EMLSAT00000010882, EMLSAT00000010882-706729 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010882
Unique NameEMLSAT00000010882-706729
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s724supercontigLSalAtl2s724:60987..94988 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010882 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010882EMLSAG00000010882-693648Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000048596EMLSAE00000048596-757524Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048597EMLSAE00000048597-757525Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048598EMLSAE00000048598-757526Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048599EMLSAE00000048599-757527Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048600EMLSAE00000048600-757528Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771022auto771022Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010882EMLSAP00000010882Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010882

>EMLSAP00000010882 ID=EMLSAP00000010882|Name=EMLSAP00000010882|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=467bp
MRRKKRYRCEFFERIQSRFGEVKAVLTHLSLYVGLIVYTLLGAMIFQFLE
HPVEKEKLTTLQDLVISERQNFLSLVYNLTAAMGGAPPHMIVPSILFSKD
LIGHKYINREKADLILDNALLEYERAVSVAADEGVDIETKTIVYQWTYVQ
AVFFASTIITTIGYGNIAPVTTKGRVFCILFAIVGIPFTLSVIADVGQLL
ATLLSVVWARIKPSIQPAIDYFRKIRDKYFKRRTRKKKSFRRGSTLSKVL
SDRLDTSSSGEEDENEEEEEDEEGVMTPDEGDLDSLGNLGITANIVMAVM
ALAVLTIFLSFGSYIFTLYEKWTFFEAFYYCFITITTIGFGDMVPDISGG
KTSYMIVSMIYILVGLAFTSTIIELVRRQYAESWRKMQELRAQIQAQLKL
AETLRRLGQEGKDIEGMDVDLDELRSQLMRFKRLGKLAGFDINDLEWMDA
DRRRIKAITILFYETSV
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mRNA from alignment at LSalAtl2s724:60987..94988-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010882-706729 ID=EMLSAT00000010882-706729|Name=EMLSAT00000010882|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=34002bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s724:60987..94988- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAGACGAAAAAAACGATATCGCTGTGAATTTTTCGAACGTATCCAATC TCGATTTGGTGAAGTCAAAGCCGTTCTAACACATTTGAGCCTTTATGTAG GACTCATTGTATACACACTGCTTGGAGCCATGGTATGTGATGGTTAATGA TTTTTATATGTAATAGAGGGACGGGTCAACTTTTTAGAGAAAATAGAAAG AAAAAAACAACATTTTTTTAAGTTATACTTAAAATATTTTATATCTAAAA AACCATGGAATGATTAAAGTTTTATTAAATGAATTAATTGACAATAGTAT CGCCAAACACTCAACAGTTGCTATTGTTTTTTGTCAGCTGTCTATTTTCT ACTTTTTTTGCTCCCTGATAAGTGTTCTGAGCACTAATTGGTAGAAAAAA ATTAGGATTATTTGATTAGATGTAAGTAATCTAATCGATTTATGTATATT TAKCTCCTYAACTTTRCCTGCCTCTAAAACAATTAGTCAAATTAACTATA TTTAATTTCCAGACATTTTACAGAATCTTGCATTGATTATTTATTTAAAA TTATATAAGAAAATTAAAAGTTACATTAAAAATCAAACCAAATTGATTTT TTTTTTGACGGTTAATCTTATAATATAATTTAGATTCTCTATTTTTAGCT ATTAAATAATGAATTTGAAAAATATATTTGAAAAAAATATTAGCTTCTAA ATAAGAATAGTTATTTTACTAGATTTCTATATGATTAGACTAATTTTGAA GAAACTGTCTTCAATATAATAAATAAATCTTTCGAATAATGAAATGTTTT TTATCAATTTTGATTAGATTAATTTTCAAATATTTAGTCATTTCATTTCG AAATATAGCTCCTAATTGAAATTATACTCTAAAAAAGTGACTTAAAAAAA GGTGTTGAGTAGGCCAACCCTACTCAAATTGCAAATTTTAAAGATCAATT TTGTATTCCATGGCTGAAATAACGATATTTAATGTAGGTTTTAGCCGCCG GGCGTTCCATGAATTAATATTGTGGCATAGTATTATTAAGCTAATAGAAA ATGAACAAAATAATGTCAAAGATGTGGAGAACTGYCTTACTAACAGCTAT TTTGCAACTATTTATATTTGTGAGAAGGAAAGGTTGAGAGATACAATCAA ATGTGTATATTTTGATTAGGAGTCCAATCTTTTTTATCAGAGTTTTTGCT CTTTTTTCTATACCAAACAAGAACCCTCTTTTCTGTAAACAAATGTCTCA TGAAATGCAGAAACTATTTTTAAAGCAATGATATTTGCCTTGTTACGGNN NNNNAAAGATATCTGATTAGATGGAGAAGTTAGGCACGTCTATTACATAT TTAAAGGAATTCAGTATTAAAGTAGTTTAGTATTTGAAGAATAAATCTAA TTGGCCTTAACTTCTTTAATGGCCTTAATTTATTCATCTCTCTTTGAGGT TTGATAGGAAATTGTGCGAATAATAATATATTATCCGTTTTTTCATAACC CATAGTATCTATTTTACMCCCCGGGGCWTTGCAACCATCAAACATTGTCC ACGCGGGGGGTAGGATGGAAGGGCGGTAGCCCCTCCCCAATTAAGGATTG TTTTCTATTTACTTTAAAATTTAATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NTTTGTCAAAAGTTTAATTTTTTGTAAGCAGTTGTGGTTTTTTGAAAAAA AAATTCTGAACAGCTGAGGATTTTTGATTTTTTTTTTCTAAAATAATAAT TTTTTGAGAATAGCTATAGATTTTTGACATTTRTTTTCSAAAAGAAATYA TWTTAGAAATTTTATTTTTGAAAATTTTTCTAAAAAAAAAATAATTTTTT TTTTTTTTAAAAACAAAATATTAACTTATCCATTCAAAAATACATCCAAA TCAGTAAGTAATAGAAAAGAAGAATGGAATTTTATTATTACTAATGAATT GCATGCAGAAAAATATTTTCTCTTGTTCCTAATCGTCTCTTGTGTAATCC ATGGTGGTGTAATAATGTAATATATTTAAAATTATTTAAATGTAGAAAAA CTCACATTGATGATACTTCTTCATTTTTGGGCGGGTTGCATGTGGCCCAT AGTTTGTCCCCCCTTGATAATAAAATAACACAAAGACAAACAAGCTGAAC ATTTGTAATAATATTCATTTTTGAATACGCAAACTTTCGATTTGGATTAT ATTTTTCGCTCCATATTTAGGTACAGTTAGAGAGGAGGTTTTTATGCTAG GGTTATGGTAGGTTTTATGGAAGGYAGTTAGAAGATAACATGGCATTGAG GACTGAAGGCCTCCTTCAAACTTTTCCACTGCCCTTTACTTCCAAGAATM TTTAAATAGCCAATAAAATGTTTAAAAATGATGGAACTTGTAGTAAATAA AAATTTATTCAAGTTTCACTAAAATATAAATGGCTTGGTTTTTCGAATTA TTTTGAAAAAAGTAAATGATATTTTTTTTCCGAAAGTATTTCAAAAATAC ATTACAATTCACAAAAATTTGAAAAAATAAATTTTTGGGGGAAAAAATCA AATATTAAATTAAATAATAAATTTCTTTAGAAAAAAGTTTCTAAGATTCA ATAGGTATTGACAAAAAATATTTAATTATAAAAATAGTTTTAATAAATCA CAGTTGTTCATAGAAAATTAAATTTTTTGTAAAAAAAATTCAAATATTCA ACTTTTTAGAAAAATATGTCAAAAATATGGTTATTCATTGAAAATACAAC TTTTTGAAAAAAAAATTCTAAAATTAAACTTTTGGGAATGAGAAGATTTA CATTTTTGGAAATTTGGATTCTGGGAGAGGGGCTCCTGCCACTCAAGACC 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TCCTATGAACTATTTAAAGTAAGTCTATCATACTAGAGGTTGGATGCAGT CCTTATATTGTAATTCAAAGTCTAGTTGCAAGTCTTAAAGATATGTACTC TAGGCCAAGTCTGGTAGCAAGAATCGATTACGTGGGTGAAGGAAATCATT AATTTCCTTATTTTTTGGAAATACAAATCTTTAAAATAACGACACCATAG GCTATCTTTATTTTTTATAAAACAATTTTACTACATTTTATGTGAGAAGG TTTTTTTTAAACTAATTTTGTGGTAGACCCTACTTATGTTCTCATAGTCT CTTATAAACATACATATTTATAACTCAAACATGCAAGTATGTGGAATAAC TATTTCAAGCTATTTATAGGTATCATCATGTATTAGAGCAAAAAAAAAAA AATTAAGAGTGAATATCTCCATTTAACAAAATTTGTTCAATGCCACACAT TATATAAGGGATTCATTAATATTAGTTAGGGGTGAAAGCTCAAAGATACC GTCTATTTCACTTGGGATTTTAATGGGTTTTTTTTTTTTTGTATAGAGTA CAAAACAAACTCTGAATAGTATAAAAAAGCGAACCATCTTTCCATAATTA GGTATTTATTATAAATAGTAAAGAAGGAGGTTAATGTATTCACATCGTCA AATTAATATCTTAATTAAATTTGTAAAACTTTTAATCCAATAAGCAAGTG GTGTAATGACGTCATATCAAAGAAGACTCCATTGTTAAATGATCATTGGT TTAATTTTGAAACATAAGCAACCTAATAAGATATGTACTCCTTAGTTGTA TATTTATGTGATAAAAGTTGATTGGTTGAACTGGAGTGAGTTAAGTTTTG AACCATTTTCTATTATTGTTGAAGAATAGTACCACAGCTAGGAGGAAATT AATTTACTAACAACTGATTTGAAACTGTTTCTCCTATTCTTTTTAGGAGG 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CCCCCCTTTGAGATTTTGTATAGTTATTACACAAAAAACTATTTGTCAAA TTTGGTATTTACAAAAAGAAAATTATGTCAAATTGTCAATAAAACCTAAG GACTTAGCCCAACTCAAAAACAATCTTACATTCGTTCCATATGATATCCT TATTATATAATTTCCCTCCCTATATTTGAAAATATATTTGAGTGTCGGTG TTTGGGATTATCATAGAAGAAGAAATGGTTTCTCTTTCCCCTACTTCAAT AGTAATTTCTTCCCTAAAGGTTTCAAAATGGGAACAATTCTTTACTATAA GACTCCATTCATAAGCACTCGATGTAACAATATTGGCATCAATGGCGGTT GTAAGTGGCGGAGTAACTTTTGTGTATACCCTCGTTTATTTCATTCCCCC TCTTCGTAACATCTGCTTATCTAATGATAAGCTATTACAGCTAAGCTGCT CTTTTCTAAATCATTATTCCATTTGCCAGGGTTATCATATTGATTTTTGG CCTCTTATTTTAGCAATCCCAAAATGCTCCTAATTAGCATCGCCGGTTAT AAGAATTACTGCCATTTCCTAGGGTTATTTTAATTGTATTTTATTTATAT TAGAAAATTAATACAAAATTAACCCATTAATTGCTAATCGGTGAAATTAC ATATCAAAGTATCCCTAATAATGATTGCATTAGTCTCCGTAGTTATAGTT TGTAATTATATAATGCAATAAAATACTACGGGAAAAAATATTATCTAAGA ACAAAAAAAAAAACACTTTAAAAAAAGAGCCACCTTCGAAAATCCTTTGT GCGTCTTTGACGTGATATATGATTATATACATCGCCTGGCTATATATTTA CAAAGATGAATAATGTTTATAAAAAGAATTGTATCTTTTAGATCATACAC ACATATATTTCTTCCGTTTTTAAATAATAAATATATATATTTATACCCAC 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TTGTCAAGTTGTAAACAATCATTTATAATTAATTGAAGAATATGTAACTC ATAATCTGAAAAAATTGGTTTTCCATTTGATTTTCGTTATCTTTCTCCTT TTGGAGGCAAGGTTGAGTGATGYWGTGAAGATTGTTACGTCTAACCTCGG CTCTTTTTATTAGCTTCAATTTATAAGCACACCATAAATATGTATATATC GTTAATGAAGAGAAGTTTTTCAATGCCAAAAATGGGAGTATGTTAAATAA TTATGTGTCATAAATCGACAAGTTATTTATTCAAATATTATACTTATTTG TGTCTGTAAATCCAATGAATTCATTTAAAATGCAAATTTCCTTGAAGTGG AAAAAATTCATTACGCTACAAGTCCAAGTTGAGTCTCAAATCTTTGCTCA CAAGTCATTTAATATTTTTATGGAGTCCTAGGATWTGTTTGGAGTTATTG AGTTTACTATGTTYAAGTCAGGTCACGAATCTTTGAGATGTAAGATGAAG TSGAGCCTCAAGTCTAAGCCGAGTCACAAGTCCCTACCACCTATGGGAGT TTTTCATTTTAATAGAGGGTTTATTTCATTTTTTTGAGCTTTTCATAACT ACTTATTTAGGAATATTTCATGCAACACTTTTGCAATCTTGAAATTATTA TTATTCTATATTTTMATTTGCATAAAATATAGCTCTACAGGGCACAAAAA GTAAGTCCAATATTTGAATCATGAGACAATCAAATGGTGTGTATGCACGC TAAACGTGGTATTGCATACATGACGAATGTAAATAAAACCATACTTTTTG TATCAATCTAACCCTTTTTCTTSATGGTTACTTATTTGCGAAGTATTAAA TCTTTTACATTTTCGGTTGTTAAAAAATAGAAACCAAAAGTCAACATGGT GGCTCTCATGACATGTCATAAGATTAGCTACATGCAGCAATGACTGAAGT 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