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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s724 | supercontig | LSalAtl2s724:60987..94988 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010882 >EMLSAP00000010882 ID=EMLSAP00000010882|Name=EMLSAP00000010882|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=467bp
MRRKKRYRCEFFERIQSRFGEVKAVLTHLSLYVGLIVYTLLGAMIFQFLE HPVEKEKLTTLQDLVISERQNFLSLVYNLTAAMGGAPPHMIVPSILFSKD LIGHKYINREKADLILDNALLEYERAVSVAADEGVDIETKTIVYQWTYVQ AVFFASTIITTIGYGNIAPVTTKGRVFCILFAIVGIPFTLSVIADVGQLL ATLLSVVWARIKPSIQPAIDYFRKIRDKYFKRRTRKKKSFRRGSTLSKVL SDRLDTSSSGEEDENEEEEEDEEGVMTPDEGDLDSLGNLGITANIVMAVM ALAVLTIFLSFGSYIFTLYEKWTFFEAFYYCFITITTIGFGDMVPDISGG KTSYMIVSMIYILVGLAFTSTIIELVRRQYAESWRKMQELRAQIQAQLKL AETLRRLGQEGKDIEGMDVDLDELRSQLMRFKRLGKLAGFDINDLEWMDA DRRRIKAITILFYETSV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s724:60987..94988- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010882-706729 ID=EMLSAT00000010882-706729|Name=EMLSAT00000010882|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=34002bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s724:60987..94988- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAGACGAAAAAAACGATATCGCTGTGAATTTTTCGAACGTATCCAATC
TCGATTTGGTGAAGTCAAAGCCGTTCTAACACATTTGAGCCTTTATGTAG
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TGGGGTTTCAATTTTATTAAGTCATTTATGTATAATGATCAAATGTCATT
TTTTTAAATCTATAACTGAAGATTTAGGCTTTTCAAAAAGGTGTATTTTT
CAGGGGTGTCCATGGGCTGTAGCCACCCCAAAATATAGAAATTTTTCCAT
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AATTTACTAACAACTGATTTGAAACTGTTTCTCCTATTCTTTTTAGGAGG
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GGAATACTCCTAGGTAATTTTAAATTAGTATTTATGTCATTTGAGACTGA
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TGATATACGTATTATTTAAGCCCTTGAAAAAAACTTTTCTACAAATTATT
TTTTTTAAATTTTGTTAAATATTTTTTACATGACAACTTTAATTATTTAA
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TAAAGTATTTACAAATCTAAAATAATTTAATAATTTAAAATAGACCGTTC
ATAGCCAATAAAGTATTTACAAATCTAAAATAATTTTATAATTTAAAATA
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TTTGGTATTTACAAAAAGAAAATTATGTCAAATTGTCAATAAAACCTAAG
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GACTCCATTCATAAGCACTCGATGTAACAATATTGGCATCAATGGCGGTT
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TTRTTTAATATATATCATTATATTATACAATTAAATANTGTAGCGGAATA
TTTTATAAGTATTCACAATCTTTCAAACCTCTCATATATAGATATTTACC
TMTAACCATGAGTTAAAATTAACCACTAATATTAAACAGTGCTAGTCAAA
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TAAACTAGTATGGAGGTACTTTAAATTTAAAGTATGGTAAATTTTAGGAA
TACAGATATATAGGAATATATTTTATTTAAAAATCACACATAATATTTGT
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TTATTACCCTATGGAACCCTCCTTATTKTCTGTATCGTTGTTCGTAGATT
TGTGGAATATGATTTCATTGCCTCTTTCCCCAATACTTCAGCAAAAATGG
GCCTAAAGACTCAACGACAAACGATACCCACAATTTAAAAGGTTCCATAG
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TAGCCAAATGGRCTGTATAATGCACTACCTTAACTAGTGTTTTACTAGSC
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ACATGTCCTACCGATATTTAAAAAATAACATAATCCCAAAATGATCATGA
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TTCCAAAAATTTTATTTTTTGTACTTTTTTTCTAAAATGATTTTTTTTTT
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TCCTATTCTAGTATAAGTTTTTTACACTCCGTGTACGAGTCGATTTGAGT
ATGAAGTTGCAGTATAATAAAACCGTAATACTAATAGTATTCACAAAACA
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CTCTTTTTATTAGCTTCAATTTATAAGCACACCATAAATATGTATATATC
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TGTCTGTAAATCCAATGAATTCATTTAAAATGCAAATTTCCTTGAAGTGG
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GGAGAATGAAGGAAATAAACAAGGATATAGACAGGAATTACTTCAATGTC
GATCCTCAATTTTACTCCGAGTCCAACAAGAACTAACACTTATAACTAGT
GATGAAAATTGTATTTACTATGGGTATGCTAAAAAACTTGGCAACCCTGA
GAATTTGAAAAGATTTAGGAAGAGAGTAGCTTAGCTSTCATGACATTTCA
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AACAAGGACATTATCAAGAATTACTCCAATGTCGATCCTCAAATATTATC
TGAGTCCAAGAAGGACTTACAATTATGACACTGCAAGAAATCATTAAGGT
TACTCTCCGTCTTTATTGAGCAAATACGAATATCCAATCAGGTTATGATT
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TTTTTTTGGAACTAAATTTCAAAAATACTGCAGCTGCTAACAAAAATTAA
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AAAATCCATAGTTATTTACGAAAAATTATTTTTTTTGGAAAAAAATTTCA
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GGGGGGGGGGAATAAACCTCCTCCACTCAACGCCCTGCAAACGCCCCTGA
ATAAAAAAGGACGTTCACTTCTAAGGAGTTAACTAATTATCACAACAGGT
AAGGAAAGTAAATGGATTTTTGATATTATGAACCCAAAAAGAAGGCGCCA
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GAAAAAACCCAAGAATAGCAATTATAAAAGGAATAACGGTCGACACATAC
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TTTAAAATTGCAAGATAAAAAAATATAAATTAATTTAAATTTAATTACAG
TATTTTCCATATACTAATGCTATTTTAAATGTAATTGGTTCTCCTCTTTA
GAGCTGTAATTCATTTTATTCCCTCAAAAACATATAAGAGGCAGCTCATA
TTAACAATCGTCTAAGGTCATAATCTAGGAATATCAGCCTTCTCCTTGAG
ACACAAATGTCATCTCTTCTTATTACTCCTCTCTGTATTTCATGAGCACA
CTCACACGTAGTTACTATATACTTAGATATAATGATGACAGCGTCGGAAA
ATTAAACACACTATTGAGATTGCCAACTACAAAAAAACTCGCACTCTATA
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GGGGACCAGAGTAAAAAATTATGCATTTAAAATTTCATTTTTTTTTAAAT
TGTAAATATTTGTTTACTTATGTACTTATATGGCTTATATGGCTATCAAT
GTGTATATTTTCAATAGTGAAAAATGATGAATAAAATATTTATACATACG
AGAATATATAATTAGTAAACRTTTTATGAAGTACAGGATGCATAAGMTAT
CTAAGTTGACGCACTCTCTTGGGCAAACAAAGGTACTGAGGCAGCTGATT
TTTGTTTTGTTGCAAAGCTTGGTAATTTTGCATCAGTTGGGGAAAAAATT
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CCTCCTTGGAATCCGCGTCARAAGCCACAACATAACATTTACTCGAACTC
TATGACCCAGTTCGTTCCCAAGGTTAGGAGATAATTTAAGACCTCTAAAG
GTGATTTCGTGATGTAGACAAAGTTCCCAGCCCACGTCTGGTCTTCTAGG
TAATTAGCTCCCAAAGCATCGTCATGACTCCTCATGTGTTTTCCYAAGGA
TTCAGGGTCAACACTGATMCCTACCTAGATGTGCTAACGACCAAGGTGAA
TCCCTGAGCCGACATGGTTACCAATGGGAGGCCCTATAYATAGCAGCAGG
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TCTTAATTTGATGAATTTTTGTTTGTTGTTATCGAACGACAAAYCAACCG
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AATCTTGTTTTATTTTTTAAATCAAATAACTGGTTGGAGAGGATATGCTA
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AATAATTAAATAATTTTCAATTCTAAGGTGCGTCTGCAGGATTATATTTT
GTGGACTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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CTGCTTTCAAATTAATTGTATTTTRTTTTTTTTTTTWCAATAATTTTTTA
TAATCCAGACAAAAATTCCATTCATTGGGGGGGGGMCAACTCCRCCATCT
CCTCACTGCAAACGCTKTGATGCTGGTTTTAGTTTGATCATTTTATATTT
TTTTATAAATGTATTAATATTGAACATGGATTGTCTTAAARTAATGAATG
TTTTCATGTAATGTCAGCATTGTTAACGTCAGCCCTTCTTTGGTCCTAAA
TATAGGATAGGMACGATCTTWACTATTGTGGGGTCCTATATAAAACGGAG
CGTGTAAGATCTAACCCCCAATCTGGTAAAGATAGTTAAAAATTTGCATG
AAATTTTGTGTACAAAATTGAATTAAGTGCTCCGAAATACTTTAAATGTT
GACAAAGGCATACGGTAAAACTGTACTGATTAATTAAAAGAATGTTTATA
AGTGACACAAACTCTTCCAAGATGGCCGGGAAGATGACAATGACGAGCAT
CGCTCTGGACAACAATGCACGTTGAAAAAATTGAAGCAGTGAAGAAAATT
GTTTTTGTAAATAMTCGAATGACTATCAGAGAAACGGCTGATGATATTGA
CATATCGGTTGGCTCGTGTTATGAAATTTTTTCGAATGTTTTGGGTATGA
AATGAGTGTCAGAGAAGTTTTTCCCCGAATTGCTGAATTTTGAAGAAAAA
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GATTTGCTCAAAAAGGTCGTCATAGCTGATGACGAATCATGGGCATAGGG
TTATGAAAAAAAACAAAAAAAATAGTGAACAATTTTGCTTAAAAGTCGTC
CCTTGGTTTTTCCTTGGATTACTTTTTCCCATTGTGAGTACTGATGTCTG
CAATAGCTGTTACATGATTATAAGATTAGAGCTATTATTTCATAAAATAC
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