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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s790 | supercontig | LSalAtl2s790:313171..331500 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011463 >EMLSAP00000011463 ID=EMLSAP00000011463|Name=EMLSAP00000011463|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=235bp
MSPVGLYTEDHPENKGHSGINQLGGVFVSGRPLPDSTRQKIVELAHSGAR PCEISRILQVSNGCVSKILGRYYETGSIRPKAIGGSKPRVATLQVVNKVK SYKSACPSIFAWEIRDNLIKDKICSSDSVPSISSINRVIRNIVEISGEFE NGNGNFQFMNHPQYCWPFKDEVETFHSTTFNYNSLQVSSEFERTHYPDIQ TRERLAQIITIPEARIQVWFSNRRAKWRRESNKKL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s790:313171..331500- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011463-707310 ID=EMLSAT00000011463-707310|Name=EMLSAT00000011463|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18330bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s790:313171..331500- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAGCCCAGTAGGGCTATACACAGAAGATCATCCAGAGAATAAGGGACA
CTCAGGAATCAATCAATTAGGTGGAGTTTTTGTTTCAGGAAGGCCTTTAC
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TTTTTTTCCTTTGAGTCCATCATCCACATGCCTTGAACTTTTTTGTCTGA
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AGCAAGCTAATTTATGTTCGAACTGCAGTTTGTAGATACACAGCCCAATC
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ACACCCATGATGTTGGAATTCTAATTATTTATCTTCACAGGCAAACTATT
CCAAGTGAGAAGCAGGACTATAATAATTAACTCGAAATGTGATACCATAT
TGCAGTGAGAATTTTTAACCACAAGAAAGGTATTTTAACGGTATAGAAAG
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TTGTGATTGTTTCTCATCTGCCTTTTGGGGTTTTTCAAAATTTCTTATCA
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TGTCTTTAAGTGTTTTGAACGTWTTTGATTATAATCTGTCTATCTTCATT
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TGGGTATTTTGATTCTTGAATGGTTAGTGAATCAATAGCACTACAAAAAG
GCATATTAGTGGAAACTTATTCAGATTTAGCTACTTTTGAAAAACCTTCA
TTTTGGTTTTTATACTTCATTTCAATTAATAAGCTTCGAATATTTTGGAA
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TGGTAACTGCTACCTTTAAAAATGCTTAAGATTTACACCCCTAACTATTT
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TTATCAACAACAAACTTCTCCCTAACAATTATGAATTTAATCAATTTTAA
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CCCCTGCTCACACAACTTTTTAAAAAAGGGGTAGAGGCAATATCATTATT
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AGAAATCAAGTTAAAAGTACATACACACGTGTCCTATTCGTTATCGTTTA
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AAGTGTCATTGATAAGTGAATTGTGGGTTTTAAATATGTATATATAAGAT
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TGGATTGCGATGCTAGATTGAAAAGATTTCAAGACTTGGAAAACTACATT
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GGTGAATGATAGTTTGCGTTATTAAAAGTATACTCCAGTTAATAACAAAT
AAAATAACAAACTTTCAAAAATCAGCACTTGTCAGTAGGGTTGTAAAAAG
GCAAAGGGTGTCTGATTTGCACCAGGGCTAAAGGAGTGTTGAGGATGCTC
CTGCAGTCTTGTTTACAAGATTGAAAGTATGGTGGCTTAAGGTCAGAGCT
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AAGTGGTCACTGCTATCATCAGAAGTCCGGCCATGTCGATAAGGCAATAT
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GGGTCAGTTTGGTTCCCTTCTCCCTAGACTACCCTCTCCTCGACTATGCA
ATTTGGGTTGTAGTGGAAAAGAGAGCCTGTACTATCCCTCACTGAAGTTT
GGATGATCTTAAAACTTATATCGAGAAGTAGTTGGTGGAAATGTCCCAGK
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GTAGCAGCCAAAGGAAATTATTTTGAGCAATAGAAATATATATCAATTAC
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GTTTACCCCATTTCTTTATTATCCAAAAGTCCATGATTTTACCTCACACA
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GCAAATACTTAATTTAAATCCCCAGTATGATCATTTAAAGACTTTGTTTA
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AAAGCTAGTTTATGATCAATATAATAAATATTATATATTTATATGTTCAT
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GTTTTTTTCATTCATATTATTTCCTGATGCCTATAAAAATTTATACAAAT
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TCACTTTTGAGTTGGTTCCGGTGGCCAATACATTGTAATTTATCTAAAAA
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AAATATTTAAGCCTGCGACATATTACATATTTGAACTGTGCTAATATATT
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GCTAGTGGTTTTATTTCTTACACAGTAACGTATATTCGACACAGGGTTAG
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CTCATAGAGATAAGAAGTATTAATAGCTATTTTTCCATGAGCTAGATATT
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TGCCACTTATCTACCAGTAAAATATTTTTGAAATTGAAAACAAGGCTCTT
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AAATTTATTACAGAAACTTAGAGGTCGAAAATAAGGGAAGGATCAAAGAA
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ATCCGTTTGACTATTTTTGGTGGGGCGTCCTTGAGAAAAAAGTCAATGTT
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TATAAAAAAGTTATTAAAGGTACAATATTTCATTGCTTGACCCTCTATTT
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CTAAATTTTGCTGCTCTAGTATTTTCGAGTTTCTGAAAAAAAAAACTCTA
GTAATTACGAGTTATACTAGTTACTCGCTCTAACGCCTTTTTCCTCGCTA
ACAAACTCCACAGTCTAAAAATCATATTTAAACAAATGTATTTAAAAATT
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AGTAACACAGCATTATGTAGGAAGCGTGATATTTTAACTTAAAATACAGT
GTTTTGTTTATTTTAGAATTTAATTATGGGAAAAGTATGCATTGCACATG
GTTGTCGTAGTAAATACAGAACAACTAAGTCCAAAAGTATCAAAACTGGC
CCCGGAAAAATAATAAAATCACATTTGTATATGTTTCCTAAGGATGAGTC
ACTAAGAAAACTTTGGATTCAAGCCGGTCCTAGCCAAAATTCGGAACCTT
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CTCGAACCTGAGGATACTAAAAATTGTGTAGTAAAGATCCTAACATAGTC
CAAAAATATTGAAAAAAAATGTAATTCCATCCTAGTTTCAAAATCTTCCT
CTTTATTACTCTAAATCAATTCTAACACTTATCTTTCTTCTTCTGGGGTC
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ATTGGCAATGTATCTTCCGTATATTAACTTTACATGAAGCTTGATCGACC
TCGTTTAATCAAAGAAATAAATGAAAATTTTAATTAAATAAATATTCTAC
AATCTTACATTTGTGAATGTAACTGTGGGATTTTGTATCAAAGTAAATTT
TAAATTGTCGATTTAAATTTGGTAAGGGATTTAACAATTTAAAGTAATTT
TCCGCTTAAGCATTTAAAATTTATTAATTTTAGGTACAAAAATAATGAGC
TTCCATTTTACCGCCTATTTGCATATTATTACTAACAATTATATTAAAAA
ATGCAAGCATTTCTGAATATACAAGCTTACTTCAATTTCTTAGTGTTTTT
GAATTTTATATTGAATGATTCAAATTTTATTGAAGATATTGATCATGTAA
AAATATCTTTACACATCAGGGGAAAAATTTAATATGAATTTGTTTACATA
TGAAAGTGATGAAGAACAGCAGACTCTTTTCAATCAAATTGATTGGGGTG
GACTTACTCGTCCATCTGATATGATATTTTTAATTTGCACTTATGGATTT
GAAATATTAAAAACAAAAAACAAAAAATCAGTAAAACAATTTCAAAAGAA
TTGTAATTTTTGGATTTTTTTAAAACAACAAATTCCAAAAACAAAGCTCT
CCCAAAATATAATCCTGCGGACGCACATGATTTGTCTATAAAAAGTTTTA
TGGACAACTCGGAGTAAAGTATATACTACATTCTATTAATAATAGTAATA
ATAATTAATATTAATAATAATTTTATTAATAATATATAATGGACTATTAT
ATATTCATACAGAATAATATAGCTGTTCATGAAAATTGCGTGTATTTTGG
GCGTGTTAAAAAAAAGAAACCAAAAATCAACGTATAGAAGCTACTACATG
TTCTTCGAGGTAGGCAAGCAGCCAGTGTGTATGGGGAGGGGGGGGGGMGA
ATGAGMGAGTACCCCCCCCCCCTCCTCCCCTAGTTAAAAGATAAGAATAA
AAGTTACTACCTCAGGAACATAGTGTTCCTTGTTTTAGATTGAATTGTTT
ATTTTTACCTTGTCCGCTCTTTCCATAGAGTCCTTTAGCTGTGACTAGAG
AGGAAGAGGAGAAAGAAATAAACAATGACATTGTTAAGAGTTACTCCTAT
GATGATCCTCAATTCCACTATGAGTCCTAACTTATAATTGTAAGTCCATG
TGGGTAGAGGGGCACATAGACTTACAATTATAACTCTGCAACAAATCCTC
AAGGTACAAGGAATGTTCAATCAAGTTTTGAATATAATAGAAAAGGAAGT
TCACTAATGAGGAGTTAAATAATAATGCCAACAGCTTAGGAAAATAAAAT
TCATTTTTCAGAGTACCTATTCCAAATAAACGGGGGAGCTAAAAAATATA
CCGGATTTTGATGACTAAATATAGTATTGTGTTGATTCCAACAACTATCA
AATCGGTTCAACTCTACTTGAGTCGATGATTGTTCGACTTCAATGGTCAT
TATAAAAATATGAATAATATTTAGGAGAAGAACAGCATATATGTCATCAA
ATTTCATTAAATTAGCTGAGAGCATCTATGATCGAAAGCAATAAACACAA
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TCTTCAATTCTACTTTGAGTCCAACAAGGACTTACAGTTATAATTACGCA
ACAAATTCGCTATATTACTTTTTTTCTTTCACGCACAACTGATTATTTTA
TAGTTATATTTTCTGTTATAAAAGAATATTGATTTCAGCTTTGAAAAATA
AAGAAACGTCTATTCATGTAGCAACTACAATAAGTCATTATCATATTATT
TACATCTATGTTTAATTAGATATAACCTTGAATTAATAAGAAAAATTTTA
AATGTTATCATGATTAAAACTATATATTTGATAGGAAGCATTAATTTGTC
TTCAAAAGCTTCTTTGCATCGTTATTTTACAAAAAATTTAATCCTGGTAA
ATTCCATCATACAGCATTTGATAAAAACATTTTCTAATTATAATAANNNT
TAATGATTGAACATGATTTATGGCTCAAAATATTGTTTCTTTGTTTTAAT
CATAAATATATTTCCAGATGATGATGAGCTCTTATCAACTCAAATGAGTA
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TTGACTTATGATATGCTGTGCTAAACTTTATATCACAAGTAGAGTTGTAT
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