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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s721 | supercontig | LSalAtl2s721:310697..323721 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010859 >EMLSAP00000010859 ID=EMLSAP00000010859|Name=EMLSAP00000010859|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=619bp
MRRNSVSRKSRNSSGNSLKSGGVHESLRHEEDLEHVPIEFAAKSQILVDP
RDIQIVEIGPNGTAGPVNITGVDDGVAFDPDEDEDGRGGWXNKWDFLFSC
ISVSVGLGNVWRFPYLCYKNGGGTFLLIYFIAMFACGIPIFFQEVAIGQY
LGSGGLTMVGQLVPILQGVGYATMTIVFFLDIYYCIIIAWTLFYLIQTFI
NFPNLPWGTCDNYWNSEYCFNGDHESNATILKKHLANNLTKSPVEEYWDR
RVLNITGGIEDVGGIQWELFGTLVCGWVIVYLIICKGLHSSGKVIWFTAI
FPYVVMTVLLIRSVTLPGASIGLWRYVTPVWDKLYDSETWIDSATQIFFA
YSIGTGALPALGSYNKFYHNCIKDSIITCFVNTGTCLFAGCVTFSILGHM
AHNQGISIEKVVNSGPGLVFVTYPEVVLKLPGGSFWAVIFFVMLVTIGID
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IFQLMDFYSASGIPILWCCFFQTISIGWIFGTKRFAGCVEQMTGFRPNFY
WIATWGFVAPVVMARLIKGLMPNIKSNRIKAPAKNMSERELQFYESSARL
LKNSSFVTPNASFNIQPVP back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s721:310697..323721+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010859-706706 ID=EMLSAT00000010859-706706|Name=EMLSAT00000010859|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13025bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s721:310697..323721+ (Lepeophtheirus salmonis)
TAGAGATTCATCCCCACTTTATTAATATAATTTTTTTAGTTGATTCCATA
CCTTCCTCCAAGTTTCATCATCTGTGTGTATGTACAATCGAAGTGATTAA
TAGGAAAGGAAAATCACTCAGATAGACGCCACCTTTTCCCCTCTTCTCTC
GCCAAAGGCATTCAAACTCATAACTTTAGTAAGTTTATCCTTTTCTTTAT
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TCCCAATGTTTACATGTATATTTATAATTAACGTGTACAAACGCGTCGTT
TATAAATAAGCCTTTTATATCATACCCATTTATTAGAGTGGGCCTCATAG
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TATATAGCCTCTGCCCTCTATGTATAATTAGTATATAATACCTAACTTTT
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AGTACTAATTACATAATTTGCATATAATTATAGACATAGGTCAACACCAG
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AATCTTTGGCCATCTTGATGAGGTTCCTCCTAGGATTTCTTGCAATCCTT
GGCATGACTGCATTCTCTGGCGTTCTTCTGGGGTTCCTTTTTGACCTTGG
TATGCCTGATCTGGGCCTGTCCTTGATATATTGGTCAAAATTGATCCTGC
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AAAAGTTATTTCATTCAAAACTGTTTGTTTTGATCTAGTTTCGACGCAAC
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AAGTTAATTTAACAGGACTTTACGGGGACCCCGATACTTATTTTAATATA
TTAAGTATACAACTCTTGAGTATGTATAAAATCATCACAAATTTTGAATT
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GGTCCAGTCAACATCACAGGAGTGGACGATGGTGTTGCTTTCGATCCTGA
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CTTCATTGCAATGTTTGCGTGTGGAATCCCAATATTTTTTCAAGAAGTTG
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GTTCCAATTCTTCAAGGTAATTCATTATATGACTGGTAATTTAGTGAGTA
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GGCTACGCCACTATGACGATCGTGTTCTTTTTGGACATTTACTATTGCAT
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TTCAACGGGGATCATGAGTCCAATGCTACCATTTTAAAAAAACATTTAGC
AAATAATTTGACGAAATCTCCAGTGGAAGAATATTGGGAGTAAGAGCCTG
GATCCCTTGTGACCCATATGCATATATACTTGATAATTTCCCTTTCTCTT
TCAGTCGTCGTGTTTTGAACATTACAGGTGGTATTGAGGATGTAGGTGGG
ATACAGTGGGAACTTTTTGGCACTCTTGTATGTGGATGGGTCATTGTTTA
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CGATCTGTGACATTGCCGGGTGCCTCTATTGGCCTCTGGAGATATGTTAC
TCCTGTTTGGGATAAGCTCTATGATTCCGAAACGTGGATTGATAGCGCAA
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GGATCATATAATAAATTCTATCATAACTGTATCAAGTAAGTAAAAACATT
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TGTATCTAGTCAAATATTCTATTAAATGCACCGGACCCTTTTTTCATTGA
AATAACTACTTATCCATAAAATGTGTTATTCACAAGTTAATACTTAATCA
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GATGTTTTCATATGTCCTTTTTCATTCCAGGGATTCAATTATTACCTGCT
TTGTGAATACTGGCACATGTTTATTTGCTGGATGTGTCACATTTTCCATT
TTGGGACATATGGCCCATAATCAAGTATAACTTATTATTATGGTGTTCTA
AATTATTTATTTATTCAAATGTGTTTTGTCTCTCATAGGGCATTTCCATT
GAGAAAGTTGTCAATTCCGGCCCGGGCTTAGTTTTTGTAACTTACCCCGA
AGTTGTGTTAAAACTTCCTGGTGGATCCTTTTGGGCTGTAATCTTCTTTG
TCATGCTTGTGGTAAGAGTCTTATAATCATAATCATGCAGATTCTTCAAG
TCCTATTGACTATGAGTTCAATTTCAACATTTTTGTGCCATTTTTTTAAG
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GTTAAAAATATATGTATGAACATACATTAGAGTTTTAAAAAAGTGGGAAA
CGTAGGGCTAAAAGTTAAAAGTATGTTTGTATATATGTAGTTGTGTAAAT
GGGGAATATTATTCTAAACTTTAGTTATTTAAATTTGGTTTGATTATGGC
TCTTTATTTTTTTTTCCGTACAAATACAAATTTAATTATGATTGTTAATA
TTTCTACTTGCAATTCAAATCGTTAAATTAATTATTTTCATTAGAAAGGA
AGACACCGCTTATTCCTCATCATCTTCTTCCATGGGGCAAATGAGGTCAT
CAAGGTCCAATTCATGCTTGGACTTTTTACGCCTCGCCAATGGAAATTGA
TTCTTTTTTTGAGTTTTAACTTTGGCTGTAGGAGTAAGGAGTGCATTGTT
TGCTTCTTGAGCCTCTCTTTTCTCTATCATTCGATCCCTACCCACTAGAT
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ATAGAAAGAAGTGAGGCCATGAGCTCTGCATTAAATTTTGGCTCAAATAC
TATGAGTGCTCCATGGACACCTGATCCTCTGAGGTTAGAGGCATACTCTG
CAAGGTCAATGTGGCGTAACCATTCCATGACTCTATGATTTGACCATAAA
GTCACTTCTGTTGGAGATGAGTATCGGTCTTTATCGTCTCCTGGATCAGC
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CTCCTCGACGGAGGCTGAGATGATGGAGCATATTTGTGATTTTTAAGTGG
AACAAATCCTCCACTGTTAAGAAGTTGAGAACACGTCCATCAATCCGTGC
CTCCAAAAATGTATCCTTGTACTGAGGGAGKCCAACATCATCAAGCCATC
GGACAACCCAATGATGATCAAGCCTTCCAGCTAAATCATCAACTTCACTC
TCAGCCTTTGCATTCAACGCCAAAACAAGCTTTTTCCTATGTAAAACGTG
TTTGATCCCTAATTTGATTTCAAGATCGGACCCNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNACAAGAACTTATTGGTGGGATTGGTTCAGATG
TTACATTGCTGATGACCATCTTGAGCAAATCATCTCCGGTTTTAACGTGC
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TATGATTGTATCCACTTTCCATTGGCGAAACGGTAGATGTGATTCTGGTA
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TATTCTCATTCGCAGAATGTTCTTGTTCAATGAGATTTCCGCTATTTGAG
CGACGCATTTTCCCCCATATTTTCTTCAGTCCTTTTGGTTTTGTTGCTAT
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GTATGCAAATATCCAGAGTACTTACTTGCATGTGGAGAGTATCTTTATCT
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CTGGTCGTTTCCTAAGGAATCAGCTCCTGAATCCTCTTCTTCGTCAAGAT
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AGCATTATTCATTCACTTGACGTCATGAATACTGATAATGTTTTCTATAG
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TTACTACTATTTTAAGGGAATTTTCTTTATTTTCATTCTTGGAATAGACR
ATTGGGATTGATAGTGAGTTCTGTATTGTGGAGAGTTTAGTTACTGGAAT
TGTGGACATGTGGCCAGACKCTCTAAGACCACGTCGACGACTTTTCACAG
CCGGAGTTTGCCTGCTCCTATTCCTTCTCGGTATCCCAATGACGACACAA
GGGGGAGCCTTCATCTTTCAACTCATGGATTTTTATAGTGCAAGCGGAAT
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GGCGGTAAGTTGTTTTCTCAGTAGCTTTTTTGCTTTCTCTCTTTTTTGGG
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GAGACATTCWMTATCCACTCTCTGCTCATGTCATTGGCTTCGTTATGTCA
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AAAAGGGCATATAGAACTATAGAGTATACTCTTGGATATTTCAACAAGTT
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TGAAATATGAGTCTGTTTTTGGATATTGGACATATCCCCCTTTTTTTTAT
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TTAAAGGGGCGGGGGAGCTTAATTTTGGGAAATTTTTGAAAAAAATACAA
AAATTTTAAAAATCCGTAGCTGTTCATAAAAWAATWAATTTMTGAAAAAA
ATACAAAAATTTTAAAAATCCGTAGCTGTTCATAAAAAAATAAATTTTYG
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TTAATTTGATCAAATGCCTCTGTTTATTTCAGAGACTCATCAAGGGCCTA
ATGCCAAACATTAAGTCCAACCGTATAAAGGCTCCAGCAAAGAACATGTC
GGAAAGAGAATTACAATTTTATGAATCAAGTGCTCGATTGCTCAAAAATT
CCTCATTTGTGACGCCCAACGCTTCATTTAACATCCAGCCGGTTCCTTAG
TTAAATACAACAACCTCCTTCAAAAAATAATTATTTATTCTCATCATGGC
TGATTCATTCTCTAGGGGTCAAAGATGTAATTATGTAATCATAATGATGA
GTCCCCAAAAGCCGTGTTCCGCAAACGTTACAACAGAAATACATTTTGTG
GAGCGCAGAGATTAAGGAACACTGTCTTAGACGTATTTAGTGCTACAGAG
AGAAATATTACATACATTGATACACCTATTAAACCTACGTATTTTWTTTT
TTTTGTTATTTTTAAGACAGCTCTTTAATAATTCGTTTCTTACTTTCTCT
CTCTTTCTTCGGTTTTAAAGTATGTAGTATACTTTTTTTCAAACCCTCTT
TAAAAAAAACTTTGTAATACACTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGAAAAATC
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CTTAGTGTTATAATTACATAGGATTATAAAATAAAAAGTTGTAAAAATGT
TGTTGATATTTATGAACTCATCCACTTMCCCAACCTAGCCCATATTGTAA
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CAACATATATTTTTATAGTTATTTATGATGTTTACGTAATAATAAAAAGG
GTTCCAAGCGGCAATTTAGAAAGGTCCTTGATGAATCCCTTCTTTTCCCT
CTTGTTAATTACTTTAATTTAATCATTTACTCATGGTTGTCAATATTTTT
GTTGTCCTTTCAAAAACAAAGAAAAATGAATTGATTTCAAATGTCCCACA
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