EMLSAT00000012295, EMLSAT00000012295-708142 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012295
Unique NameEMLSAT00000012295-708142
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s899supercontigLSalAtl2s899:179229..186811 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012295 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012295EMLSAG00000012295-695061Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000055197EMLSAE00000055197-764125Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055198EMLSAE00000055198-764126Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055199EMLSAE00000055199-764127Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055200EMLSAE00000055200-764128Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055201EMLSAE00000055201-764129Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055202EMLSAE00000055202-764130Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055203EMLSAE00000055203-764131Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055204EMLSAE00000055204-764132Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto774019auto774019Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012295EMLSAP00000012295Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012295

>EMLSAP00000012295 ID=EMLSAP00000012295|Name=EMLSAP00000012295|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=178bp
MTFLEIWDTAGQERFRSVTRSYXRGAAVYRVFDIRILIYVSLLGALLVYD
IASRESFNALTNWLTDARTLASPQIIILLVGNKKDLESEREVSFLEASRF
AQENDLIFLETSAKTGXAVEEAFLKCSKSILAKIETGELDPERIGSGIQY
GESLQQRXHEXYTYTFPTPNCGQLDCVF
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mRNA from alignment at LSalAtl2s899:179229..186811+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012295-708142 ID=EMLSAT00000012295-708142|Name=EMLSAT00000012295|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7583bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s899:179229..186811+ (Lepeophtheirus salmonis)
CAGACATATTATGTATTTGTTCCTCCATCAAGCAAGTCTACACTCTACAC TTAGAGTAAGTATTACATTGAAGCTGTGTGTGTAAAAACAACAATCATTT ACTTGACATAATTCTAAAATACTTATAGTAATATCTAACATCAGCTCTTT CCCTTCATGCGTACACAGAGTGTTGTTCTATGACAGGTGTAAGCAAAATT TGTGGATATAAATTATCTTGAATTACAAAAGTTAACTTATATGAATTACA ATGGCCCTAGATTCACTCACCTCCATGGAACAACACAAATGTCTTCCACG TCACAATACAAGGATCTATTCAATGGAAGCTACATCAGCAATCCAGTATA TGACCATTTATTTAAATTGATTATTATTGGAGAGTCCGGAGTTGGGAAAA CATGTATTACACTGCGTTTCACGGATGAATTATTTAAAGTTAAGATAGTT ATTTGGTTTATTCTTATATCCGTTCTGTACAAGTTGCAATTTCTATAAAG CTTGTATACGAAGTTATCATTTATATGTTTCATTAGGCTTGGTTTAATTA CAACATACCAGGGTCGTTTGAAAAGTCCGTACAAAGTCTGAGAGATTGCA CTACTGGCGCGTATTGAAGTCATGTTTCGTTAGTAGCATTTCTCGGAAGA ACACGCACAAACTTTCAGCCAGATCGGTCTCTTTCTTTCTGTTTGACATT CGTTTGAGTCGAGGAATCGGCCGGAAAGATTATGACGACTGTCTTTTGGA TTCCCAGGGATTAATCCTCTTCGACTATATGGAAAATGATAAAACAATTA TATGTCCATATTATTCATCGTTATTGGACCGTTTGAAAACCGAGCTGCAA GAAAAATGCCAACGATTGGCCCACAAAAAAGTCCTTTTCCATCATTACAA TGCACCAGCTCATACCTTAGCATTTGTGGCTGSAAAATTAATGGAAAWAG GATTCCAACTCAAGATGCCAACAGCACTAACATTATCGACCACCTTCACT CTTCTGTTATCTATGACCATATCATGGATTTATCCTTGATTTATTGAGTA GTAACATCAACAGGGTGGCCAGAACGTTCATCGTCATCTGTGTGCATATA ACCACTCCAAAAATATTGAAACTACTTATAAACTGTTGTAGTCGAAGGTG CAGAGTCCCATAATGTTTATCAAACTTCTTTTTAGTCTCTTGAACTGTTT TGTCTTTCATAAAGTAATGTTTCATCTACATACGAAAAAAAAATTTCCTC CATTTTCTGCAAATCCCTCCACTTCCTCGATTCAAACGAATACCAAACAG AAATAAATAGATCGATCTTCCTGAAGTTGGTGTGTGTTTTTCCAAGAGAT GCTAATCACTAGATATAACTTCAACCCGCGCCAGTAGTGCCATCTCTCGG ACTTTGCGCAGACTTTTTAAAGACCCCTTGTATATCTAATGCTGTCTATT ACAATAGGCATTTAATATGTATTGGCATGTAATATAATTGTGGGGATTTC AACATTATAATTTGTCACATAATAATACTTATTACCTTTCAATTTGTGAT TTCCAATAAAAAAGTAACAAATTACCAGTTTAACTTGTAAGTGGAGTGTG AAAAATACAGATAGTACTCCTGGATTTAAGTATATTAGTGTTAGTACTTA TCTAGTTTATTATCGGTTCAGTTCAGTCCTGCATATTAGTCCTCTAAAAC CTATAAAGTTAGGTCCTTGATGACGTCACTAAACTTTATTTAAAGTGTTT TTAATCAGTTACAGTGTTGATAGTCCAAAGGACCGACAGTCTTAAGGATA TAAGGGGCGTTTGCAACGGGMGGGCTGGYGGGMRTGTAGCCCCCCCCCCC CACACACACAAAATGGACTTTTTCCTCTTTATTATAAAAAAATATTTTTT GAAATTTTTTGTGAATCCAAAAATCAAGCCCCCGTCCTCAATATAATCCT ACGGACGCGCCTGGGATCGGTTCTAAGACTGGACTGGACCGAATAAATAA GGACCGGTACAATACTAGATTGAAGCCTAATTTGAATTTGTGCGTTCAAG TGTTATTTGTATTGTTATAAACTATCCTTTGATACTAATTGCATCTTACA ACAATCATTTAAATTTATTTCTGAAGATAAAGAATCCTTCTTATTCCAGC TCAATTTTACACACACTCTTGGAGTTGATTTTAAGGTAAGGATCAAAATA GCATCACATGTAATTTCCCTGACTTTTTCAATCTTTCTTAACTTTCCGCG GGTGGGCTTGCTCTATTAGATAAAAACTGTAGATATTAAAGGGAAAAAGA TTAAGCTCCAAATCTGGGACACAGCGGGTCAAGAACGCTTTCACGCTGTT ACGACTTCCCATTACAAGCATACCCATGTAATAATTAATTAAACTTATTT AAATAATAATATATTGATCATTATTCTATACCTTTTTACCTAGGGTGTGA TACTTGTCTACGACATCACCAACTACAACTCCTTTCTGAACATTCGAAAG TGGCTGAGGMATACATCCATAAAAATCATTCCCCATAATCCCTTATACAC TTTGAGTTTGTTTATCAAATAGAAATGTGGAGGAGTTTGGCCGAGAAGGA GCTCATCTCGTCTTGGTTGGAAACAAATTAGATCTAGAAAGTCAAAGGGA GGTCACGTATAATGGAGGTTATCAATTGGCCAATGACTTGGGCATGACGT TTTTAGAGGTATCTGCCAAGGAGGCGAGTAATATTGATGAGTAATACCAA GTTTCCTAAATGAATTAATGGGCTGAACGACTACAACTTTATTATTATTT CATATTTTCTTTTCAGATGCTTCATAGTTTTAGTGGAGAATATTCTTAAG AAAAATCCGGATGATTTACGGATATTAAATGATATTCAAAACTTGGCAAC CGTGAAAAAGAAGTCGGACGGACATTGTAATTCAAAAATATGTTATTAAT TCATTGTAAAGGCTTGTTGTATTTGTATATTTATCGATATTGTTTATAAA TTGAAGAATTTATCTATCAATCAGAAAAAAAGAATTTATCAAAAACCGTA GAGTGTGTTAAATGTAATATTTTAATAATATTATGTGTGATATGTCATGA CTGTGGTTTGTCAGTATAAAAACAATTTTGAAGATAATTTAAAAAAATAG AAACTCCCAATATATCATTTTACTTCATATATTCATATACTTCAATATTC CATAGACATATTTGAGTCAATTAGAAGGGTATTAGTCAAATTTATAGGAT GACATTATAATTTTAGCTACATTTTATAACGTTTATTTGATTTAAAGGAC TTATATTGGCCGTGGTATGGCTCTTTTTTATATAAAATCTATCCATTTCC TTACTTCATATATATGAAGATACAGTCCAACATTTTCMGGCGTCTGCYGG GGTGGCTTGGAGGGGCTGCAGCCCCTCTCCCAAATTAAGGATATTTTTTT GCTTTTTATTATATAGAAATTTTAATATTTAAAATTGTTTTCCAAAATTT AATTTTTTAAGAATAGCTATAGATTTTTGAAATTTTATTCTTAATAGCTA TGAATTTTTGAAAGTTTTTTCTCAAAAATTTCATTCCTTCAAAACAGTAA TGTATTTATGAAAAAAATTTAACTTTTGGAATTTTCTCCCAAAAGTTTAA TTTTTTGAGAAAAGCAATGAATTTTCAAAAAAAAATTCTCAAAAATTTAA TTTTTTCTGAACAGTTATATATTTATGAAAAAAAAAATTTTTTTTTAAAG TTTAATTTTTAAATTTTTCGTAAACAATTATATATGTATGGAAAAAAATT AATTTTTGGAATTTTTTGAGAATAACTATGAGTTTTGAAATATTTTTCTC AAAAATTTAATATTTTGTGAACCGCTATGTATTTATGAAAAAAAAATCCA AAAAATTTAATTTTTAATTTTTTGAGAATAGCTATGGATTTTTGATTTTT TTTTCCAAAAAATTGAATTCTTTGAGAATAGCTTTGGATTTTTGAGGTTT TTTTTCCAAATACCTATTGACTTTTAAAAAAAATTCCAAAAATTTAAATT TTGTGAACAACTATGAATAATTATATTTTTCAAAAATACACCTCTGATAT TTGAGTCAATTACAGGATTTTAAGTCAAATTTTTAAGATGAGTTATGATG CCCCAGAATTTTAGGTAGAGTTTAGAAAATATAATTGATTTAAGGGACTT ATATTGGCATACATATGGCCCCTAGAAATAAAATATATCAATTTTGACTT TAATTTATTGATAGCTATTGACGAGTATTCGTAATCCACACTCAATTTTG AGAAAAAGTATTCTAGCTTGCTTTTATGCTGAGGAGTCATATATGTATAT CTACTTACATATTATTTTGAAAGTAGATACAGCTTTTACAAAAAAATAAT ACTACATACTCAAGGGACTCTCTTGTCTAAAAGAGAGMGAATCTACTGTT GCTCAGTGCAGTCTACTGTACGTATGAAAGCTGTATGACTTGTAAAGTTA AGAACCCCTCCTTAAATTGAGAGAAAGGTGTGTGCCCTTAGCTCTAATAA AAGGTTCCCAAATGTATATAAAAATACCTAAATATGTGTCCTAATAAAGT ACGTACATAAATAATAAGAATAAATTATATGTCTTGTACAATTTGCGATT TATGTACAAGTTCCAACTTGTATATGAACGTTGTACAAGGMGTTATTTCT ACGTCTCATGGGTCCTTKTTTAATTAGATTGTTAGTCATTTTAATTAATG ATAATTATCAACTACATAGTCACATTTTGATCTATTAAAAGTATGAATGT ATTGCGTATTTAATGAGTACATTTTTGATTGCAACTTGTACAACTTACTT ATACAAGTTGCAATCACTCGTACAATTACGTATTATAAGATCAATGTTGA TAAATGACGTCACTTTTATTCCAACAAGTAAGAACTCAAACTTTTTTGTA TATCACTTGATTCCATCTTGAGTTCAAGGGTAGAGTCTCAAATTATATAT TTGACATTGAGAGAACCTAGACGTGATATGCATCTAGGCTTTATCAAGGC TATACTTACCTTTTTTTGTTCTTAAAAGTCATGTTATTGGATATATATAT TTTTTTTTAAATATGGCTATAGGAGAAAWCCTTATGTGACGTCATAGTTT TTTCATCATCACTTCTTCTGCTGATAATAATAATTTTCTGATTTACTTGA CTGTACTTCTATTGACAATTTTATATTTACATTTAATTGATCAAATAAAG CCAAAAACGGATCTGAGATATTATATGCTATGTGGCTTGAGTAATTATTG GACTATTTGACGGCCAAGTGAAATAATGTCTGATCAGTACGATTATTTAT TCAAGTTTTTAGTGATCGGATCCGCTGGTACTGGTAAATCCTGTCTTTTG CATCAGTTCATTGAGGGCAGATATCTAGATGATTCACGTCATACCATTGG GGTCGAGTTCGGATCCAGAGTTCTTCCCGTTGGAGGGAAAACTGTTAAAT TGCAGGTATAAGCTTCATAGTTCGTGTAGTCAATGATATAATATATTACA ATTGTGACCCGTCAACACAAGAAGAAGCTAGAATGATTTTTCTTAAAATT AAGCCTGGATAACATTTGTATTCTTATACGAATTATCCTCCACTTCTATT TAAAAACTATTCTTATTAACCCTTAGAAGGCACCACAAATTGCATTTAAT TCAAGTAGACATAATTGATCGTTACGATTAAAGAATAAGAAAATGATAGA TTTAATATTATTATTATTTAAGTTTGAATAATAATGAAAACTTTTGTATT CCTCTTTGCGTTTCAGATATGGGATACAGCGGGGCAGGAGCGATTTCGAT CTGTCACAAGAAGCTATTNCCGTGGAGCAGCAGGTAAATACTTGTCAAAT TAGTGTAATACAAGCCAAAGTAGGGATTAATTATCGTTACAATTTAGTTA CTTTATACTATACAACTCTTATTAAAATGATAAGACTTCAAAATGTAGTT TTTTAATATTTATTTAGTACATAGTATTTCAAAGACTACACCCACTTAAT GAAAGACCCTCAATCACAGTCTCCAATTCTCAACGAATGGTAGTAAAGAT GTTCGTGATGTTATTTTTACACTTGAGAGGCATGGGGGGMAGATACCTTG ACCTTTATCTATAAAACGCTCCAGACAGAATAATCCAGAGGATTGAGGAT AGGTCTCTGTTAAGGTCACACTTTCTAATTATAGAACACTGATTCCTGTG ATCCGCTAAACAGCTCTTCTTTAAACAGATTTAGGGGGATTTCTTTAGGT TTGGGAAGGACTGCCAACTCCAACCAGAGAAACACATTCTAATGAAACAA CCTATGGGCACTATGACCTTCTAGACTATCGAGGATATCTTTTCATTTGC ATCCATGAAAATGATGGGAAACTTATTTCCATCTGAAGAAATTATTCCTA AAACCATGACTTCCTGTGATAAATGGATTCATTTGGAGCCACTTGTTGAG ATTTGATATATTTGTGCAACAGTGTTTCAACTTTTGTACGTTTTAAGACC TGTATCTTGACAAAAACTAAATCAAATTCATAAAAAAACCTTTGTGATAT ATTTTAGAGTAAGTATTTAGTCTACCGAATTATGAAAGCTTAAAACAGTA ACTTAAAATCATCAGGAGTTAGATGTGGAAAAGTTTTATAACGATAATTA ATCCCCTCTCTGTAGTGTATCGAGTGTTTGACATCAGGATTTTAATTTAT GTCTCTCTTTTAGGAGCATTGCTAGTCTATGACATCGCATCAAGAGAGTC TTTCAATGCCCTTACAAATTGGCTCACGGATGCTCGAACCCTTGCATCTC CTCAAATCATAATCCTCCTAGTCGGTAATAAAAAGGATCTTGAGTCAGAG AGGGAAGTTTCTTTCTTAGAGGCTTCCAGATTCGCTCAGGAAAATGACTT AATATTTTTGGAGACATCTGCKAAGACGGGAYAAGCCGTTGAAGAGGCAT TTTTAAAGTGTTCTAAATCCATTCTTGCAAAAATTGAGACTGGGGAATTA GATCCCGAGAGAATTGGATCAGGTTAGCTAGATATAATATACTAATGGCT AATATATAGTTTGTATAATCCTAACATAAACTATCTTCCTAGGTATTCAA TACGGCGAGTCCCTTCAACAACGGAGMCATGAGAGMTATACCTACACTTT CCCTACACCTAATTGTGGTCAGTTGGATTGTGTATTTTGAAATTAAATGG AAGGGCTTGAGGCCCATAGAAATGAATCTCATTTCAAATCCAATGATGAC TGTGTATCGTATTTTTGGTATTTATTATCATCATTATTCATATTAGACAG TATATATAACTGATGATACCATATTTATGTTAATTTATTAAAGGTTCTAT AAGAAAATATGTAATTAAATTAAAGAGATAATTCTGTTTTACATTTCCCC TCATTAATTAACGAGTTTTCTTTTCCATTTATACTTAGGAATATTTTCCT TTTTATTTTGCTAAAAATTTTATACATTTTTTAATCTCCAAAAAATGCAA TTAATTTCTACAATTTATGATTGTGTTGTTGTT
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