EMLSAT00000012971, EMLSAT00000012971-708818 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012971
Unique NameEMLSAT00000012971-708818
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s98supercontigLSalAtl2s98:1296021..1320554 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012971 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012971EMLSAG00000012971-695737Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000058277EMLSAE00000058277-767205Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058278EMLSAE00000058278-767206Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058279EMLSAE00000058279-767207Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058280EMLSAE00000058280-767208Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058281EMLSAE00000058281-767209Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058282EMLSAE00000058282-767210Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780604auto780604Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012971EMLSAP00000012971Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012971

>EMLSAP00000012971 ID=EMLSAP00000012971|Name=EMLSAP00000012971|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=413bp
MMADARRSQSSSNSMAWDPILRDFGQLKIQNMDLKDKPFNGGYNIHEIPP
TENGDPLTVEVSVSLRNILEIDEHKQLLTIETTLRLYWVDERLSVKHLLE
NSSMDYILLHPKVAKLIWFPDIYIDFAKDLRIPTYMTPPASLRIYRNSTI
RYATHPFVNFIGVYPGVIMKIILKRNINYHLLQTYLPSGIFVFVAWLSLF
LPPQSIPGRITMAMTTLLTLAAMFGAVRQSTPRVSYVSALDIWMCTCIIF
VFFALLEYVIMLSLMTKCGKLKKKRSSKEKEEEEDQSSTFLRRPHPCEAP
SATQGINKVFYSVESPCHLVMNKQEPKVVTKKRGFSGLCHKKRRVSSLKG
RMSDSPNSSNSNNINSNVDMNITPFIKFERSCSFIMAVLFISFNGFYWSW
LLKEPKGEPQFQN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s98:1296021..1320554-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012971-708818 ID=EMLSAT00000012971-708818|Name=EMLSAT00000012971|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=24534bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s98:1296021..1320554- (Lepeophtheirus salmonis)
TTTCGTATTTCTTGGTGTCAAATTGGGATTGAGGATCTCATGATGGCTGA TGCACGACGTTCACAATCTTCTTCCAATTCTATGGCATGGGATCCTATAC TAAGAGATTTTGGACAATTGAAAATCCAAAACATGGACCTCAAGGATAAA CCATTCAATGGAGGATATAATATCCACGAAATCCCTCCAACAGAGAATGG TGAGGATTTAAATTAATTTTGTTGTGGCAATCAGTGCAAAAATTATAAAA ACAGGATCAAAGTTATTTAGAAATTTGTTAAATTGCTAAGATTTTCTTTA TCTTTAAGAGACTTATTGATCTGTTTTAAGATTATTTTAACGACTTTGAA GAGGAGATCAATTCAAAGGGGGAAAAAAAAGAGTGTTTGACAAAGGGTAA ATCAGGATTGTCAGTTAAAATTTTCTTTATATAGAAGGGTTGTCAATCCT AGACATATTTAAGTGGCCAAATATATTTGTTGTTGGCGACATAAACGATG TTTTATATTATGTAGACATGTTATCATTATTCTTGAGGATTTAACCTCGC AGTATAAAGTGCATTGCCACATGAATGGATGAGAGGTACATGGAGGATTT GTTTGGGGAGTTATACACTCTGTCAAAAAAGTTTGGGTATTTAAAACCAT TAATAATGACAGTATGTTTTTTTAAGAAACTAAAATGAAAATAGTATATC CTTTCAAAACTACAATGTATCCTCCCTTTGACTTTTTGACCTTACAGCTC TTCAAGTAAATGATTAATACTTAATTCTTGCAAAAAGAATGCTAATCCCT GTGACTGAACAGAAACATTGATACAAATAAAATATCACATAAACTTATAA AGTGTGTCAAAACATGCTTCAAAAATATAAGACTAAATTGAGTAATTCAT ACAATGCATTTGAGAGATATATATATTTTTTAAATGACAAAAACACAGGG 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AGCTTCTGAATCCTGTATTTCTGTAGAAAACATTGCCTAATTTATATTGT CAATCAAAAAACAAAAAATCTGTAAAATAATAAAATTAAACTAATATGAA TGGAAAGGAGAGGGAGTCTGTATTGTTTTTCAAGTTAATTCTAAACCTTT TTTTATGGTCTGGGATATATTATTGAAGAGAAATAATTGAGAAAAAAAAG AGATTTTGATGGATAAACCATTATTAATATATATCACCACACACACACAC AAATAAAAAAATAGAGGCTTATATCTAGAGTTAGTTGTAAAAAGTATCAC ATTAGACGAATGCAAAACATTTGATAGTTCCAATCTGAAAAGGGTCTTTT ATTTTGCATAAATTATATCATAAATTATTCTTTTATTCTTCAGTAGGGAA CTGATATATTGGGAGTGATATCATGAATAGTGGAGAGTAATATTAAGGAT TGATGTAGGAGCTCAAAGGCTAAGTACTTGTTGGACTCGGAGTAGAATTG AGGATTGACAATCATAGTTATTCATGCCTTCAATCCTTACAAAATTCGGG TGGGATGTCTGTTGATTTCCTTCCCCTCATTGATAAATGCAGTTAATTGA ATAAAAACACATAAGAGTTAAGATGTTATTCTCCTTTATGTACCGGGTGC GCCAAAAAAATCTTTAAACTTTCAATTTAGAACTTTATCATGATGTATTT CAGCAACAAGTTATAATAGAGTATGTAAATAAAATAAAAATAACTAGCAT GATGTCTTGGCTTTTCCTTAATCATCGATCGTACCCCCCCCCCCCTTGGC AGCAAATGATGGCTTCCAGACGGCCTTAAAGTCCTTAGAAATCAGTAGTC TATTTGTCCGTTCCGAACTTATACGCGTATATTTACAAAATTTCGATAGA TGTGGGAATCCGCCTTTATATTTTGCAATATATATATGTAATGATTAAAT 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ATATTTGGGTTTTTAATTATCTTCTAGAATAAATTAGGTGGTTTTACATT CAATTTAAATAGACAAATATAAATTATAAATAACATTATCTATTTGATTT AAATTATTTGACAGACAAAAATATGGACTATMCACCATCAGCCTTTTGTG TCCAAATACGTTCCCCTCGCCGATGTGTCCGTGGAACGGACAGGTTCTTA CTAGTTTTTTTATACAAATTAATACATGCAAAGCAACGTAATTGGTTGAA TGAAAAAGTACTGAGGTTTAAAAGTGTTCCTTTTNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNGTTTTAATATCARCCGCACATTACAGTTTTTTGGTCCTTAT GAACAAATTTAGTTTGAGTTAAGGACTATCAAAATTTAATTGTAAATGGT AGGAAGGATACAACCCCCTCCCCCCTCAGGTACATAGAATTTTTGTAGGA TAAGTGTGGGACCTCAAGAAAGATTAAAAACCATCGCCGCAACTTTAAAA GAAATTCCCTAAATAATCGCCTAAGCTTTAAGTCAATAGGTTTTGTATTA TAAACTTGGATCCACGAGGAAGATTATATAAACTAACACCGTTGCTTCAA GAACCATAGATTTCCTCATTTCCCAATCCATTTTACAATGGCAGTTTCAA CAGCTGCTATCTACTCGTATAACTTTTCTACAGATGGGGAAAAAATTGTA CGGATCCTTAGACGGGGTCATAGAGAATATACATAAGTAGAGGAACTACT CTCCTGTTGACCACCCTATCAAAGAACAATATATGAAAAATTGTTGKCCT GCCTCGACTTGTTGGGGCAAGAGAAACTATTTTAAAACTACGCACTTTAA TAATCTATTGAGTCATAGAGCTTCCTACAGGAGTTTGGAAGCATTTCAAA 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CTTGGAAATATGTATTGGTACTACAGGCGTTCCTTGGACGAATTGGCTCT GGTTTTCAGCAATCTCGGGCCAATCTGAGGGTGGAGAGTATTCAACCATA TTTTAATAGGACCTAAGCTATTTATAACCCCCCCTCCTTCTTAACAATTC TCTCAATCCATTTCTTAGACGATTGGATTGCATTTAATGAAATTGTATTA CAATAATATTACTCACACTTAAAGGTTCTCCTTTGGGAGATGGAACAAAC AAATATGTTTAGATATTTGTATACTAAGCGAATTTATAATGGGTTATTAT TCATCATGAAGTTTGAACAAAATTCCGGCAATTTCTCCCAGGGTAGTTTT CTTATGACTACTCTAAGACTACTGCTCCAATTTGACGAATAATAAGTTGA CATATTCAACAATGCTTTATTACTCATAATATTTATTAATGTATAATGAT ATTTATTGATTCTACATTCACTTTAGGTGACCCACTGACTGTTGAAGTTT CCGTCTCTCTCAGAAATATCTTGGAAATCGACGAACATAAGCAATTGTTA ACCATAGAAACAACTTTAAGACTATATTGGGTAGATGAAAGACTCAGTGT AAAGCATTTGCTAGAAAATTCATCCATGGACTACATTCTTCTCCATCCCA AAGTTGCAAAACTCATTTGGTTCCCTGATATCTACATTGACTTTGCAAAG GATCTGCGAATTCCAACCTATATGACTCCCCCTGCTTCGCTTCGAATTTA TCGTAACTCTACCATCAGATATGCAACACAGTGAGTAAATCAATAATTGT ATTTTAGCAGTGCCGTAAGAACCATTGGGACATAGGGGCCCTACAGAGTG CAGAGCCATAAGCATCTTTAAATCCCGCGAAATAAACAATGATAATCTTC CTATTTAAACATAACTCATATTAATTTTTATTTACGAGTATAATGCTAAC 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