATTCTCATCATCTTAAGT CCTCCTCGTCCCTAATACATGTAATCGTGTATTGGGGGCCTAAAAACGAG CAATGCTGTAATGATGATGAGCTTTGCAAGGTATTTTCACATTTCTTTTG AGTTTTTTTTAAACTCTATCTCTCCTCTCAATACACACTAGGTCGGTTTG TTTTTCAACTTTTTCGAATTTTGATTATGTTTAGATTGGAAAGGTTGGGA TTTGGTATGGAAATAATCTATGCAAAATGTTATTTTCGTGCGATGTCATC TTTAGGTAGCACATCCTGTTCAAAGTTTGAAAGGAGGCAAAAGATTTTAC TTCGTCAATAAAGATTAAAATATAGGATTCATCATTATTTTACCTTAGTT AATGATGATAGACATTATTCTAACCTATACAAAATATTAGTAAAGTTATT TTCTAAAACTAACATATAGAGCAAAATGGAGAATAAAATTTGACAAAAAA TTATCTTTCGTTTTTAAAAATAAGAACAAAAATGATGCGCACTATACGCG GATCATCAAATTTTCCAGACTTTTTTTTTTTTTTTAGCTCAATAAGACAA TTCAAAAAAGAAAAAAAGACTTTTTAAATAGAACAATGTCTATCAAAACT ATTTAATGCAAAATAACTAAAAATGTATTTTTAGTATCTATATTCACTAA GTAAAGAGTTTGATCCTTTTTTTCATAATTTGATAGAGATGAATCACCTA AAAATAACATAGTAGGACAATGCAATTTTGCATAAGTAATTCTCATACCA GTTGCCAATTTTTACACTCTAACCCGTAATCGAAATTCGAAAAAAGTTGA AAATCAAACCGGTCTATTACACACATCTCTAAAAATAAATAATTACTCCT ACTAATAATTAGTTTCAATACTTATAAAGTTTTTCTTAGATTAATTCATA ATACTTACATTTCAAAATTTGTAAAATGATGGATTCGTTTCAAAATTTAT ACATAGTACGTACTTTGAGAAGGACCCATACTATCTCTTCAACACAAAAG CAAGCTAGGATGATTATCTTCTCTGACATAAAAGTAATAAATAATAATTT CTCATCTAATTATCTTTCTCTTCTACTGAGTGTTTTCACACTGACGTCAC AAAATAACAGCCAGAAAATCTAGTAAACTTCATAGTTTTTTTTTTTCAAA CAAAATAACTCATTACCAAGGTGAGTACAGTTTCTCCCGTTTGGTGGTGC TGTCTGTTCATTATGACGTCAAATAAAGATGCTCTATAAATAATCATTAA 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