EMLSAT00000013052, EMLSAT00000013052-708899 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000013052
Unique NameEMLSAT00000013052-708899
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s9supercontigLSalAtl2s9:472417..505110 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000013052 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000013052EMLSAG00000013052-695818Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000058657EMLSAE00000058657-767585Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058658EMLSAE00000058658-767586Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058659EMLSAE00000058659-767587Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058660EMLSAE00000058660-767588Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058661EMLSAE00000058661-767589Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777980auto777980Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000013052EMLSAP00000013052Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000013052

>EMLSAP00000013052 ID=EMLSAP00000013052|Name=EMLSAP00000013052|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=435bp
TLEIAKAATIKQFFTLLFLSLCSSFYEANVLFRSLPLGCFFFLVSVARVV
VCVCFCLSVSFFPSVYERVPFFFRVEENREQAKQTIRGYLHDPDMGSDNF
CLRWNDFESNVSSSFRELREENDLFDVTLVTDSEKEFKAHKVILSACSSF
FKGILRRMGSPSPLIXLRGIGSSDLAAIXDFMYNGEVNVAQEELNSFLSG
LTQKPASSENVSQGGEDGEMPRKMGSKSKLLSSQSSSGAPSSPSSSKKFR
RIAPKSSEDGGGGGGVKELIDVKSEPTIASIAEASGADYDDGGDVSGSYD
DAYADESAYFDETGMMGLDDMPHDASQDSSKGGVSVFKQHCKEERDDIDE
LDRIILSQMTKVDRFWSCDTCGLQSRDKTDMRRHVEARHIDTNGFPCDQC
SYVSKTRYNLVKHVRRKHLIKGEDETSSSLTSFLP
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mRNA from alignment at LSalAtl2s9:472417..505110-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000013052-708899 ID=EMLSAT00000013052-708899|Name=EMLSAT00000013052|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=32694bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s9:472417..505110- (Lepeophtheirus salmonis)
ACGCTGGAAATAGCCAAAGCTGCCACAATTAAACAGTTTTTTACTTTATT ATTCCTTTCACTCTGTTCCTCCTTTTATGAGGCCAACGTATTATTTAGAT CCCTCCCCCTGGGCTGTTTTTTCTTTTTGGTGAGTGTTGCTAGAGTTGTT GTATGTGTCTGCTTCTGTTTGTCTGTATCGTTCTTTCCCTCTGTGTACGT ATGCGGTATGTAGCCTCCCTCCCTCCCTCTCTTTTTTTTTCTCTCTCTCT TTTCCCTCCTCTTGTTCTCTTTTCTTCTTTTTCTAACCTCTTCTTCTCTC TTTCTTCCCCCCCTCTTTGTTCCAGGAGCGCGTCCCCTTCTTCTTCAGAG TTGAAGAAAACAGAGAACAGGCAAAACAGACAATCCGCGGATATCTTCAC GATCCAGGTGAGTACTTTTTCCCACATATTGAGAAGGGATCCATTCATCA TTAAATTATTTAATTTTTAGACATGGGGTCGGATAACTTTTGTCTAAGAT GGAACGATTTTGAATCCAACGTATCTAGTAGCTTCCGTGAACTACGAGAG GAAAATGATCTTTTTGATGTTACTTTGGTCACGGACTCTGAGAAGGAGTT TAAGGCCCATAAAGTGATCCTTTCTGCTTGCTCTTCCTTTTTCAAGGGGA TATTGAGACGAATGGGGAGTCCAAGTCCCTTAATTTKCCTCAGAGGTATC GGCTCTTCTGATTTAGCCGCTATTTTMGACTTTATGTATAATGGCGAAGT CAACGTGGCACAGGAAGAGCTCAACTCCTTTCTCTCTGTGGCTGAAGATC TGCGTATCAAGGCATGGACACATTCATTCATTCATTAGAAATCCTCTTAA TACACTACTTCACTTAGTCATTACCAATTGCTTTTTTTTCTTACTCATTC TCCACGTTGAGGCCTTGATTTGTGGACGAAGAGGATTTCTAATAATGTGT ATTATTTTGTTTGTCTCTAAAGGGTTTAACTCAGAAACCCGCCTCATCCG AAAATGTGTCTCAAGGCGGAGAGGACGGCGAGATGCCCCGTAAAATGGGC TCCAAATCCAAGTTACTGTCCTCTCAATCATCCAGTGGTGCCCCCTCTTC TCCTTCATCTTCCAAAAAATTCCGTCGTATCGCTCCTAAGTCGAGCGAAG ACGGAGGAGGTGGAGGAGGAGTKAAAGAGTTAATTGATGTAAAATCCGAG CCGACTATTGCATCCATTGCAGAAGCGTCTGGAGCCGATTATGATGACGG TGGAGACGTATCAGGTTCCTACGACGATGCATATGCCGACGAATCCGCGT ATTTCGATGAAACTGGAATGATGGGATTAGATGACATGCCCCATGATGCC TCACAAGATAGTTCCAAAGGTAGGAAAGACTTCCTCTTCTTCAAATCCAA TTTCATTTCTATTTTCCTTATTATTTTATACAAAAAAAATATTGTAGTAA CCCTCCCCCTACCTCTCCTCATAAAATCCAGTCTCTCTGATATGTTTACT ACCCAAGAATGGGCTTTTCATTCAGAATGTTGTACACCTATGATGTTGAT TTCATTTAACATATAATGGGCTTTTTAATTATGATATGATAGGATTCAAT TTGAATGGTGGAGTGATCATATTACTATAACACGATATAATTTCCCCTTT CTCTCTGGCCATTGAGATGATAATATGATATAAGAACCCATTTGGTACTT ATTATTTTCGCCTCCTGCTATTTATTTCTCTTTTTTAAATGAGACAGGAG CAGCTTTAATAAAAGTAAATGTAAAAACCTACAACTGTTTTCCAATGTGT AATATTTATCTTCATATTTGAATACCGTTCTAATTTGACTTACTTTAATT GAGCTCTATGGTAGTACGCACAACATATCGTCATCATCATCACCACCTTA TATTAATTAGAAAATACTGTAGAAATAGATGATGAGGGGGATGCATCGGT GTTCTACAATTAAATTAAATTTATTTGGTGATTTGTAAATCCATTACTAT TGTTAACTGACTTTTGGTTGATGAAGATAATTTTTGTGTAAACATGAAGA GAGTTAGGATATATTTTTTTAATTTTATATATTTATGTTGAACATGTATT TTTATGTTCAGTAGTTTTTTTATATCAATATAAAGTTCTCTTACTATGGG AGGGGAAATGTGTGTTTTAAGTAACCGCGTCGTCGCGTTTTGTTAAGAAG AGAGGCTGTTGAGAAAGCAGGACTTTTTAGAGCACACGTAGTTTTAAATA TGATGAAGCAATAAAAATAATTTTATTTTTTGTCTTGGATGGTTGTAGAG TAGCACCATTTGTTCATATACATATATATATGTCGTTTACAAGTTACAAT TTCTACGTGTCCATTTACAAAATAGGTCATTTTAATTACCGACAGCTATT CCTCGATGCTATCGTTTCATATTGATCTATTCAAATTACTATAGGGATTT TTAACTAATGTGTCATAGAAAAGTATTATCAATTTTTAATGTTAATTAAG AAGTTCAAAGTTATATCATTACTATGGTATATATTTAATTGCAATTTACT CATCATAAGTAGGATTCTAATGTTTTGAGTAGTTATAACTTGTACTAGTT GCATCCCATTAAAGAGAATATTAATGACTTAAAGTACTTGTATGAGGACA GTACTATAATTGAATACTCGAAGGATGGTCGATGAAAATTATTAATTGAT ACGTATTATGTGACTCATAAAAGTTATAAAATCCCTATGGTAATTTTGAA TAGATTTTTGAAAAAAAAAAAAGGCATTAATGTACATATAATTATTGGTA ATTAAACTGACGGATTCTCTAATTAAATAGAGCGTAATGAGACGTGGAAA 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TAATGGATCCCAATTTTTAATTATTTACAAATCTAGTCATCTTATAGGGA TTTTTAGGACCTATTTCTTTGATTTAATTCAAATATTCCTCTTTATAATT AGCATTAAGCAGTATTCAATGCAGGTATTAAGTTTCTTTTATTCTTAAAG CTATTTAATGAAGTTTCATGAAAGGTTGTCGGAAATTTGTCCAATTTATG TAGTACAAATGCCAATTATGAAACCCCAACATGGCGTCTTCTACAATTAG GATATACTTTATCACATCAGTGAAAACGCTCTATAGATTTGAACACTTAA CATTTTTGCATTTTTATGTGCAATTATTTTATTTTTAGTATACTCATGTG AAGAACTGATCATTTATTTCTGGTGCTTATAAAAACAGAACAGGGTTGGA TTAATGTACATAAATATATTTATAAAATGAAGTTTTACATCATCAGTGAA TAAAGTGAACAGCTTATTTAATGGTGTAGGGGGTTAGGAAGGCGCGTTTC TCTTAGTATTCGAGTTAAATTAGTATTGATAAAGTCTGTTSATTTTTGTA GATCAATATGTCCGTCGATTGAAAAACGGAGCTGGTGGAATTTGCCTAGT TTGTTGTAAAAAATTTAGCAAAATGGGTAATGCCCTTCGTCACTACGAGA TACGTCATTCCAACTTTTCTCAATGCCTCTCCTGTTCTGTTTGTGACAAG AAGACAAAAAATCAGATTTCTTTGGATCAACATATGAGGATTAATCACGG AGTTTACAAAAGAGAAATTGTCGGATCTGTACAGTTCCCACATAACAGAC CCTGATTATTTTTCTGTTGTATTTTAATTTTATAACCATGATAAAATATT CAAATATATTGATAGAAATTTGGTTTATTGTTGGATATACTTAACTCTAA TCTATTTTTTAGTTTAACAGCTGAAAAGTATTCAAATATTTTTGATTCAA 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