EMLSAT00000008180, EMLSAT00000008180-704027 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000008180
Unique NameEMLSAT00000008180-704027
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s491supercontigLSalAtl2s491:139644..159945 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000008180 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000008180EMLSAG00000008180-690946Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000036122EMLSAE00000036122-745050Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036123EMLSAE00000036123-745051Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036124EMLSAE00000036124-745052Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036125EMLSAE00000036125-745053Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773097auto773097Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000008180EMLSAP00000008180Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000008180

>EMLSAP00000008180 ID=EMLSAP00000008180|Name=EMLSAP00000008180|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=197bp
MLRVSVPDPLILGSAADLFCDFDMEGAQLYSVKWYKNGKEFFSLFIYVLQ
KGKSSANRVHLKFVRWSTEGRYKCEVTAGKPSYDTIVNTSNARIVAMLSP
IYLKSNEISFEVKHPLKAPVLESRGQNRKNLEVPSSVYGGLVEIVDDXNX
HXSHESEFESDSSKESSNILLFPFNNNGLPLRSSVITCCCGLITXFI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s491:139644..159945-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000008180-704027 ID=EMLSAT00000008180-704027|Name=EMLSAT00000008180|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=20302bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s491:139644..159945- (Lepeophtheirus salmonis)
ACAGTTAATTATTCATTAAATTTTCTTTCAGAAAATAGAGGAATCAAAAT GCTTAGAGTTTCTGTACCAGATCCCCTCATCCTTGGGTCTGCAGCTGATT TGTTTTGTGACTTTGATATGGAGGGAGCACAGCTTTACTCTGTTAAGTGG TACAAAAATGGAAAAGAATTTTTTAGGTAATATCAACTTAAAGTTTATAT TTTTCAAATACATCTAATATGCTTATAATTTCCAGATATATGGCGGATGA AATTGACCCAATTGATACATTAAATGTACATGGAATCTATGTTGACGTAA GTATATTTTTAATTCAAATAATCAATACTTATTTATTTGGTGTAGTTCAG TTTTAAAAACGGTAAATAAAAATGTCAGGCCTTCCTACTGTCGGTACTAG AACTGATTAATAAAGAAAGAAATAAAGTTAATTGATGTCATCAAGGACAG AGTTTTAAAGGTTGTGTAGGACTGATATCCATAAATGAACTATACAGAAC TGTAGTTCTAAGTCCTAAATTAAGAATAGGCTCACACTTCTCATTACAAA AAATATCAAAGTGATTTATTGGAACATTCTTCATATGGGTCAACCTTTAA TAAATGATATGTATACGACATCCAGATGTTTAGATAAGGGAACATTCTCT AATCCAATGGTCATTTATGAAGGAATGGATTAAGGCCTAAACCCACGTTT AGCCTAGTTTGGAGGGAGACGGTCCACTTAAAACAAAGTAGATCAGGATA GTTTACCAAGATGGTTTAAATTACATCATAGGACAAAAGGCCCAAGTATT TAAAAAAATAAAAATAGGTAAACCAATTTCGATTTTGAAAGAAAAAAATA ATTTTTTGTATTCAAGAGAAAAAATAAAAGAATAGTCTTACAATGTATTT TCAATGGGGATATAAAACACAAATTATGAATTAACTTTCCACAAAATATA 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TTAAAAGTAAGGCAATCATCATAATTCCATAAACATTATTAATTAAAAAT TTACTACAGAATTATTGTCATCATTTGAAAATTGTCTGAAGAAAAACTAC AATCGATGGAAAATTACGTACAATTATACAATATATTAACTTTAGAAAAC CGGTTGAACATAGAAGTAAGCCGTTGTAACTGTCAATGTAAAAATGTATT TGGAAATTAAAACATGTTCTTGAAAGGGGATGTGGATTTTTTTAAACAGT CTCGAAACCTTTGGTAAGTCTACACAAAATATGTGTGCCCTAGGTACAAT TGGTGAAATTAAAAGGATTTTTTTTTGTCACCCATCTGCATATAAGAAAA CTATTAACGGATTCTTAAATGGGTCATATTCACCTGTTGATAGAACAGAT CGGTAGAAAGAAATCCCTACATCCCTATATACTATAGTTGCAAGCAGTTT TTTATTAATGGGAAATTTTCATTGGGCAATTATCTGATGTCAAAAAGTGT CATCAGTAGAACATTTCTGAAGGGAAAATTTTAATAGATGNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCTCTCTAT AAAACAAAAATTATTRCTTAGAAATAGTTTTATTTTTGCTTTACTTAAGA CATTTTTTTTCTCTACATACATGTTACTGTAATAAATGGTTTTTTATAAA TAAAGAAAAGTATATCCAGAAACGCTTCTATTAGATAGAATATATGATTT 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