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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s86 | supercontig | LSalAtl2s86:232361..274920 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012113 >EMLSAP00000012113 ID=EMLSAP00000012113|Name=EMLSAP00000012113|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=297bp
MKVFIVLASLCSIXLAEKPLGGYGAPPLSSYGGPDPLDEYAAGGIAGGEV EGVGGEIASTGDAGAGTGDAAVDGNGEGESLIPGVPGKDYPIYNKVPETS FSCEGQIEGGYYADPEAECQAFHICIADGEGSLLKASALCHNGTIFNQEI FTFINNELVFIVLTTVFGLALSDNPLGRYGAPPLSTYGAQPLGEYVSGGA GSALGGEGSGDAAAGENGEDKSPIPGVPGEDYPIYNEVPETSFSCEGQVE GGYYADPEAECQAFHICIADGEGTLLKASALCHNGTIFNQEIFTCDL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s86:232361..274920+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012113-707960 ID=EMLSAT00000012113-707960|Name=EMLSAT00000012113|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=42560bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s86:232361..274920+ (Lepeophtheirus salmonis) ATCATTATATGCAAAGTCATCTTCACACCAATAGCTAAAAAGAATTGCTT
ACTCCTCATTCCAAAATGAAAGTATTCATTGTTTTAGCATCCCTTTGTAG
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TGTTAAAAGAAAGTGAGTTGTAAATTAAGTGTACTGTAAAAAGTCATTGT
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GGTGTTAAAAAATTTGTTTATTATTACATATCTGATTATAATAGATTAAA
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TTTAATGATAAAGCAATCACTTATTCATACAAAATGAAAAAAACGTACTT
CGGATTGTTGTTTAGATATAAGGCGAGTTGGGCAAGTTAATGTAACTTAA
CTTAACTTAGATAAGTTTAGTTAATTAACTTTTAACTTAACTAATTATTT
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TTAACTTTAACTATACTTGATTAAGTTAATTAATTAAAGTTAAATTTTTA
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TAGTTCTCCGATTATTTAGTTAAATAGTGTCTCAACACTATCTGTTTTAT
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GCATTACTTTTTCACTTCCAAACAAAAGTTGTTGGGAGTTTGAATCTCTA
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ATTTATTTCTTATTATCTAAGAATAACAAATTGTAGATTTTTGAAGCCTC
AATTTTTTGTTCTTAAGATTATTAAAAAAAATCATCAAAGTCTTATATCC
TAATACAAGTATTCTAGGATTTTAATATATAACTATTAACTATATTAGTC
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GATCCCCAGGACCATTGTTTGGGTAATATGTTTTTTTACCGAGCACATCT
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CTTGATCCACGCACAAGCTTTCTTGCACCTCTGCAGACTCATTTCCTTCA
GAGTGCCCGTCAACAGGTGGTGTGGGGTCCTTGTGTAAAAGGATAACCGT
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GATCACAGCTTCCTTAAATGAGGAGTTCCAAAATTGCGAAAATTTGAGTT
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GTAGATAAAATTAAGTTTGTAGACATTTGTTTGGAAATTATTTTGCATAT
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GTATAATAARTTCYTATAATTGTATGCCCACTTGAAATATACTTATTATG
TTCTTTGACTAATTTTATAAAGATATATTTCATAACAAGTATATTTCTGC
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AATTCAAATTATTTGTTTCTTCTAAAAAGAGAACCACAACTCAAGATAAA
ATGCTGGAGGTACCCTTAGGAAGGGGTTAGTTTTCTTTTTCAGGGATATA
AGTATCTGGGAGAGGTACAGTGTTTGCTGATAGATTTGATTAATTGATAA
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TTAAGTATAAAAAATCTGAAATTCTACCGATGTTGAGTGCGACAAACCAA
CAAAGTTTGGAAAAGTGGTACTCAACTTTCTACGAATGGAAATGGAAGCT
CAATTTTAGAAGTAGAAATCAATGGAAAAAGTACTCAAATTGGAATTCAT
ATTTCAAGAACATGAGTAAAAATTATCATTGTTTGTTTTTCGTCACTTAG
TAATTTGTAAAGCTACGAAAAGAAAAAGTAAATTAATATGTNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATTTAAAACGACTTATACT
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TCCCTTTGGATCCCGTTCATGCTGTTGCTCTTGACCATGTTTAGTTTGTG
GTGTTAGAGGGGATCCTGGGATGTATTGGTTGAATTAGTGGTGTTTTTAA
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AGATACCTGTTTCTTGATTCATTCTCGTTGTAATGAAACTGTCAAATCAT
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MSTTATTTAATATTTATAAATATAGGATCCAGCCATTTAAAAGTGTTACA
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TATAAAAAATGTAATTTTAAGTTAAGAAGTGGAGGCATAATTTTTATATT
ATAGTGTAGCATTGAATGGTTGCAGCCCCCCCCCCCCCCAAATTTAAGCA
ATTTTTGTATTTTTTCCCTAAAATATTCAATTAAAAACTCAACCCCCCCC
CCATCCTTACCAATCCTTGATTGGATTGAATTTAATTAATTCATCATGAA
GTTTGAAAAATACGGGCAGTTTTACTAACTGTCAATTTTCTCTTGGGCAA
TCTTGCACGGGCAGTTTTCCTAATACCATCATCTCATTTTTTGGTTGCAA
CTTTTACAATTTTCTTATACAAATTACAACTTGTACACAACAACTAGATT
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AAAAATTAAAAAAACTAAACACCTGCATTGAATTCTCAATTTTTTTTTTT
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AGGGCCACATCGGAACCAATATAAGTCTCATAAATCAAATAAAGGTTCTA
AAACATAGCCACTCGAGTTAAGAACTAATTTTTAAAAGTAGAGTATCTCA
GCATATGTAGTATTTTATTCATCTGTCTGATGGATTTTTAACAAAGTTTT
GGATCGAGAATATAGGTCGAAGGAGTTATTCTTTGGTAAAGGTAATTTGA
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GAAAGTATACTTTTTATTTCAGAAATAGTTCCTATTTACTTATTATAATA
TGTGGTCCTAGGACTGATCCAACAACAACAACTGATTAGAGTCATTATAA
TGTAGTCTCGAACCGATCCAAAACTAATTAAAATACATAAATAGAAAGAG
TGTGTCATTCATATTAATAAAAAAAGTTGGAATTGCAAGAAATACATAAT
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TTCTTTTAATTAAAGAGAAGGCAAGAACGTGATTTGTGTAGTCTCAAAGA
CTCAAAGAAATTGACTCGTGGAAATTAGATAACTAAAGCTAAAGAGATCA
AACGCTCATTCTGTTACATAACGACTGAAAATACCATATTATTTTTGCAA
TTAATACACCCCCTCCTTTCCCGGTTACTCATATAAAAACCACGCCTGAG
ATGTCATCACATAAATAGATATAGTAACTTGTAACAACTACGCTGACAAG
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GAGCTGCCGTTACGGTCAATGGTGAGCTCTATCGGGCCATGTTGGAAGAT
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ACAAGATGGCGCTACGTGCCACMCAGCCAACGTTACAATGGATCTTTTGC
GCACTGTCATCGACAATCGCATCATAAGCCGAAACGGCAACGTCAACTGG
CCACCTCGTAGCTGAGATTTGACTCCATTAGACTATTTTTTGTGGGGAAC
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AACATGAAATTGGAGTCGCCATTGCAGCTATTGAAGCACACACAATCGAA
AATGTATTGAAAAATTGGGTCGACAGAATGGGCTATTGTAAGGCCAGCCA
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TATACTTATTTCTATTATTATTGTTTAAAATTGATGGATTGCGTTTAAAA
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TATTTTCTCCCTTATTGGCTGKKTCTGTCATATTTWCAACCAATAAGAAA
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GTGGATATGGGATTAATAGTTTATCTATGTATTTCAGGTCATGCCTAATA
AGTGCTGTGTTCCTAAGTGCTCCTCTGAATATGATGGAAACCCAGCCATA
GCAAGGTTATCGCTCCTTTCCTTTCCACTGGCGTGTTTCTTTGTCATTTG
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TTGCATCTTCTTTTCAAGCGACAACAGCCCGACTAGATGTAACCAACTTC
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ATTGTGGATAAAGAGTGCAATATGGAGCTAGTAATCCTAAAAAGATGATT
GACTTTGCACGGAATTACGAAGATCGTTGAAAGTTCAAAAGAATTTGTAC
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GTCACTCTCTCTAAAAGAAGGTACTTGACAGAGGAGTCATTATTGATTGA
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ATATACATGAATTTACATGTAATTATAATATTTTATTTCTACTAATGTTA
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AATAAGATAAGTAGAGATGTGAAAATTGTAAAAATCATCGTCAGCATACA
TTTAAAAAAGGTATACGTTGGTTGGTAATCTGTAAGATACTGGTGTGTGC
GTCTAAAACTGAGCACTCCTTTAAATTTTATGCCATGCACATATTCGTGA
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TAATAAACAAAACTCCCGTAAAATCTAAATAGCAACAGTGAAACAMCAGC
CGATAATATGGAGAGACGTCGAGTCGCAATTTTGGAACTTTCCGTGCGGG
TGTAAAATGAATATGACCCCTTAAAAGTAGCTTGCAGTAATTTACATCAC
TAATTTTTATACCCAAGAAATGTGGTGAGCAGAGTGGAAAACAAAAGTTA
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ATGTAAGTCTGGCATTAGTCTAGGAACTGTCTTTTTATTGCTATTTACCT
TTTTACCTTCTTTTTAGGCTTATAAGGCTTTAATATTTATGGATGCACAT
TCATTCAATGTATCTTGGAAAATGTCACCAGAGTCTCATTCAGTGTCTAC
ATTTACAAGTTATAGCCAATTAGTTTTAATACAATCTCAAGGAGAACAAG
CTCCAAACTTGTAACCTGTTGTGGTAAGAAACATCATTTTTTATGATTAA
TTCAACTTGGCGAAGGGTCTTCTAACGTCAATGTTCAAAATATTATTGAA
CGGATAAATTTGAAGATGAGAATGATCTAATGGACTTCAAATTGCCATCA
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TTCTACAAACATGATATTTCCTCCATTAAGAGTTTGAATGAAAATAACTT
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TTTTTTCTCATTATAACAATGTTTAATGAGAGCCTGCGTAGTAGTATATT
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GTAGAGTTCAATTGCCTGCTTCCATTTTATTCAATTGTACTTCAAGAACA
CTGGCTTTTTCTAGATTCTTCAACTTCATGTTCAAGGGATCTTGCCACTT
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TGTGAAGATGACTTTGCATATAATGATGGATGAGTAGAATATGTCATGCC
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GCTAATGGTATAAACTAGTTCACAATATCTTTTTTAGAATTCAGGCTTTC
TTTAAAATTACTAAGTAAGTCATTTTNNNNNNNNNNNNNAAATTTTTATT
TCTTTTCTTTGTCCATTAATTTTTTTAATTTATATATATAGATCCTGTAA
ATCTGAATTATTTCATTTGTCAGTATCATATTTTTAATCTTTTTCTGTAT
TTTTCTTTTATTTTACATTTTAATGAACATTCTTATAAGTGGTTTTTATT
TAATCTTTATAGAAATAATTCATGTCAAATTAATATGATATGTAGTTGAG
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ATGTAAAATATGCATATTCTTAATTTTACGATGATTCAATTTATTAATTT
GTTCTTACATGTATAGGGCAGATCTTTTTGTAAACATGAGTAAAATCCTT
ACTCATGTTACTACTGAAATGAACTTTAATCAGCTGCTCATTTTTTTCTT
GGTTTGGCGTCTAGCCAGAAGGGGTTGGCGTAAATTAAAGAAAATGAAAT
ACTTATTCCACAATTGTGGAAAAGCAGAACGTCCTTGTTGCGATTGGAGG
CGGACCAAACAGTGTTGAGATTGGAAAAAATTTAAACCTAGAAATTTCAT
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CTCKCATCAAAYAAATTATTGGCGCGGTCGTCCAATTTTTTTTTTTTTTT
TTTAAATTTAGTGTTTAGCTTCCAAACTCACCGGACCTCAAAGCCATTGA
CTTATTTATGTAGTTAAGCAACACATCCCCATATCCTCGTGCAACACAAA
ATCCAAGTTGATGTACAGGACACAGAAAATTCAGGAATCTCCCATGGGGA
CTGCATGATGACCTGCTCCTGTTAAAGGTAAAGTACGAGGCAATTACAAT
GAATAAAAAAATATTGGGGATTCAGTTTTCATTTGGCAATGTTTTTCATT
CAAGTCAGAGGATTAGTTAAGGAGAAAGTTAAAAAACAAAAAGTCGTGAT
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ATGGTATATAAACTATATTGCTCTTTACGTTTTTCCAAGTACATATAACA
TGTAAGAACAAGCTTGTTTTTTCAACTTGTCTGAGCGCATTTTTAAGCCT
ATTAAGGAAAACAGGCTGTTATACACCCCAAAGTTGATAAAACTGCTTCT
TTATCCTTATAATCGAAATTTTATTGCCAATTCTTCTCAATAAGGTCCTA
AAAAATTACTTCTGATTATATGCAATGATTTATTTATCTTGATAATGCTT
CTCTTAAAATTTATTCGTATCTTTAGCAATTTTTAATGGAGGTTTAGTGA
ACTGTTTTGTTTTAATCCCTTTGTACTGAACGTTCTATTTATAACGTTTT
ATTGAACTGTGTAAAAAAACAAAAAACAAATATAGCGTATTTAATCAAAT
GATAAACAGTTAAACGATTGGTATATTAACATTATTTGATCCATAAATTT
TTATGTTTCATTATTCCATCATTTTGCACTCCTAAAAAATATCAATTTAA
ATGCTAAAAATACATCTATAAATATAAAAATCCTTATTTTAGAAACAATC
TTTAGAACATGAGCTAATAATATAATTTGTTGTTCTTTTGGGTAATAAAA
ATATTAAACTTATATTTTTGATAAATATTTCTATTTAATAATCATTACTT
TATCCGAATTTTGGGCATTAGTATCCAAAAGTTTTGGGCGTATTATAAAA
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TCTTATATTGAAAAAAAGAGTCCAGGAAATTAAAAGGTTAGTTAGATTCT
CTGAACCTCGATTAAAAATTGCGAAATATAAAGATAAATCCTAAACAAGG
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GCTATAAAATGAGGATTCAATGGAAGAATAAATATTTTTATAAATCTTGA
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ATTAACATTTTTTTTCTAACATTCATACTTATTAGAATAAAAAAAGTTTT
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CCATTTTTTGGAAAAAATTGTTTAAAATCCATAGCTATTCATAAAAATCA
AATAAAATTTATAATATTCAAATTTTTGAAAAAAAATAATTAAATATTAC
ATTTTATAGTAAAAAACAAAAATTCCTTAATTTGGGGGGCTACAGACCCC
TCAGTCTACACTTTGAAGACGCCCCTGAGTTATGCACCTCTTGTAAAATT
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GGAGTTAAATAATGCCGATATCAAAAAAAAAAATATAGTATAAATAAAAG
GATCTACAACATTACTTTTAATTATAATCCAGACAAAAAGATGGAATAAT
TGTAACATAGTTGGAATTTTCATACGTTTTAAGATTTATTCATCGTTATG
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ATATATCTCCTTCTCCTAGGGATAATCCACACTTCTTAGGGGTTCTCCAA
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AAGAGTAATGTTTTTATTTCGTAAGGTGTATCCCGCGATAGATTTAAATA
CTTTATACAGAGATATGTGAAGATAGTCAGTTCGGATAGACTATAATGAT
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GGAATTCAAAAGTATACATTTCTAGAGACCAACTCAAAAATATAAATATG
GAGGGGCGTAGGTTAGTAGACAACTGACCCAGAATAAATCAACGTACGTC
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