EMLSAT00000010934, EMLSAT00000010934-706781 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010934
Unique NameEMLSAT00000010934-706781
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s731supercontigLSalAtl2s731:103747..120677 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010934 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010934EMLSAG00000010934-693700Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000048869EMLSAE00000048869-757797Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048870EMLSAE00000048870-757798Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048871EMLSAE00000048871-757799Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772223auto772223Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010934EMLSAP00000010934Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010934

>EMLSAP00000010934 ID=EMLSAP00000010934|Name=EMLSAP00000010934|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=206bp
MGNGTSMPDVDGFSREEISRLEKRFQKLDLDRSGSISVGEFLSVPELKEN
PLVKRVVAVMDSDLSGEVDFKEFVMGLAQFAIRDYDRKSKLEFIFRIYDM
DRDGYISNNELFQVLKMMTGKNLTDQQLQQIVDKTIIYLDKDNDGKISFE
EFCSVVDARGPEHDVTSKMTFDKNSLFSDDEFLSAYSLNIFFMKSLTTYY
IYLLSE
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mRNA from alignment at LSalAtl2s731:103747..120677-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010934-706781 ID=EMLSAT00000010934-706781|Name=EMLSAT00000010934|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16931bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s731:103747..120677- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGGTAATGGAACTTCAATGCCAGATGTGGACGGTTTCTCTCGAGAAGA AATCTCACGATTAGAAAAACGTTTTCAAAAACTCGATTTGGACCGATCAG GATCTATTTCTGTAGGGGAATTTCTTTCTGTACCAGAATTGAAAGAAAAC CCTCTAGTTAAACGTGTTGTTGCTGTTATGGATTCAGACTTGAGTGGAGA AGTCGATTTTAAAGGTAAAATTAGTTTCCTCGCTAAAAGTGATCATTACA TATTTTGTGTATGAATAACCTTGAAGTTTAATCAAGAAATGTTAAAATTA GCGTCTATCTTTATGTATCTCCCTTCATACAATTATTTCACTTAAAACTT TTAATAAGAAATGAATTTTATCTAACTTCTACACCAACGTAGTGGAACAT AAATTTCAGTATTGTATGTCAAATAAGTTTCACTTCCTATTAATAGAAGG AATTTTTGAGTAGTTTATCACTCAACATTGACAGTGTTGAATGAATGAAC ATAGATTATTCTATTTAATTTTATTACAGTAGCAATAAATCGGAATAATG GAACTGAGAAATGTGCTTGATCTGGAATTCAAATAGTTTCAAATAGATAC TGTAGCATAACCTGACGTCATGCCATGCAAAATATGTTTAACCTGTTCAA AAATATAGAAATGTGCATTTTAATTAGTCTGTTCACGTTTAGTTCACTTG AATTTATAGAGAGCGTTCTCAGGTGAAGTCACAATGAATAGGCAATACCA CCAAATGGAGGTATATTAGTTATAAAACTTAGTACGTACCCTCCAGCCTG ATGGCGCTGGCGGKTCATTTGTAAAAACACAATCTCATAAAGTGTTTTGT TTAATAATTTCTTGTAAGAGGAGACGCCATTTTAAGGACTCAAAGGTGAT ATTTTTACTACATAAAATGAACAAAATCTTGATGAAACTTTATCAAATGG CTTTAAGAATTAAAAAAAACATAACATCTGTAGTGAATACTACTTGATAC CAATTATAAACACTGATATTTGAATTAAATCAAAATAATATCTGCTAGAA ATGGCTAGATTTGTACAAATTTGTTTTCTGATTGATGAAGTAAGAGAAAA ATACAAGGTTAATTATACAAAAATATCCTACGTTTTCCATCATATTAGTT AATTTTTCTCTACAACATGGAAATAAGATTGAATAACGATATAAAACATA TTTAAATGCATTTTAGTGTCAGATATATAATAAAACTAGGCAATAGATGG ATAAACTTTTTATAAATGGTAAGATATTTTACTTGTTGATCCCATTTTGA CGTTCAATAGTTCACTATTTTCTATAATATCAATGAAAAACTGTTAAAAT TGTTATTAAAATGGGTAATTAAGGCCTCCAAAATGGCTGACATCAACAAT GTTGTTATAACGTGAAAATGCTCTATAGCATTTTTATCTTCTTAAAACAT TTTAAATATGTTAAACCAAATATTTGATTTATGTGATCTTTCGAGGAGCC CAGGTTGTGAAACATTGATCTAAACTAATAATTATACATATAAAGCTAAT ATATGTTCCAGATGTGATTTTTCAAAATTTTTGTATCTTTTGTCCTGTTT AAGAAATTTGTGTCTATTGTAATTTAATTAATTATTGTTTATGCTCTACT CTTTAATGCTGAAATTTACTTTTAATTGATAAAACTATTTATGTAAATGT GAACTATAAGTCACTAGAATTTCGTTACCAACTAATGTAATAAATATCTT TCTTCATTTCAAATTAATTATATTATAGATGTTGACCCTAGTCAACTTTC CATAAATACAAATAATTTTTATAGATATGATAATTAATTGAGCTAAATTG CTTCTTATTTGTACCTATAGAAAATATGAAATTAAACTATCTCACCAAAT 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TTTAATTTCTCCTCGTTTTAAACTTGCAGTCAAACTAGGTGACAACACCT GGACAATTACTTTTTAATTTTGGCTCAATTATACAAAAGTTGTTCAAATT TACAAGTACCAAAATTTAACATAAATTATGTAAATCAGTTTTACTATTGT TTGATTATGCAGTCAAACCTGTATGGAGAATTGTAAAAGTTACTGCTACC TGCAGCTGGCCTCTTAAACCAGGTTGGTATTTTGGAACAATTGAAAAGTT GAAACTAGTTGATAAAATAATACAAATTTACGTCTGGGTTGTAATGGAAT AACATTCATTCTTAGATAAAGAGGGAGGAAAGGACATAAATTTAGAGAAT GCWTTCWTTTACCGGGTAWARAAAAAGTACGGAGMCCTGCCTCTAAGAAG TCATTAAAATAATCATTATTGATCAAAATGATGTTTTACATAGAAATTTT ATTTTATAATATTTTTTACTATAACAATGCACATTAATTATGAATATGGG CGCCATCAGCTTAAATCACAGCCYCCAACCGCTTCCGGAACCCCTTGCAC ACGTTGGCAACGTAGTCCTTTTTCATGATCCTCCACTGCTGGTTATCGGA GGTCTTTAGGGCATCAATATTCGTGTGAGAGACTTTGCAGGCCTTGTTCT CATTTTGCCGCCAAATTGAATAATCTAGTAGATTCAGATCTGGGCTCTGA GGGGGCCAAAGGTTCTTGGACCAGAAGTTCATGTTSCTMCCCATCCACTC TTTTACAATATTACCTGTATGGGCCGTAGCCCCGTCCTGCTGAAATACCT ACGTGGCCTTGTTGGACTTCTTCATGATCTTGGTGATCTATGGGACCACA TTTTCCTACAACACCATCAAGTAGTCGGCCGCGGGCAACTGGTATCCAAA AGTTAACCAAATGGTTTGCATTATTTCTCCAGTTGATGCCAGAACCACCA 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TCAGCTTAGTTGGTTTATCGATTAATTATCAAAATGTAATAAATCCCGTG GTGGATTTCCATTTTTAATTATTTTTTGTAAAAATTGATATTTAAGGAAA AATAGAAATGGCTTCAATAAATTTATATTTCATATAACATACTGTTATTT TCAAAAGTCTATGCACTTTTTACGACTTACCAAATGATGCTCATGATATA AATCTTGATGAAGTTTGATAAGATTATTGCAACTACTTATTGTAATAGAG CATAATTCAATTGAAATTCATCAATTTCAGTGCCATTGGCTTCAATAAGA CGCTCCTGATCGCCCTTGAAGGCTTTACACACGTTGGTGATGTACTTCTT CTTCATGGACAATCATAATTTGTCGACTTTGAGTTCATAAATATGTTGTG ACGATTTATGAAGGCATTGAATTCTACATGTCACTAGATGCTGTAATCTA GAGGGTAAACGTCTGGGCTCTGGGGCAGAAGTTCATGGGCCAACACGACA TGTTATCACTGAAAATTGTTGATGCCACGACTTCTAACATCATTACGGAT GCAAGGTACTTGGAGTCGAGATCTTCCTGAGGTCATAGTCAGCCTTGTTG AAAGAAATATATCTTATTATTCTGGTTATTGATCACTGGATCGATAGTGA AGGTATTCCTATTGGAGATGATGATAATTCGTCCACCATTGTGTTTCATG CTCTTCAGAATGTGCCTATAACGCTCCAGACGGACTTCTTCCAGTTTTTG NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAAAGAGGCATTTC CACATGTCTAATAGACTTACGACTAGCCTTTTTCACCACCATGGGCACTG ACACCTTCCACTTGGCTAAAGTCGTCACCTTTGGATTCGCCCTGAAGGCT 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