EMLSAT00000012335, EMLSAT00000012335-708182 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012335
Unique NameEMLSAT00000012335-708182
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s8supercontigLSalAtl2s8:1774326..1798104 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012335 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012335EMLSAG00000012335-695101Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000055356EMLSAE00000055356-764284Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055357EMLSAE00000055357-764285Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055358EMLSAE00000055358-764286Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055359EMLSAE00000055359-764287Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055360EMLSAE00000055360-764288Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055361EMLSAE00000055361-764289Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055362EMLSAE00000055362-764290Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055363EMLSAE00000055363-764291Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055364EMLSAE00000055364-764292Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780877auto780877Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012335EMLSAP00000012335Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012335

>EMLSAP00000012335 ID=EMLSAP00000012335|Name=EMLSAP00000012335|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=301bp
GAFSQVRLAEQREEPSKLYAVKIIDKKALKGKEDSLENEIKVLRRLDHPN
VVKLLEAYESKSSVYLVMELLHHPNIVELLEVHEERHKVYLVMELVTGGE
LFDRIVEKGSYTEKDAADLIKQVLSAVAYMHTEGVVHRDLKPENLLYHST
DEDSKIMISDFGLSKMEDSGEFEFDSPYWDDISDEAKAFIRQLMCVDVDK
RLSCSEALEHAWITGAKNDKDIHASVSEQLKKNFAKSRWRQAYNAIAVSR
QMKKMVLNSGATTTDNKDNSPGPEKSAAEEFFRRPKRMLNFYFKSKVNGK
R
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mRNA from alignment at LSalAtl2s8:1774326..1798104-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012335-708182 ID=EMLSAT00000012335-708182|Name=EMLSAT00000012335|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23779bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s8:1774326..1798104- (Lepeophtheirus salmonis)
GGAGCCTTTTCTCAGGTTCGATTGGCGGAACAACGTGAAGAACCATCAAA ACTTTATGCCGTCAAAATCATCGACAAAAAGGCCTTAAAAGGAAAGGAAG ACTCCTTGGAAAATGAAATTAAAGTACTGAGACGGTAAGTCATCGTTCTA TTTCTTTGTCACATTTATACATAAGTAATAATGATCAAATAATAATTATT CATTTGGATCCTACTCCAAAGGACGATTTCAATGGTCTCCGATGTGAAAT ATCCAGTTTCTTGTTTTCTTGTACTTGGTACTTCTACACATGTCCATTAG AAATAAATAGACATTGTTCATCGTTTGTTTTGTTTGCCTTTTCATTAACT TTTGTGAACAAAATTCCGCTAACTAATCCTTTAGAATGTGTGGTACGGGA AAAAACCATCTCGGATCTCTTCAAAAAAATAAATAAAAAGTTTTCTTTCT ACAGTAAATAAACCAACAGTTTAGATCTGCCACCTGATTCAAATATTGTC CTATTAAGTCGAGTTGCTTAGATCTTTTTCTCTGCAGTTTTTTTCTTACA CAATTTTTGAAAAAACAATTCTAAGGCAAATGTGAATATACTTAAAAATA GATTTATTTTGTGCAAACTTAAATGTTAATTTCAAATATATTTTATAACT ACTTATGTATACTTAACATAAGATTGTTCAGTCCTACAAAATTTAATATT AATGTTCTATATTTTCAAAGATTTTTATTTGAATTTGAATAGCGGCACGT TTTACATCTTTTCAGGTATTAAATGAGTCATTTTATGAATAAGTTATTCT TCTATAAAGAAAGGCCTAATATATTGTATTGTTGTAGTAATATTGATTAA ATTGCTTCTTTTTTTATGTAAGCAATCAAACTAATGGTTTTTTTCTTATT GTTGACTTGTGAGGCACCCATTCATTTATTCGACCTTGATAAAATAATTC TCATTAAATCTTTTCTACTATATTAATCAATCATTTCATCTTTCATAGGA ATACAATCATTCCAACGTTTTTAAATGGGCTTTAACAGCTTTTTTTTATT GAAGGATGTGTCTTTTGAATCCAAATAAGCTTTGGATACCCACAAAAAAC TACGTGTTAGTGTACTCATGTAAGACTCTGAGGATTTGCTCAGGAGTTAT GAGTGAAAGTACTTGATGTACTCAAAAGTAGAATCGAAGATCAGAGTAAT TGTTCATTTTCTTTCTCCCTACACTCGTACTATCTTCTTATAGCAGATCT TGTCTGACTTATTATGTTGAATTTCGATTTTCTTTTTTTTACTTAGCGAA AATGCTTATGATTCACAACTCTACGTTTCTTCATCTCATATTTGTGGTAC TCCTAAAGGTACATACAACATATAATTGACCAGAAGAGGGTGTTGTTGTT TTTTAAAGGACGATTTTGTAAACAATAAAAGGAAGAAATGTCATTTAGCT TGACATTATTTCATATCATTTTCTGTTTTTTTTGTTTTTTTTCAAATAAG CAACAACCAAAAATACGAACTTTACTATTGACTATTGACAAATATATGTA TTTAAATGTGAACTTTAGAGCAAAAGTTCTCAAAAACAATGAATAAATTA TAATTAAAAACGAATTCAATTGTTATAAAAAGAAAGCTTTGTCAATTTAA TGAAATACATTTTAAACATTTGTGTGGGATATTTTACATAAAATATTGCG TTATGACATATGTTATTCTAAGTTGTTTGTTTCTTCTCTTTTTGTTACAG AAAAAAATTCAGAGGTCAATTATATGTTGCATTACCATTTTAAAGCCATA TTAAGTACTCACCACGATAGGGACTCACTGGAAAGGTTATTATCCATCCT TAACTAATCTATATCCTTATTTTCTTTTATAGACTTGATCACCCAAATGT AGTTAAGCTCTTAGAGGCTTATGAAAGCAAATCATCAGTATACTTAGTTA TGGAATTGTAAGTTGACATTTATATTTTCTTTTTTTCTTTTATTAATTAC AGGTTACATCATCCTAATATAGTTGAATTGCTTGAAGTACATGAAGAAAG ACATAAAGTTTATTTAGTAATGGAATTGTGAGTAGTAAAAAAAAAAAGAG AAATAGTTTTTTTTGGGAATGATCTCTTTTTTAAAATAAATAAAAACAAC ACCGTTTTTTAACTTATTTTTTTTTTCTGTTGCAAGTGTTTTTCCCTAAT TAGTTCAGTGTTTGAGTTGCTTTCTAAAATATTCATAATACATAAGTATT AAAACTATAATAACGTATATGTTTGTATTTCAAACACTTTTTCTTTTCGT TTTTTGCTTGGTTTGTTAAATAATAACATCATTTTATGACATGTTTTTTA TAATCCATTTGCTTTTTGTTTTTTACACTTAAAAAAAAAATATAGAGTAA TAATGTCTTTATGACTCAGAAGTGAGTATAAGGCAATCAAATTAATTTTA TTTTTTCAAAAGTCATGAATTATATAATTTACTCATTTGCTTTTTTTTCG TCATGCTTTTTTTTCAACAACCATTTAGTTGTTTTTTTGATATTTTCTAT GATAAAATAATGTTTTTTTTTAAATCAAAGTCGTTAGTGAAAGAACAACA AGAAGAGCTCATTAATTTATCTTTATGTATATATTTTTGTGCAAAAAGAT TGTAACCTAAATTATTATATATACCGTGTGGTCCCTTGAAATCTAAAAAC TTACTAACTCAATAAATAATTAGGGTTGAGTAATTGAAATAAATTCATAT TTCGATTTATTAAAGGATAAAAAATTAGTTACAAAATAAAATAGACCTGA GCTCTTTAGCTTACGTACAAGTCAATAAAATTACACTTGAACGTGATGGA 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TTACATTTAAGATGTAGTCAACTCAGTAATAGCAATGTATGTTAGTGCCT GAAATGTGCTTTAGTTTTCTGTTTTAGTTTTTATTTTTTTATTTTTTTCT GTCAATGTGTTTTTAATTTAATATATAATAATAATAATAATTTATAAAGT GCTTTTTGAAGGACACTCATAGAGAGAGGGAAGAGTTTTTGAAGGAGGCC AATTTGTAGGCATAAAGGAAAGAAGAAGTACATCTATGATGGGGGGGGGG GGGTCTATTTAKAWACCATTTACTTCGAAGAACAAATACTTTTTTGAGTA CACATCCTCACAATGAAAATTGGACATTTATGTGCATTATAGGTATGAGC CAATTGAGTTGATGGACACTAAATTATAGGGGTTTTTAATCCCTACATTG TGTTTATGATTTGTCAAATAGAGGAAATATGTTTAGGGACCCATAATATT GGCTAYTGTTGTTTRGGMCCKTATTTWGGACCGCAGTCCAGTCTAATCCC ACTTGTCGGTCCTTGAAGAAGGTAAAATTGATCCCTCGTGACGTTAATGA GGGTGTTTTTCCAATATAATATGTTCGCAATATATTTTATTATAATGAGA TATGTGCTGTAATCTTAATACATATTTAATATATCTTATTTGGCTTGATA AATCATAGATATTTTATGAGAAATTCCAAGGACTGACAGTTAAGGACCGG TCTCAAAGTCTGACGGTCCTAAGGACCAATAGGGCCTGTCCAAAGACTGG ACTGGACCGAATAAATAAGGATCGACACAACACTAGTGCCGGTAACACTT AACTATGCCGGTAGGTACATATTTATCGTCCCTTTGTCAAAGTTTAAATT AAATTCTTATTTTATAGGAATTTATAAAATCACTTGATTTAATTTAATAT CATAGTCTTTCAGCTTTCGAATGATATATCACATGTTCTAATTGTATTAA AAATGTCCAATCAAAGACATCAAACCCAACAGATAGTTGATTTGATCAAA TTGGAAGATTTTTAACATTTTAAAAGTAAGTATCAGGACTGTCCAGCTGA TTCAAACACGCATGGCTTAKAAGAAAGGTGGRTAGCCATTCGAAACCCGC AGATACACCTCATACAAATGTCTAGGGGCCATCAAAAAGGATCCAATAAT GTCCATGTGTTAGAATGCAAAGAAACATGGAAATTTCGAGGACAACAATT TCATGACAGTTTAAGGAGCTTGGTTTGAGGTCGTTTGTATGGGTCCAAAA ACGAAAACGGTCTAACGATACAAATCAAATAATATCATTTTTAAAAGATA TGAACAAAAATATATTTACAATTGACCAGGTCTACAAGAGGATTAGTGAC AGATATATAACCACATGTGATGTTGCTGTTCTATATTGGATAYAACATTG AAKCAAAGTCAAGATTTTTAGGTTTATTTCTCGGGCAGCCCTGTTTGGCC GATTGACTACCATCAAATCAAGTATCCGTTGTCTTTGTATTGATTGAACT GACAACGTTACTCCAATTGGAAAATGTGACTTTTCATTCCAAAGCTGAAA GGCTCAGAAATAAAATTGTACCCCTTGCTTTTATAAATAAACGTTGAATT GAAGCTTTAAAAAAATCACAATAAGTATGTTCCACCCAGTAAAACGCCAT AGTTTATTTCTCAATAACATCAAATTTGCATAATCCTGTGTATTTTTTTG AAATAAAGATATTTTTGACTATTGGTGAACAATGCCCCTATGATAAAAAG ATGAATGTAAATAATATTTACATTTAAACAAAGGAAGGTGATTCCTTCTC CCAGTGAGCTTTACCTGGGATGAGTAATCTCACAACAAACTTTCGAAAGG TAAATTTTGTAAAGGTGAGCTTTCCTAGAGTCCATTACTAAACCTATTCC 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AACTGTGGAATAATTATTGCTCAATAATTGGGTAAGAATTGTTCAGAGGA ACTGAACATTAGATGATTCAACCAATCTGTGTTCAAAACACGGATTGGAG GAAAAGGAGTATGCACATCAACAGTTGGCAAGAGAATACTGATGCATATT TTTGTGTTAAATGCACGGATAATTTGCAGGGGGTCTGCAGAATCATAATT TTAGTTTTTGCAATGGTTTTTGGATTTTTTTTTAATTTAAAATTTTTATG GAAAAAAAATTGAAATATTAAATTGTAAAAAAATATTCATATATTAAATT TAAAAAAATAAATTGAAATATTAAGTTTTTGAAAAAATGTATCAAAAATT CACAGCTATTCACAAAAGATTTCGAAAATCCACAACTATTTACAAAAAAT TTGAAAAAATAAATTTCAAATAATAAATTTTTTGGAAAAAAATTTCAAAA TCCGTAGCTTTTCTCAAAAATTAACACTGAGAGAAAAAAAAAATCCAAAA TCCAAGCATAATGACAAACAATTAATTTTTTGGAAAAAAAAATCCAAAAT TCTTAGCCATTCTCAAAAACTTCCTGAAACTTATTGAAAAAAGAAACTCC GACATTCACAACTATTGACTAAAAAATTTAATATTAAATTGTCGGGAATT TTTTAATAATTTATAGCTATCTCTAGAAAAATTAAACTAATTAAAAAAAA AATTTGTGGAGAAAAATTTCAGAAATTATATTTCTATTATTAAATTTTTT AGTAAAAAAGGAGAAATTCCTTAATTTAGGGGGGGGGGAGGGGMATAGCT CCTATAGCCCATCTTCTGCAGACACCCTAGAAATATTAGCTACTTTTTGA GGAATTTATATTCTTCTTTATATCGTAAAAAAGAAAGGATTTGAAACGCT TATAAAATAATATGTAAGTGATCTTCTTACATCTTTAGTTTATATATATT 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CCTGTTTTTACTGAAACAAAACCTCCCCTACCCTCTGTCTTTCTATATCT CCCTCCTTCTGTCTATGTTTTCCTTCTTCTCTTCTCCCTCTGTTTCTTTC TACAATGCTCTCTCTGCCTCTTCCCTTCTACCTTCATTCTTTGTTTCTAT TCAGCACTTCCATGCAGGTACCCCCTTCTAGTATCTACTATAATATAATA TTATAGATATTAGATACATACTTTACTTATAAAAGAAAAGCTGTTCAGAA TTTTGAATTACATACATAAGGCCATTATGATCAGACCAGATTCATGGATT CTGGAGGCTAAGTTTGTTTTTTAGATTAAAGTTGATTTTGTTCATTAAAA AAAACAACATTGATTCCCTGTGTCTCATTTTATTTATTTTGTGAACAAGA CATACTACACTTTTTTGGCCTTGTGGACCGGTGCAAAGTCTTGTAGGAAG GTGTCATTTCTTCTTTAGGCTATCCAGGAGTGAACATAAATTAAAAGTGC AAAACCAGTACAATGGCAATATGCACGAGGTCGCCCGGGCCAAAGATTCC GGCGCCATGTGGTCTAAGTTATAAAGAAAAAAGGATCTCATAAATAATAA CACACTTTCCAACAAAATCACACTTTTTTTATGCACAAGCACAGCATATG CTCAACTTAGTACAGTTTGATCCCTGATTCCAAATATGGCCTTATTTTTT CACTCATGGCATCGTGGCCTTCAAAAAAAGACATATGTTTTTTTGTTTTT TTTGGCTATTTTTAAGGTTCAAAGCTGTTTTAAGCCCTCGGTGTTGAAGA AAGGGATATATTATGTTAATAAATTTTAAAGCTAAATACTCTCTATATCG TTGTCAATTTGAGATAAGACCACGACAATATTTCAAGGGAAAAACTTATT TTTGAATTGATCTCTTAATAAAAGTTTTATTTTTCTCTCTCTTTGTTCCT ATCTCTTTTCTTCTTCCCCTGTCTTTAGTTCTATCTCTTCAAGCTGGGGA ATACAAATACTTATGCACTTTTATTATGAGATCAATTCAAAAATGAGTTT TTCCCATGAAATATCGTCCTGGTCTTATCTCAAATTGACAACGATATAGA GCATTTTTTGGAGAGGCTCTTTTTTTTTTTTCAATTAAAGTTCATACTAT TAGCTATCTACTGCAATACTTTTAAACTTTTTTGAATCTATTTGTCTTGA AGCTATGAGTCCCTGAATAAAAAACACCTNAAACTTTTTTGAATCTATTT GTTCTTGAAGCTATGAGTCCCTGAATAAAAAACACCTATTTTCAACTTTA AACAAATATAACTTGAGTTGTAAGCATGATGCAGACATTTTAAAAATAGT CTTAGAATTTTGTACCATTCGGCTTTAAAATATATTAATAGGAATTATTC CTGTACTCAATAATGAGGGCTTAAAACTGCTTTGAACCTTAAAAATAACA AAACATTGTATGGCCTCTTTCTGAAGGCCACAAGGCTATGAGTTAAAAAA TAAGGACATATTTGGAATCAGGGATCAAACTGTACTAGGTTGAGCATTTG CTGTTTTTGTGCCATTTTTGCTGTTGGACAGTGTAATTGAATGTAATAAT AAAAATGTAGTTCGTTCGTTATAAGCTCTTAAAGATTTACCCAATTTATC TGGACCATCCTATATATGTACATAATATCTTTCTTAGAGATTTGCATATT TAATATTTTTTAAGTTACTTTATTTTTATAATTTACTTGATATATTTATT CCATCCTAACTAATTGGACTATTTTATTTCAATCTCTTGCTACATATTTA AATTGTATATGTAGTAGACTTAGACTATTGTTAAATATTTTACAACTTTT TTTCTTTTTCATTTAGGTGAATTTGAATTTGATTCGCCTTATTGGGATGA 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