|
|
Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s292 | supercontig | LSalAtl2s292:581184..588551 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005436 >EMLSAP00000005436 ID=EMLSAP00000005436|Name=EMLSAP00000005436|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=352bp
MENIYXAMGDAGSFLTKAVQDSHITDEANTMLTRAKQFTEEKLGKAERTE
NDPFYELLSKQTDVTKGYSEKIIRDTEAVLIPNPAARLETFMFENVPVDK
IGITNTRLSNLEYLGTDMIEAGNEFGAETPYGSALIRVGQTEKSLGEIER
EYIRGGHTGLIAPLQNFLDDDMKNIIRSRKVLENKRLDLDASKNKVRKCR
GMTIQTQKDGIDPRALLEQAESELRTAQRDYDMQVELTKKLMEGLSVVQT
HHLRYLQDFVEAQCKYYAGCHQTMQELQGELNGTMTIIPGQTASLFQSSN
ASNNSNNPNEKSNNNNNSVLESNGPEGLQQINLSSPPPPPSAPVSRGQAD
FF back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s292:581184..588551+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005436-701283 ID=EMLSAT00000005436-701283|Name=EMLSAT00000005436|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7368bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s292:581184..588551+ (Lepeophtheirus salmonis)
CAACGATGTCTATAATATACTTGCTTATATATAACTCCTTTTAGTCTCAT
TCCCCTTCGCATTCTTCTTGTTTCTCTCAGTCGTACTGGATTCCTGGTAT
TAAATAGTTTCTGTTTTCAACCTCGTCAAGACGCAACACATGGTTTAAAA
TGACATTTCAATTTCGAAACGAAAAAATATCATTTATTTTCGAGCAGTTA
AAGCTAGCAACTCAACCCTATAACCCGAGAAGATATTTCCTCAGAAACTT
TGGCAACAGCTTTTATCGAGCACAAAATTTCACCTCCTTATTATAAAAAA
ACTATTTACTTCTCCTATAGGTTGCAGCACTGTGTCGTTCTCGAACAATT
CGTTCTTTTGAACGACTCTTTTTAGTGGACCAAGTAATACTAAAAACAAC
TGGAAGTACATACGTCTTAAAATTGTACTCACTTTTTTTCCACACGATGA
GGCTGACACATTCTTCCTTTGTTTTATAATAATGGAAAACGTGGTTTACA
AAAGTTTATTAATTTGTTTTGTTATTATTTAATTAATAATGATGAACAAG
TCTTCTGCTACTGGATGCAAGCAATGCTGTGACGAGAATACTAAGGATCC
AGATGAGAGCTTTCACAAGTTCCCCATGAAAGACTACAAAAGCCTAACAA
AATGGCTTAGGGCCATGCCAAGAGATAAGATTGACTAGATAACAACAGCG
AATTCAACACATTTCAGTCTGTATTATAAACTGATGGATTTTAGCACTGT
AGATAAATCCCACAAGAGAGGAAAATCCCTCCATAAAAGGTAAGCAATGC
CCACCAATGCTATGAATATTGTTTGTGAATCTCTAAGATGGCTCTTCATA
TTCAATAAATAAGTATTAATTACTTATTCTAAATAGTAAATACTAAATAT
AATTAAAGAAAAGAGTAAAGATCCAATATTCAGAGATGTATTTGAGTCCA
CCTTTTTCAATGTTTAGGTGAAGTCCGAGTCTTCGTCCTCGGGATCTTTA
CGTTGCCAAGTCATCATACTGTAGGTTTTTTGGGTTCAAAGTACATGTCC
TCATGCTCCGAGTCCATGGAGAAATAAGTAAAGACTGGATCTACCTGTAG
TCTCGTCTAAGGCAAGATATCATTTCCCACAAGATCTTCCTTAATCTTTG
ACAACACTAATTTACTTTATTGACTTTGTTATGGCGTAGTCAGTATTAAA
AAGAATAATGATGACAGTTTTGGTAAAAAAAAAATATATTAAGTGGGGGG
AGGGGGGAGCACTCTCTCAGAATCAGGTAACAACTGCAAAAAGGCGGACT
CTCTTTTTAAATAACATTTTTGCAACTCTAACAATGATTGATTGTTAGAG
TAGGGGACTTTGCAGTCGTTGTCATTGATCACTCATTAATAATGACTAAT
GCATCATTAATCCTTATTAATGAGTGACCATCTAAACTGTTTAAAAAAAG
AACTGATTCACCAAAAGAACGAATCATCAAAAGAACAGATTTACTAAAAG
GGCATCTTGTAATATCTAAAAATACGGCTGKGCAGGKGRAGKGATGAGCC
CCAAAGGKAGTTTAAACTCCATCGCCGTTGCGTTATATTTTATAGAAATG
GAAATGTGTATGAATTACATCTAACATTTAGGAAGACATGCTATAAAATA
AACATAAGTTTCTACTTTTAAATTTGATATAATTTTTATTTATTTTTTTA
ATCAAACTTTTGTAATATCCATCACAATTATACATTTAAACAATTTGAGT
TGTCTTTTTTTGGGGGTTTTGATGAGGACGATGGAATTGTTTTTGACGTC
CTACATAATATTGAATCCAATTCTTGGCAATAATAATTTTGTAATTAAAA
AGATAATATGATTTCAATATTTAGAGGAAATGGCAGTTTAATATTGAAAA
TTAATATTTTCCAAGCTTGAAGAAAAAACTTGATAAAAACTATGTGAAAT
AATGGATTAATATTGTAACCCTTGTTAACCATACAAAATTGTTTGGAAAG
TTATAATGATGATTATGATAAAAAATTCTTGTTGGACTAAGACTAGAGTT
GAGGATCGACTCCGAAGAAATTATTGGCAATGGTTTTACAATATGAATTG
TCTATTGATACAGAGTAGGAGTTGTGTTCCCTTTCTTTCCTCCCTTCTCA
GAGCTGTTTACAGCTAATCCAGTATGGGATCTAATAAAGAGGGGTGAAGT
ACGCCTCACTCTCTAAAATTGCTGTAGGGAAAGAAAAAATTATTTAGTTC
TTTGATTTTTTCCTTTTTTGAATACAGAATTTCCCACCAAAGAGAAGAGG
GGTTTTCAATTATACATTTATGATTTATTCGTTGTTATTGTAATAATAAA
AGTATAATTTAAGATAGAATGGTCAATAATTGCCAGAGGTAGGAATTGGA
CTCGAGTTGTAATTGAGTCTAAATTTTTTAGACGATATCACAATCAAAGA
CACGAGAAGACTTGACTTAGACTCCATAACTAAGTCTTGTGACTCGTCTT
GGATTCCAAAGCTAGTATATTGCGGACTCAGGAAAAGCGTTAACACTATG
AACCCTATATTATATTAATTGACTTGAAATGAGCTTGAATTATATCTGAG
GAATCGATGCAAATATTCAAGAACTTGGACATGACATGATATTTGAAGTG
GACTTACAGTATAAGGACGTCTTCCCTACTCAGATTAATGCTGTGTCGTA
AGCTGCAGGAGTGGAAAGGATTAGACGCCTACTATAATTCAAGTATGAAT
TCATAACATATAAAGATATAATTCCATCTATCTTTGTACCCAAAACACAC
TTTTTAATCTTACGAAAGGTGAAATACAAATTTCGCATCTTCTGAAGAAA
GATGCAGTAAATAATTGGAGTTATTAAATGAAAAAATTGACGCGTTTCAC
GCCTCCAATCAACTCAACAATTTGTCAGACATCCAATTAGGGTGGTTTTA
GAGCAAGAGCTTACTTTTTATCCTTATCAAAATCATAAGACCCTTACAGT
GTCAAAGTTTGTGTATTTTGTGAGTACTCTCATCACTATCAGCTTCTCAC
TCAATACCTAGAGGTTCTCTCATTAAGGATATGAAAAAATCGCGTGTTAA
TTTTTTTAGCATGATTTGATTAGCCAGAGAGTACTGCTGTTCGTTGCTGA
GCCTCAACTAAAGTCACATTAACTTTTTTAAATTTTATATAAAGTACTTC
CCGCTTTTTTTTTTCTTTTTTAATATGAGTTGAACTAAACTCCAGCGAGA
TTTAATTTCATTTTTTATAGTCCCTTTTTCCTTCTTGATACCATACTGGT
ATATGATATATCTCAGGGAGCACTATTTACAGTGCACTCTATGACTGTCT
TTCATACCGACATACAGTTAAACTTTGCCTTCCTAATATAGATAAAACAG
AGGTTTCATAGAAAAGCAACGAATCGGATGATTAATCTTGGAATATATAT
GCATGACTCATGAGTAAAGAGAGTAAATAAACTCTCCACATTTGTCTTTG
TCCTTATTACGTCAAATATATATTTATAGGTTTTATTTAAGTTTCGACTC
ATAATCGCCATGCAAAAAAAACACTTTGTTTAGTCATAGCTGACGAAATT
AACGCTGCTATCTCATTGTATAATTAGATTGGGGGTATATGTATTTGGAA
GRGAGGGGGGGGGGGATCAATACTTAAGCATTAAGAACTCATGCAATATA
GAAAATATTATATGCACCGGGAGATTTGATGGATTAGAAATGCATGTCAT
GAGATTCGCCTACACCTCTCTAATTAAGTATTTTTTGAGAAGCACTCAGT
GCCACCTTTTTTTAACGAAGAAGGAAGATTATTTATAAAAACGAAAACCA
TTTAAAGTAAAAAACAGTGTTACTACAATCATTTCATAATTGGACAGCTA
TTGAATGTGATATATAAAGTAACTCATGTCTAAAATAGTAGTATCTGAAT
ACTCATAACTATGTTCCTAAGACAGTTTCTTCTCTTTCCTCTTTTTTCTA
CTCTTTTTTGCTCTCCCTTTCTAGAAGGCGAGGAGAAAAAAGGCCATTGT
GATTGAGAAAGCAGTTGAATATTTCTTTGATATACCATAGGAAGCTTCAC
TTGATGTGAGCTAAGAAATTATCTAAAATCAATCATTTCTACAAAGGATA
GATATTACGTGATTAAAAAAAATTGGATCCTAATTGTGACATATAATAGA
GTCAGCTGCTATTTTGACTAATATATTGAACCATCCTTGAAGATCTATTT
AAAATCATTGATCTATAATGGAAAACATTTATSGAGCCATGGGAGATGCT
GGATCCTTCCTTACCAAAGCCGTTCAAGTAAGTATTCACTTTTCATATAC
ATATCTATAAATTGACCAAATTCACTGTTTAAAGGATTCACACATCACAG
ATGAGGCCAACACCATGTTGACTCGTGCAAAACAATTTACAGAAGAGAAA
TTAGGTAAAGCAGAGCGGACTGAGAACGATCCCTTTTATGAGTTACTCTC
AAAACAAACAGACGTAACCAAAGGATATTCTGAGAAGATAATTCGTGATA
CTGAGGCCGTTCTAATACCAAATCCAGGTTCAATTAGACATAACATATAT
ATTTATTAGCACTCAAAAATAACATTTTAATCCTCCTAATTAGCCGCCAG
ACTTGAGACATTCATGTTTGAAAACGTTCCTGTGGATAAAATCGGAATCA
CCAATACCCGACTTAGTAATCTGGAGTACCTTGGAACAGATATGATTGAA
GCAGGGAATGAGTTTGGAGCAGAGACCCCATATGGATCTGCTTTAATCCG
TGTTGGACAAACAGAAAAAAGTCTGGGAGAAATTGAAAGGGAATACATTC
GTGGAGGACATACGGGCCTCATTGCTCCTCTGCAAAACTTTCTTGACGAT
GATATGAAGAACATAATAAGATCTAGAAAAGTCCTGGAAAATAAACGATT
GGATTTAGATGCTTCGAAGAATAAAGTGAGAAAATGTCGAGGAATGACGA
TTCAGACACAGGTAAGACTGCGTACGATTGTTCATATCAAAATTTTAATT
TTGTTCCGTATCTCACAGTCATCTCATTTATCATATTATTAGACTTTAAA
TATTAAGCCTTTAAACACAAATATCTTTAATGTATCTATATTTTTTTCTC
AATAAAATTTTTACCCAATAGAAAGATGGAATTGATCCAAGAGCACTTCT
AGAACAGGTACAGGCTTTTTATTTTCTGCATGAAAACCCTCGTAATAACC
CTGTAAATATCCACAAAAACTCTCAACACATCATGAAACTTTGCTCGACA
AAAATACATACTTATCTTTAACTTTAGTCTTCATTGAAAATAGGTGTTGT
TGCTATAATCCTACAATTTCTATATTACTTTAGTAATTTTATCAGAAGAT
TAAATTATGAGATAAATTGGGGTACTTGTCACAGTTGCAATTAGACTATT
ATTTTTTTAATCTCTTTATATTTAAATATTATTATTGCCGTGTTTTTGTT
TAGTGATAACACTAAGAGAGCTAAATCCAAGGAAGAAATCGTCATTGAAA
CAAGATCCTGGACCCTCATCTTCTCTACTACTTATTCTTAATAATATGTT
CTTATTGCACAATTAATCATTTTAGATCACACCACCAAATAGTCGATCCT
CAATAATTTTAATATTTGTCAAAGAAAATAATATATATTTCATATTACCA
AATATGGATTGAGAGTTGACAAATTAAACCATATTAGTATTTTTCTTTTT
AATTACGCCCTTAAAATCATTCCCTAATCATAATTTTATTTAATGCAACG
TTCTTACTTTTATCCTCCTCATTCAGGCTGAGAGTGAACTCCGTACTGCT
CAAAGAGACTATGACATGCAAGTCGAGTTGACAAAAAAACTAATGGAGGG
TCTTTCTGTTGTTCAAACGCATCATCTCCGCTATCTTCAAGACTTTGTTG
AGGCTCAATGTAAATATTATGCTGGATGTCATCAAACCATGCAAGAGCTC
CAGGGAGAATTGAATGGGTAATGCTTTCATTGCAATAGCCTAGGATACAT
ATGTGTATGTCCAAACCGATATGTGATCGATACCATACCCATTATGTATT
TATAGTTTTCAAACTAACACATGATATCTCAATAACAATTAATCAAACAA
AATCCCAAACATAGTCATTTGGTAGCTATATACATATATTCATCAATAGA
GCCGAGCAGATAATTCTCTAAAATTTTGAAAATCATTTTTATTTTATTAA
TAGCTATTGTGGGCTAACATATGAATTTTTACAAGTTTTTAGTTATTGAA
AATTAATTATCATTAATTTTCAAAAAAGAAAATTATTACAGTGAATCCTA
CTAAAATTAAAATTACTCTTTTTTTTGTAACCTGTCCATTTATCCCCGTT
ATTTTCCTTCATCTGTGTTTTTTAAGTAAACTTGATTTAACTCGAATTAT
CATTTGTTCAATTGTGCTTTCAATTCCCTACTAGTAAATGTAGAATAATT
CCACAGATAGAAAGAATTGGATAGCTGTTAACTGACTCTTTTCTTATTTT
GTTTTTCAACAGAAAGATTTAGGGTTAAAACAAAGACGATAAAAATAATA
TTTAAACCAACCATGTTTAGTGTTTCAAGGTTTCAATAATTTTTAATAAT
TGTTGATTTTAAATTGAATCCTGCTTATAATTGTGGGTAATAAATAAAAA
AATAGCCAATTACCAATTAATCAAAAATCGTCCAAATTGAATTGGTTAAT
GAATATATCATATCAATGAGGTTCTAATATATATATCTGTACTTTAATTT
TAAGGTTTTTTATATGTCTTTTTTTATTTTTTTACAGAACTATGACGATC
ATCCCTGGACAGACAGCGTCTCTCTTCCAGAGTTCAAATGCTTCCAATAA
TTCCAACAACCCAAATGAAAAAAGTAATAACAACAATAACAGCGTCCTTG
AATCCAATGGGCCTGAAGGCCTACAACAAATCAATCTGTCCTCTCCMCCA
CCACCACCCTCTGCTCCTGTCTCACGTGGTCAAGCCGACTTCTTCTAATT
TAATTCTACAGTTTTCTTGTTAAATTATTGATAGTTTTTATTTAGAAGTT
TTAATTTCATTAGTTTTCACTATTGATGCCTCTATAAACAGAATTGAAAT
GATAAGCTTTTTTCTTGCTCATTCCACCTGATTCATATATATTGATTTAT
ATATTGAGGTCCACCATAAACCGTTGTTATAAAGGCTGTTAAGAAATTGT
TAAATTTCAGAGTAGATTTTAATTATAATAAACATATAATAATTCTAGAT
ACCTTAAAATCCATGATTTTGAAGTAGTTGCAAGTTGAGACTTTTTCGAT
AAACATAATATATTTTAT back to top
|
