EMLSAT00000010626, EMLSAT00000010626-706473 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010626
Unique NameEMLSAT00000010626-706473
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s705supercontigLSalAtl2s705:386673..407361 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010626 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010626EMLSAG00000010626-693392Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000047361EMLSAE00000047361-756289Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047362EMLSAE00000047362-756290Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047363EMLSAE00000047363-756291Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047364EMLSAE00000047364-756292Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047365EMLSAE00000047365-756293Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047366EMLSAE00000047366-756294Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047367EMLSAE00000047367-756295Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047368EMLSAE00000047368-756296Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047369EMLSAE00000047369-756297Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047370EMLSAE00000047370-756298Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047371EMLSAE00000047371-756299Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777145auto777145Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010626EMLSAP00000010626Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010626

>EMLSAP00000010626 ID=EMLSAP00000010626|Name=EMLSAP00000010626|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=996bp
MVFQKLISYTWNQNNSERDGDPSIVYLDGVIPPASSTPRRSGTVPSPSMN
KANANLLHTILEDELENRTIDDDNAYSKSEECNNYMNDVSEYGITGDEED
RISSDGSCITINSSSSNGNSVSRKSSMESVLSNDVTMSEGGETISNQICN
SNNGKDAEEDNNNSLPKDVSGEELELLKKLEEANRLIETDAKSLNSLKSG
SGHSRRSSDXSQISITSGTSSNVTVSSQPEQSPAHDPEEDLWSYWGKIIS
EWEXGSRKKVPNFKELVRKGIPHHFRGIXWQLLCGAHESKDNKKKYADYM
KTQSACEKVIRRDMAXTBPEHEFFKKKDGIGQEALFNVMKAYSIHDREVG
YCQGSAFIVGLLLMQMPEEESFAVLVKIMQEYRMREMFKPSMAELGLCMY
QLDMLLQEHVPDVYAHFQSQSVHTNLYASSWFLTLFTTSLPINLSCRVMD
CFLSEGTEVIFRLALALIILGRHDLLVEDMEGVIRYFQKDMPAKFDAEPN
NVFDLAFSLKINQKKMKKMEKEYTTMKTKEKEDEIELKRLRTENRLLRQR
VDLLETESSELADRLIQGQVTRAEVEEHTFAXKRELXAIKQHDIDTNAKL
EEAKDQITTLSEIVESSSKPSSMEEEVFLKSEIIKQKEEMISCLQDELIK
VRLREAENEESIKNLSEKLQEVEEEKKKLREIIPENEVASLQEELAASKL
REAEAQLALKDLRISVTELQGLWTKHLKRRADEKANDPDSSSFRSGFNIN
SNGDVVSSNTTSSITMPSTPKKLLGTLLDPVGVVNAKSEAARLEEELMTS
RLVEVEGQAQIKTLELQVMTLETQNQVIANQLKRQGDEVTSLQDDVDKKN
GFESELRVQLKESHRKYTDLETCMKEEIMLARIRDAENTQCVAELTQKIS
SLEYKNQEILTEGNLASSIRQSDKVTRLSLMNSKLSKSLSLHNLAMSFSC
SSSSSSSXLSTPSTTPNRVESPSTAHLRLNLSASLQRLPSSXSSSS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s705:386673..407361-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010626-706473 ID=EMLSAT00000010626-706473|Name=EMLSAT00000010626|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=20689bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s705:386673..407361- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGTGTTTCAGAAACTCATATCCTATACATGGAATCAAAACAATTCCGA GAGGTAAGTTCCTCCATGTCGCAAATGAAAGGGACCTATTGAGGGGTGTT GTCGATAAAAAATGTTAAATGAATAATAAATATTCGAATACTATATAAAT TTATTCTATTCGTAAAATATGGAATCTAGTATTTCGAATAAAAGATTGCG TGAAAGGAAAAGAATGATTCACAATAGTGTGAGATCCTACCGATATGACG TCCTCATCTGTTTTATTTCAAGGGTGTCCGCAGGATGGTGGCCTGGAGGC GCTATAGCKCCCCCCCCCCACCCCCAACCAAGGATTTTTTGAAAAATTAT AGATATGGAAGGAAAAATTATCAGGAGAAAACATGGGAGAAAAACATTAT TTAATAATTTATTTATCTAAAAAAAGGGAATTCGATCAAATTGTACTGTG GAGCACAAGAAAAAAAAACAAGCTGGTGATGATGCCGTTTGTGTGTCGGM AGACCATCAGTGATGGTTCATCACTATGAATAGAGTCGTAAAGAATATTA TCTCAGAGTTGTTATCATTATAATTTGACTCTGGAAGAGAGAATATCTAC CTAAGTATAAAATGCGTGAGTTCCATCAATCTTGATAATCATCTAAGTAT ATGTTGCTTAAGGGTGCTAATATCACACAAATTATGCAGCATAACTTCAC ATCAACTGATTTATGATGTACATTTACATATTTAAATTTGAAAATCCGGG AAAAAAACAAAAAGAAAAAATATATATACATTATATATTAATAAAACAAA GTTTGTCTGTTTTTATGGCTGTACTACGTACAGTCATTTTTGAGTGTATC TTAGGAGTACATAGATACTTAATCTAAGAGTAGGAATGCAATCGAGCGTG GGCAACATATTAAACAAGAAAAAAAAGGGGATACAGGTGTCCTCAAAATT ATCCACGGCCTTGTAATTTTGGGGANTTTTTATTTTTGTAATGGAACTAA TGTAAGCTAATCAGACTATATTTAGAGTTGTAAATAATAAGCATTCTTTA GCGTGATAGTTGTTGTTGTTGTTTTTGAGGAGAAAAACACCTGAGCAATG AGTTCTTATATCATAGTATAAGAACACATTAACCTAAGCATTGAGTAACT AATTTAAGTGTTCTCCAGAAAAACGACGAGTAACACTGAGGATTTGTTGA GGAGTTATCTTCCATATGAATTAGTAAAGTTGGTCTGTTCGTTGACGCCT AATTGCTCCGGTCCATCTGGGTACTACCGCTAGAAATGTAAATATAGCGT AAATCCACTAAAAACAGTTGAAGTAAATTATATCATATTATTGAACGTGG AATGATTAATTATAATTCAAAAATGATTCAATTATAGTTTGACAAAACTT GAAAATTTACGATATATAATTTTTTCTTAAATCATCTTTTTTCCTTTCGA AGAATGAAAAGTATATACTCAGTCACTTAACCAGTGGTGTATKAAGCCGA TACGCCAAACATCCCAAAATTTAAGTTAACAGTTTGATCAAGATAGGAAA ATCGACTCTTTAAATAATATTACAGACTATTGCTGTATATTTTGCAACTA TTGAGCGGGGATTTAGCCACTTAAAGCTAACAAAAACTTATTTAAAATCA TCTATATCAAAAGAACGACACATGCACACCAGGCCGGTTTTACGGTGAGA GGGCATTTTTATTTTTAAAGTTGAATTTTTTTTTTCGATTTATTTTTTAA ATATAACCTTTTTTTAACAGAAAAAAATTATCGAATCCTTGTTGTTGTTT TTTTAATGAACTATGATGCGTAGCTCTTTTCATCTTTGTTTGTTTCTAAA TAGCCTTTTTTAGTAAAGACAGTTCTAATTTTATTTCAAATGAGCTTAAT TTAAAAAAAATAAAGTTATTAATTTCTGAAAAATCTAATCTTTTTGGGGC ATAATCAAGTGAAAAAACGGGGCTAATGATCCAATGCTCCCCTCCTTAAA TCAGACCTGTATTTWCAATGTGTGTATATTTWCATTAGCTTRTTAACAGG GYCGTCGGCAGGYGTTTWTTTTGACTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGA TTATTATTTTTTTGGTCAAGCTTGGACTCGTGAAAGTGACCTTTWTCTAT AACAAAAAACTTGAAAAAAAAATCCTTCTGTTATCATTAATTTTTCCTTC AAAGCGATAATTTTTTAATGGTAACGAGAAAAATTCATCGATTTGGAGGT AGCTGAGGTCCCTTTAGCCCACAATCTGTTGACGCCCTTGRTTAGCCGTT GGAATCGGGGAGAGGGTGTATTTTATTTTTATTTTGTCTCGAATATTTTC GAAATGATTTTATTTTAGAAAATACATTTCATTTTTTTCATTTTTTTTTG TTTATTAAATATTCAACATTTTTCATGACAACCGCTGTCTTTTCCACAAA ATATTACATCAAATTTTCCAAGAGATATATCATTATTTCTTACATACCTT ATCATCCTGTTACAATGGGCCTGTCTGTACTCAGAACCGACCTGGGGCAT TGCAGGGTCCTTTGCACAAAGCTTAATTCTCAATCTGGTTAGGGATAAGG ATAATAATTAATAACAACGTAGGGGAATAAAAAAAATGTTCAATTTGCAA CTAAAACAAGAGTGCAATCTTTCATTGTCATATTTTTTAAACATAGTACA TAATAATATTTATGATTAATCATTTCATCTTCCCTTCTCGACTTCATCTC CTAGGAGCACTAGCATAATTAAAAAATCTAATTATGCATCCCAACGTTTT CTTGATTGAAATTCCCGAGTGACGAATTGTTTTTCTTGTAAAACATATAT GTCATACTATTCTTTATATGTGCATATTATGGTAAAATTACAATTAATTA TATTATTATTAGTAAATGAGTCATTAATATTAGGGTTACCTTTAATTTTT TTGATAATAAACAAAACAATAATCCACCCAAAGAAATAACTGGCTAATAA TACAATTCGGATCAAAATAATCTCATTGATCTTCTTAGTTTGTAACCATA TTGATCCTCGACTTTTGTATCTTAATCATTTATTGTGTTTCCTATATGGG TACTACTGTTGTAATAAAATAAATATAACTAAGTTGTTGACAACATGGCC ACAGAAAGCCTCTCACCCAACCAAATAAACTGGGGACTCCACATTAAAAG ATCTTTGGTCTTTATAACAATAGGAGAGACAATTCAAAGGCGTAAGTTCT TTTGACCTTGGAAATTTGAACAATATTAATATTATTATAATTATGTTATT GTAATTACAAAAAATGTATTCCAACGAGGAAATTATCTCCTGGCGTTGAA GTAGACCTTACCTGCTGAAAAAAAAGGAATTATGTTGATCATTTAGTCTG TACTAAATATCCATCAGCCTTAAAATAATAAAAATAATCCATTCGTACGA GCCATCATTACATATTTCGGAAGTTTATACGTTATTCACGCAACCCCTCT CTTAAATCATTTATTTGAAATGTTCCAACCACATACTCCCTATGTTATAT TGATTTTCCTTTATTTAATTACTAAAGCAGGTTAACATGGAAGACACCAT GGCTTGTGAGCATTCTATCTACCATACATATTATACAAATACTAGCACAT AATATAATCAAATATTCTAGACTGTACATGTCTACTTTCACTTTTTCAAT TGCTGTTCTTTTTTTAGTTGTGTGAATTACATACGTTGAAATATATAAAT ATTTTTAAAACTTTTTATTTTATTATATGAATTTAAATTCTAGAATTTTA TATTCTAAATATAGGTATATGTAGCTATTTTAAATTGAATTAACAAAAAA TTAAAAGATTTCTATAAACTCTGCGAGTATCTCAAGTATTTAATCGAGAA ATTGGATGTTCATGCACATATTGTCTATAAATATATAAGTACATAAAATA ATGATAATTATTTATTCATTATATGAAGCAGTGTGAATGACAAAGTTGGA AGGAATTATCTTCTCCACTATTACTATTATAACCTTGACAACGCACAATA ACCAATATTTATGTATTATACACAAACCATATACATTTTTATGTATAAAA CAACATACAAGTTTTTTATATAACAACGACTAATAATTATTATATTATAA GCCAATTAATTGTATACAAATTAGGTTCATTCACAAGGTTCTATTGTTAC GTCTTGTTGCCGCTATTATACGTATATTGTATTTTTTTAAGAACATGCAA TAATCAATTATCTTCCTTTTCGGATGAGGTGATTGGTACTGTACACATTC TTCTTTAGTCTGAGCAAGCCTAATCCAATCATGCATTAAATCATTTCATA GATCCACTATGATATTTGGTTAACGTGGCACATTATTCACATTTAATAGA ATTCCTTGAAATTGAGGTTACCTCACTAAACATTTTTCATTTTGAAAACT TTGATTGCTTGTGTTGTTTGTCTCTTTCTTTCTTACTCTTTATTTTTCTA CGTAGTATACACTCCACATCCTAAATTAAGACAAATTATGACTTATAGCA TAAGTAAATAAGTTGGAATACATAATATTTTCACTATTATAATTATGTAT ATATTATTTAAATTGTTATAATCAAAACATTTTATCTTTTATTCTAGGGA TGGTGATCCCTCCATCGTTTATCTGGACGGTGTTATACCACCAGCAAGTT CGACACCACGTCGAAGTGGAACTGTTCCTAGTCCCAGTATGAATAAAGCT AATGCCAATCTACTTCACACCATTCTTGAGGACGAATTGGAAAACCGGTT AGTTTTCTTGTGCATTTTACTGGCAATTCTGATCTATGATGTAAATAAGT GCGGGAAATTTTTAGAATTAAAAAATTTTCAATTGAAAGAGGGCATTATG ATTTCTTATCAATGTGTGGATAAGAATGCATGCATAGGATTTGCTGTTAA GCTAACTAGTTATGGAAGGAGGAGAAAGGGTGCTTAGGCCGGTGGAAAGA TATATCTTCTACATATGATGAACAAATTGATTTAGAGGGAGAATGGGGGA ACACATTGTTAATTGATTGGTACTATCATTGAAAGACTAAACATCATATT AAATAATATCATATTCTGAGGGAGAGCAATATCGATAAGAATCACATTCA AAAGAAGATGATTCCTAATTTTGGTTGACATTTTTCACCCTCCTTTCTAT CCCTTTCTGCCTTTACTCTTAGAAAGCTAGAATTTAACCCTTCTCTATGT AACCAAGTATGTATATATATTATGATTGTATGCAACAACCAAAAAAAAAA TTGCCCGGATTCCCTTTANAAGTAATCTCAATGATGTCTTATGAAAGTTT TTGATACAGAGGGGGGKGGGAGAAAAATTTCTAGCATCACAGCCCTATTC TGCCCCTTAGAGATGAGAATATTTTCCTTGTAGAAAATTAGAATAAAATT ATGCCATATTTTTTACTATTAATCACTTTACTCCATCAATGTAAGGAATG GCGAAAGGAGTCTAGAATCTTTAGTAGTTGAGAGAAGATGTGCGCTCGAG AGTGAAGGAAGAAGAAAAATATTTATGCCCGTAAATGAAGGGCCTTGAAG AAGGATTTTTTTAAGGCGTGTGTTTTGTATATGTAGAGCTAGAAGGAGAG GGGAGAGAGAAAAAAAGAGTGAGAAGAAGTGGAAGGAAAAGAGGACGCTT CGCTTTTTCATTATGACCATTTTGAATGTATTACTTAGTAACTCTATAAC AGCCGGGGGTGTGTGTCGTCGTGATGATGAAGTACATCTTTTGAAAGAGT AGTGTGACGTAGAGAAAGGGGTCGTGCTGCTATTCACATAAAATATATAA ATATAAGAGATAAATATCAAAATTTAACTTAAATTAAGAGGTAAAGGCAC AAATATAAATAAAATAACTTATTTGCACTTTTATATTTATCCTTTCATGT GTAAAATAAATACATACATATATATATCAAAGTATTTCAATTTTCCTCTC CACATAGTTCGTTCTTTGCACTTGATATTCTTCTTTTTTAAAAGAAAAAT TCAAAAGGAAATGACAGGAAACATTCATAGAATATCTTATATGTACATTC TACAGTCAATGTTACGTTCATGCACACATAATAAATTAGAAATTCATTCA CTTACTTTAATAGCAATCACATTAAATAGAAGAACAGAAAGAAACCAAAC GTAAACCGCTACCACTACAACGACGACAATGTTTTCAATTTTCCACCTGT ACGATTCCTTCCCCCTACGTCCAACCATTTTAATTATCGTTGTCTTTCGT AATATTATCTATATATTATAATAATATGAGATCATCATGTAGATGGATAC ATACTATTTATATAGTGASCAGCCAATGTTTCTCGGATGTTGTGATTCTC CATTGATAGATATTCCATGAATGACTTTGAAGTGACTGCTGATGAATCAG AACAGTGCTATCACGAGATGCAAGATCCATTGACATGCATGTATACTAAA TGCTAATATTACAATGTACATACTCCCATTCATCAAATATTAATTCATTA TACATATTATATGTCTTTCATTCAAAATCATCTCTGTACTATATGAAAAT ATGATATTTTCTTAAAAGAATGAATCATTTCACTGATGGAGTTTTCATTA 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AAATCAAACTCCGAGCCAAAAAGTCATCATCTAAAACAAAAGAGGGTCGG CTAAGTAAACTCTGGGAGGGAGTAGCTGGGTTGGTGGTTGGGGAAAAAGA ACAAAGTTATCTTCCTTCTCAAACTCCACCTGTTCCTAGAGTTGAAAGTC CTCCTAATATAGTCGTGGATAGAATATCTGAAATATTTAGTGATATTGAG TCTGAGCTTCCTCTCAAGGATAGGCCTTCCTTCTCATCTAAAGAGGCTGT GATAAAAAGAGGAAAAAAATCTGGGTTTTTTAGTAAAAGGAGTCGACAAA CCATGTCGGGTATTTTTAATGATTGGACTAAATGGATGCAGCTCTCAGAG TCAAAGTAATGATCTCTTTACGAGTATTAATATGTCAAATGATAAAAAAT GTTTTTGTACTTATATTAAATATATGATATATCTTTGTTGATTATAATCA ATTAATTATTTTTATTTTACTTGCAGACTCATTGAAACAGACGCAAAGTC CCTCAACTCACTCAAATCTGGAAGTGGACACTCACGCCGCTCATCCGACK CCTCCCAAATCTCTATCACATCTGGAACATCCAGCAATGTAACAGTATCT TCACAGCCCGAACAATCTCCAGCCCATGATCCGGAAGAGGATCTATGGAG CTACTGGGGGAAAATTATTAGTGAATGGGAGMCTGGCTCAAGGAAAAAAG TACCCAATTTCAAGGTGAGTCACACATAATACTTTTAATTTTTACTAATA AAAAAATAGCAGATAACTCTGTCAATTCCATTTTATTAACAAAGATCGAG GGGGAAAATCAGAGTCTGCAAGTAATGTACATTCTATTACAAACTTATCA TAGTAGGAATATTTTGTTTTTACATATTATAATATGTATTTTGGAACCTC TGGCTATGTGTGTAGTGCATACATACATAGAATTGTTGAATTAATGATCA 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