EMLSAT00000000327, EMLSAT00000000327-696174 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000327
Unique NameEMLSAT00000000327-696174
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s104supercontigLSalAtl2s104:349309..365036 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000327 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000327EMLSAG00000000327-683093Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000001529EMLSAE00000001529-710457Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001530EMLSAE00000001530-710458Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001531EMLSAE00000001531-710459Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001532EMLSAE00000001532-710460Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001533EMLSAE00000001533-710461Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001534EMLSAE00000001534-710462Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001535EMLSAE00000001535-710463Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776704auto776704Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000327EMLSAP00000000327Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000327

>EMLSAP00000000327 ID=EMLSAP00000000327|Name=EMLSAP00000000327|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=465bp
MNVISLRLKMIMLALYAFWSILLCPGIKGQLSFPDCGKYENIHSDSSGLL
QHNDGKIDHSLPWMALIAFTKFEMDISKRCGGVIISKKFIISAAHCFCSD
GDLPCARFRKKGGSEIVFRPLYKFQEVIRVYFQQSFENDIALLELQNPLL
ISPKINAICLPFGAGFPDTSSRGTVAGWGSDKKECITDEFGPSRFTPCKF
PFIYKGESFSQCLKTSPPSNEVCEVYGKRVLKGSSASRNEVAHILFKNET
LTHCYSFAVGDGGWXGTYKDCNAAVVTGDESWGWCSQDTCTSSLDTISPS
SLSYFLKKIELTIFDESKCSQLFNSSKSQPENDSLSSFNRKTQLCAGKLN
SKTKKKKIFDLVESIRDDGQKSASFVQKESKFETDVFIGGHESCLGDVGG
PLWRFMGIQEKRAFVVGIVSRGFGCSMIESPGVYTRVKEYIPWIVRNVKR
EENQEFQFGEFTRLK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s104:349309..365036-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000327-696174 ID=EMLSAT00000000327-696174|Name=EMLSAT00000000327|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15728bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s104:349309..365036- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGTAATAAAAAAGGCGTAAGCGGTGGGTGGTGTCTTGCTTTCAAATTA ATGTATTGAACTCCTTTTAAAAGAATGTAATCTCCCTAAGACTCAAGATG ATCATGTTAGCACTCTATGCCTTTTGGAGCATTTTACTATGGTTTGTATA TTTCAAATTGAATGAAATAAAAGTTTTCCAGAAAAACCCATTTCAAATTC CCTTCATTAAAAAATAAAATAAAAAGTGAAATATTATTTCCTCCTAGTCC CGGAATCAAAGGACAGTTATCCTTCCCAGACTGTGGAAAGTACGAAAATA TTCACAGCGACTCAAGTGGACTACTTCAACACAATGATGGGAAAATAGAC CATAGCCTCCCCTGGATGGCGCTCATTGCCTTTACAAAGTTTGAAATGGA TATTTCCAAGCGATGTGGTGGTAGTGTGGTCTCTCAAGGGCACAATTCCT CTCTCTCAACCTATCCTTTTTGTTGCAGGTGTCATCATTAGCAAAAAATT CATCATATCCGCAGCACACTGCTTTTGTAGCGATGGAGACCTTCCCTGTG CTCGCTTCCGCAAAAAGGGTGGTTCAGAAATCGTGTTTCGACCTCTCTAT AAATTCCAAGAAGTCATTCGAGTCTACGTAGGGGCGAATCAAATACAAAA TGAGAGTGTGTTTCTCCCTATACATGATGTTCTCATTCATCCAAGGGTAA GTAAGACCTAATTGCTAAGAGGGGGGGGGGGCCAGAAACACTTGCAACAT GGTCTTCTTCTATAACATAAAAAAGCTTGGCCCACAAAATGTACATCACA AATATCAAATATATGGCAGAACATTGTCGAAAAACCAAGAACTTTTACAA TTTTCCTTAAAGATCTTACATATAAATTTATTTTGAAAAGTGAAGAAACA ATAATTCAGTACTTAATTTCATTTCTTGTTGTTTTTTAATAACTTATATC CTTTCCATAATTGATTATTTGAATACAATTCAATCAAATTTTATCAAAAT TAAAGAAATCACTGTTTTAGTAGAAATTTGAGATACTGTTGAACTCATTA CAAAAGGGTTCTATGTAATAAGTCTTGCTATTTTCCTTGTATTTTTGATT CTATTATATATTTCTGCATCCCAGTATAAATGTTCTTTAGTCAAGGGAGA ACGATGAACAGGGATGTGAGAGCAAATCTATTTGTTCTATAACCCTTTTC ACTCACCGATAATTCATGTAGTGAATATGTATGTCCCCATCTTGCACGCT GTACTGTATTTTAATTGGAATAAAGTCAAATGAACTCTGACATAGTTGAC ATTAACGGGAGGTTTATTCTATATTTATCCAAAAACATGATTTGTGAACT TASCCGCCATTCGTGGCAATGAAAGCCTTCAAGTATTTCCAACCGATTAA GATGCAGCTCTGGGGTGGCCAAAAGTAAGTTAAAAAGTAATTAAGAAGAC TCTTAGAATGGATCATACAAATTTGTTGATAATTTTGAGGCAAGAATGGC CTTTCTTCAAACTTTTTCAACTCCTTCCAACCAGCCTTGACCACCTTTAT CACGGTAGATCAGTCCAGGCACATCTTTTTTTGTTTGAATTTGACCATAA ATGCAGCAGAGTTGGCTTCAAAAAGAGTGCTTAGCAGCTTCAGGGATGAT CTTGACTGGCTTACAGCTTCGAGAATGATCCTTAAAGCTGTATCCATCAT ACAGGAGGKTACACACATGGTAGATCATATTCTAACGATAACAACTCACC ATAAGTGTGCCCAACTTTATGCTTGTAACTCTCTACACCTCCCAAAAATA AAGTCTTATTCACTATCCTGTATTATGTAAATCTTATTATATTTTAAAAA CCGTTACTATGCAATAAACAACTTGAAAGAACCTAATTAAATGTTTGAAC AATATTCTTTAGTTTAGCTTTTTTAAATTGATTAAATTCTTTGTCAAGCG GTATTCAAATGTAATTTGTAAAAAAAAGTCTAGACTTGTATATAGGGCTA AATAGATACAAGAATAGGAAACAAATGTGTCTCGTTAACACAATTTTTCT CAAAATTAGAGTTGAATTACATTTTTATTCTCCGACCAATTATCATCAAT TTATGACAACAAATTATTTACATTTACCCTTTAAGCGTCTCGAAAATTGC AGTTAAAGGAGCAAAAATTGATGCTCATAATAAAAGAAGAAGAAATTGAC CTAATTTTATTTGAAAGACCATATTAGGTCTAATATATGGCTTTGTAATC AAATAAAGGTATTAAACTATAGCTAAAAATCTTGAGTTTCAAATATCATC CACGTAATTTGATTAATAAGCCTATATTGTTTCCAATATGTCTATGAAAT ATTGGGATTTTTCTTCAAGATTGTTTTTATGTTGAGACACCAAAAAAAAT GTCGCAAGTTTCTCCCCTACAATTTTTTATACTCACTATGTACAATGTAC AACACTATGCGTACGTCCACTGGACATAATTTGCGAGATATGAAAAGTAT CAAATTTCTATCATCATAAAACAGCTGTTTTTATGTCCTGATTGCTAAAT ATTCTTATGTATCTATGATGTACATATATGAGAGAGAATTTCATCCATAA CTTTGTATTAAGTATTTATTTATTAACTGAAAGATATGTGCATATATTAA AGAAATTAGGGGACGGGATGCGACGTACATATACTATCTCTTTATGCTAG ATGAATAAATACCTAAAAAAATATTAGCTCCTTCCAACATTTCTTCATAT TTATGTATCTTTAGTATAATAGAATATAAAAAAGTCATAATATATATTAT ATCTATTTATTAAATATAATAATCGAACAATGGATAATATTTTTTTTTAT 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ATTTTTCTATTTATATGCTTCCTGAATTTTTCACTTTACAAAAAAAAAAA AAAAGAATCTARAAATGTTTTATGTTTAGATAAAACTAAGGAGCTTGTCT ACTTTTTTTTTTAAATAACAAAATACAAAAAACAACAACAACAACATAAG TTTCGTTGAAATTTTTTATAGCTTTTCCACAATGTATTATACTAGCCCAT CAATCCTTTGATTTAGGAGATATCATGAATCAAAAGTTAAAGAAATCTTT AAAAACTTTGAACTCAATTTGGATTAAGTTACAGATACAAAATTTCGCTT TTGTGTTTGTCATACTAAATTTGATTGAAATCCGTTTCCAAATGGAATGC CTTAAATATATTTTTACGTTTCATTTGAATACCGAAATTATTTAATAATT AGGCAGGGTAAGGTCCTGAAAAGTATTAAGTGATCCTGCTATCACTCAGC ACGTATACTTAATTGTGTTTAAAATATTTTAAATCTCTGTATAACATTAA TCTGCTATCTACAAATGTTAACCATCTTATTAGCTATGTTGTGTTAAATT TTGTCGAGTCTAGCTCAAACCAGTCTTGAGCCATTTAGAAAAAAGTGTTA TACTGCTTCTATTCTCCCCTAACCTAACAAAAATGCTATGCTAAGCATCT ATATATTTAAATCTCTGTGAAATCTACATTAATAAATATCTATCAATAAA AACCTTTTTAAAATTTGTTACTGCACATAGATATAAAATCATAGTATTTT AATTTTAGTTTTTTTAATGTTTAAATCCCCTCACCTCCATTTTGTCATTC ATACTGTAAAAAATACATTTTAAAGGTTTGAACCTTTAGATTGTTGATCG TATATAAATACATATGTAGTAAGTTTGTATAAAAACAATCTTGAAAAGGC TATTACATCAAATATATATAAAAGGCCGTGTTCAATAATAAGCCTTTGTA TAAAAACAATCTTGAAAAGGCTATTACATCAAATATATATAAAGGGCCGT GTTTCAATTATATGCCTTGTAATCAAATTTCTGGGACAAGTTTTGATACC CAAGGTTGTTGGCTATAGTTGAGTTACTTTATTTGATATTAAAGACGTAA TTTGGTTCCAAAATAACCCCTTTGTGACATAATTATATCAATTTCTATTC ATTATATCGTGACGATGAGTTTTTGACACTTTAAGTGGTGCAATTTGCAG CGCCTCCAAAGGAGTAATAAGTAGAATTTATTAATGGAAATGGAAAAATT TGTCAAATAGAGAAAATATGTAATCACCATTTAATTTCGAGAAAAATGAT TTTAGATTGCTTTTGTATTAATATAACACATATCCCCATGTTTCAATAAA CAGGATCATCAAGAAGGGGCGGATTGGAGGGGCTTGAGCTTCATCCCCAT AAATCAAGGAATTTTTGTCATTGTCAACTAAAAATTATAGCTTTGCAGAA AATATATTTGAAATGTGGAAACAAATATATATTTATGTTTTTTTAAGTTT TCATTCCTAAAAAAAGTTGACTTCGTCAAACTTAGACCCAAAATAAAGTC CTGCAGACCTCCTGATAAGTACCCGGTCTGACACATCTATGCTAGTAGTA TTGTTGACAGACTCAAGTAATTTCCAGTTAGTACCATTCTTCAAAGCGTC TCAAAATTTCAATGCAGTTGGTTTAATGGTACAATCATTTTAGTGACGAA TTGTCTTTTAATTTTAATTGGTTGATTAAAAGCAGTTTTTTGATGGGAAA TCATACTGTTCAAGCCTAAGCGTGGCTTATAAGCATTATGTAAACTTTTC ATCCAGAAAATCACCTATTCTGGACTAGTATGTTGAATTTAAACGCACCA TCGTACAAGCACCGATGATTCTTAAATCTCTTGTCTACTCAAAATCGGCA 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TAATAGTTATCATCATTATATAAATTACATTCAAAACTGTATCAAAATAT GAATCAATGACACAGTATGAAATGGCACGAATTTGAAACGAAGGCCATTG ATTGATATAAATTAATATGAACATTTTATGACGCAAAGAGTCAACATTGA AAAACTAATGAAAGTAGATGCAAGGGAAATAGATCACATCCTTGTTTATT TCAAAAAGCAGGCCGTGTGATGGTCGAGATTAATTTATAATGGCGTAACT TGATGATGTCCTTGATAACATCGTTTAGTAAAAAGCGTTTTACTTGACGA CTTTTAAGTCCAATCTGGACGTGTTTTTAAGATTTAGGACTGAACGGGAT GCCGAAATGTAGGAATGCATACATTTGTCACTTTTATAGTATCAAATTTT ACATCCATTATGAAATATTAGAAGGAAAAAAACTCCTGAAATGACGGGAT TGGATTTTACTTAACTTAGGACACAGTTAGAGCGGTCAACAATAAATTGT TGTCCTACTCCCAAAGTTAAGTCTGTTTTTCAATTGATCAGTCAATAATA TAATCAATATTTATTTTAAAATACATTCAACTTTTTATTGTATCCAATAT TGCAGATATCATGTACATAACAATGCAGAAAAAATGGCAATTAAAATATT CAATTGTTTCACAAAGTCTGTTTGTATAATCTGCGTTTTTTAAATCAGAT TTACGCCATGATTCGAAGACTGGGATAGATCGATTAAATAAGTATTGGCT AAACCCTATTTACATAACCTGTAGAATATTTTTTTGATCAATCTATAAAG CTGAAAAAATGGCCTTTGATTAGGAGTAGAGGTCTTAAAAAACTCTTTAT AGGTCGATTATTTGACTAATTATAAATAAGTAGTTAATAGCTTATAAGCA AAGGGATGAACACCAAATTAAATATGCCTCATGTATAATCTAATGATTTA 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GTATTCAAATTGTAGGAAGATATTATGTATAGGGGCTTGAAAAAATTAAA TGTGGAGTTGACTATTGAGTACATCCCAAACAAGTTTTTCTTTTGTTGAT TCATAATTTAAATTGAATACATTCGTACATGGTATAAAAGAAAAATAAAA ACTTCTAAAAGTAATTAAAAAATGATAAATTTCAATCTTACTGCATCGCA AATAAAATAATATAAAGAGTATAAAAACGAATGTATACTACGATTTGGGA AGGGAAAGTAAATGTAATTTATTCAAATATATAAATTCCCCATACATAAA AACCCTTCCTTTTCTGCATTAATATCTTATATTTCCACTCTTACAGTTCC AACAAAGCTTTGAGAACGACATTGCTCTTCTAGAACTCCAGAATCCACTT CTCATCTCCCCAAAAATCAATGCCATTTGTCTCCCTTTTGGTGCTGGATT CCCTGACACATCATCTCGAGGAACTGTCGCAGGATGGGGCTCTGACAAAA AGGAGTGTATCACAGATGAATTTGGCCCTTCACGCTTTACTCCTTGTAAA TTCCCCTTTATCTACAAAGGAGAAAGCTTCTCTCAATGTTTGAAAACTTC TCCTCCAAGTAATGAGGTATGTGAGGTCTATGGGAAACGGGTTTTGAAGG GCTCTTCGGCAAGTCGAAATGAAGTCGCACATATTCTCTTTAAAAATGAA ACCTTGACGCATTGTTATAGCTTTGCGGTAGGAGACGGTGGATGGKGTGG GACTTGTCGGCTGRGKAAGKGCAATTCGGGGTTTCCTGCTTAAAGCTTTC AAATTCTATTGTTTAATTTTATATAGATAAGGACTGCAATGCAGCAGTGG TCACAGGTAATCACTTCATTTGTCTGATTTGATGATTTTTTAATAGAAAA TGCGACCTATAGGTGATGAGAGCTGGGGTTGGTGCTCACAAGACACTTGC ACAAGTTCATTGGACACGATCTCCCCATCATCTCTCTCCTACTTCCTCAA GAAAATAGAGTTAACCATCTTTGATGAATCAAAATGCTCTCAACTCTTCA ACTCATCAAAAAGCCAACCAGAGAATGACTCCCTATCCTCCTTCAACCGC AAAACTCAACTCTGTGCCGGGAAGCTTAACTCCAAAACAAAGAAAAAGAA AATATTCGATTTGGTGGAGTCCATCCGCGATGACGGGCAAAAATCCGCCT CCTTTGTACAAAAGGAATCCAAATTTGAAACGGATGTCTTCATTGGTGGA CATGAGTCCTGTCTTGGAGACGTGGGAGGACCTCTTTGGAGATTCATGGG TATACAGGAAAAAAGGGCATTTGTGGTGGGGATTGTGAGTCGTGGATTTG GATGCTCCATGATTGAATCACCAGGGGTTTACACAAGAGTTAAAGAATAT ATTCCATGGATCGTTAGAAATGTCAAAAGAGAGGAAAATCAGGAATTTCA GTTTGGAGAATTTACACGATTAAAATAA
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