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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s9 | supercontig | LSalAtl2s9:472417..505110 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000013052 >EMLSAP00000013052 ID=EMLSAP00000013052|Name=EMLSAP00000013052|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=435bp
TLEIAKAATIKQFFTLLFLSLCSSFYEANVLFRSLPLGCFFFLVSVARVV VCVCFCLSVSFFPSVYERVPFFFRVEENREQAKQTIRGYLHDPDMGSDNF CLRWNDFESNVSSSFRELREENDLFDVTLVTDSEKEFKAHKVILSACSSF FKGILRRMGSPSPLIXLRGIGSSDLAAIXDFMYNGEVNVAQEELNSFLSG LTQKPASSENVSQGGEDGEMPRKMGSKSKLLSSQSSSGAPSSPSSSKKFR RIAPKSSEDGGGGGGVKELIDVKSEPTIASIAEASGADYDDGGDVSGSYD DAYADESAYFDETGMMGLDDMPHDASQDSSKGGVSVFKQHCKEERDDIDE LDRIILSQMTKVDRFWSCDTCGLQSRDKTDMRRHVEARHIDTNGFPCDQC SYVSKTRYNLVKHVRRKHLIKGEDETSSSLTSFLP back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s9:472417..505110- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000013052-708899 ID=EMLSAT00000013052-708899|Name=EMLSAT00000013052|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=32694bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s9:472417..505110- (Lepeophtheirus salmonis) ACGCTGGAAATAGCCAAAGCTGCCACAATTAAACAGTTTTTTACTTTATT
ATTCCTTTCACTCTGTTCCTCCTTTTATGAGGCCAACGTATTATTTAGAT
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ATGCGGTATGTAGCCTCCCTCCCTCCCTCTCTTTTTTTTTCTCTCTCTCT
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TTTCTTCCCCCCCTCTTTGTTCCAGGAGCGCGTCCCCTTCTTCTTCAGAG
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GAAAATGATCTTTTTGATGTTACTTTGGTCACGGACTCTGAGAAGGAGTT
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TATTGAGACGAATGGGGAGTCCAAGTCCCTTAATTTKCCTCAGAGGTATC
GGCTCTTCTGATTTAGCCGCTATTTTMGACTTTATGTATAATGGCGAAGT
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TACACTACTTCACTTAGTCATTACCAATTGCTTTTTTTTCTTACTCATTC
TCCACGTTGAGGCCTTGATTTGTGGACGAAGAGGATTTCTAATAATGTGT
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ATTATTTTCGCCTCCTGCTATTTATTTCTCTTTTTTAAATGAGACAGGAG
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ATTAAGCAAATTAAGTTGCTTGTAGAGAGCGTTCAGTATTTCTTTCCTTT
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AAGACAAAAAATCAGATTTCTTTGGATCAACATATGAGGATTAATCACGG
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TTAAGTAAGTTTGTTTCTAGAAACAGAATTGTATATTTGTCTTGAAATTG
GTGGTGAGGTAACGGGTCGGGATTCTTCTTCCAGTCCTAACACGATCTTA
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CTATATGAAACGTTGTCTTTTTATTAATTGATAATGACTTGCACATTCCA
ATTTATAATTAGGCTGTGTTGTTTTTAATGAAAGGTTCGATGACGGTATA
TTACAGCTTTTACCATTGTTTGTTTGTTTGTTTGATTGATTAGTTGTTTT
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AGACTCTCATCATGATTTGAAAAGTCATTTTTTGTTTTGCTTTTTTTTTC
AGAGTCTATAAATACGAATAAGGATTTAAGTATAGGAAAGCTTAAGGACA
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AGCACCGCTAGGCGACATGCGAGAAGAATACATTACAATCATAAATGTGA
AATATGCTTTAAGAGGTTCATGACCTCCCATTTACTAGAAGAACATCGCT
ATCGATGCTCTCTTCAATACTCATTTTACAATTTTAATAACAATTAATAC
ATACATGTATAATATTTGTGATTTTTTTAAATTTATTATGATTATTTTGA
GAGCTGTGGCATAAGGAATTGATTATGAGTAAAACACATTTATTTTAGTA
TTTTTTTACGATATCTTAGTGATAGATTGATTTTGTATTTCTTTTAGAGC
GCGTGTGCGCGCTCTCTCTCTTGTATCTCAAAAAGTTGCTACATTTTTTT
AATTGATAAGTGTGATCAAAATGTCTCAACAAATAAACTTATAAATTTAC
CTCAATTAGTAGTGGTAGTAAGATAATTCTGATAACTATTTTTAGTATGT
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CTTCTCATCTATATGCTATACCATAGTTTACTGTTGCCGTAGTTAGTAGG
TAGTAGGACTTGACTATTCCGTAGTGGGAGAGATAAGACCATTCCATGAG
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ATTTCGTTATTTGTGCCATTTATACCATATCTTATTTTCAATAAATACAC
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AAAAAGAATAAACCACTTTTCAGTATTTACTCTCTGTATTATGGCTCATG
CTGTATGTGTTATCATTTATTATTACATCAATCCATAGGGAAGTAAATAC
ATAAGAGGAGCCGACAAGGGTTGCTCAGGAATTACTTATGGACTATGTAG
TTCGTGGGATGCTCAATGGGGACGGCATACTTGTTTTTGAATAATATTGA
GTCATTTCAATTTGAATACAACCATTTGTTTATGTATATCAAAAAGTCCT
GACAGTTGATGTATATCGAATCGTTTGATCTTGACCTTATTTTTAACTAT
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TATCTTTTTTTAAGCGTGTTACCCCACTTTATGTAGATTGTCATTTTTAG
TATTAGTTTTGTGTATATATTGCAATGTTGGATCTGGGTAAATAGTGAAT
TTTATTACTATATAGGGTCTTGAAATAAAAGTCTGTAATATAGCGAAACT
TGGACTAAACAGAGTATTATTAATATATTGACTGAATCTATTGGCGCAGC
TGGCATAATGTTTTGTATCACCTGCCGCCCAATTATGCCGAATCTACAAT
GAAAACCCTCCTTATGTTTTTCTTTCTCTATGGATTACTCTATTGAGACT
GTAGATAAGTGGTTAGACTCTACTAACGAATATATATCCCCCCAATAGGA
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TTCTCTATAAAAAGAAAACTAGCTCTTCTTACTTGGTGTGTTTATTGATC
TTATTGTCGATTTTATGTATATTTAGACACAAATATAAAATAATGCTATA
GGGAACCAGCTGTTTAGTTTATTTATGCATTTTTAACTTCAACTCTAACC
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GATAATATGTTACTTTTCCTCGTTCTTTTGAATTSCAGCCACAATATTGA
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TTGATTGAAGCTTTATATTCCTGTTTTCAGGCTATGTTCGGAGACTACGA
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TGGCAGTGCAACCAGACATTTTCGGCTAGTACATTCGAAAGCTAGAAATA
ACTACAGATGTACAATTTGTGGGAAGGCGTTTGTTTGCAAATTATATCTC
AATGGTCATTTAAGAACTGCTCATCAGATATATCAAAGAGAACTTCTTTC
TGAGCCTACAGAGGATGTAATTAGCGAGGAAGTAACAACTAATTCTATTT
AATCTGAACTTTCTTTCTGTTAACAATTTTGTGATTGAGCTTTGTTGAGT
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AATATTATATAATTGAAAGAAATAAAGTAATTATTTGTATTTTTTAATTG
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GTGTACTACTCTAAATAGGAGGAGAGTGCTGATTTTCACTTACTATTTCG
CTCTTATTTTAATTTGCCTGCAATGATTTAACTGCTTTAATATGATTGAN
TTAAATCATAAATATTATATTTTAATATATTAGAATGCATTTTAAACTAG
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ATGAACTTTTCCATGAATGAATTATGAAAAGGAAGTCTGTACCATTATGA
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CTATTACATCGCAAAGAAGACTATACTTTTCCATAATTATCCTACTTTTC
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TTATTTTATAGTCACTTTTATAATTAATTAATTATTGATCCTTTGTCATG
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TAGAGTGTTTTCATTTAACATCAGAATTGAGGATGTCGACCATCTTGGGG
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TACTGGCACTTTGCCTTGAGCTGTTATTTTTCACATTTCATAATGTTTCC
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GAAAACGCYTTTAACTACATAACATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TAATCCTTCGATCCATATTTATACATCTTGAAACTATTTATAGGACATTT
TTAACCAATATTTATTCTTACTTAAAATAGCAAAATGTATTCCCAGGTTA
AGAAAACCCTTGGCTTAACAGATCCCTGATTATTGCTCTTAAGACTCGAG
GATGGATATCCTATTACCACAAATTATTTTATTTGATCCATACACATAAG
TATTATATTTTTACTTAATGGTAATTGAGTAATACCCTCTTAATCTTTTG
ATAGCTCCTTTGGAGGGATTGCAAAAATTACCTATAATAACTTTAAATAT
ATATATATATATATTAGAAAGTATAAATCGCTGTAAAATGAAGGCTCTCT
GAACTATAGGTAATCTCAACTTAATTATTATGTCAGTCATTTTAATTTTT
TGAAGTCAATTAAATACACATCGTTTTCTTCTCTTTGTTCACGTTTGGTT
TTATGTTGACGTACCACACATATGCATATGGTTTTGGGTGTAAATAACAG
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TGACAATCGAGGGAAATGCTTAGTTTGTGGAAAAGTGTTCAGTAGATATG
ACTACTGTCGTCGTCACTACAATAGTGTACATAATACTGAGACCAAAGGA
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GGCTCATAAAAGAAATTGTCATTTTTTAAAGGAGGGGGGATTTTGAATTG
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ATAAGACGTAGATCATTAGCCTTTTTTTTTATATGTCGCTATCCTTCATT
ATAATATTACTATTAGTAAAAGAAGTTTCAAATATATACCTACTATGTTT
TCAATGATGGTTGAAGTCCTTTATTTGATGAGGGTTCATAGTAGGGTGTA
TATAATTAATTAATGAGTGTATATCATGACTTTAAATGTTGTGAGTTGTT
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ATTGTGTTTTATTACTACTTGCATTACGCTATATAAAAATTGCACCGCCG
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AGTTTGCAACTTGTACATCACAGGGAAGCCGTTTATATATCCCATTCATC
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ATTTTTGGACGAATAATTATCGTCAATTTCCATTTACAAATTACAAAAAG
CATTGTTTAAGTAGCAAAGGTTCATCATCACAATCACAGAATTAGATAGA
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AAGTCTACTCAATAGTTCTTAACATTCTTCTCCTCATCCCAGAAATTTGG
ATAGAAACGTATGAAATATTGATATTGCTTGAAATGTTCTTGATTTTCAT
TGGAGATTATTTTTGTATTTTTGCATTTTGTACATTTTGAATGAGGAGAA
GGAAGGGATATTAGAAATATTTAGCCCCAGATTAGAGGGAGAGTCATTTT
GGTTCTTAATTTCATTTTGTTAGATAATGTTGAGAGGAGGACGACTTTTT
AAAAAAAGTGCCAATGTATTTTTAATGTGCTTCTATAATTGTTTTTAATT
AATTAAATGTGGAGGGGGGGCGGGGGGAAGTAATAAGGAACTGCTCTTTT
TCTCTGTTATCACATATTCTCGCTACAACTAAATCGTAAAAAAAAAAAAT
ATCTTTACAACTAATAAAAATAACTATTATACATAATATGTAAATTTTCT
TGATGTTGTTGTTAAGAGAAAAAGTCTAGTTTTTCTGTGTTTATTTTTAG
GTAAGTATCTAAAACTTCCTGGCAATAGAGGAAAGTGCTTAGTGTGCATG
AAGATCTTCACTAGATATCATTATTGTAAGCGACATTACGAGATTGTGCA
CTGTAATGATTCGCAGTCAGTGATATGTGATATATGCTGCATGCCTTATA
AAAATATTGAGTCTCTAAACTCCCATAGAAGAACCTGCCACCAAATATTC
AAGTTCAAATACTGATTAATGATTCATTATCTATTATTACTACATCATAT
TACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTWTTTAATTTTTTMTAAAGCGCTC
TGTAGACTGAAATTAAATAATTATGATAATTTATAGTTTTTGTTCCCATG
GGTTTTGGAATAATGAGAAATAAAACACCTTTAAAAACCACACCTCATAA
TGTACTGTATTATATTTTAACCAATTTTTTTTTTATTTCTTTTTTCTATC
ATGATGATTTTGTTATTTTTCACTTTATACTTTGATGCTCCAGTGCGCTA
GGTGCCTATGCCATAAAACCAGTTGATTGTTCTTTTTAAATACATATTTT
GTCACCTTGCATTTATGATGATGATAATGATTAAAATGTCCAAACATATA
CTACCACTACACATACTTAATTAATTATTATTGTACAAAAACAGCAAAAA
TAAGCTCCCAATAATGTCCAAATCGACAAATTAAGGGAAATAACTGAAAA
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ATTAGTCATGTAGTAATATGTATCTTACTATTAAGAGAGATATAGTTAAG
ATAAATCCATCTTAGTTAATATAAGAGTCTTCCCCGGATCCCTAGCGATT
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ACTTAACATCATTGTATAGCTGCTAAATTATCAATGAAAACCCTTTTCTC
TTTCCTTTCTTCGTCTCATTGCTAATCGGAATCGAATAAAGTACTAATAT
ATAAATATAATGCCCATTATAAAAATATAAAAAGACCATTTGACAAATTT
GAATTACAATTATTAAGGATTTATTCATTTGACGTAAATTGAATATGGGT
TTGATTAGTGCATTCAAATAAGGGACACGGGATTGGTGGTTATATTCCTT
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ACTCTCCTCTCGATGTAATGAATCAATAAAATGATCTTTTTGACATCCGA
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AAAAAGAATGCCTTTTTATTATATAAGTATATATATATATATATTATACA
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AAAAGAAAAAAAAATAATAATTATACTTTTAAAAAAATCGAAAAAAAAAC
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